KEGG ENZYME: 3.1.1.96

ENZYME: 3.1.1.96

Entry

EC 3.1.1.96                 Enzyme

Name

D-aminoacyl-tRNA deacylase;
Dtd2;
D-Tyr-tRNA(Tyr) deacylase;
D-Tyr-tRNATyr deacylase;
D-tyrosyl-tRNATyr aminoacylhydrolase;
dtdA (gene name)

Class

Hydrolases;
Acting on ester bonds;
Carboxylic-ester hydrolases

Sysname

D-aminoacyl-tRNA aminoacylhydrolase

Reaction(IUBMB)

(1) a D-aminoacyl-tRNA + H2O = a D-amino acid + tRNA;
(2) glycyl-tRNAAla + H2O = glycine + tRNAAla

Substrate

D-aminoacyl-tRNA;
H2O [CPD:C00001];
glycyl-tRNAAla

Product

D-amino acid [CPD:C00405];
tRNA [CPD:C00066];
glycine [CPD:C00037];
tRNA(Ala) [CPD:C01635]

Comment

The enzyme, found in all domains of life, can cleave mischarged glycyl-tRNAAla [5]. The enzyme from Escherichia coli can cleave D-tyrosyl-tRNATyr, D-aspartyl-tRNAAsp and D-tryptophanyl-tRNATrp [1]. Whereas the enzyme from the archaeon Pyrococcus abyssi is a zinc protein, the enzyme from Escherichia coli does not carry any zinc [2].

History

EC 3.1.1.96 created 2014, modified 2019

Orthology

K07560

D-aminoacyl-tRNA deacylase

K09716

D-aminoacyl-tRNA deacylase

Genes

HSA:	112487(DTD2) 92675(DTD1)

PTR:	458119(DTD1) 746238(DTD2)

PPS:	100987982(DTD1) 100994065(DTD2)

GGO:	101126648(DTD1) 101146704(DTD2)

PON:	100446518(DTD2) 100459622(DTD1)

NLE:	100586951(DTD1) 100589047(DTD2)

HMH:	116460876(DTD1) 116484746(DTD2)

MCC:	700895(DTD1) 717267(DTD2)

MCF:	102114928 102119138(DTD2) 102119325(DTD1)

MTHB:

126929205 126959912 126960731

MNI:	105477940(DTD2) 105486824(DTD1)

CSAB:

103214988(DTD1) 103228786(DTD2)

CATY:

105582024(DTD1) 105592253(DTD2)

PANU:

100999487(DTD1) 101011550(DTD2) 101014081

TGE:	112629472(DTD2) 112630113 112633551(DTD1)

MLEU:

105539319(DTD1) 105549562 105549997(DTD2)

RRO:	104667432(DTD1) 104671212(DTD2)

RBB:	108523180(DTD1) 108537581 108544676(DTD2)

TFN:	117068402(DTD1) 117069845(DTD2) 117078860

PTEH:

111546400(DTD1) 111552906(DTD2)

CANG:

105511683(DTD2)

CJC:	100384960(DTD1) 100387280(DTD2)

SBQ:	101031541(DTD2) 101032426(DTD1)

CIMI:

108292053(DTD1) 108293332(DTD2)

CSYR:

103265582(DTD1) 103275264(DTD2)

MMUR:

105875963(DTD2) 105879622(DTD1)

LCAT:

123622814(DTD1) 123650349(DTD2)

PCOQ:

105813247(DTD2) 105820686(DTD1)

OGA:	100954312(DTD2) 100965332(DTD1)

MMU:	328092(Dtd2) 66044(Dtd1)

MCAL:

110286512(Dtd1) 110306890(Dtd2)

MPAH:

110318480(Dtd1) 110324807(Dtd2)

RNO:	366619(Dtd2)

MCOC:

116080245(Dtd2) 116091073(Dtd1)

ANU:	117704583(Dtd1) 117717020(Dtd2)

MUN:	110548495(Dtd1) 110562429(Dtd2)

CGE:	100752381(Dtd2) 100765967(Dtd1)

MAUA:

101833154(Dtd1) 101840020(Dtd2)

PROB:

127221358(Dtd1) 127230579(Dtd2)

PLEU:

114693358(Dtd2) 114709429(Dtd1)

MORG:

121452534(Dtd2) 121460243(Dtd1)

MFOT:

