KEGG   Trichormus variabilis: Ava_1552
Entry
Ava_1552          CDS       T00277                                 
Name
(GenBank) serine/threonine protein kinase with TPR repeats
Organism
ava  Trichormus variabilis
SSDB
Motif
Pfam: TPR_1 TPR_11 TPR_2 TPR_8 TPR_16 TPR_17 Pkinase TPR_19 TPR_12 TPR_14 ANAPC3 TPR_9 TPR_6 PPTA PK_Tyr_Ser-Thr TPR_10 BTAD ABC1 RIO1 APH gp37_C TPR_3 Kdo ChAPs Kinase-like SCP-1
Other DBs
NCBI-ProteinID: ABA21175
CyanoBase: Ava_1552
UniProt: Q3MCW1
Position
1904892..1907015
AA seq 707 aa
MLGNTLVGRYQIISHLGGGGFGETFVACDTHLPGMPKCVVKKLQPQANDQATLEIARRLF
DTEAQVLYKLGSCDRIPQLLAYFEENAEFYLVQEFIPGHDLSKELTPGKVFTQDEVTILL
QEILTILEFVHEQNVIHRDINPRNLLRRQDGKLILIDFGAVKQITTQIVTPTGENKSTVI
IGTPGYIPGEQAQGNPKFSSDIYAVGIVAIQALTGLLPHQLEHDADTHEIIWQNHAQVSS
EFARFIDKMVCYDFRQRYASATTALQALTELTKPASDTIAITPTLPPTKFRFNHTKKSIF
IKLLLAILLISATGTASVFVVNSINSNNATELAKQGNTFFELQRYKDALSAYKKAVDIRP
DYAPAWYGKGKTLFRLKQYQDALTAYDKAIQIQPDYVEAWSGRGFSLQSLQRYAEAIASF
DKALQLNENYPEVWNARGEAFSNLKQYDRAIKSYDKAIEFKSDAYESFYNKGLALQSLKE
YNEAINAYNKAIEIKSDYERAWYNLGNSLVNLNRYEDAFKAYDKAVQYKTDYAIAWLSKG
NVLIILRRYPEAIESFNQVIKFNPNSYQAWYGKGWSQHQNQRYAEAIESYKKAATIKPSN
YQVWYSLGNSQYILQQYQEAIASYNKAVRYQPKHIESWYSRGNALFSLKQYQDAIASYEQ
AIKHKPDYSQAINARDEAQRQLQAATPKPVVIPVMPTPEFTNPSQED
NT seq 2124 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgctgggaaacacacttgttggaagataccaaattattagccacttgggaggaggggga
tttggtgaaacttttgtagcttgtgatactcatctaccaggaatgcctaaatgtgtagtc
aagaaactgcaaccccaagcaaatgaccaggctaccttggaaatagccaggcgattattt
gatacagaggcgcaagttttatataaattgggaagttgcgatcgcattcctcaacttttg
gcttattttgaggagaatgcagagttctatctggtacaggaatttatccctggtcacgac
ctgagtaaagagttaacgccaggaaaagtctttactcaagatgaggtgacaatactatta
caagagattctgaccatcttggaatttgtccatgagcaaaatgtaattcatcgtgacatt
aatccgcgaaacttactcaggcgacaggatggtaagttaattctcatcgactttggggca
gtgaagcaaatcaccacccaaatagtgacccccactggtgaaaataaatctactgtgatt
attggtacaccaggttacataccaggagaacaagcccaaggtaatcccaagtttagtagt
gatatctatgctgtggggatagttgcaattcaagcattgacgggattattaccccatcaa
ctagaacatgatgctgatactcatgaaattatctggcaaaatcatgctcaagtctcatca
gagtttgccagatttatagacaaaatggtgtgttatgatttccggcaacgctatgcttca
gcgacaactgcattacaagcactcacagaattaacaaaacctgcgtctgatacgatcgcc
ataactcccactttaccacctaccaaatttagatttaatcacactaaaaaaagtatattc
atcaagttattattagcaattttattaattagtgcgactggtacagcttcagtatttgtt
gtcaacagtattaatagtaataatgctacagagttggctaaacaaggtaatacttttttt
gaattgcaacgatacaaagatgccttatctgcttataaaaaagcggttgatattaggcca
gattatgctcctgcttggtatggcaaaggaaaaaccttatttcgactcaagcaatatcaa
gacgcattgacagcttatgataaagccattcaaatccaaccagattatgtagaagcttgg
agtggtaggggttttagtttgcaaagtttacaacgttatgcagaagcgatcgcctctttt
gataaggctttacaactcaatgaaaattatccagaagtctggaatgctagaggggaagct
tttagtaatttaaaacagtatgaccgagcgattaaatcttatgataaagccattgaattt
aaatcagatgcttatgaaagtttttataataagggattagctttgcaaagcctgaaagaa
tataatgaagccataaatgcctataataaagctattgaaattaaatcagattatgagaga
gcatggtataatttaggaaattctctagttaatctgaaccgctacgaagatgcttttaag
gcttatgacaaggcagtacaatataaaacagattatgctatagcttggttatcaaaaggt
aacgtcttgattattttacgacgttatccagaagcaattgaatcttttaatcaagttata
aaatttaatcctaatagttatcaagcatggtatggaaaaggttggtcgcaacatcaaaac
caacgctatgcagaggcaatagaatcttataagaaagcagcaacaattaagcctagtaat
tatcaggtttggtatagtttaggcaattctcagtatattttacagcaatatcaagaggcg
atcgcttcttataacaaagcagtgcgttaccaaccaaagcatattgaaagttggtacagt
cggggtaatgccttatttagtttaaaacaatatcaggatgcgatcgcctcctatgaacaa
gccattaaacataaaccagattatagccaagcaattaacgctcgtgacgaagcccagcgt
caactccaagctgcaacaccaaaacctgtagttatcccagtcatgcctactcctgaattt
actaatccttcccaagaggattaa

  All links  
Genome (1)   
   KEGG GENOME (1)   
Gene (18)   
   RefGene (15)   
   NCBI-PROTEINID (1)   
   CYANOBASE (1)   
   OC (1)   
Protein sequence (1)   
   UniProt (1)   
Protein domain (26)   
   Pfam (26)   
All databases (46)   

Download RDF
DBGET integrated database retrieval system