KEGG ENZYME: 6.3.1.19

ENZYME: 6.3.1.19

Entry

EC 6.3.1.19                 Enzyme

Name

prokaryotic ubiquitin-like protein ligase;
PafA (ambiguous);
Pup ligase;
proteasome accessory factor A

Class

Ligases;
Forming carbon-nitrogen bonds;
Acid-D-ammonia (or amine) ligases (amide synthases)

Sysname

[prokaryotic ubiquitin-like protein]:[protein]-L-lysine

Reaction(IUBMB)

ATP + [prokaryotic ubiquitin-like protein]-L-glutamate + [protein]-L-lysine = ADP + phosphate + N6-([prokaryotic ubiquitin-like protein]-gamma-L-glutamyl)-[protein]-L-lysine [RN:R11207]

Reaction(KEGG)

R11207

Substrate

ATP [CPD:C00002];
[prokaryotic ubiquitin-like protein]-L-glutamate [CPD:C21177];
[protein]-L-lysine [CPD:C02188]

Product

ADP [CPD:C00008];
phosphate [CPD:C00009];
N6-([prokaryotic ubiquitin-like protein]-gamma-L-glutamyl)-[protein]-L-lysine [CPD:C21178]

Comment

The enzyme has been characterized from the bacteria Mycobacterium tuberculosis and Corynebacterium glutamicum. It catalyses the ligation of the prokaryotic ubiquitin-like protein (Pup) to a target protein by forming a bond between an epsilon-amino group of a lysine residue of the target protein and the gamma-carboxylate of the C-terminal glutamate of the ubiquitin-like protein (Pup). The attachment of Pup, also known as Pupylation, marks proteins for proteasomal degradation.

History

EC 6.3.1.19 created 2015

Orthology

K13571

proteasome accessory factor A

Genes

ERZ:	ER308_20560(pafA)

EUZ:	DVS28_a2576

MTU:	Rv2097c(pafA)

MTV:	RVBD_2097c

MTC:

MT2158

MRA:

MRA_2112

MTF:	TBFG_12132

MTB:	TBMG_01885

MTK:	TBSG_01897

MTZ:	TBXG_001869

MTG:	MRGA327_12905

MTE:	CCDC5079_1939

MTUR:

CFBS_2220

MTL:	CCDC5180_1916

MTO:	MTCTRI2_2136

MTD:

UDA_2097c

MTN:	ERDMAN_2315

MTJ:	J112_11230

MTUB:

MT7199_2128

MTUC:

J113_14520

MTUE:

J114_11240

MTX:	M943_10865

MTUL:

TBHG_02055

MTUT:

HKBT1_2214

MTUU:

HKBT2_2215

MTQ:	HKBS1_2219

MBO:	BQ2027_MB2124C(pafa)

MBB:

BCG_2117c

MBT:

JTY_2111

MBM:	BCGMEX_2101c(pafA)

MBK:	K60_021790

MBX:

BCGT_1919

MAF:

MAF_21110

MMIC:

RN08_2325

MCE:	MCAN_21241

MCQ:	BN44_50022

MCV:	BN43_31312

MCX:	BN42_40005

MCZ:	BN45_50418

MORY:

MO_002198(pafA)

MLE:

ML1328

MLB:

MLBr01328

MPA:

MAP_1833c

MAO:

MAP4_1995

MAVI:

RC58_09955

MAVU:

RE97_09965

MAV:

MAV_2406

MIT:

OCO_24090

MIA:

OCU_23970

MID:

MIP_03326

MYO:

OEM_22520

MCHI:

AN480_12125

MIR:

OCQ_22620

MMAL:

CKJ54_10915(pafA)

MLP:

MLM_2188

MMAN:

MMAN_15600(pafA)

MSA:	Mycsm_03736

MUL:

MUL_2329

MMI:

MMAR_3083

MMAE:

MMARE11_30050

MLI:	MULP_02722(pafA1)

MPSE:

MPSD_31980(pafA)

MSHO:

MSHO_45370(pafA)

MMC:

Mmcs_2467

MKM:

Mkms_2512

MJL:

Mjls_2504

MMM:

W7S_11615

MKN:	MKAN_02160

MYV:	G155_17635

MYE:	AB431_14660

MHAD:

B586_10675

MDX:	BTO20_14070

MSHG:

MSG_02973(pafA)

MFJ:	MFLOJ_02440(pafA)

MSTO:

MSTO_03140(pafA)

MSIM:

MSIM_47220(pafA)

MSAK:

MSAS_10440(pafA)

MKU:	I2456_15155(pafA)

MLW:	MJO58_15925(pafA)

MXE:	MYXE_23310(pafA)

MNV:	MNVI_43350(pafA)

MPAG:

C0J29_17515(pafA)

MNM:	MNVM_39310(pafA)

MGOR:

H0P51_16515(pafA)

MCOO:

MCOO_11160(pafA)

MBAI:

MB901379_02855(pafA)

MSEO:

MSEO_17840(pafA)

MHEK:

JMUB5695_02258(pafA)

MGAU:

MGALJ_14420(pafA)

MLJ:	MLAC_20880(pafA)

MBRD:

MBRA_37150(pafA)

MSHJ:

MSHI_11670(pafA)

MMAM:

K3U93_13885(pafA)

MSPG:

F6B93_13185(pafA)

MOT:	LTS72_08970(pafA)

