KEGG ENZYME: 3.1.4.2

ENZYME: 3.1.4.2

Entry

EC 3.1.4.2                  Enzyme

Name

glycerophosphocholine phosphodiesterase;
glycerophosphinicocholine diesterase;
glycerylphosphorylcholinediesterase;
sn-glycero-3-phosphorylcholine diesterase;
glycerolphosphorylcholine phosphodiesterase;
glycerophosphohydrolase

Class

Hydrolases;
Acting on ester bonds;
Phosphoric-diester hydrolases

Sysname

sn-glycero-3-phosphocholine glycerophosphohydrolase

Reaction(IUBMB)

sn-glycero-3-phosphocholine + H2O = choline + sn-glycerol 3-phosphate [RN:R01030]

Reaction(KEGG)

R01030;
(other) R01470

Substrate

sn-glycero-3-phosphocholine [CPD:C00670];
H2O [CPD:C00001]

Product

choline [CPD:C00114];
sn-glycerol 3-phosphate [CPD:C00093]

Comment

Also acts on sn-glycero-3-phosphoethanolamine.

History

EC 3.1.4.2 created 1961, modified 1976

Pathway

ec00564

Glycerophospholipid metabolism

Orthology

K18695

glycerophosphocholine phosphodiesterase GPCPD1

Genes

HSA:	56261(GPCPD1)

PTR:	458085(GPCPD1)

PPS:	100992325(GPCPD1)

GGO:	101144579(GPCPD1)

PON:	100457313(GPCPD1)

NLE:	100585965(GPCPD1)

HMH:	116460781(GPCPD1)

MCC:	719117(GPCPD1)

MCF:	102119326(GPCPD1)

MTHB:

126929113

MNI:	105481647(GPCPD1)

CSAB:

103246868(GPCPD1)

CATY:

105582107(GPCPD1)

PANU:

101019332(GPCPD1)

TGE:	112632971(GPCPD1)

MLEU:

105536116(GPCPD1)

RRO:	104674573(GPCPD1)

RBB:

108533306

TFN:	117068491(GPCPD1)

PTEH:

111546467(GPCPD1)

CANG:

105511036(GPCPD1)

CJC:	100403898(GPCPD1)

SBQ:	101052158(GPCPD1)

CIMI:

108300922(GPCPD1)

CSYR:

103265018(GPCPD1)

MMUR:

105865955(GPCPD1)

LCAT:

123622748(GPCPD1)

PCOQ:

105806173(GPCPD1)

OGA:	100942596(GPCPD1)

MMU:	74182(Gpcpd1)

MCAL:

110312472(Gpcpd1)

MPAH:

110318489(Gpcpd1)

RNO:	362219(Gpcpd1)

MCOC:

116090982(Gpcpd1)

ANU:	117703119(Gpcpd1)

MUN:	110557046(Gpcpd1)

CGE:	100772527(Gpcpd1)

MAUA:

101829324(Gpcpd1)

PROB:

127221405(Gpcpd1)

PLEU:

114699529(Gpcpd1)

MORG:

121460172(Gpcpd1)

MFOT:

126496617

AAMP:

119814121(Gpcpd1)

HGL:	101716686(Gpcpd1)

CPOC:

100713039(Gpcpd1)

CCAN:

109695566(Gpcpd1)

DORD:

105981656(Gpcpd1)

DSP:	122120176(Gpcpd1)

PLOP:

125353282(Gpcpd1)

NCAR:

124975950

MMMA:

107139845(Gpcpd1)

OCU:

100340388

OPI:	101522744(GPCPD1)

TUP:	102476992(GPCPD1)

GVR:	103590575(GPCPD1)

CFA:	485778(GPCPD1)

CLUD:

112673631(GPCPD1)

VVP:	112930064(GPCPD1)

VLG:	121477797(GPCPD1) 121488974

NPO:	129523301(GPCPD1)

AML:	100464203(GPCPD1)

UMR:	103674412(GPCPD1)

UAH:	113258363(GPCPD1)

UAR:	123799580(GPCPD1)

ELK:

111141391

LLV:

125108477

MPUF:

101692701(GPCPD1)

MNP:	132008096 132021743

MLK:	131808023(GPCPD1)

NVS:	122916245(GPCPD1)