126499575 126512052

AAMP:

119800345 119815175(Dtd1) 119819653(Dtd2)

NGI:	103734265(Dtd2)

HGL:	101699177(Dtd2) 101720730(Dtd1)

CPOC:

100714368(Dtd2) 100720371(Dtd1)

CCAN:

109678675(Dtd1) 109690404(Dtd2)

DORD:

105993707(Dtd1) 105998660(Dtd2)

DSP:	122096135(Dtd1) 122106118(Dtd2)

PLOP:

125353215(Dtd1) 125363383(Dtd2)

NCAR:

124977254 124978322

MMMA:

107146424(Dtd1) 107147300(Dtd2)

OCU:	100353457 100354854 100355288

OPI:	101524318(DTD1) 101531965(DTD2)

TUP:	102469307(DTD2) 102498600(DTD1)

GVR:	103584540 103584578 103602771(DTD1)

CFA:	119865107 607771(DTD1) 609308(DTD2)

CLUD:

112655811 112657215(DTD2) 112673522(DTD1)

VVP:	112922676(DTD1) 112926596(DTD2)

VLG:	121477806(DTD1) 121493905(DTD2)

NPO:	129499507(DTD2) 129523224(DTD1)

AML:	100471352(DTD2) 100481392(DTD1)

UMR:	103664506 103680544(DTD1) 103680899(DTD2)

UAH:	113258307(DTD1) 113266106(DTD2)

UAR:	123795708(DTD2) 123800198(DTD1)

ELK:	111140614 111141744

LLV:	125104975 125109164

MPUF:

101680161(DTD2) 101690355(DTD1)

MNP:	131999870(DTD2) 132021697(DTD1)

MLK:	131808163(DTD1) 131836437(DTD2)

NVS:	122893811(DTD2) 122916300(DTD1)

ORO:	101364989(DTD2) 101369829 101379630(DTD1)

EJU:	114216415(DTD1) 114217801(DTD2)

ZCA:	113910539(DTD2) 113927642 113938716(DTD1)

MLX:	118003228(DTD2) 118011196(DTD1)

NSU:	110585317(DTD2) 110589996(DTD1)

LWW:	102739056(DTD2) 102745535(DTD1)

FCA:	101082142(DTD1) 101087489(DTD2)

PYU:	121012541(DTD1) 121031623(DTD2)

PCOO:

112856115(DTD2) 112869213(DTD1)

PBG:	122467743(DTD2) 122496615(DTD1)

PVIV:

125162604(DTD1) 125168986(DTD2)

LRUF:

124503522 124508888

PTG:	102949280(DTD2) 102949858(DTD1)

PPAD:

109254296(DTD2) 109274671(DTD1)

PUC:	125909594 125936854

AJU:	106967061 106976299

HHV:	120241788(DTD2) 120248233(DTD1)

BTA:	514035(DTD2) 514493(DTD1)

BOM:	102274436(DTD2) 102275384(DTD1)

BIU:	109567615(DTD1) 109575405(DTD2)

BBUB:

102414889(DTD1) 112577603(DTD2)

BBIS:

104986138(DTD1) 104993666(DTD2)

CHX:	102177665(DTD2) 102180946(DTD1)

OAS:	101116351(DTD2) 101122541(DTD1) 105603710 105612785

BTAX:

128058517(DTD1) 128064494 128066899(DTD2)

ODA:	120868972(DTD1) 120875395(DTD2)

CCAD:

122448279(DTD1) 122455048(DTD2)

MBEZ:

129550495(DTD2) 129559052(DTD1)

SSC:	100522380(DTD2) 100524407(DTD1)

CFR:	102514851(DTD2) 102521157(DTD1)

CBAI:

105075248(DTD2) 105083162(DTD1)

CDK:	105094135(DTD1) 105094183(DTD2)

VPC:	102524795(DTD1) 102539177(DTD2)

BACU:

103014532(DTD1) 103020127(DTD2)

BMUS:

118881915(DTD1) 118890105(DTD2)

LVE:	103073322(DTD1) 103081563(DTD2)

OOR:	101273158(DTD2) 101280309(DTD1)

DLE:	111164211(DTD2) 111185061(DTD1)

PCAD:

102980190(DTD1) 102982981(DTD2)

PSIU:

116740745(DTD1) 116749716(DTD2)

NASI:

112391322(DTD2) 112405367(DTD1)

ECB:	100056036(DTD2) 100061946(DTD1)

EPZ:	103552719(DTD2) 103564614(DTD1)

EAI:	106840407(DTD1) 106841297(DTD2)

MYB:	102245589(DTD2) 102257173(DTD1)

MYD:	102762267(DTD2) 102772453(DTD1)

MMYO:

118663014(DTD1) 118678244(DTD2)

MLF:	102429458(DTD1) 102432500(DTD2)

PKL:	118707983(DTD1) 118726418(DTD2)

EFUS:

103285704(DTD1) 103303799(DTD2)

MNA:	107534409(DTD2) 107536329(DTD1)

DRO:	112296484(DTD2) 112304230(DTD1)

SHON:

118989924(DTD2) 118994381(DTD1)

AJM:	119042980 119047544(DTD1) 119061161(DTD2)

PDIC:

114492434(DTD2) 114506875(DTD1)

PHAS:

123815052(DTD1) 123820447(DTD2)

MMF:	118619020(DTD1) 118637107(DTD2)

PPAM:

129070902(DTD1) 129074186(DTD2)

HAI:	109378072(DTD2) 109388407(DTD1)

RFQ:	117016304(DTD1) 117022759(DTD2)

PALE:

102879028(DTD1) 102885562(DTD2)

PGIG:

120608570(DTD2) 120611858(DTD1)

PVP:	105299115(DTD1) 105303051(DTD2)

RAY:	107499470(DTD2) 107511619(DTD1)

MJV:	108387857(DTD2) 108397677(DTD1)

TOD:	119237644(DTD1) 119238995(DTD2)

SARA:

101542960(DTD1) 101554049(DTD2)

LAV:	100661992(DTD2) 100677074(DTD1)

TMU:	101357041 101360757

ETF:	101647902(DTD2) 101649665(DTD1)

DNM:	101437635(DTD2) 101439390(DTD1)

MDO:	100012824(DTD2) 100031436(DTD1)

GAS:	123235921(DTD2) 123236914(DTD1) 123238181

SHR:	100917029(DTD2) 100923390(DTD1)

AFZ:	127548450 127549357

PCW:	110208570(DTD1) 110220289(DTD2)

OAA:	100081921(DTD2) 100091581(DTD1)

GGA:	416726(DTD1) 770817(DTD2)

PCOC:

116229345(DTD2) 116231779(DTD1)

MGP:	100547572(DTD2) 100548585(DTD1)

CJO:	107310922(DTD1)

TPAI:

128075505(DTD1) 128086294(DTD2)

LMUT:

125689723(DTD1) 125694878(DTD2)

NMEL:

110396086(DTD1) 110402102(DTD2)

APLA:

101797841(DTD2) 101803288 119716581

ACYG:

106031735(DTD2) 106044729(DTD1)

CATA:

118250755(DTD2) 118256306(DTD1)

AFUL:

116487170(DTD1) 116489359(DTD2)

TGU:	100190723(DTD1) 100227685(DTD2)

LSR:	110475306 110475818(DTD1) 110477178

SCAN:

103819301(DTD1) 115485493(DTD2)

PMOA:

120500519(DTD2) 120506200(DTD1)

OTC:	121334889(DTD2) 121346388(DTD1)

PRUF:

121362542(DTD2) 121365327(DTD1)

GFR:	102043613(DTD2) 102044919(DTD1)

FAB:	101811132(DTD1) 101817215(DTD2)

OMA:	130251330(DTD1) 130254419(DTD2)

PHI:	102102075(DTD1) 102112860(DTD2)

PMAJ:

107202457(DTD1) 107206179(DTD2)

CCAE:

111926603(DTD1) 111930871(DTD2)

CCW:	104685724(DTD1) 104688402(DTD2)

CBRC:

103612837(DTD1) 103621002(DTD2)

ETL:	114055055(DTD2) 114066250(DTD1)

ZAB:	102062594(DTD1) 102063632(DTD2)

ACHL:

103805935(DTD1) 103806426(DTD2)

SVG:	106857286(DTD1) 106862263(DTD2)

MMEA:

130581322(DTD1) 130589266(DTD2)

HRT:	120750381(DTD1) 120754776(DTD2)

FPG:	101916071(DTD1) 101922316(DTD2)