MLM:	MLPF_3311(pafA)

MPAA:

MKK62_11130(pafA)

MMEH:

M5I08_13245(pafA)

MKY:	IWGMT90018_26970(pafA)

MADI:

A7U43_16660

MWU:	PT015_06675(pafA)

MSM:	MSMEG_3890

MSG:	MSMEI_3800(pafA)

MSB:	LJ00_19325

MSN:	LI99_19330

MSH:	LI98_19335

MVA:

Mvan_3445

MGI:

Mflv_3089

MSP:	Mspyr1_24050

MCB:	Mycch_3075

MNE:	D174_14315

MYN:	MyAD_14060

MFT:	XA26_35950

MPHL:

MPHLCCUG_02715(pafA)

MVQ:

MYVA_3356

MLL:	B1R94_11720

MRH:	MycrhN_5100

MTHN:

4412656_01940(pafA)

MHAS:

MHAS_01604(pafA)

MDU:	MDUV_10580(pafA)

MCHT:

MCHIJ_40140(pafA)

MDR:	MDOR_17290(pafA)

MAUU:

NCTC10437_03321(pafA)

MMAG:

MMAD_33250(pafA)

MMOR:

MMOR_35830(pafA)

MFX:	MFAL_11700(pafA)

MAIC:

MAIC_25600(pafA)

MIJ:	MINS_30100(pafA)

MALV:

MALV_03970(pafA)

MTY:	MTOK_53490(pafA)

MPSC:

MPSYJ_32640(pafA)

MARZ:

MARA_06180(pafA)

MGAD:

MGAD_10380(pafA)

MHEV:

MHEL_57440(pafA)

MSAR:

MSAR_42250(pafA)

MANY:

MANY_17160(pafA)

MAUB:

MAUB_53540(pafA)

MPOF:

MPOR_36190(pafA)

MPHU:

MPHO_15920(pafA)

MMUC:

C1S78_010430(pafA)

MMAT:

MMAGJ_70880(pafA)

MBOK:

MBOE_38240(pafA)

MFG:	K6L26_14330(pafA)

MSEI:

MSEDJ_45570(pafA)

MFLV:

NCTC10271_02102(pafA)

MCEE:

MCEL_05300(pafA)

MBRM:

L2Z93_001587(pafA)

MMON:

EWR22_12535(pafA)

MGO:	AFA91_20610

MHOL:

K3U96_11530(pafA)

MSEN:

K3U95_15005(pafA)

MPAE:

K0O64_14035(pafA)

MRF:	MJO55_15730(pafA)

MDF:	K0O62_14490(pafA)

MCRO:

MI149_14845(pafA)

MGRO:

FZ046_21720(pafA)

MKR:	MKOR_06590(pafA)

MPAK:

MIU77_07570(pafA)

MAB:

MAB_2183

MMV:	MYCMA_1156

MABB:

MASS_2110

MABL:

MMASJCM_2134

MCHE:

BB28_10985

MIZ:	BAB75_11700

MSTE:

MSTE_02123(pafA)

MSAO:

MYCSP_09360

MSAL:

DSM43276_01897(pafA)

MJD:	JDM601_2120

MTER:

4434518_02041(pafA)

MMIN:

MMIN_37270(pafA)

MHIB:

MHIB_15770(pafA)

MHER:

K3U94_11975(pafA)

MVM:	MJO54_11925(pafA)

ASD:

AS9A_2012

CGL:	Cgl1494(Cgl1494)

CGB:

cg1688

CGU:

WA5_1437

CGT:

cgR_1554

CGS:	C624_08270

CGG:	C629_08280

CGM:	cgp_1688(pafA2)

CGJ:

AR0_08005

CGQ:	CGLAR1_07870

CGX:	SB89_07710

CEF:

CE1623

CDI:

DIP1245

CDP:	CD241_1175(pafA2)

CDH:	CDB402_1154(pafA2)

CDT:	CDHC01_1174(pafA2)

CDE:	CDHC02_1153(pafA2)

CDR:	CDHC03_1148(pafA2)

CDA:	CDHC04_1158(pafA2)

CDZ:	CD31A_1256(pafA2)

CDB:	CDBH8_1223(pafA2)

CDS:	CDC7B_1239(pafA2)

CDD:	CDCE8392_1146(pafA2)

CDW:	CDPW8_1224(pafA2)

CDV:	CDVA01_1115(pafA2)

CDIP:

ERS451417_01245(pafA2)

CJK:

jk0945

CUR:

cu1043

CUA:	CU7111_1025(pafA2)

CAR:	cauri_1264

CKP:	ckrop_0910(pafA2)

CPU:	CPFRC_05215(pafA)

CPL:	Cp3995_1056(pafA)

CPG:	CP316_05365(pafA)

CPP:	CpP54B96_1052(pafA)

CPK:	CP1002_07930(pafA)

CPQ:	CPC231_05220(pafA)

CPX:	CPI19_06300(pafA)

CPZ:	CpPAT10_1032(pafA)

COR:	Cp267_1081(pafA)

COP:	CP31_05595(pafA)

COD:	Cp106_1015(pafA)

COS:	Cp4202_1025(pafA)

COI:	CPCIP5297_05385(pafA)

COE:	CP258_05380(pafA)

COU:	CP162_05910(pafA)

CPSE:

CPTA_01604

CPSU:

CPTB_02159

CPSF:

CPTC_01595

CRD:	CRES_1023(pafA2)

CUL:	CULC22_01108

CUC:	CULC809_01093(pafA2)

CUE:	CULC0102_1215

CUN:	Cul210932_1149(pafA)

CUQ:	Cul210931_1099(pafA)

CUZ:	Cul05146_1173(pafA)

CUJ:	CUL131002_1131c(pafA)

CUS:	CulFRC11_1117(pafA)

CVA:

CVAR_1421

CHN:	A605_07335

CCN:	H924_06855

CTER:

A606_05520

CMD:	B841_06805

CAZ:	CARG_04755

CFN:	CFAL_05320

CCG:	CCASEI_07210

CVT:	B843_07040

CGY:	CGLY_08740(pafA)

CII:	CIMIT_06335

CUV:	CUREI_06090

COA:	DR71_64(pafA)

CDO:	CDOO_07310

CHM:	B842_06855

CSX:	CSING_06960(pafA)

CMQ:	B840_06270(pafA)

CKU:	UL82_05180(pafA)

CCJ:	UL81_05990(pafA)

CMV:	CMUST_08010(pafA)

CEI:	CEPID_06380(pafA)

CTED:

CTEST_06610(pafA)

CUT:	CUTER_05430(pafA)

CLW:	CLAC_06485

CDX:	CDES_07215(pafA)

CSP:	WM42_0091(pafA)

CSTA:

CSTAT_06520

CCJZ:

ccrud_07250

CFK:	CFRA_05855

CPHO:

CPHO_06095

CFC:	CFLV_06340

CGV:	CGLAU_06375(pafA)

CSTR:

CBE89_07190

CAQU:

CAQU_06335

CSPH:

CSPHI_06710

CAMG:

CAMM_06720

CMIN:

NCTC10288_01260(pafA)

CPEG:

CPELA_05585(pafA)

CXE:	FOB82_12430(pafA)

CEE:	CENDO_05765(pafA)

CSAN:

E3227_09380(pafA)

CGK:	CGERO_05550(pafA)

CRF:	FRC0190_01220

CRL:	NCTC7448_01910(pafA)

CCHO:

CCHOA_05830(pafA)

CPRE:

Csp1_14320(pafA)

CPSO:

CPPEL_05785(pafA)

CSUR:

N24_1585

CCYS:

SAMEA4530656_1099(pafA)

CYZ:	C3B44_05670(pafA)

CKF:	I6I12_06725(pafA)

CANS:

GP473_04260(pafA)

CLIA:

C3E79_05515(pafA)

CPRP:

I6I69_10945(pafA)

CAMC:

I6I65_02720(pafA)

CGLU:

I6J20_03710(pafA)

CUO:	CUROG_04785(pafA)

CLIZ:

G7Y31_05845(pafA)

CSIL:

CBE74_06240

CTUB:

I6I74_11085(pafA)

CLUJ:

IAU68_05920(pafA)

CQN:	G7Y29_05400(pafA)

CKW:	CKALI_05630(pafA)

CCOE:

CETAM_06665(pafA)

COK:	COCCU_07315(pafA)

CZO:	IAU67_04240(pafA)

CCYC:

SCMU_20730(pafA)

CORY:

FQV43_05090(pafA)

CMF:	GWO64_006195(pafA)

CUW:	LH390_05800(pafA)

CPOY:

GP475_05880(pafA)

CACC:

CACC_06390(pafA)

CFY:	I6L56_02875(pafA)

CPSL:

KBP54_05820(pafA)

CHIN:

J5O04_08230(pafA)

CJH:	CJEDD_06515(pafA)

CPSP:

L9H27_05275(pafA)

CMAS:

CMASS_05340(pafA)

CHEI:

CHEID_04905(pafA)

CIHU:

CIHUM_05680(pafA)

CCOY:

CCOY_06405(pafA)

CHAD:

CHAD_06230(pafA)

CFG:	CFREI_06745(pafA)

CAQM:

CAQUA_05845(pafA)

CCAW:

CCANI_07090(pafA)

CAUI:

CAURIS_05685(pafA)

CFAC:

CFAEC_07190(pafA)

CFOU:

CFOUR_05760(pafA)

CFEU:

CFELI_06945(pafA)

CAUS:

CAURIC_05180(pafA)

CATR:

CATRI_06535(pafA)

CDUR:

CDUR_06820(pafA)

CCOU:

CCONF_06010(pafA)

CHAN:

CHAN_07130(pafA)

CAFE:

CAFEL_05625(pafA)

CGF:	CGUA_06665(pafA)

CGOI:

CGOTT_05930(pafA)

CAPP:

CAPP_05970(pafA)

CBOV:

CBOVI_05750(pafA)

CBRE:

QP027_05510(pafA)

CPYR:

CYJ47_06125(pafA)

CRIE:

AK829_03545

BFV:	C628_08200

NFA:

NFA_31700

NFR:	ERS450000_00902(pafA)

NCY:	NOCYR_3335(pafA)

NBR:	O3I_026795

NNO:	NONO_c34100(pafA)

NSL:	BOX37_11540

NSR:	NS506_05082(pafA)

NTP:	CRH09_17345(pafA)

NOD:	FOH10_12430(pafA)

NAH:	F5544_26410(pafA)

NAD:	NCTC11293_04454(pafA)

