Entry
Name
[histone H3]-lysine9 N-methyltransferase;
PRDM3 (gene name);
PRDM16 (gene name)
Class
Transferases;
Transferring one-carbon groups;
Methyltransferases
BRITE hierarchy
Sysname
S-adenosyl-L-methionine:[histone H3]-L-lysine9 N6-methyltransferase
Reaction(IUBMB)
S-adenosyl-L-methionine + a [histone H3]-L-lysine9 = S-adenosyl-L-homocysteine + a [histone H3]-N6-methyl-L-lysine9
Reaction(KEGG)
Substrate
S-adenosyl-L-methionine [CPD:
C00019 ];
[histone H3]-L-lysine9
Product
S-adenosyl-L-homocysteine [CPD:
C00021 ];
[histone H3]-N6-methyl-L-lysine9
Comment
This entry describes several enzymes that methylate the L-lysine-9 residue of histone H3 (H3K9) only once, generating a monomethylated form. These modifications influence the binding of chromatin-associated proteins. cf. EC
2.1.1.368 , [histone H3]-lysine9 N-dimethyltransferase, EC
2.1.1.355 , [histone H3]-lysine9 N-trimethyltransferase, and EC
2.1.1.366 , [histone H3]-N6,N6-dimethyl-lysine9 N-methyltransferase.
History
EC 2.1.1.367 created 2020
Pathway
Orthology
K04462 [histone H3]-lysine9 N-methyltransferase (ecotropic virus integration site 1 protein)
K22410 [histone H3]-lysine9 N-methyltransferase
Genes
HSA : 2122(MECOM) 63976(PRDM16)
PTR : 457227(PRDM16) 460837(MECOM)
PPS : 100974472(PRDM16) 100994741(MECOM)
GGO : 101137489(PRDM16) 101143561(MECOM)
PON : 100431606(MECOM) 100435350(PRDM16)
NLE : 100591579(MECOM) 100592850(PRDM16)
HMH : 116481217(MECOM) 116812816(PRDM16)
MCC : 100430112(PRDM16) 698603(MECOM)
MCF : 102132224(PRDM16) 102139452(MECOM)
MTHB : 126948321 126962306
MNI : 105466009(MECOM) 105496680(PRDM16)
CSAB : 103221284(MECOM) 103225739(PRDM16)
CATY : 105586041(MECOM) 105594463(PRDM16)
PANU : 101001831(MECOM) 101003094(PRDM16)
TGE : 112618964(MECOM) 112631947(PRDM16)
MLEU : 105545501(PRDM16) 105549705(MECOM)
RRO : 104661346(PRDM16) 104677766(MECOM)
RBB : 108516319(MECOM) 108535988(PRDM16)
TFN : 117074583 117083696(MECOM)
PTEH : 111543501(MECOM) 111544592(PRDM16)
CANG : 105516737(MECOM) 105522340(PRDM16)
CJC : 100403987(MECOM) 118155323(PRDM16)
SBQ : 101028887(PRDM16) 101051357(MECOM)
CIMI : 108285007(MECOM) 108313857(PRDM16)
CSYR : 103249480(PRDM16) 103274037(MECOM)
MMUR : 105877367(PRDM16) 105879179(MECOM)
LCAT : 123630238(MECOM) 123635985(PRDM16)
PCOQ : 105806970(MECOM) 105824667(PRDM16)
OGA : 100940836(PRDM16) 100951161(MECOM)
MMU : 14013(Mecom) 70673(Prdm16)
MCAL : 110290693(Mecom) 110292493(Prdm16)
MPAH : 110319807(Mecom) 110323056(Prdm16)
RNO : 100366024(Prdm16) 294924(Mecom)
MCOC : 116095046(Mecom) 116097116(Prdm16)
ANU : 117702116 117708363(Prdm16)
MUN : 110545680(Mecom) 110559746(Prdm16)
CGE : 100762301(Prdm16) 100768628(Mecom)
MAUA : 101840940(Prdm16) 101844454(Mecom)
PROB : 127213457(Prdm16) 127223342(Mecom)
PLEU : 114695325(Mecom) 114708286(Prdm16)
MORG : 121443532 121448261(Prdm16) 121452670(Mecom)
