KEGG   Arabidopsis thaliana (thale cress): AT3G54590
Entry
AT3G54590         CDS       T00041                                 
Symbol
HRGP1
Name
(RefSeq) hydroxyproline-rich glycoprotein
Organism
ath  Arabidopsis thaliana (thale cress)
SSDB
Motif
Pfam: Extensin_2
Other DBs
NCBI-GeneID: 824624
NCBI-ProteinID: NP_001325986
TAIR: AT3G54590
UniProt: Q9M1G9
Position
3:20206128..20208783
AA seq 743 aa
MGPSAHLISALGVIIMATMVAAYEPETYASPPPLYSSPLPEVEYKTPPLPYVDSSPPPTY
TPAPEVEYKSPPPPYVYSSPPPPTYSPSPKVDYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVDYKS
PPPPYVYNSPPPPYYSPSPKVDYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVEYKSPPPPYVYSSP
PPPYYSPSPKVDYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVEYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPK
VDYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVDYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVDYKSPPPPY
VYSSPPPPYYSPSPKVDYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVDYKSPPPPYVYSSPPPPTY
SPSPKVDYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVEYKSPPPPYVYSSPPPPTYSPSPKVYYKS
PPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVYYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVYYKSPPPPYVYSSP
PPPYYSPSPKVYYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVYYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPK
VHYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVHYKSPPPPYVYNSPPPPYYSPSPKVYYKSPPPPY
VYSSPPPPYYSPSPKVYYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVYYKSPPPPYYSPSPKVYYK
SPPHPHVCVCPPPPPCYSPSPKVVYKSPPPPYVYNSPPPPYYSPSPKVYYKSPPPPSYYS
PSPKVEYKSPPPPSYSPSPKTEY
NT seq 2232 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atggggccttcagcccatctcatttccgctctaggagttatcatcatggcaacaatggtt
gctgcatatgagccagaaacatatgcctctccgccaccgttgtattcttcaccgcttcct
gaagttgaatacaagactcctccactaccatacgtcgacagttccccaccaccaacttac
acaccagctcctgaagtggaatacaagtctccaccaccaccatatgtctatagttctcca
cccccaccaacatactccccatctccaaaggttgactacaaatctcctccaccaccatac
gtctacagttctccaccaccaccatattactcgccttctcctaaggtcgactacaagtct
cctccaccaccatacgtctacaactctccaccaccaccatattactcgccttcccctaag
gtcgactacaagtcacctccaccaccatacgtctacagctccccaccaccaccgtactac
tctccatctcctaaggttgagtacaaatctcctcctccaccgtacgtctacagttctcca
ccaccaccatactactcaccatcccctaaggttgactacaagtctcctccaccaccatac
gtatacagctccccaccaccaccatactattctccatcccctaaggttgagtacaaatct
cctcctccaccgtacgtttacagttctccaccaccaccatactactcaccatcccctaaa
gttgactacaagtctcctccaccaccatacgtctacagttccccaccaccaccatactat
tcaccatcccctaaagtagactacaagtctcccccaccaccatacgtttacagctcccca
ccaccaccatactactcaccatccccaaaggttgactacaagtctcctccaccaccatac
gtctacagctccccaccaccaccatactactcaccatccccaaaggttgactacaagtct
cctccaccaccatacgtctacagctccccaccaccaccatactactcaccatccccaaag
gttgactacaagtctcctccaccaccatacgtttacagttccccaccaccaccaacctac
tctccatccccaaaggttgactacaagtctcctccaccaccatacgtctacagctcccca
ccaccaccatactactcaccatccccaaaggttgagtacaaatctcctccaccaccgtat
gtctacagctccccaccaccaccaacctactctccatcccctaaggtgtactacaagtct
ccaccaccaccatacgtatacagttctccaccaccaccatactactcaccatcccctaag
gtgtactacaagtccccaccaccaccttacgtatacagttctccaccaccaccatactac
tcaccttctcctaaggtgtattacaagtctccaccaccaccgtacgtgtacagttctcca
ccaccaccatactactcaccttctcctaaggtgtattacaagtctccaccaccaccatac
gtctacagttctccacctccaccatattactcaccttcccctaaggtgtactacaaatcc
ccaccaccaccatacgtctacagctctccacctccaccatattactcaccttcccctaag
gtgcactacaaatccccaccaccaccatacgtctacagctctccacctccaccatattac
tcaccttcccctaaggtgcactacaaatccccaccaccaccatacgtctacaactctcca
ccaccaccatactattcaccatctcctaaggtgtactacaaatctccaccaccaccttac
gtctacagttctcccccaccaccgtactactctccttcacctaaagtgtactacaagtct
ccaccaccaccatatgtctacagctctccaccaccaccatattactccccttcccctaag
gtgtactacaagtctccaccaccaccttattactcaccttcccctaaggtatactacaaa
tccccaccacatcctcatgtatgtgtttgtccaccaccacctccatgttattctccatcc
cctaaggttgtgtacaagtctcctccaccaccatatgtctacaattccccaccaccacca
tactactcaccttctccaaaagtttactacaagtctcctccaccaccatcttattattct
ccctctccaaaggttgaatacaaatctccacctccaccatcgtattcaccttctccaaaa
actgagtactaa

  All links  
Genome (1)   
   KEGG GENOME (1)   
Gene (28)   
   RefGene (23)   
   NCBI-PROTEINID (1)   
   NCBI-Gene (1)   
   OC (1)   
   PGDBJ (1)   
   TAIR (1)   
Protein sequence (5)   
   UniProt (1)   
   SWISS-PROT (1)   
   RefSeq(pep) (3)   
DNA sequence (3)   
   RefSeq(nuc) (3)   
Protein domain (1)   
   Pfam (1)   
All databases (38)   

Download RDF
DBGET integrated database retrieval system