NWL:	NWFMUON74_32200(pafA)

NIE:	KV110_25975(pafA)

NTC:	KHQ06_22310(pafA)

NHU:	H0264_20860(pafA)

NYA:	LTV02_13450(pafA)

NGP:	LTT66_27200(pafA)

NSPU:

IFM12276_23670(pafA)

NYU:	D7D52_19490(pafA)

RHA:	RHA1_ro00841

RER:	RER_31710(pafA)

REY:

O5Y_14565

REB:	XU06_14785

RQI:	C1M55_15805(pafA)

ROP:	ROP_05790(pafA)

ROA:	Pd630_LPD04924

RPY:	Y013_04110

RBY:	CEJ39_14805(pafA)

RHB:

NY08_1006

RAV:	AAT18_13810

RFA:	A3L23_04257(pafA)

RHS:	A3Q41_04009(pafA)

RHW:	BFN03_08345

RRZ:	CS378_03515(pafA)

RHU:	A3Q40_01727(pafA)

RHQ:	IM25_17995

RHOD:

AOT96_26000

RRT:	4535765_02618(pafA)

RCR:	NCTC10994_00434(pafA)

RTM:	G4H71_21830(pafA)

RKO:	JWS14_04415(pafA)

RGO:	KYT97_04525(pafA)

ROZ:	CBI38_13580

RPSK:

JWS13_42010(pafA)

RGOR:

NMQ04_11075(pafA)

RANT:

RHODO2019_07925(pafA)

RHOP:

D8W71_17075(pafA)

REQ:

REQ_23310

PDEF:

P9209_19320

WHR:	OG579_02425(pafA)

GBR:

Gbro_2465

GPO:	GPOL_c23990(pafA)

GOR:

KTR9_2374

GOQ:	ACH46_10495

GTA:	BCM27_12660

GOC:	CXX93_12500(pafA)

GIT:	C6V83_11435(pafA)

GRU:	GCWB2_13010(pafA)

GOM:	D7316_01005(pafA)

GAV:	C5O27_15080(pafA)

GOD:	GKZ92_11770(pafA)

GAM:	GII34_11770(pafA)

GPD:	GII33_11065(pafA)

GJI:	H1R19_11850(pafA)

GOI:	LK459_21485(pafA)

GHN:	MVF96_12065(pafA)

GAMI:

IHQ52_15505(pafA)

GMG:	NWF22_22375(pafA)

GSI:	P5P27_09435(pafA)

SPIN:

KV203_09690(pafA)

TPR:

Tpau_2166

TSM:	ASU32_11810

TPUL:

TPB0596_24140(pafA)

TSD:	MTP03_24580

SRT:

Srot_1603

DTM:	BJL86_1630

DIT:	C3V38_13700(pafA)

DIZ:	CT688_07875(pafA)

DPC:	A6048_08130

DLU:	A6035_07725

DKN:	NHB83_07435(pafA)

CBQ:	AL705_00125

TOY:	FO059_08630(pafA)

SCO:	SCO1640(SCI41.23c)

SALB:

XNR_5187

SMA:	SAVERM_6685

SGR:

SGR_5863

SGB:

WQO_05965

SFI:

SFUL_1158

SANL:

KZO11_05620(pafA)

SGRF:

SGFS_091330

SCYE:

R2B67_30475(pafA)

SCB:	SCAB_73511

SSX:	SACTE_1070

SVL:	Strvi_6646

SHY:

SHJG_3077

SHO:	SHJGH_2841

SRC:	M271_38560

SMAL:

SMALA_1428

SSOI:

I1A49_10700(pafA)

SFA:

Sfla_5196

SBH:

SBI_08486

SVE:

SVEN_1233

SDV:	BN159_6943(pafA)

SALS:

SLNWT_6263

STRP:

F750_1438(pafA)

SCI:	B446_08465

SLV:	SLIV_29540(pafA)

SGU:	SGLAU_06775(pafA)

SVT:	SVTN_07630

STRE:

GZL_07028

SCW:	TU94_06880

SLD:

T261_6604

SLC:	SL103_11310

SXI:	SXIM_04690

STRM:

M444_08535

STRC:

AA958_03980

SAMB:

SAM23877_1695(pafA)

SPRI:

SPRI_5915

SCZ:	ABE83_29855

SCX:	AS200_35270

SRW:	TUE45_02066(pafA)

STRF:

ASR50_07835

SLE:	sle_54770(sle_54770)

SRN:	A4G23_00873(pafA)

SPAV:

Spa2297_06355

STRT:

A8713_05815

SCLF:

BB341_23675

SGS:	AVL59_34805

STSI:

A4E84_08175

SKY:	D0C37_27930(pafA)

SALW:

CP975_06370(pafA)

SGM:	GCM10017557_66830(pafA)

SCAD:

DN051_30450(pafA)

SPHW:

NFX46_28710(pafA)

SLS:	SLINC_1856

SNR:	SNOUR_32210(pafA)

SALU:

DC74_2110

SALL:

SAZ_11115

SPLU:

LK06_004995

STRD:

NI25_30990

SNW:	BBN63_28360

SAUO:

BV401_11015

SSIA:

A7J05_28850

SVU:	B1H20_05145

SPUN:

BFF78_33330

SGV:	B1H19_10135

SLAU:

SLA_1175

SALF:

SMD44_01695(pafA)