MFOT : 126499290 126508256
AAMP : 119817157(Prdm16) 119826790(Mecom)
NGI : 103731713(Mecom) 103749783(Prdm16)
HGL : 101718355(Mecom) 101721685(Prdm16)
CPOC : 100714489(Prdm16) 100727638(Mecom)
CCAN : 109682858(Prdm16) 109700158(Mecom)
DORD : 105985625(Mecom) 105998434(Prdm16)
DSP : 122107242(Mecom) 122127313(Prdm16)
PLOP : 125351997(Mecom) 125354492(Prdm16)
NCAR : 124977451 124992923
MMMA : 107149498(Mecom) 107155573(Prdm16)
OPI : 101517451(MECOM) 101533206(PRDM16)
TUP : 102488385(MECOM) 102500375(PRDM16)
GVR : 103587514(MECOM) 103610349
CFA : 479582(PRDM16) 488148(MECOM)
CLUD : 112645928(MECOM) 112646959(PRDM16)
VVP : 112924714(PRDM16) 112926657(MECOM)
VLG : 121477369(MECOM) 121499519(PRDM16)
NPO : 129497713(PRDM16) 129498810(MECOM)
AML : 100481590(PRDM16) 100482997(MECOM)
UMR : 103678456(PRDM16) 103680825(MECOM)
UAH : 113255350(MECOM) 113270599(PRDM16)
UAR : 123786368(MECOM) 123796137(PRDM16)
MPUF : 101683225(PRDM16) 101684534(MECOM)
MNP : 132001862(PRDM16) 132012065(MECOM)
MLK : 131809083(PRDM16) 131824888(MECOM)
NVS : 122899361(PRDM16) 122908678(MECOM)
ORO : 101368160(PRDM16) 101384287(MECOM)
EJU : 114209093(MECOM) 114213223(PRDM16)
ZCA : 113912626(PRDM16) 113916913(MECOM)
MLX : 118006026(MECOM) 118019654(PRDM16)
NSU : 110575344 110591643(MECOM) 123323672
FCA : 101088775(MECOM) 101090880(PRDM16)
PYU : 121019580(PRDM16) 121033966(MECOM)
PBG : 122479836(PRDM16) 122491755(MECOM)
PVIV : 125172224(PRDM16) 125174966(MECOM)
LRUF : 124515395 124526640
PTG : 102952036(PRDM16) 102955865(MECOM)
PPAD : 109262104(MECOM) 109273982(PRDM16)
HHV : 120234625(MECOM) 120242521(PRDM16)
BTA : 100137803(PRDM16) 532209(MECOM)
BOM : 102282884(PRDM16) 102288339(MECOM)
BIU : 109558403(MECOM) 109570163(PRDM16)
BBUB : 102403098(PRDM16) 102404893(MECOM)
BBIS : 104985176(MECOM) 104995911(PRDM16)
CHX : 102182261(MECOM) 102183895(PRDM16)
OAS : 101120004(PRDM16) 101121055(MECOM)
BTAX : 128045496(MECOM) 128061337(PRDM16)
ODA : 120869247(MECOM) 120880661(PRDM16)
CCAD : 122444956(MECOM) 122451981(PRDM16)
MBEZ : 129545711(MECOM) 129551451(PRDM16)
SSC : 100518275(MECOM) 100624476(PRDM16)
CFR : 102519252(MECOM) 106730153(PRDM16)
CBAI : 105066680(MECOM) 105071187(PRDM16)
CDK : 105085966(MECOM) 105104887(PRDM16)
VPC : 102545172(MECOM) 102546104(PRDM16)
BACU : 102999753(PRDM16) 103008158(MECOM)
BMUS : 118881325(PRDM16) 118894722(MECOM)
LVE : 103072534(PRDM16) 103078502(MECOM)
OOR : 101285697(PRDM16) 101289893(MECOM)
DLE : 111174247(MECOM) 111187060(PRDM16)
PCAD : 102976185(MECOM) 102993206(PRDM16)
PSIU : 116742567(PRDM16) 116752976(MECOM)
NASI : 112404937(MECOM) 112409873(PRDM16)
ECB : 100057450(MECOM) 100060844(PRDM16)
EPZ : 103548757(PRDM16) 103558280(MECOM)
EAI : 106834666(MECOM) 106844756(PRDM16)
MYB : 102249519(MECOM) 102257120(PRDM16)
MMYO : 118676683(MECOM) 118677054(PRDM16)
