KEGG   ENZYME: 1.14.99.69
Entry
EC 1.14.99.69               Enzyme                                 
Name
tRNA 2-(methylsulfanyl)-N6-isopentenyladenosine37 hydroxylase;
miaE (gene name);
tRNA 2-methylthio-N6-isopentenyl adenosine(37) hydroxylase;
tRNA 2-(methylsulfanyl)-N6-dimethylallyladenosine37 hydroxylase
Class
Oxidoreductases;
Acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen;
Miscellaneous
Sysname
tRNA 2-(methylsulfanyl)-N6-prenyladenosine37,donor:oxygen 4-oxidoreductase (trans-hydroxylating)
Reaction(IUBMB)
2-(methylsulfanyl)-N6-prenyladenosine37 in tRNA + reduced acceptor + O2 = N6-[(2E)-4-hydroxy-3-methylbut-2-en-1-yl]-2-(methylsulfanyl)adenosine37 in tRNA + acceptor + H2O [RN:R12676]
Reaction(KEGG)
R12676
Substrate
2-(methylsulfanyl)-N6-prenyladenosine37 in tRNA;
reduced acceptor [CPD:C00030];
O2 [CPD:C00007]
Product
N6-[(2E)-4-hydroxy-3-methylbut-2-en-1-yl]-2-(methylsulfanyl)adenosine37 in tRNA;
acceptor [CPD:C00028];
H2O [CPD:C00001]
Comment
The enzyme, found only within a small subset of facultative anaerobic bacteria, belongs to the nonheme diiron family. The enzyme from Salmonella typhimurium was shown to catalyse a stereoselective (E)-hydroxylation at the terminal C4-position of the prenyl group.
History
EC 1.14.99.69 created 2020
Orthology
K06169  tRNA 2-(methylsulfanyl)-N6-isopentenyladenosine37 hydroxylase
Genes
STY: STY4809(miaE)
STT: t4505(miaE)
SEX: STBHUCCB_47610
SENT: TY21A_22925
STM: STM4471(miaE)
SEO: STM14_5366(miaE)
SEV: STMMW_44171
SEY: SL1344_4401(miaE)
SEM: STMDT12_C45990
SEJ: STMUK_4457(miaE)
SEB: STM474_4668(miaE)
SEF: UMN798_4840(miaE)
SETU: STU288_22425
SETC: CFSAN001921_18070
SENR: STMDT2_43171(miaE)
SEND: DT104_44611(miaE)
SENI: CY43_23285
SEEN: SE451236_05375
SPT: SPA4271(miaE)
SEK: SSPA3968
SPQ: SPAB_05628
SEI: SPC_4604(miaE)
SEC: SCH_4326(miaE)
SEH: SeHA_C4875
SHB: SU5_0520
SENH: CFSAN002069_09835
SEEH: SEEH1578_08420
SEE: SNSL254_A4819
SENN: SN31241_8410
SEW: SeSA_A4726
SEA: SeAg_B4756
SENS: Q786_22025
SED: SeD_A4855
SEG: SG4296(miaE)
SEL: SPUL_4447(miaE)
SEGA: SPUCDC_4433(miaE)
SET: SEN4223(miaE)
SENA: AU38_21785
SENO: AU37_21800
SENV: AU39_21820
SENQ: AU40_24355
SENL: IY59_22345
SENJ: CFSAN001992_11615
SEEC: CFSAN002050_05770
SEEB: SEEB0189_020030
SEEP: I137_21275
SENB: BN855_45480
SENC: SEET0819_06225
SES: SARI_03178
SBG: SBG_3891(miaE)
SBZ: A464_4460
SBV: N643_19695
SALZ: EOS98_19870
ENC: ECL_00680
ENL: A3UG_02670
ECLG: EC036_05040
ECLE: ECNIH2_03570
ECLN: ECNIH4_20230
ECLI: ECNIH5_02745
ECLX: LI66_02585
ECLY: LI62_03070
ECLZ: LI64_02755
ECLO: ENC_43870
EHM: AB284_22450
EXF: BFV63_02570
ECLA: ECNIH3_02745
ECLC: ECR091_02735
EAU: DI57_16010
EKB: BFV64_02285
