#=GF ID ATHILA
#=GF AC PF03078.19
#=GF DE ATHILA ORF-1 family
#=GF AU Mifsud W;0000-0002-9805-6461
#=GF SE Pfam-B_2240 (release 6.4)
#=GF GA 20.20 20.20;
#=GF TC 20.20 20.20;
#=GF NC 20.10 20.10;
#=GF BM hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM hmmsearch -Z 75585367 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP Family
#=GF RN [1]
#=GF RM 8534844
#=GF RT Athila, a new retroelement from Arabidopsis thaliana.
#=GF RA Pelissier T, Tutois S, Deragon JM, Tourmente S, Genestier S,
#=GF RA Picard G;
#=GF RL Plant Mol Biol 1995;29:441-452.
#=GF RN [2]
#=GF RM 9611185
#=GF RT Potential retroviruses in plants: Tat1 is related to a group of
#=GF RT Arabidopsis thaliana Ty3/gypsy retrotransposons that encode
#=GF RT envelope-like proteins.
#=GF RA Wright DA, Voytas DF;
#=GF RL Genetics 1998;149:703-715.
#=GF RN [3]
#=GF RM 10889217
#=GF RT Ty3/Gypsy retrotransposons: description of new Arabidopsis
#=GF RT thaliana elements and evolutionary perspectives derived from
#=GF RT comparative genomic data.
#=GF RA Marin I, Llorens C;
#=GF RL Mol Biol Evol 2000;17:1040-1049.
#=GF DR INTERPRO; IPR004312;
#=GF DR SO; 0100021; polypeptide_conserved_region;
#=GF CC ATHILA is a group of Arabidopsis thaliana retrotransposons [1]
#=GF CC belonging to the Ty3/gypsy family of the long terminal repeat
#=GF CC (LTR) class of eukaryotic retrotransposons[2,3]. The central
#=GF CC region of ATHILA retrotransposons contains two or three open
#=GF CC reading frames (ORFs). This family represents the ORF1 product.
#=GF CC The function of ORF1 is unknown.
#=GF SQ 1198
#=GS A0A4P1RP64_LUPAN/1-121 AC A0A4P1RP64.1
#=GS A0A067KRB6_JATCU/12-211 AC A0A067KRB6.1
#=GS A0A6D2JMV6_9BRAS/269-511 AC A0A6D2JMV6.1
#=GS Q9ZPT9_ARATH/54-195 AC Q9ZPT9.1
#=GS A0A0D3AMI1_BRAOL/241-394 AC A0A0D3AMI1.1
#=GS A0A6D2JVI8_9BRAS/12-130 AC A0A6D2JVI8.1
#=GS A0A6D2JBG3_9BRAS/81-158 AC A0A6D2JBG3.1
#=GS A0A6D2HN92_9BRAS/49-135 AC A0A6D2HN92.1
#=GS A0A6D2KAM5_9BRAS/86-180 AC A0A6D2KAM5.1
#=GS A0A392QEX8_9FABA/2-50 AC A0A392QEX8.1
#=GS A0A6D2JAX9_9BRAS/1-233 AC A0A6D2JAX9.1
#=GS A0A6D2J3X8_9BRAS/98-165 AC A0A6D2J3X8.1
#=GS A0A5N6PND8_9ASTR/40-193 AC A0A5N6PND8.1
#=GS A0A6D2I6W3_9BRAS/155-262 AC A0A6D2I6W3.1