PKL : 118723215(MECOM) 118731969(PRDM16)
EFUS : 103286715(MECOM) 103295377(PRDM16)
MNA : 107537489(PRDM16) 107539280(MECOM)
DRO : 112299628(PRDM16) 112307202(MECOM)
SHON : 118987426(MECOM) 118998163(PRDM16)
AJM : 119043606(MECOM) 119050552(PRDM16)
PDIC : 114490488(MECOM) 114496387(PRDM16)
PHAS : 123826822(MECOM) 123831994(PRDM16)
MMF : 118617285(MECOM) 118626477(PRDM16)
PPAM : 129076179(MECOM) 129079019(PRDM16)
HAI : 109383470(MECOM) 109391194(PRDM16)
RFQ : 117027275(PRDM16) 117037203(MECOM)
PALE : 102878481(MECOM) 102890420(PRDM16)
PGIG : 120585894(PRDM16) 120598778(MECOM)
PVP : 105299204(PRDM16) 105305980(MECOM)
RAY : 107510664(PRDM16) 107512516(MECOM)
MJV : 108402581(PRDM16) 108404714(MECOM)
TOD : 119235959(PRDM16) 119257641(MECOM)
SARA : 101539582(PRDM16) 101556018(MECOM)
SETR : 126010834 126010954 126011772
LAV : 100664202(MECOM) 100673967(PRDM16)
ETF : 101650652(MECOM) 101658796(PRDM16)
DNM : 101438899(MECOM) 101445231(PRDM16)
MDO : 100012479(MECOM) 100619344(PRDM16)
GAS : 123240938(PRDM16) 123242827(MECOM)
SHR : 100915676(PRDM16) 100928711(MECOM)
PCW : 110200307(PRDM16) 110203730(MECOM)
OAA : 100084365(MECOM) 100681161(PRDM16)
GGA : 419388(PRDM16) 424997(MECOM)
PCOC : 116242715(PRDM16) 116243427(MECOM)
MGP : 100541414(MECOM) 100549442(PRDM16)
CJO : 107318330(MECOM) 107323435(PRDM16)
TPAI : 128082674(MECOM) 128085067(PRDM16)
LMUT : 125697532(MECOM) 125703436(PRDM16)
NMEL : 110398567(MECOM) 110408633(PRDM16)
APLA : 101793295(MECOM) 101798424(PRDM16)
ACYG : 106031974(MECOM) 106044631(PRDM16)
CATA : 118253106(MECOM) 118253365(PRDM16)
AFUL : 116492753(MECOM) 116497539(PRDM16)
TGU : 100229260(PRDM16) 100230662(MECOM)
LSR : 110472547 110480337(MECOM)
SCAN : 103815279(MECOM) 103820814(PRDM16)
PMOA : 120504251(MECOM) 120511129(PRDM16)
OTC : 121336547(MECOM) 121344079(PRDM16)
PRUF : 121353723(MECOM) 121358423(PRDM16)
GFR : 102034533(PRDM16) 102039580(MECOM)
FAB : 101806754(MECOM) 101819648(PRDM16)
OMA : 130256699(MECOM) 130261609(PRDM16)
PHI : 102102577(PRDM16) 102104707(MECOM)
PMAJ : 107208729(MECOM) 107213569(PRDM16)
CCAE : 111933313(MECOM) 111938476(PRDM16)
CCW : 104688053(MECOM) 104693385(PRDM16)
CBRC : 103622273(PRDM16) 103625072(MECOM)
ZAB : 102063184(MECOM) 102068102(PRDM16)
SVG : 106857662(PRDM16) 106859635(MECOM)
MMEA : 130580755(MECOM) 130583234(PRDM16)
HRT : 120757039(MECOM) 120762368(PRDM16)
FPG : 101922605(PRDM16) 101924233(MECOM)
FCH : 102055141(MECOM) 102058719(PRDM16)
CLV : 102089407(MECOM) 102090083(PRDM16)
EGZ : 104129303(PRDM16) 104132485(MECOM)
NNI : 104008933(PRDM16) 104022029(MECOM)
PLET : 104623847(MECOM) 104624450(PRDM16)
EHS : 104506195(MECOM) 104506988(PRDM16)
PCAO : 104047239(PRDM16) 104051221
ACUN : 113483543(MECOM) 113487928(PRDM16)
TALA : 104362631(PRDM16) 104365039(MECOM)
PADL : 103913951(PRDM16) 103924951(MECOM)
AFOR : 103894696(PRDM16) 103899975(MECOM)