FCH:	102048390(DTD2) 102048963(DTD1)

CLV:	102092484(DTD1) 102095622(DTD2)

EGZ:	104128809(DTD1) 104133313(DTD2)

NNI:	104009547(DTD1) 104011808(DTD2)

PCRI:

104026094(DTD2) 104034308(DTD1)

PLET:

104619159(DTD1) 104626997(DTD2)

EHS:	104504876(DTD2) 104516373(DTD1)

PCAO:

104048597(DTD2) 104049799(DTD1)

ACUN:

113478559(DTD1) 113480485(DTD2)

TALA:

104360010(DTD1) 104362108(DTD2)

PADL:

103912937(DTD2) 103921501(DTD1)

AFOR:

103900809(DTD1) 103908058(DTD2)

ACHC:

115349649(DTD2) 115349813(DTD1)

HALD:

104318788(DTD2) 104322406(DTD1)

HLE:	104835966(DTD2) 104838227(DTD1)

AGEN:

126049301 126052575

GCL:	127014672 127017208

CCRI:

104156507(DTD2) 104169327(DTD1)

CSTI:

104549583(DTD2) 104553462(DTD1)

CMAC:

104473805(DTD2) 104487598(DTD1)

MUI:	104535246(DTD2) 104535250(DTD1)

BREG:

104630176(DTD1) 104638730(DTD2)

FGA:	104071482(DTD1) 104071697(DTD2)

GSTE:

104253965(DTD1) 104261436(DTD2)

LDI:	104339812(DTD2) 104350858(DTD1)

MNB:	103777447(DTD1) 103778421(DTD2)

OHA:	104334342(DTD1) 104338127(DTD2)

NNT:	104400904(DTD2) 104402202(DTD1)

SHAB:

115606619(DTD2) 115613999(DTD1)

DPUB:

104305294(DTD1) 104309422(DTD2)

PGUU:

104460059(DTD2) 104469958(DTD1)

ACAR:

104518100(DTD2) 104525460(DTD1)

CPEA:

104385403(DTD2) 104394970(DTD1)

AVIT:

104275179(DTD2) 104277539(DTD1)

CVF:	104288175(DTD2) 104295148(DTD1)

RTD:	128906564(DTD1) 128909328(DTD2)

CUCA:

104060711(DTD1) 104061675(DTD2)

TEO:	104376433(DTD2) 104378346(DTD1)

BRHI:

104493682(DTD1) 104500975(DTD2)

AAM:	106483032(DTD2) 106494126(DTD1)

AROW:

112975856(DTD2) 112977473(DTD1)

NPD:	112949325(DTD1) 112958079(DTD2)

TGT:	104566227(DTD2) 104579987(DTD1)

DNE:	112980339(DTD2) 112985545(DTD1)

SCAM:

104140934(DTD2) 104142954(DTD1)

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CSEC:

111863359

SGRE:

126284159 126320605

BROR:

134542035

IEL:

124158039

FCD:	110854067 110859259

DPX:	DAPPUDRAFT_299963

DMK:

116933659

DPZ:

124341952

PVM:	113808497 113821389

PJA:	122264521 122265737

PCHN:

125041592 125042230

PMOO:

119581810 119581869 119592182

HAME:

121856547 121873822

PCLA:

123745841 123755366

CQD:	128685701 128706515

PTRU:

123515394

ESN:	126985133 127001490

HAZT:

108674225

EAF:	111706225 111707697

LSM:

121124719

TCF:

131888713

PPOI:

119108573 119109306 119110126

DSV:

119455358

RSAN:

119394511

RMP:

119172512

VDE:	111250384 111253649

VJA:	111266859 111271948

TUT:

107359474

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113793404 113796172

DFR:

124493110

CSCU:

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PTEP:

107445072

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129972212

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129222021

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106461923

PMEO:

129583057

CEL:	CELE_T16G1.10(pqn-68)

CBR:	CBG_09496(Cbr-pqn-68)

NAI:	NECAME_08280

BMY:	BM_BM5812(Bma-pqn-68)

LOA:	LOAG_06351

TSP:

Tsp_02626

HRO:	HELRODRAFT_69972 HELRODRAFT_83187

LGI:	LOTGIDRAFT_189561 LOTGIDRAFT_57629

PVUL:

126820462

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112569960 112571213

BGT:

106074025

GAE:	121371620 121371663

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CVN:	111129835 111130904

CANU:

128176047 128177439

OED:	125650212 125651775

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117319816 117323260 117327882

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127699148 127732623

MMER:

123534134 123534148 123540825

RPHI:

132725491 132757263

DPOL:

127873181 127873786 127874676

OBI:	106869573 106875827

OSN:

115223550

LAK:	106155974 106170430 106171008

SMM:	Smp_210180

OVI:	T265_04295

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EGR_07509

NVE:	5508454 5521244

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116290033 116291148

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AMIL:

114958192 114971993

PDAM:

113686413 113687090

SPIS:

111344610 111346263

DGT:

114525666

XEN:

124453146

HMG:	100203441 100211804

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TAD:	TRIADDRAFT_19862 TRIADDRAFT_31009 TRIADDRAFT_51776 TRIADDRAFT_51789

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100640315

ATH:	AT2G03800(GEK1) AT4G18460

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104710293 104718471 104723213 104773341 104779701 104790138

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CPAP:

110821916 110823080 110824276

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123192337 123214714

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120124776 120169426 120170734 120205819 120209842

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PVU:	PHAVU_003G280600g PHAVU_006G179400g

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123882130 123882131 123887205

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109326102 109334346 109345137

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QSA:	O6P43_025584 O6P43_031903

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RCN:	112166840 112167467 112200343

PPER:

18781175 18793887

PMUM:

103325082 103342018

PAVI:

110746265 110747223 110765583

PDUL:

117616614 117626576

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126587572 126594956 126607024 126622683

PXB:	103944137 103947289

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MNT:	112090650 21392219

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115697936 115700620

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CMOS:

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MESC:

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132172680 132178548

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VRI:	117903924 117904613

SLY:	101244765 101245317 101263327

SPEN:

107011887 107015967 107023885

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SIND:

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OEU:	111372747 111388113 111388114

EGT:	105967708 105968707 105973545

SSPL:

121769475 121811199

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130985393 130995955 130997987

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125213421 125215032

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127247656 127261598

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122579014 122582720 122611265

LSV:	111901382 111902352 111914343

CCAV:

112514696 112519782 112525341

DCR:	108206443 108211073 108212658

CSIN:

114263059 114277070 114282331 114282798 114319794 114320565

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130809396

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122058221 122093741

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113300228 113317214 113343079 113348768

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101767884 101775548

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120649980 120654405 120691276 120695419

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AOF:	109841892 109844808

MSIN:

131245315 131255700

NCOL:

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SMO:	SELMODRAFT_158189 SELMODRAFT_166581 SELMODRAFT_169316 SELMODRAFT_99197

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MNEG_3447

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Reference

1 [PMID:10918062]

Authors

Soutourina J, Plateau P, Blanquet S

Title

Metabolism of D-aminoacyl-tRNAs in Escherichia coli and Saccharomyces cerevisiae cells.

Journal

J Biol Chem 275:32535-42 (2000)
DOI:10.1074/jbc.M005166200

Sequence

[eco:b3887] [sce:YDL219W]

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Authors

Ferri-Fioni ML, Schmitt E, Soutourina J, Plateau P, Mechulam Y, Blanquet S

Title

Structure of crystalline D-Tyr-tRNA(Tyr) deacylase. A representative of a new class of tRNA-dependent hydrolases.

Journal

J Biol Chem 276:47285-90 (2001)
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[eco:b3887]

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Ferri-Fioni ML, Fromant M, Bouin AP, Aubard C, Lazennec C, Plateau P, Blanquet S

Title

Identification in archaea of a novel D-Tyr-tRNATyr deacylase.

Journal

J Biol Chem 281:27575-85 (2006)
DOI:10.1074/jbc.M605860200

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[sso:SSO2234] [pab:PAB2349] [afu:AF_0625]

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Authors

Wydau S, Ferri-Fioni ML, Blanquet S, Plateau P

Title

GEK1, a gene product of Arabidopsis thaliana involved in ethanol tolerance, is a D-aminoacyl-tRNA deacylase.

Journal

Nucleic Acids Res 35:930-8 (2007)
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Pawar KI, Suma K, Seenivasan A, Kuncha SK, Routh SB, Kruparani SP, Sankaranarayanan R.

Title

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Journal

Elife 6:e24001 (2017)
DOI:10.7554/eLife.24001

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