SALJ:

SMD11_5383(pafA)

SLX:	SLAV_29310(pafA)

STRO:

STRMOE7_08815

SFK:

KY5_1442c

SNZ:	DC008_06240(pafA)

SGE:	DWG14_06835(pafA)

SRJ:

SRO_5828

SLK:	SLUN_07650(pafA)

SDX:	C4B68_32490(pafA)

SGD:	ELQ87_31525(pafA)

SQZ:	FQU76_04960(pafA)

SCYA:

EJ357_09135(pafA)

SAST:

CD934_27505(pafA)

SNQ:	CP978_07770(pafA)

STIR:

DDW44_02230(pafA)

SKA:	CP970_35495(pafA)

SGZ:	C0216_21595(pafA)

SVN:	CP980_26560(pafA)

SNK:	CP967_28220(pafA)

SHAW:

CEB94_08585(pafA)

SRK:	FGW37_06685(pafA)

SFIC:

EIZ62_27050(pafA)

SGAL:

CP966_06640(pafA)

SSPO:

DDQ41_01690(pafA)

SVR:	CP971_26515(pafA)

SPAD:

DVK44_04125(pafA)

SFY:	GFH48_32180(pafA)

SAQU:

EJC51_10900(pafA)

SGF:	HEP81_06135(pafA)

SCAV:

CVT27_04790(pafA)

SSEO:

D0Z67_05115(pafA)

SBY:	H7H31_04850(pafA)

SRIM:

CP984_33300(pafA)

SSUB:

CP968_26400(pafA)

SPHV:

F9278_07825(pafA)

SCIN:

CP977_07170(pafA)

SFUG:

CNQ36_06880(pafA)

SPAC:

B1H29_29370

STSU:

B7R87_04960

SCHA:

CP983_34825(pafA)

SGX:	H4W23_08095(pafA)

SCOE:

CP976_09280(pafA)

SBAT:

G4Z16_28765(pafA)

SSPB:

CP982_09545(pafA)

SNF:	JYK04_02294(pafA)

SPLA:

CP981_07925(pafA)

SBRO:

GQF42_10865(pafA)

STUI:

GCM10017668_12150(pafA)

SATA:

C5746_08695(pafA)

SCHF:

IPT68_07265(pafA)

SHUN:

DWB77_06114(pafA)

SHAR:

HUT13_03095(pafA)

SCYG:

S1361_09045(pafA)

SFEU:

IM697_14370(pafA)

SLIA:

HA039_27955(pafA)

SDW:	K7C20_07025(pafA)

SVD:	CP969_09175(pafA)

SCAL:

I6J39_05325(pafA)

SAUH:

SU9_005965(pafA)

SFB:	CP974_04555(pafA)

SMOB:

J7W19_05900(pafA)

SPRA:

CP972_07310(pafA)

SPEU:

CGZ69_06710(pafA)

SROI:

IAG44_32310(pafA)

SXN:	IAG42_28905(pafA)

SGJ:	IAG43_05555(pafA)

SHK:	J2N69_06290(pafA)

SANU:

K7396_28785(pafA)

SDD:	D9753_28675(pafA)

SACT:

DMT42_07215(pafA)

SMAO:

CAG99_24945

SGOB:

test1122_01280(pafA)

SINE:

KI385_10310(pafA)

SLF:	JEQ17_37225(pafA)

SDEC:

L3078_09325(pafA)

SAOV:

G3H79_30505(pafA)

SDUR:

M4V62_33810(pafA)

SYAN:

NRK68_07275(pafA)

SRUG:

F0345_04285(pafA)

SAKB:

K1J60_36100(pafA)

STAA:

LDH80_31320(pafA)

SNIG:

HEK616_19190(pafA)

SVIO:

HWN34_26200(pafA)

SCAE:

IHE65_36230(pafA)

STUB:

MMF93_05815(pafA)

SSPN:

LXH13_08195(pafA)

SCIR:

STRCI_001711(pafA)

SXT:	KPP03845_101872(pafA)

SLON:

LGI35_11380(pafA)

SDRZ:

NEH16_25900(pafA)

STUD:

STRTU_005790(pafA)

STEE:

F3L20_09655(pafA)

SENG:

OJ254_20250(pafA)

SGK:	PET44_07125(pafA)

SANT:

QR300_34150(pafA)

SYUN:

MOV08_32250(pafA)

SARG:

HKX69_27995(pafA)

SJN:	RI060_34255(pafA)

SCYN:

N8I84_08970(pafA)

SOV:	QZH56_29120(pafA)

SFIY:

F0344_30285(pafA)

SHAU:

K9S39_34980(pafA)

SKG:	KJK29_31130(pafA)

SCOA:

QU709_35375(pafA)

SLAI:

P8A22_31675(pafA)

SROC:

RGF97_27855(pafA)

SFP:	QUY26_32550(pafA)

SCHG:

NRO40_04955(pafA)

STTN:

BSL84_07000

SINN:

ABB07_30465

STRZ:

OYE22_04645(pafA)

SCT:

SCAT_5177

SCY:	SCATT_51690

KSK:	KSE_66650(pafA)

KAB:	B7C62_04860

KAU:	B6264_21070

KIT:	CFP65_1315

KIS:	HUT16_31440(pafA)

STRI:

C7M71_027770(pafA)

YIA:	LO772_28310(pafA)