ACHC : 115343079(PRDM16) 115347508(MECOM)
HALD : 104317780(PRDM16) 104321016(MECOM)
HLE : 104832012(PRDM16) 104835074(MECOM)
AGEN : 126039581 126040369
CCRI : 104157910(PRDM16) 104158944(MECOM)
CSTI : 104551300(MECOM) 104563014(PRDM16)
CMAC : 104482501(MECOM) 104483238(PRDM16)
BREG : 104634351(PRDM16) 104638097(MECOM)
FGA : 104079897(MECOM) 104082135(PRDM16)
GSTE : 104256618(PRDM16) 104256885(MECOM)
LDI : 104343033(MECOM) 104344633(PRDM16)
MNB : 103776675(MECOM) 103779525(PRDM16)
OHA : 104327822(PRDM16) 104334394(MECOM)
NNT : 104402745(MECOM) 104409965(PRDM16)
SHAB : 115611686(MECOM) 115611687 115617535(PRDM16)
DPUB : 104301922 104309927(PRDM16)
PGUU : 104464978(PRDM16) 104467130(MECOM)
ACAR : 104520704(MECOM) 104523487(PRDM16)
CPEA : 104395576(PRDM16) 104396836(MECOM)
AVIT : 104271549(MECOM) 104277512(PRDM16)
CVF : 104285912(MECOM) 104290516(PRDM16)
RTD : 128910758(MECOM) 128918320(PRDM16)
CUCA : 104059840(PRDM16) 104062508
TEO : 104374781(PRDM16) 104375132(MECOM)
BRHI : 104494577(MECOM) 104498696(PRDM16)
AAM : 106485721(PRDM16) 106486591
AROW : 112963835(MECOM) 112975487(PRDM16)
NPD : 112952459(MECOM) 112957475(PRDM16)
TGT : 104569464(PRDM16) 104571520(MECOM)
DNE : 112981149(PRDM16) 112986427(MECOM)
SCAM : 104142006(PRDM16) 104143307(MECOM)
ASN : 102383256(PRDM16) 102388244(MECOM)
AMJ : 102561786(MECOM) 102565647(PRDM16)
CPOO : 109308413(MECOM) 109314223(PRDM16)
GGN : 109287956(MECOM) 109293621(PRDM16)
PSS : 102446951(MECOM) 102457121(PRDM16)
CMY : 102933835(PRDM16) 102944134(MECOM)
CCAY : 125624306(PRDM16) 125642792(MECOM)
DCC : 119845096(PRDM16) 119861367(MECOM)
CPIC : 101936261(PRDM16) 101944916(MECOM)
TST : 117867853(PRDM16) 117883099(MECOM)
CABI : 116815391(PRDM16) 116822706(MECOM)
MRV : 120372281(MECOM) 120387979(PRDM16)
ACS : 100555060(mecom) 100564351
ASAO : 132764704(PRDM16) 132770523(MECOM)
PVT : 110085535(MECOM) 110086807
SUND : 121926171(MECOM) 121936468(PRDM16)
PBI : 103060962(PRDM16) 103065321(MECOM)
PMUR : 107290019(PRDM16) 107292215(MECOM)
CTIG : 120305498(MECOM) 120319206(PRDM16)
TSR : 106554440(PRDM16) 106556923(MECOM)
PGUT : 117660382(PRDM16) 117678211(MECOM)
APRI : 131187014(PRDM16) 131200876(MECOM)
PTEX : 113439707 113439788(MECOM) 113451882(PRDM16)
NSS : 113411115(MECOM) 113411805
VKO : 123025609(MECOM) 123031048(PRDM16)
PMUA : 114597957(MECOM) 114602574(PRDM16)
PRAF : 128414746(MECOM) 128419668(PRDM16)
ZVI : 118087798(PRDM16) 118093525(MECOM)
HCG : 128338596(PRDM16) 128351199(MECOM)
GJA : 107110332(PRDM16) 107125967(MECOM)
STOW : 125438025(MECOM) 125445594(PRDM16)
EMC : 129331943(MECOM) 129344870(PRDM16)
XLA : 100301954(mecom.S) 108696629 108697710 734157(mecom.L)
XTR : 100485690(prdm16) 100496511(mecom)
NPR : 108784020(PRDM16) 108788059(MECOM)
RTEM : 120915717(PRDM16) 120936732(MECOM)
BBUF : 120997870(MECOM) 120999138(PRDM16)
BGAR : 122928850(PRDM16) 122934442(MECOM)