ENO: ECENHK_02610
EEC: EcWSU1_00483(miaE)
ELG: BH714_17070
ECAN: CWI88_19590(miaE)
ERN: BFV67_02510
ECLS: LI67_003600
ECHG: FY206_03095(miaE)
ESH: C1N69_02590(miaE)
EPT: HWQ17_09905(miaE)
ENT: Ent638_0461
EAS: Entas_0480
ENR: H650_18010
ENX: NI40_002580
ENF: AKI40_4437
LNI: CWR52_09665
EBG: FAI37_04005(miaE)
END: A4308_00250
ENZ: G0034_02460(miaE)
ENS: HWQ15_11065(miaE)
ENK: LOC22_13455(miaE)
EHU: D5067_0020450(miaE)
EMOR: L6Y89_02510(miaE)
ENB: ELK40_03240(miaE)
EQU: OM418_02545(miaE)
EPU: QVH39_02590(miaE)
ESA: ESA_03451 ESA_03470
CSK: ES15_3430
CSZ: CSSP291_16115
CSJ: CSK29544_00400
CCON: AFK62_02650
CDM: AFK67_02635
CSI: P262_05089
CMJ: AFK66_017170
CUI: AFK65_02565
CMW: AFK63_15950
CTU: CTU_04970(miaE)
KPN: KPN_04661(miaE)
KPU: KP1_0542(miaE)
KPM: KPHS_05140
KPP: A79E_4536
KPH: KPNIH24_02640
KPZ: KPNIH27_02570
KPV: KPNIH29_02730
KPW: KPNIH30_02775
KPY: KPNIH31_05315
KPG: KPNIH32_02785
KPC: KPNIH10_02625
KPQ: KPR0928_02630
KPT: VK055_2798
KPO: KPN2242_01395
KPR: KPR_0638(miaE)
KPJ: N559_4629
KPI: D364_23735
KPA: KPNJ1_04953
KPS: KPNJ2_04902
KPX: PMK1_02129
KPB: FH42_19705
KPNE: KU54_023960
KPNU: LI86_23800
KPNK: BN49_4776(miaE)
KVA: Kvar_4593
KPE: KPK_5007(miaE)
KPK: A593_13355
KVD: KR75_10810
KVQ: SP68_17395
KOX: KOX_09310
KOE: A225_0537
KOY: J415_00435
KOM: HR38_08030
KMI: VW41_20870
KOK: KONIH1_02955
KOC: AB185_33265
KQU: AVR78_07200
EAE: EAE_09745
EAR: CCG32089
KQV: B8P98_24775
KLL: BJF97_03705
KLW: DA718_25755
KAR: LGL98_22360
KGR: JJJ10_24855
KPAS: LUW96_09505
KLC: K7H21_25020
KLM: BWI76_03020
REE: electrica_04548
ROR: RORB6_16260
RON: TE10_04790
RPLN: B1209_24240
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RTG: NCTC13098_06604
CFD: CFNIH1_09050
CBRA: A6J81_14050(miaE)
CWE: CO701_19070
CYO: CD187_21175
CPOT: FOB25_08495(miaE)
CFQ: C2U38_02495(miaE)
CSED: JY391_19435(miaE)
CAMA: F384_24555
CAF: AL524_06320(miaE)
CIF: AL515_04210(miaE)
CFAR: CI104_22015
CIR: C2U53_13155(miaE)
CIE: AN232_00995(miaE)
CPAR: CUC49_22200(miaE)
CTEL: GBC03_07825(miaE)
CITZ: E4Z61_14135(miaE)
CARS: E1B03_03900(miaE)
CIX: M4I31_20825(miaE)
CIB: HF677_020605(miaE)
CENS: P2W74_20290(miaE)
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CEM: LH23_02605
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CLAP: NCTC11466_00408
PGE: LG71_00725
ESC: Entcl_3895
KLE: AO703_02460
KSA: C813_12435
KOR: AWR26_22395(miaE)
KRD: A3780_01325
KCO: BWI95_02960
KOT: EH164_19735(miaE)
KPSE: IP581_02615(miaE)
KOB: HF650_03080(miaE)
KOO: O9K67_21870(miaE)
KGO: CEW81_21980
KIE: NCTC12125_03174
KAS: KATP_40160
KLU: K7B04_02270(miaE)
KCY: RIN60_20040(miaE)
LAX: APT61_19850
LEI: C2U54_07385(miaE)
LEH: C3F35_09210(miaE)
LEE: DVA44_21265(miaE)
