KEGG   Trichormus variabilis: Ava_4928
Entry
Ava_4928          CDS       T00277                                 
Name
(GenBank) multi-sensor hybrid histidine kinase
Organism
ava  Trichormus variabilis
SSDB
Motif
Pfam: MASE1 HATPase_c Response_reg HisKA PAS_4 PAS PAS_9 HATPase_c_3 Glyco_hydro_77 PAS_8 Taxilin DUF2205
Other DBs
NCBI-ProteinID: ABA24525
CyanoBase: Ava_4928
UniProt: Q3M3B1
Position
complement(6196882..6199551)
AA seq 889 aa
MTDSMKIAIMRRWLMISLLGLFALVIAHGMALIYRIQPGVSLWFPPSGVAIALTFWFGPC
GIILTGLASFLMSPFWGLHGWERLIAFVDIIEPLSAWLLYRRLWKGSRTINTLKDATLFT
VSAPLVACATLATIGSLSLVAIGKMPLAGLSHNIPHWWLGNAIGIMAIAPTALLVFTPYF
QSQGWLHRTEPLNSGFVSRNFRPSLHLLLEFSAILLLCLAIATLTVAETNQNGFKLQQLS
FLGFVPVLWAATRFGVTSGMLTSSFCVLVTLFAYLVAYPKAMYLATFPVQAEVLHVHKLS
LLVQCAVSLFVGIAITERSSIQVELAVEKVRRGEYQSRAELSEKLIQLNESLVEINDCLE
ESHREKDELLRREQALRSRLSNILSSMTDAFIAVNRDWDITYCNHQAAKIQHLEPEDLIG
KNYWEQWARTKGTDFEREYRRSLAENIPVHFEVLYELWDMWFEVHAYPAEDGLGIFFRNI
TERKQAEQEREYLLMREQIARSEAERANRLKDDFLAVLSHELRTPLNPILGWATLLKKRN
LEEATRRRGIETIERNAKLQIQLIEDLLDVSRIQQGKLNLNIQSVNLVNTIEEALETVSL
AIEAKNIDVKTALNVNVCMVAGDAARLQQIIWNLLANAIKFTPPAGQIQVALERVNNSAQ
IQIQDNGKGISSEFLPYVFEYFRQADGTITRQFGGLGLGLAIVKHLTELHGGTVKAESAG
EGMGATFTVNLPLMLNAPQIVPQVGQPDNTWGLAGLYILVVDDDVDTGEFLTLMLEQSGA
EVTAVTSAGEALEVIARTKVDLLLSDIGMPGIDGYMLMQLIRAMPSAKGGKIPAIALTAY
AGEINQKQALAAGFQLHLVKPVEAEKLLQGISEVLAASPPEFSYVSVEN
NT seq 2670 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgacagactctatgaaaattgccattatgcgtagatggctgatgatttcacttttgggc
ttattcgctctggttattgctcatgggatggcgctgatttaccgcattcagccgggagtg
tctttgtggtttcctccatcaggtgtggcgatcgctttaactttttggttcggcccttgt
ggtattattctcaccggattggcttcttttctcatgtcgccgttttggggtttacatggt
tgggagcgattaatagcttttgtcgatatcatcgagcctctgagcgcttggttactgtac
cgccgtctctggaagggttcccgaaccattaataccctcaaggatgccactctttttact
gttagcgcccccctcgtcgcctgcgctactttggcgacaattggtagtttatctcttgtc
gctataggcaaaatgcctctcgctggtttgagtcataacataccccattggtggttaggt
aatgcaattggaatcatggcgattgcgcctactgccttattagtttttacaccctatttt
caatctcaaggctggttacaccgtaccgaaccactaaattctggatttgtttctcgaaat
ttccgtccttctttgcacctcttattagaattcagcgccatattactactttgtttagct
atagcaaccttaacagtggctgaaactaatcaaaacggatttaagttacaacagttgtct
tttttaggctttgttccagttttatgggctgcaacccgctttggcgtaactagtgggatg
ttaacttcaagtttctgtgtattagtaacgctatttgcttacttagttgcttaccctaaa
gcaatgtatttagccacttttccagtacaagcagaagttttacacgtccacaaattgagc
ttattggtacagtgtgctgtgagtttatttgtgggcattgctattactgaaaggtcaagt
attcaagtagagttagcagtagaaaaagtgcgtcgtggggaataccaaagccgcgcagaa
ttatcagaaaaacttatccaactcaatgaatcactggtggaaatcaatgattgtttagaa
gaatctcatcgagaaaaggatgaattacttcggcgtgaacaagcgctccgcagtcggttg
agcaatattttgtcaagtatgactgatgcttttattgctgtgaatcgagattgggatatt
acatattgcaatcaccaagcggcaaaaattcaacatttagaaccagaagacttgattggt
aagaactactgggaacagtgggcgagaactaaaggtacagactttgagcgagaatatagg
cgatcgctagctgaaaatattccagtccattttgaggtattgtacgaactatgggatatg
tggtttgaagtccacgcctatccggctgaagatggcttagggatattttttcggaatatt
actgaacgcaaacaagcagaacaagaacgggaatatctgctgatgcgtgagcaaattgct
agaagcgaagctgagagagctaatcgtttaaaggatgattttctggcagttctttctcac
gaattgcgtactccacttaacccgattttaggttgggcaactctactgaaaaagcggaat
ttggaagaagctacgcgccgacgggggatagaaacaattgagcggaatgctaaattacaa
attcaacttattgaagatttattagatgtctctcgcattcagcaagggaaattaaattta
aatatccagtcggtgaatttagttaatacgattgaagaggctttggagaccgtaagtcta
gcaatagaggcgaaaaatattgatgttaaaactgcactaaatgtcaatgtttgtatggtt
gcaggtgatgctgctcgtttacaacaaattatctggaacctgcttgctaatgccattaaa
ttcactcctcccgcaggacaaatacaggtagctttagaaagagttaataattctgcccaa
attcaaattcaagataatggcaaggggataagttcagaatttctaccttatgtctttgag
tattttcgtcaagcagatggcacaataacaagacaatttggcggtttaggattagggttg
gctattgttaagcatctcacagaactacatggtggcacagtaaaagcagaaagcgcaggg
gaaggaatgggtgcaacatttacagtcaatttaccattaatgcttaacgcgccgcagata
gttccacaagtggggcaaccagataatacttggggtttagctggactgtatattttggta
gtagatgatgatgttgatacaggcgaattcctgacattaatgttagaacaatctggagcc
gaagtaacagccgtgacatcagcaggtgaggctttagaggtaatagcgagaactaaagtc
gatttgctcttaagtgatatcggaatgccaggaatagatggttatatgttgatgcagtta
attcgagccatgccttcagcaaaaggtggtaaaattccagcgatcgccctaactgcttat
gctggagaaatcaaccaaaaacaggcactagctgctggctttcaactgcatttagttaaa
cccgtagaagcagaaaagttacttcagggtatatcagaggttttagctgcttcaccgcca
gaatttagttacgtttccgtagaaaattaa

  All links  
Genome (1)   
   KEGG GENOME (1)   
Gene (17)   
   RefGene (14)   
   NCBI-PROTEINID (1)   
   CYANOBASE (1)   
   OC (1)   
Protein sequence (1)   
   UniProt (1)   
Protein domain (12)   
   Pfam (12)   
All databases (31)   

Download RDF
DBGET integrated database retrieval system