MUO : 115478640(MECOM) 115482637(PRDM16)
GSH : 117349064(PRDM16) 117366404(MECOM)
DRE : 497407(mecom) 796720(si:ch211-263k4.2)
SRX : 107710791 107730859 107748963(prdm16) 107752009
SANH : 107683385 107687110(prdm16) 107691062 107704745
SGH : 107582226 107587798 107595763 107602466(prdm16)
CCAR : 109094668 109094669 109103379 109103380
CAUA : 113058632 113078801 113097232 113107828 113114962
CGIB : 127963231 127972606 128018185 128028962
PTET : 122350912(prdm16) 122359151(mecom)
LROH : 127169675(prdm16) 127177158(mecom)
OMC : 131546046(prdm16) 131554413(mecom)
PPRM : 120469521 120477584(prdm16)
RKG : 130077922(mecom) 130082039(prdm16)
MAMB : 125248870(mecom) 125280292(prdm16)
CIDE : 127495479 127518042
MASI : 127414438 127422432 127424664 127430167
TROS : 130565101(mecom) 130567654(prdm16)
TDW : 130428395(mecom) 130440002(prdm16)
MANU : 129413913(prdm16) 129438345(mecom)
IFU : 128607557(prdm16) 128621806(mecom)
PHYP : 113533631(prdm16) 113544589(mecom)
SMEO : 124394478(mecom) 124399917(prdm16)
TFD : 113648358(mecom) 113656267(prdm16)
TVC : 132853216(prdm16) 132858072(mecom)
AMEX : 103028334(prdm16) 103042447(mecom)
CMAO : 118798921(mecom) 118813605(prdm16)
EEE : 113568060(mecom) 113578193(prdm16)
CHAR : 105899625(mecom) 105912013
TRU : 101064167(prdm16) 101069476(mecom)
TFS : 130530634(prdm16) 130535119(mecom)
LCO : 104920227(prdm16) 104936038(mecom)
NCC : 104948658(prdm16) 104952759
TBEN : 117470072(mecom) 117493956(prdm16)
CGOB : 115010881(prdm16) 115017293(mecom)
PGEO : 117450129(prdm16) 117457863(mecom)
GACU : 117542056(prdm16) 117542301(mecom)
EMAC : 134866813(prdm16) 134880677(mecom)
ELY : 117259822(mecom) 117266695(prdm16)
EFO : 125888762(mecom) 125891644(prdm16)
PLEP : 121943517(mecom) 121946755(prdm16)
SLUC : 116040810(prdm16) 116045529(mecom)
ECRA : 117940932(mecom) 117947311(prdm16)
ESP : 116678806(mecom) 116692394(prdm16)
PFLV : 114553079(mecom) 114559119
GAT : 120823708(mecom) 120829022(prdm16)
PPUG : 119215775(mecom) 119222497(prdm16)
AFB : 129092079(mecom) 129099360(prdm16)
CLUM : 117734126(prdm16) 117741316(mecom)
MSAM : 119883057(mecom) 119906040(prdm16)
SCHU : 122878911(mecom) 122882777(prdm16)
CUD : 121517475(prdm16) 121520079(mecom)
ALAT : 119012450(mecom) 119022312(prdm16)
MZE : 101468114(mecom) 101472744(prdm16)
ONL : 100697246(prdm16) 100699103
OAU : 116309756(prdm16) 116330361(mecom)
OLA : 101156011(prdm16) 101169474(mecom)
OML : 112149673(mecom) 112159255(prdm16)
CSAI : 133441639(mecom) 133457325(prdm16)
XMA : 102224242(mecom) 102232494(prdm16)
XCO : 114133278(mecom) 114146334(prdm16)
XHE : 116707997(mecom) 116725545
PRET : 103467987(prdm16) 103474425(mecom)
PFOR : 103139020(prdm16) 103152917(mecom)
PLAI : 106937298(prdm16) 106945686(mecom)
PMEI : 106922470(mecom) 106931565(prdm16)
GAF : 122832390(mecom) 122835953(prdm16)