STRH:

GXP74_13180(pafA)

ABRY:

NYE86_11550(pafA)

AGLA:

OIE69_31315(pafA)

LXL:	KDY119_01692

PSIC:

J4E96_07530(pafA)

ART:

Arth_2178

ARR:	ARUE_c23340

ARM:

ART_0666

ARL:	AFL94_08230

ARE:	AL755_11820

AAQ:	AOC05_06985

ARW:	MB46_05420

ARH:	AHiyo8_63940

ARY:	ATC04_09670

ARZ:	AUT26_10760

ARU:	ASPU41_15965

ARQ:	BWQ92_21035

ARN:	CGK93_12645(pafA)

ARX:	ARZXY2_1801(pafA)

ACRY:

AC20117_18705

ARTH:

C3B78_10245(pafA)

ARTP:

E5206_12580(pafA)

AJG:	KKR91_08990(pafA)

ASUN:

KG104_09425(pafA)

ASUF:

MNQ99_10530(pafA)

ARTY:

AHiyo4_24200

APOA:

J0916_06605(pafA)

AWW:	G8758_05255(pafA)

ACAO:

NF551_08655(pafA)

AZH:	MUK71_08850(pafA)

AGEG:

MUG94_08715(pafA)

AOD:	Q8Z05_18960(pafA)

AKO:	N9A08_08360(pafA)

AZX:	N2K95_08685(pafA)

AJR:	N2K98_09290(pafA)

ARI:	UM93_04355

AAU:

AAur_2179

PUE:	FV140_11020(pafA)

PNV:	JMY29_10340(pafA)

ACH:

Achl_1921

APN:	Asphe3_19030

PSUL:

AU252_21595

PSNI:

NIBR502771_14855(pafA)

PSEY:

GU243_04665(pafA)

PDEL:

JCQ34_09615(pafA)

POK:	SMD14_10210(pafA)

AAI:	AARI_16390

GAR:	AOZ07_08430

GCR:	GcLGCM259_1411(pafA)

GLU:	F0M17_08245(pafA)

GPR:	JQN66_08400(pafA)

GMI:	NMP99_08465(pafA)

GMY:	XH9_00445(pafA)

GNC:	QQS42_08255(pafA)

RSA:	RSal33209_2034

KRH:

KRH_13850

KPL:	KPaMU14_06510

KFV:	AS188_10780

KII:	KocCE7_07100(pafA)

KRS:	EQG70_09775(pafA)

KOD:	HBK84_07265(pafA)

KVR:	CIB50_0001743(pafA)

MLU:	Mlut_11920

MICK:

B1A86_00005885(pafA)

MYU:	M8233_05645(pafA)

MLY:	CJ228_003715(pafA)

MPOR:

KW076_08080(pafA)

MTEU:

R3I42_03990(pafA)

RMU:	RMDY18_10370

RDN:	HMPREF0733_11951(pafA)

RAJ:	RA11412_1841

RTER:

IDM49_06415(pafA)

RAMA:

IDM48_06260(pafA)

RKR:	I6G21_09280(pafA)

SATK:

SA2016_2039

NAE:	BHE16_02845

AUL:	DCC27_003655(pafA)

AIG:	QDX25_02930(pafA)

CMUA:

P8192_07905(pafA)

PAEY:

KUF55_09495(pafA)

PALU:

CJ193_001080

BCV:

Bcav_2237

BFA:	Bfae_16170

BRX:	BH708_03525

BRV:	CFK39_00595(pafA)

BGG:	CFK41_08660(pafA)

BRZ:	CFK38_10865(pafA)

BSAU:

DWV08_05575(pafA)

BRR:	C1N80_10870(pafA)

BKI:	M4486_05440(pafA)

BRHA:

NLU66_11815(pafA)

BHH:	Bra3105_02225(pafA)

BHQ:	BRM3_11900(pafA)

DVA:	DAD186_10820

DJJ:	COP05_05565(pafA)

DHM:	CYJ49_000765(pafA)

HMM:	R3I40_05070(pafA)

JDE:

Jden_1206

DNI:	HX89_07365

DAY:	FV141_06620(pafA)

LMOI:

VV02_15885

YIM:	J5M86_07405(pafA)

ALX:	LVQ62_12665(pafA)

BEI:	GCM100_15930

XCE:

Xcel_1490

XYL:	ET495_03625(pafA)

XYA:	ET471_13220(pafA)

IVA:	Isova_1451

IDO:	I598_0768(pafA)

CET:	B8281_12335

CCEU:

CBR64_19365

CPRT:

FIC82_011120(pafA)

SKE:	Sked_20850

SANW:

G7063_07205(pafA)

CFL:

Cfla_1999

CFI:

Celf_1794

CGA:	Celgi_1834

CEZ:	CBP52_04180

CELZ:

E5225_07705(pafA)

CEJ:	GC089_08020(pafA)

CELH:

GXP71_05825(pafA)

CIRA:

LFM56_08040(pafA)

CPAL:

F1D97_11030(pafA)

CELC:

K5O09_09185(pafA)

CDON:

KKR89_10100(pafA)

CWAN:

KG103_10185(pafA)

CFEN:

KG102_07845(pafA)

CWN:	NP075_10465(pafA)

CCHE:

NP064_06695(pafA)

CXIE:

NP048_10150(pafA)

OEK:	FFI11_012710(pafA)