LER: GNG29_02745(miaE)
LEA: GNG26_02290(miaE)
LPNU: KQ929_18200(miaE)
LEY: DVA43_15245(miaE)
LAZ: A8A57_02580
LEF: LJPFL01_0511
LEW: DAI21_01660(miaE)
BUF: D8682_18365
BAGE: BADSM9389_05360
BFT: MNO13_02700
AHN: NCTC12129_00587
ASUB: NLZ15_02470
YRE: HEC60_20315(miaE)
SGOE: A8O29_020005(miaE)
KIN: AB182_22375
PDZ: HHA33_25080(miaE)
METY: MRY16398_49840
IZH: FEM41_02585
PSHI: SAMEA2665130_1733
PSGC: G163CM_30300
SCOL: KFZ77_16875
PVJ: LMA04_14960(miaE)
SUPE: P0H77_03175(miaE)
TOE: QMG90_19065(miaE)
EBF: D782_3976
EBC: C2U52_04375(miaE)
EBU: CUC76_12760
PSTS: E05_18780
SMAR: SM39_4828(miaE)
SMAC: SMDB11_4610(miaE)
SMW: SMWW4_v1c04890
SPE: Spro_0556
SRR: SerAS9_0490
SRL: SOD_c04320(miaE)
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DZC: W909_05335
DSO: A4U42_14665
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DFN: CVE23_06140
DAQ: DAQ1742_03136(miaE)
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DLC: O1Q98_17310
DDA: Dd703_1016
LBQ: CKQ53_09840
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EPE: CI789_21315
ERWI: GN242_02600
ETP: LU633_04075
ERP: LJN55_02850
ETO: RIN69_02735(miaE)
EGE: EM595_0578(miaE)
PAM: PANA_0491(miaE)
PLF: PANA5342_3807(miaE)
PAJ: PAJ_3639(miaE)
PAQ: PAGR_g3686
PVA: Pvag_3715(miaE)
PAGG: AL522_06700
PAO: Pat9b_0533
KLN: LH22_19585
PANT: PSNIH1_07755
PANP: PSNIH2_15680
PAGC: BEE12_09480
PSTW: DSJ_04240
PALH: B1H58_04885
PANS: FCN45_02660
PEY: EE896_16840
PDIS: D8B20_02340
PER: LAC65_01855
PJI: KTJ90_16735
PANO: OJ965_18595
KPIE: N5580_15950
PALF: K6R05_16375
PPHO: CTZ24_02760
PGZ: C2E15_02890
PCD: C2E16_02955
MINT: C7M51_04090
MTHI: C7M52_02943
MHAN: K6958_02785
TCI: A7K98_01410
TPTY: NCTC11468_00359
PLU: plu0721(miaE)
PLUM: A4R40_03615
PAY: PAU_00695(miaE)
PAKH: B0X70_04120
PLUI: CE143_04055
XNM: XNC2_3697
XDO: XDD1_3157(miaE)
XPO: XPG1_2761(miaE)
XGR: QL128_03790(miaE)
PSI: S70_05595
PSX: DR96_224
PSTA: BGK56_08410
PTHA: OI982_18245
PRG: RB151_034840
PALA: CO695_08975
PHEI: NCTC12003_00957
PRQ: CYG50_21070
PRJ: NCTC6933_03093
PVC: G3341_04655
PMAG: JI723_05090
PHAG: PZ638_04725
AET: LDL57_03435
AAPC: QG404_12095(miaE)
GKN: PVT67_10650(miaE)
VCH: VC_1910
VCF: IR04_14710
VCS: MS6_1672
VCE: Vch1786_I1401(miaE)
VCQ: EN18_12670
VCJ: VCD_002452
VCI: O3Y_09250
VCO: VC0395_A1500(miaE)
VCR: VC395_2025(miaE)
VCM: VCM66_1834(miaE)
VCL: VCLMA_A1657
VCX: VAA049_965
VCZ: VAB027_2554
VVU: VV1_2956
VVY: VV1316
VVM: VVMO6_01897
VVL: VV93_v1c12280 VV93_v1c12290
VPA: VP1099
VPB: VPBB_1028
VPK: M636_16285
VPF: M634_07420
VPH: VPUCM_1177
VHA: VIBHAR_01791
VCA: M892_04215
VAG: N646_0151
VEX: VEA_003885
VDB: AL552_13790
VHR: AL538_15625
VNA: PN96_07965
VOW: A9237_02415
VRO: BSZ04_13355
VSP: VS_2052