PPRL : 129359178(mecom) 129372372(prdm16)
CVG : 107094210(mecom) 107096740(prdm16)
CTUL : 119773273(prdm16) 119775271(mecom)
GMU : 124874798(prdm16) 124883767(mecom)
NFU : 107380509(mecom) 107390703(prdm16)
KMR : 108236815(prdm16) 108240489(mecom)
ALIM : 106523993(mecom) 106524184(prdm16)
NWH : 119410524(mecom) 119417675(prdm16)
AOCE : 111570893(prdm16) 111573022(mecom)
MCEP : 125004427(prdm16) 125013663(mecom)
CSEM : 103377560(mecom) 103384944(prdm16)
POV : 109630615(prdm16) 109634633(mecom)
SSEN : 122773299(mecom) 122776837(prdm16)
HHIP : 117764484(prdm16) 117772924(mecom)
HSP : 118106548(mecom) 118111321(prdm16)
SMAU : 118298899(mecom) 118317598(prdm16)
SDU : 111219051(prdm16) 111224094(mecom)
SLAL : 111649993(mecom) 111670668(prdm16)
XGL : 120792306(mecom) 120804141(prdm16)
HCQ : 109525487(mecom) 109526576(prdm16)
SSCV : 125971781 125988378
SBIA : 133504313(mecom) 133508680(prdm16)
PEE : 133405256(prdm16) 133405387(mecom)
PTAO : 133481964(mecom) 133482806(prdm16)
BPEC : 110174294(mecom) 110174717(prdm16)
MALB : 109960327(mecom) 109969283(prdm16)
BSPL : 114858910(prdm16) 114868635(mecom)
SJO : 128357569(prdm16) 128360595(mecom)
SASA : 106566953 106572198(prdm16) 106580920 106612562
STRU : 115163229 115166095(prdm16) 115168976 115206170
OTW : 112233035(prdm16) 112247400 112265381 112267385
OMY : 110491048 110503751 110507082 110532167(prdm16)
OGO : 123992868 124006191 124031842(prdm16) 124046197
ONE : 115120562 115132052(prdm16) 115136895 115141695
OKI : 109883894 109905594 109906987(prdm16) 109909385
OKE : 118361104(prdm16) 118371328 118377888 127931225
SALP : 111949772 111966356(prdm16) 111976939 111982777
SNH : 120018783 120028738 120058705(prdm16) 120060937
CCLU : 121538233(prdm16) 121545990 121564826 121567563
ELS : 105013856(prdm16) 105024028(mecom)
SFM : 108922168(mecom) 108924879(prdm16)
PKI : 111834017(mecom) 111859128(prdm16)
AANG : 118207605(prdm16) 118209957(mecom)
LOC : 102685573(prdm16) 102695548(mecom)
PSPA : 121322874 121326704 121328269 121328807
ARUT : 117417159 117423468 117425596 117426089
PSEX : 120531070(prdm16) 120532998(mecom)
LCM : 102358043(MECOM) 102363350(PRDM16)
CMK : 103180852(mecom) 103184259(prdm16)
CPLA : 122540386(prdm16) 122556249(mecom)
HOC : 132821741(mecom) 132821742 132833788(prdm16)
LERI : 129703274 129711763(prdm16)
PMRN : 116946935 116950399
CIN : 723797(ci-zf(c2h2)-87)
DSI : Dsimw501_GD21809(Dsim_GD21809)
AALB : 109402239 109415858
DPX : DAPPUDRAFT_113201(HAM)
MMER : 123526931 123527699
» show all
Taxonomy
Reference
Authors
Pinheiro I, Margueron R, Shukeir N, Eisold M, Fritzsch C, Richter FM, Mittler G, Genoud C, Goyama S, Kurokawa M, Son J, Reinberg D, Lachner M, Jenuwein T
Title
Prdm3 and Prdm16 are H3K9me1 methyltransferases required for mammalian heterochromatin integrity.
Journal
Other DBs
ExPASy - ENZYME nomenclature database: 2.1.1.367