ORO:	101373799(GPCPD1)

EJU:	114216418(GPCPD1)

ZCA:	113937202(GPCPD1)

MLX:	118011263(GPCPD1)

NSU:	110579501(GPCPD1)

LWW:	102737079(GPCPD1)

FCA:	101081213(GPCPD1)

PYU:	121012460(GPCPD1)

PCOO:

112869702(GPCPD1)

PBG:	122496544(GPCPD1)

PVIV:

125161832(GPCPD1)

LRUF:

124503089

PTG:	102966968(GPCPD1)

PPAD:

109274735(GPCPD1)

PUC:

125936784

AJU:

106980167

HHV:	120225824(GPCPD1)

BTA:	518469(GPCPD1)

BOM:	102271682(GPCPD1)

BIU:	109567633(GPCPD1)

BBUB:

102408701(GPCPD1)

BBIS:

104986032(GPCPD1)

CHX:	102172822(GPCPD1)

OAS:	101115143(GPCPD1)

BTAX:

128058604(GPCPD1)

ODA:	120868923(GPCPD1)

CCAD:

122447808(GPCPD1)

MBEZ:

129559998(GPCPD1)

SSC:	100152321(GPCPD1)

CFR:	102516881(GPCPD1)

CBAI:

105083009(GPCPD1)

CDK:	105101383(GPCPD1)

VPC:	102526551(GPCPD1)

BACU:

103000701(GPCPD1)

BMUS:

118881036(GPCPD1)

LVE:	103090265(GPCPD1)

OOR:	101289006(GPCPD1)

DLE:	111165654(GPCPD1)

PCAD:

102976465(GPCPD1)

PSIU:

116740289(GPCPD1)

NASI:

112412514(GPCPD1)

ECB:	100051946(GPCPD1)

EPZ:	103559713(GPCPD1)

EAI:	106823173(GPCPD1)

MYB:	102244847(GPCPD1)

MYD:	102752720 102768123(GPCPD1)

MMYO:

118654251 118662987(GPCPD1)

MLF:	102419527(GPCPD1)

PKL:	118708491(GPCPD1)

EFUS:

103285655(GPCPD1)

MNA:	107536381(GPCPD1)

DRO:	112304233(GPCPD1)

SHON:

118990886(GPCPD1)

AJM:	119051146(GPCPD1)

PDIC:

114507095(GPCPD1)

PHAS:

123815175(GPCPD1)

MMF:	118618266(GPCPD1)

PPAM:

129070840(GPCPD1)

HAI:	109383836(GPCPD1)

RFQ:	117015623(GPCPD1)

PALE:

102889103(GPCPD1)

PGIG:

120603420(GPCPD1)

PVP:	105298656(GPCPD1)

RAY:	107499046(GPCPD1)

MJV:	108392437(GPCPD1)

TOD:	119232779(GPCPD1)

SARA:

101549384(GPCPD1)

SETR:

126017307(GPCPD1)

LAV:	100661261(GPCPD1)

TMU:

101350480

ETF:	101650601(GPCPD1)

DNM:	101429276(GPCPD1)

MDO:	100033295(GPCPD1)

GAS:	123236893(GPCPD1)

SHR:	100923561(GPCPD1)

AFZ:

127548515

PCW:	110207658(GPCPD1)

OAA:	100083805(GPCPD1)

GGA:	421311(GPCPD1)

PCOC:

116231205(GPCPD1)

MGP:	100543090(GPCPD1)

CJO:	107310902(GPCPD1)

TPAI:

128086910(GPCPD1)

LMUT:

125688758(GPCPD1)

NMEL:

110395459(GPCPD1)

APLA:

101795969(GPCPD1)

ACYG:

106045601(GPCPD1)

CATA:

118251080(GPCPD1)

AFUL:

116488172(GPCPD1)

TGU:	100218511(GPCPD1)

LSR:	110474855(GPCPD1)

SCAN:

103821340(GPCPD1)

PMOA:

120506814(GPCPD1)

OTC:	121335802(GPCPD1)

PRUF:

121358634(GPCPD1)

GFR:	102037405(GPCPD1)

FAB:	101809898(GPCPD1)

OMA:	130266837(GPCPD1)

PHI:	102106750(GPCPD1)

PMAJ:

107201576(GPCPD1)

CCAE:

111926646(GPCPD1)

CCW:	104696625(GPCPD1)

CBRC:

103625005(GPCPD1)

ETL:	114069820(GPCPD1)

ZAB:	102072423(GPCPD1)

ACHL:

103801611(GPCPD1)

SVG:	106863243(GPCPD1)

MMEA:

130584345(GPCPD1)

HRT:	120750655(GPCPD1)

FPG:	101911738(GPCPD1)

FCH:	102047465(GPCPD1)

CLV:	102085356(GPCPD1)

EGZ:	104130157(GPCPD1)

NNI:	104014927(GPCPD1)

PCRI:

104024451(GPCPD1)

PLET:

104618100(GPCPD1)

PCAO:

104043940(GPCPD1)

ACUN:

113477801(GPCPD1)

TALA:

116964169(GPCPD1)

PADL:

103919568(GPCPD1)

AFOR:

103901668(GPCPD1)

ACHC:

115344250(GPCPD1)

HALD:

104317053(GPCPD1)

HLE:	104836251(GPCPD1)

AGEN:

126038700

GCL:

127015320

CCRI:

104157558(GPCPD1)

CSTI:

104558594(GPCPD1)

CMAC:

104473719(GPCPD1)

MUI:	104533357(GPCPD1)

BREG:

104634995(GPCPD1)

FGA:	104072569(GPCPD1)

GSTE:

104261707(GPCPD1)

LDI:	104343459(GPCPD1)

MNB:	103782623(GPCPD1)

OHA:	104329669(GPCPD1)

NNT:	104409179(GPCPD1)

SHAB:

115609920(GPCPD1)

DPUB:

104301207(GPCPD1)

PGUU:

104465977(GPCPD1)

ACAR:

104521723(GPCPD1)

CPEA:

104385033(GPCPD1)

AVIT:

104276420(GPCPD1)

CVF:	104293036(GPCPD1)

RTD:	128907476(GPCPD1)

CUCA:

104055414(GPCPD1)

TEO:	104378016(GPCPD1)

BRHI:

104502301(GPCPD1)

AAM:	106499795(GPCPD1)

AROW:

112973151(GPCPD1)

NPD:	112942911(GPCPD1)

TGT:	104575910(GPCPD1)

DNE:	112989338(GPCPD1)

SCAM:

104151833(GPCPD1)

ASN:	102375902(GPCPD1)

AMJ:	102563733(GPCPD1)

CPOO:

109319474(GPCPD1)

GGN:	109296697(GPCPD1)

PSS:	102452347(GPCPD1)

CMY:	102937446(GPCPD1)

CCAY:

125633359(GPCPD1)

DCC:	119852655(GPCPD1)

CPIC:

101936233(GPCPD1)

TST:	117874204(GPCPD1)

CABI:

116824047(GPCPD1)

MRV:	120400178(GPCPD1)

ACS:	100554925(gpcpd1)

ASAO:

132781724(GPCPD1)

PVT:	110078954(GPCPD1)

SUND:

121921029(GPCPD1)

PBI:	103049142(GPCPD1)

PMUR:

107287452(GPCPD1)

CTIG:

120301792(GPCPD1)

TSR:	106553523(GPCPD1)

PGUT:

117674343(GPCPD1)

APRI:

131197187(GPCPD1)

PTEX:

113442693(GPCPD1)

NSS:	113412741(GPCPD1)

VKO:	123030312(GPCPD1)

PMUA:

114593646(GPCPD1)

PRAF:

128410042(GPCPD1)

ZVI:	118082507(GPCPD1)

HCG:	128340084(GPCPD1)

GJA:	107107082(GPCPD1)

STOW:

125434621(GPCPD1)

EMC:	129327288(GPCPD1)

XLA:	108717755(gpcpd1.S) 735213(gpcpd1.L)

XTR:	100216176(gpcpd1)

NPR:	108795467(GPCPD1)

RTEM:

120938026(GPCPD1)

BBUF:

120998888(GPCPD1)

BGAR:

122934402(GPCPD1)

MUO:	115465658(GPCPD1)

GSH:	117356701(GPCPD1)

DRE:	492483(gpcpd1)

SRX:	107742708 107756671

SANH:

107697181

SGH:	107593247 107600082

CCAR:

109050125 109074258

CAUA:

113073668 113092558 113120472

CGIB:

127938500 127983890

PTET:

122324915(gpcpd1)

LROH:

127182793(gpcpd1)

OMC:	131527363(gpcpd1)

PPRM:

120460285(gpcpd1)

RKG:	130103225(gpcpd1)

MAMB:

125278455(gpcpd1)

CIDE:

127502147

MASI:

127409853

TROS:

130565577(gpcpd1)

TDW:	130434163(gpcpd1)

MANU:

129429411(gpcpd1)

IPU:

108257980

IFU:	128600903(gpcpd1)

PHYP:

113545179(gpcpd1)

SMEO:

124376978(gpcpd1)

TFD:	113644348(gpcpd1)

TVC:	132843289(gpcpd1)

AMEX:

103023293(gpcpd1)

CMAO:

118815561(gpcpd1)

EEE:	113590126(gpcpd1)

CHAR:

105899545(gpcpd1)

TRU:	101064928(gpcpd1)

TFS:	130515835(gpcpd1)

TNG:	GSTEN00020271G001

LCO:	104920852(gpcpd1)

NCC:	104947581(gpcpd1)

TBEN:

117498356(gpcpd1)

CGOB:

115028864(gpcpd1)

PGEO:

117440384(gpcpd1)

GACU:

117554188(gpcpd1)

EMAC:

134877377(gpcpd1)

ELY:	117270643(gpcpd1)

EFO:	125897183(gpcpd1)

PLEP:

121955275(gpcpd1)

SLUC:

116041931(gpcpd1)

ECRA:

117961880(gpcpd1)

ESP:	116705860(gpcpd1)

PFLV:

114572945(gpcpd1)

GAT:	120808384(gpcpd1)

PPUG:

119194709(gpcpd1)

AFB:	129107012(gpcpd1)

CLUM:

117727079(gpcpd1)

PSWI:

130202487(gpcpd1)

MSAM:

119908492(gpcpd1)

SCHU:

122863595(gpcpd1)

CUD:	121521201(gpcpd1)

ALAT:

119012278(gpcpd1)

MZE:	101468338(gpcpd1)

ONL:	100707161(gpcpd1)

OAU:	116332213(gpcpd1)

OLA:	101160778(gpcpd1)

OML:	112158022(gpcpd1)

CSAI:

133418517(gpcpd1)

XMA:	102224753(gpcpd1)

XCO:	114158454(gpcpd1)

XHE:	116733987(gpcpd1)

PRET:

103457864(gpcpd1)

PFOR:

103148039(gpcpd1)

PLAI:

106946442(gpcpd1)

PMEI:

106929200(gpcpd1)

GAF:	122825015(gpcpd1)

PPRL:

129369032(gpcpd1)

CVG:	107097542(gpcpd1)

CTUL:

119784117(gpcpd1)

GMU:	124881878(gpcpd1)

NFU:	107378119(gpcpd1)

KMR:	108231836(gpcpd1)

ALIM:

106518546(gpcpd1)

NWH:	119418471(gpcpd1)

AOCE:

111569672(gpcpd1)

MCEP:

124998819(gpcpd1)

CSEM:

103381050(gpcpd1)

POV:	109632383(gpcpd1)

SSEN:

122783978(gpcpd1)

HHIP:

117758229(gpcpd1)

HSP:	118099423(gpcpd1)

SMAU:

118290313(gpcpd1)

LCF:

108896917

SDU:	111239486(gpcpd1)

SLAL:

111672778(gpcpd1)

XGL:	120788804(gpcpd1)

HCQ:	109507215(gpcpd1)

SSCV:

125989795

SBIA:

133496533(gpcpd1)

PEE:	133416826(gpcpd1)

PTAO:

133467897(gpcpd1)

BPEC:

110168258(gpcpd1)

MALB:

109962217(gpcpd1)

BSPL:

114849634(gpcpd1)

SJO:	128376960(gpcpd1)

SASA:

106571744 106608056

STRU:

115173737 115174476

OTW:	112217816 112250575

OMY:	110522444 110529876(gpcpd1)

OGO:	123991001 123995276

ONE:	115108001(gpcpd1) 115139221

OKI:	109866320 109900974

OKE:	118371940 118398401

SALP:

111954649 112074500

SNH:	120019106(gpcpd1) 120024034

CCLU:

121548716 121552493

ELS:	105017514(gpcpd1)

SFM:	108929397(gpcpd1)

PKI:	111837604(gpcpd1)

AANG:

118229954(gpcpd1)

LOC:	102683496(gpcpd1)

PSPA:

121315940 121317062

ARUT:

117403129 117411053

PSEX:

120516627(gpcpd1)

LCM:	102367204(GPCPD1)

CMK:	103181646(gpcpd1)

RTP:	109923471(gpcpd1)

CPLA:

122553075(gpcpd1)

HOC:	132819881(gpcpd1)

LERI:

129699297(gpcpd1)

PMRN:

116939640(GPCPD1)

LRJ:	133347301(GPCPD1)

BFO:

118420929

BBEL:

109466177

CIN:

100183868

SCLV:

120337795 120342627

SPU:

594641

LPIC:

129277781

SKO:

100370219

DME:	Dmel_CG2818(CG2818)

DER:

6542896

DSE:

6613279

DSI:	Dsimw501_GD23248(Dsim_GD23248)

DYA:	Dyak_GE18251

DAN:

6498062

DSR:

110178121

DPO:	4802613 4817318

DPE:	6589046 6591582

DMN:	108157720 108162983

DWI:	6642274 6647701

DGR:

6566784

DMO:	Dmoj_GI14466 Dmoj_GI23897

DAZ:	108610002 108612117

DNV:	108649745 115562108

DHE:	111595869 111601922

DVI:

6627721

CCAT:

101451344

BOD:

106620031

BDR:

105222723

RZE:

108373374

AOQ:

129247251

TDA:	119680215 119683062 119689065

MDE:	101888955 101897749

SCAC:

106086462 106093448

LCQ:	111675154 111690423

LSQ:	119600128 119609536 119614202

GFS:	119633117 119645011 119645015

ECOE:

129949225

CLON:

129608568

HIS:

119648817

ACOZ:

120957125

AARA:

120900357

AMER:

121595927

ASTE:

118513390

AFUN:

125760738

AMOU:

128305040

AALI:

118468945

AAG:

5564200

AALB:

109427939 109428257

CQU:	CpipJ_CPIJ009059

CPII:

120414647

CNS:

116340808

BCOO:

119066954

AME:

410117

ACER:

107998176

ALAB:

122712378

ADR:

102681354

AFLR:

100863281

BIM:

100749468

BBIF:

117210622

BVK:

117237471

BVAN:

117164087

BTER:

100645227

BAFF:

126916364

BPYO:

122565812

BPAS:

132904814

FVI:

122529676

CCAL:

108622100

OBB:

114874953

OLG:

117605483

MGEN:

117218680

NMEA:

116435247

CGIG:

122398134

SOC:

105197583

MPHA:

105837893

AEC:

105149901

ACEP:

105627339

PBAR:

105432811

VEM:

105562446

HST:

105186802

DQU:

106747817

CFO:

105250928

FEX:

115243420

LHU:

105674904

PGC:

109858983

OBO:

105281516

PCF:

106789265

PFUC:

122514283

VPS:

122634924

VCRB:

124430324

VVE:

124954036

NVI:

100118232

CSOL:

105369048

TPRE:

106650168

LHT:

122509877

LBD:

127285185

MDL:

103575478

CGLO:

123272750

FAS:

105266185

DAM:

107039166

AGIF:

122856737

VCAN:

122411463

CCIN:

107274174

DSM:

124405269

NPT:

124211480

NFB:

124176821

NLO:

107224460

NVG:

124299135

AROA:

105689618

TCA:

662257

DPA:	109538548 125503911

SOY:

115880662

AGRG:

126743673

ATD:

109601749

CSET:

123310962

AGB:

108904758

LDC:

111512440

NVL:

108559381

APLN:

108732534

PPYR:

116171193

OTU:

111414033

BMOR:

101743990

BMAN:

114245519

MSEX:

115440996

DPL:	KGM_214218

BANY:

112058257

MJU:

123866835

NIQ:

126781051

VCD:

124531381

MCIX:

123669384

PMAC:

106714445

PPOT:

106099662

PXU:

106127637

PRAP:

110999094

PBX:

123712557

PNAP:

125056508

ZCE:

119830561

CCRC:

123706028

LSIN:

126972669

AAGE:

121738113

HAW:

110375482

HZE:

124645855

TNL:

113500995

SLIU:

111352320

OFU:

114364713

PXY:

105398594

PGW:

126382064

CFEL:

113366746 113382697

CCRN:

123303817

API:

100159211

DNX:

107166899

AGS:

114126205

RMD:

113559632

ACOO:

126836764

DVT:

126899797

BTAB:

109031275

DCI:

103511955

CLEC:

106672797

HHAL:

106684327

NLU:

111055517

HVI:

124364298

MQU:

128999878

PHU:	Phum_PHUM249710

FOC:

113210381

TPAL:

117643143

ZNE:

110832935

CSEC:

111866397

SGRE:

126271919

BROR:

134531520

IEL:

124169466

FCD:

110846680

DPX:	DAPPUDRAFT_307611

DMK:

116934144

DPZ:

124328936

PVM:

113808219

PJA:

122259563

PCHN:

125039388

PMOO:

119586140 119586141

HAME:

121863753

PCLA:

123757268

CQD:

128692714

PTRU:

123504100

ESN:

126988329

MNZ:

135199532

HAZT:

108679733

EAF:

111701033

LSM:

121118824

TCF:

131887005

PPOI:

119099782

DSV:

119437428

RSAN:

119389923

RMP:

119160977

VDE:

111250093

VJA:

111272083

TUT:

107371100

DPTE:

113792484 113795557

DFR:	124495407 124500122

CSCU:

111641727

PTEP:

107451427

ABRU:

129980991

UDV:

129222835

SDM:

118181448

LPOL:

106466137

PMEO:

129589287 129590533

CEL:	CELE_K10B3.6(gpcp-1) CELE_T05H10.7(gpcp-2)

CBR:	CBG_13338 CBG_14135

CRQ:	GCK72_005113 GCK72_024032

BMY:	BM_BM5605(Bma-gpcp-2.1)

LOA:	LOAG_02221

TSP:

Tsp_08442

LGI:	LOTGIDRAFT_132728

PVUL:

126812825

PCAN:

112562577

BGT:	106066638 106071052

GAE:	121382877 121383736

HRF:

124139276

HRJ:

124275920

CRG:

105336617

CVN:

111123815

CANU:

128157455

OED:

125678919

MYI:

110441956

MMER:

123551895 123552075

RPHI:

132733615 132742918

DPOL:

127837450 127838555 127876146

OBI:

106879322

OSN:

115217981

LAK:

106168463

SMM:	Smp_054800 Smp_162910

SHX:	MS3_00004597(GPCPD1_1)

OVI:	T265_02264 T265_14041

EGL:

EGR_05839

NVE:

116610300

ATEN:

116304130

DGT:

114519105

HSY:

130612668

TAD:	TRIADDRAFT_53182

CMT:

CCM_08480

PSCO:

LY89DRAFT_773861

SLA:	SERLADRAFT_460326

TVA:	TVAG_2v0583460 TVAG_2v0586790

» show all

Reference

1 [PMID:13315235]

Authors

DAWSON RM.

Title

Liver glycerylphosphorylcholine diesterase.

Journal

Biochem J 62:689-93 (1956)
DOI:10.1042/bj0620689

Reference

2 [PMID:13143024]

Authors

HAYAISHI O, KORNBERG A.

Title

Metabolism of phospholipides by bacterial enzymes.

Journal

J Biol Chem 206:647-63 (1954)

Reference

3 [PMID:13403918]

Authors

WEBSTER GR, MARPLES EA, THOMPSON RH.

Title

Glycerylphosphorylcholine diesterase activity of nervous tissue.

Journal

Biochem J 65:374-7 (1957)
DOI:10.1042/bj0650374

Other DBs

ExplorEnz - The Enzyme Database:

3.1.4.2

IUBMB Enzyme Nomenclature:

3.1.4.2

ExPASy - ENZYME nomenclature database:

3.1.4.2

BRENDA, the Enzyme Database:

3.1.4.2

CAS:

9025-85-8

DBGET integrated database retrieval system