PSEI:

GCE65_06340(pafA)

PSEK:

GCM125_28160

ICA:	Intca_1774

JTE:	ASJ30_07870

JLI:	EXU32_07225(pafA)

JME:	EEW87_007395(pafA)

JAY:	H7A72_08015(pafA)

JCR:	O9K63_04785(pafA)

TEH:	GKE56_04690(pafA)

PHW:	G7075_06515(pafA)

TED:	U5C87_14615(pafA)

SERJ:

SGUI_0335

SERW:

FY030_07960(pafA)

ORN:	DV701_02815(pafA)

ORZ:	FNH13_10860(pafA)

ORD:	L0A91_04080(pafA)

OCP:	NF557_09025(pafA)

BLY:	A2T55_09300

BLIN:

BLSMQ_2079

BRI:	FDF13_11110(pafA)

BLUT:

EW640_03465(pafA)

BCAU:

I6G59_12800(pafA)

BSPO:

L1F31_09525(pafA)

DCO:	SAMEA4475696_1703(pafA)

AUS:	IPK37_17315(pafA)

GEZ:	FE251_07040(pafA)

GYU:	FE374_07425(pafA)

HALT:

IM660_08845(pafA)

RHAL:

LQF10_08305(pafA)

RSUA:

LQF12_07405(pafA)

DEM:	LGT36_005520(pafA)

DSS:	GCM25873_09810(pafA)

MPH:	MLP_17560(pafA)

MIK:	FOE78_16335(pafA)

MICG:

GJV80_10350(pafA)

RAIN:

Rai3103_15835(pafA)

PRV:	G7070_17060

BRT:	J4N02_07140

NCA:

Noca_2648

NDK:	I601_3312(pafA)

NOY:	EXE57_01950(pafA)

NOI:	FCL41_08465(pafA)

NOO:	FE634_10425(pafA)

NDP:	E2C04_09065(pafA)

NSN:	EXE58_17665(pafA)

NBE:	Back2_02400(pafA)

NANO:

G5V58_10980(pafA)

NMES:

H9L09_20300(pafA)

NARO:

CFH99_12585(pafA)

NPI:	G7071_14860(pafA)

NAQU:

ENKNEFLB_02400(pafA)

NRO:	K8W59_08755(pafA)

NOQ:	LN652_01975(pafA)

NCQ:	K6T13_09045(pafA)

NPC:	KUV85_05055(pafA)

NPS:	KRR39_08565(pafA)

NMAR:

HPC71_10660(pafA)

NFC:	KG111_09310(pafA)

PSIM:

KR76_13420

AER:	AERYTH_08940

AEZ:	C3E78_09335(pafA)

AEB:	C6I20_06930(pafA)

AEF:	GEV26_08745(pafA)

ASEZ:

H9L21_08125(pafA)

ADB:	NP095_08300(pafA)

AWN:	NQV15_09480(pafA)

MGG:	MPLG2_1733(pafA)

MUZ:	H4N58_10325(pafA)

SGRG:

L0C25_21420(pafA)

NBT:	KLP28_16150(pafA)

KFL:

Kfla_5110

KQI:	F1D05_08030(pafA)

KSL:	OG809_41830(pafA)

TFU:

Tfu_1788

THAO:

NI17_011025(pafA)

TALX:

FOF52_08555(pafA)

NDA:

Ndas_1497

NAL:	B005_4102(pafA)

NGV:	CDO52_13730(pafA)

NEX:	NE857_13835(pafA)

NAKE:

KGD83_18320(pafA)

NCG:	KGD84_20930(pafA)

STRR:

EKD16_11915(pafA)

SNAH:

OUQ99_20020(pafA)

SAIU:

J4H86_01320(pafA)

TCU:

Tcur_2313

ACTW:

F7P10_00630(pafA)

AGRA:

AGRA3207_000490(pafA) AGRA3207_003824(pafA)

ACIR:

OG979_37765(pafA)

SPIQ:

OHA34_02510(pafA)

ACTQ:

OG417_28435(pafA)

SRO:

Sros_5868

NOA:	BKM31_06475 BKM31_50015

NOW:	GBF35_32100(pafA)

NCX:	Nocox_26060(pafA)

NGN:	LCN96_07780(pafA) LCN96_35135(pafA)

NFS:	OIE67_13335(pafA) OIE67_53050(pafA)

TBI:

Tbis_1829

MHAI:

OHB01_33765(pafA)

FRA:	Francci3_2612

FRE:	Franean1_4874

FAL:

FRAAL2878

FSY:	FsymDg_2220

FRI:	FraEuI1c_3746

ACE:

Acel_1191

NML:

Namu_2960

NAK:	EH165_06940(pafA)

NAKA:

H7F38_16300(pafA)

GOB:

Gobs_2684

BSD:	BLASA_2671(pafA)

BLAP:

MVA48_03735(pafA)

MMAR:

MODMU_2605(pafA)

KRA:

Krad_1875

SEN:

SACE_2254

SACG:

FDZ84_01905(pafA)

SVI:	Svir_21990

SACC:

EYD13_12255(pafA)

AMD:

AMED_4890

AMN:

RAM_24890

AMM:

AMES_4831

AMZ:

B737_4831

AOI:	AORI_3826(pafA)

AJA:	AJAP_20030(pafA)

AMQ:	AMETH_3535

AMYC:

CU254_18280(pafA)

AMYB:

BKN51_11615

AAB:	A4R43_10760

AMYY:

YIM_27265(pafA)

AORI:

SD37_19635

AACD:

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MUY14_13170(pafA)

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NQK81_03470(pafA)

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L1857_20480(pafA)

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VSH64_13230(pafA)

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Psed_3293

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PSEE:

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STUC:

G5S47_03550(pafA)

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AOS:	AXE84_08970 AXE84_11460

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B6G06_04920

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ACTO:

C3V41_03825(pafA)

ANE:	ATCC27039_08560(pafA_1) ATCC27039_13710(pafA_2)

AHW:	NCTC11636_00462(pafA_1) NCTC11636_00835(pafA_2)

ACTZ:

CWT12_05135(pafA)

AIR:	NCTC12972_00246(pafA_1) NCTC12972_00921(pafA_2)

ASLA:

NCTC11923_01767(pafA_1) NCTC11923_02332(pafA_2)

AVC:	NCTC10951_00885(pafA_1) NCTC10951_01229(pafA_2)

AWE:	JG540_05645(pafA) JG540_07855

AMAM:

HPC72_04825(pafA) HPC72_07380

AREP:

ID810_04445 ID810_06705(pafA)

AGH:	M3I41_03825

ACTM:

HCQ94_00450

AMAS:

QU670_07605(pafA) QU670_10740

ACAP:

MANAM107_02400(pafA_1) MANAM107_22810(pafA_2)

AUO:	R3I39_08005(pafA)

ALIL:

D5R93_04555 D5R93_07080(pafA)

AVU:	BK816_03975

FSL:	EJO69_01745(pafA) EJO69_10280

FLH:	EJ997_02820(pafA) EJ997_10020

WNE:	PIG85_05145(pafA)

GEU:	CJ185_004805

GHM:	CJ187_002810(pafA)

VCB:	CYK25_003695(pafA)

BLO:

BL1797

BLJ:

BLD_1975

BLN:

Blon_2124

BLON:

BLIJ_2201

BLF:

BLIF_1510

BLL:

BLJ_1494

BLB:

BBMN68_26

BLM:

BLLJ_1465

BLK:	BLNIAS_00680

BLG:

BIL_01800

BLZ:	BLGT_07820

BLX:	GS08_07745

BAD:

BAD_0549

BADL:

BADO_0563

BADO:

BBMN23_0595

BLA:

BLA_1169

BLC:	Balac_0641

BLT:	Balat_0641

BBB:

BIF_01344

BBC:

BLC1_0614

BNM:	BALAC2494_00489

BLV:

BalV_0618

BLW:	W7Y_0645(pafA)

BLS:

W91_0666

BANI:

Bl12_0598

BANL:

BLAC_03225

BNI:	BANAN_03200

BANM:

EN10_03265

BDE:

BDP_0755

BDN:

BBDE_0723

BBP:

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BBI:	BBIF_0658(pafA)

BBF:

BBB_0618

BBV:	HMPREF9228_0491(pafA)

BBRU:

Bbr_1380

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B12L_1321

BBRV:

B689b_1403

BBRJ:

B7017_1582

BBRC:

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BBRS:

BS27_1398

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BBBR_1436

BAST:

BAST_1106

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BCOR:

BCOR_0941

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BPSP:

AH67_03540

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BANG:

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BBSC_0980

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PDO:

PSDT_1158

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AFO:

Afer_0912

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IAM:	HC251_11035(pafA)

IMA:	PO878_10795(pafA)

DHI:	LH044_02375(pafA)

CCZ:	CCALI_02217

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MIN:

Minf_1278

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kam1_1267

MFH:

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MCAO:

IT6_00465

MEAP:

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AMOB:

HG15A2_04740(pafA)

SVP:	Pan189_03590(pafA)

NDE:	NIDE0960 NIDE3054

NMV:	NITMOv2_0805 NITMOv2_3549(pafA)

NIO:	NITINOP_1621 NITINOP_3237(pafA)

NJA:	NSJP_0043(pafA) NSJP_1985

NKF:	Nkreftii_001178

NIF:	W02_14140(pafA) W02_32320(pafA)

NTI:	DNFV4_03151

NALL:

PP769_00750(pafA) PP769_15890

NNEO:

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LFC:

LFE_0660

LFI:	LFML04_0395 LFML04_1971

LFP:	Y981_02025 Y981_10025

LEG:	ABH19_02100 ABH19_10400

NLI:	G3M70_02760

NWT:	NSPWAT_2803

NVA:	G3M78_03050

MOX:

DAMO_0753

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Reference

1 [PMID:20355727]

Authors

Sutter M, Damberger FF, Imkamp F, Allain FH, Weber-Ban E

Title

Prokaryotic ubiquitin-like protein (Pup) is coupled to substrates via the side chain of its C-terminal glutamate.

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Guth E, Thommen M, Weber-Ban E

Title

Mycobacterial ubiquitin-like protein ligase PafA follows a two-step reaction pathway with a phosphorylated pup intermediate.

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Allosteric transitions direct protein tagging by PafA, the prokaryotic ubiquitin-like protein (Pup) ligase.

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Barandun J, Delley CL, Ban N, Weber-Ban E

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Crystal structure of the complex between prokaryotic ubiquitin-like protein and its ligase PafA.

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