VEJ: VEJY3_05385
VFU: vfu_A02418
VNI: VIBNI_A2329(miaE)
VCY: IX92_04070
VCT: JV59_10450
VTU: IX91_10425
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VMI: AL543_18680
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VSL: LTQ54_03420
VPL: SA104470976_01622(miaE)
VJP: NP165_04455
VPG: LZI70_12365
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VTI: CEQ48_09490
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VNP: KW548_13860
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VMT: QYQ96_04910(miaE)
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VFM: VFMJ11_1585
AWD: AWOD_I_1581(miaE)
PPR: PBPRA2472(STY4809)
PGB: H744_2c2702
PDS: CAY62_04820
PGH: FH974_05385
GHO: AL542_03655
GKD: K6Q96_06220
PMAI: CF386_06100 CF386_12025
SALY: E8E00_04505
SKS: FCN78_08340
SCOT: HBA18_08850
SPRO: N7E60_09255
PAE: PA1790
PAEV: N297_1838
PAEI: N296_1838
PAU: PA14_41430(miaE)
PAP: PSPA7_3513
PAG: PLES_35391
PAF: PAM18_3256
PNC: NCGM2_2694(miaE)
PAEB: NCGM1900_4771(miaE)
PDK: PADK2_16730
PSG: G655_16215
PRP: M062_09335
PAEP: PA1S_17045
PAER: PA1R_gp5408
PAEM: U769_16760
PAEL: T223_18100
PAES: SCV20265_3616
PAEU: BN889_01916
PAEG: AI22_16945
PAEC: M802_1835
PAEO: M801_1837
PMY: Pmen_2575
PMK: MDS_2130
PRE: PCA10_36930
PPSE: BN5_1760(miaE)
PFUW: KF707C_20010
PALC: A0T30_09945
PCQ: PcP3B5_20450
PMUI: G4G71_22480
PNT: G5B91_11980
PPAA: B7D75_16090
PPU: PP_2188
PPF: Pput_3549
PPG: PputGB1_1812
PPW: PputW619_3431
PPT: PPS_1799
PPB: PPUBIRD1_3463
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Reference
1  [PMID:8253666]
  Authors
Persson BC, Bjork GR
  Title
Isolation of the gene (miaE) encoding the hydroxylase involved in the synthesis of 2-methylthio-cis-ribozeatin in tRNA of Salmonella typhimurium and characterization of mutants.
  Journal
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Reference
2  [PMID:9620964]
  Authors
Persson BC, Olafsson O, Lundgren HK, Hederstedt L, Bjork GR.
  Title
The ms2io6A37 modification of tRNA in Salmonella typhimurium regulates growth on citric acid cycle intermediates.
  Journal
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Reference
3  [PMID:23906247]
  Authors
Corder AL, Subedi BP, Zhang S, Dark AM, Foss FW Jr, Pierce BS.
  Title
Peroxide-shunt substrate-specificity for the Salmonella typhimurium O2-dependent tRNA modifying monooxygenase (MiaE).
  Journal
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DOI:10.1021/bi4000832
Other DBs
ExplorEnz - The Enzyme Database: 1.14.99.69
IUBMB Enzyme Nomenclature: 1.14.99.69
ExPASy - ENZYME nomenclature database: 1.14.99.69
BRENDA, the Enzyme Database: 1.14.99.69

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