#=GS A0A6D2JD58_9BRAS/74-257 AC A0A6D2JD58.1
#=GS A0A6D2L8R4_9BRAS/1-180 AC A0A6D2L8R4.1
#=GS A0A6D2JNI0_9BRAS/1-118 AC A0A6D2JNI0.1
#=GS A0A6D2JF18_9BRAS/194-289 AC A0A6D2JF18.1
#=GS A0A6D2J9T7_9BRAS/2-65 AC A0A6D2J9T7.1
#=GS A0A6D2HZX7_9BRAS/33-203 AC A0A6D2HZX7.1
#=GS A0A6D2KQK8_9BRAS/146-288 AC A0A6D2KQK8.1
#=GS A0A6D2K7V7_9BRAS/109-230 AC A0A6D2K7V7.1
#=GS A0A2P5W272_GOSBA/2-168 AC A0A2P5W272.1
#=GS A0A087FWS1_ARAAL/2-263 AC A0A087FWS1.1
#=GS D7LP16_ARALL/5-194 AC D7LP16.1
#=GS D7KZ06_ARALL/61-388 AC D7KZ06.1
#=GS A0A6D2IV15_9BRAS/126-265 AC A0A6D2IV15.1
#=GS A0A6D2L4T2_9BRAS/69-344 AC A0A6D2L4T2.1
#=GS A0A6D2L408_9BRAS/36-149 AC A0A6D2L408.1
#=GS A0A6D2KZP4_9BRAS/2-88 AC A0A6D2KZP4.1
#=GS A0A067KGJ7_JATCU/1-103 AC A0A067KGJ7.1
#=GS A0A6D2JUD5_9BRAS/10-133 AC A0A6D2JUD5.1
#=GS A0A6D2J9W8_9BRAS/1-136 AC A0A6D2J9W8.1
#=GS A0A6J0LI40_RAPSA/134-601 AC A0A6J0LI40.1
#=GS A0A6D2HPA8_9BRAS/1-57 AC A0A6D2HPA8.1
#=GS A0A6D2L271_9BRAS/122-231 AC A0A6D2L271.1
#=GS A0A6D2KVE5_9BRAS/8-146 AC A0A6D2KVE5.1
#=GS A0A6D2I1V6_9BRAS/197-300 AC A0A6D2I1V6.1
#=GS A0A6D2KP76_9BRAS/4-156 AC A0A6D2KP76.1
#=GS A0A6D2I2Y5_9BRAS/82-168 AC A0A6D2I2Y5.1
#=GS A0A0J8BGS1_BETVV/3-219 AC A0A0J8BGS1.1
#=GS A0A6D2II42_9BRAS/316-404 AC A0A6D2II42.1
#=GS A0A6D2K0A0_9BRAS/2-65 AC A0A6D2K0A0.1
#=GS A0A6D2HFV3_9BRAS/156-200 AC A0A6D2HFV3.1
#=GS A0A6D2HUQ5_9BRAS/69-307 AC A0A6D2HUQ5.1
#=GS A0A6D2HGA6_9BRAS/1-247 AC A0A6D2HGA6.1
#=GS A0A6D2ISV2_9BRAS/180-354 AC A0A6D2ISV2.1
#=GS A0A6D2KFS4_9BRAS/28-97 AC A0A6D2KFS4.1
#=GS A0A6D2KWM8_9BRAS/46-231 AC A0A6D2KWM8.1
#=GS A0A0D2ZS37_BRAOL/60-308 AC A0A0D2ZS37.1
#=GS A0A484KTS3_9ASTE/43-218 AC A0A484KTS3.1
#=GS A0A2P5Y340_GOSBA/28-231 AC A0A2P5Y340.1
#=GS A0A6D2JYC5_9BRAS/78-193 AC A0A6D2JYC5.1
#=GS A0A6D2KNZ0_9BRAS/2-120 AC A0A6D2KNZ0.1
#=GS A0A6D2JB71_9BRAS/1-86 AC A0A6D2JB71.1
#=GS A0A6D2KIP2_9BRAS/14-127 AC A0A6D2KIP2.1
#=GS A0A6D2J9W5_9BRAS/25-126 AC A0A6D2J9W5.1
#=GS A0A6D2JDD3_9BRAS/2-83 AC A0A6D2JDD3.1
#=GS A0A6D2JW43_9BRAS/1-96 AC A0A6D2JW43.1
#=GS A0A2P5WIH3_GOSBA/21-208 AC A0A2P5WIH3.1
#=GS A0A6D2JES9_9BRAS/8-259 AC A0A6D2JES9.1
#=GS A0A087HRN4_ARAAL/339-609 AC A0A087HRN4.1
#=GS A0A6D2HWB2_9BRAS/68-344 AC A0A6D2HWB2.1
#=GS A0A6D2J2A4_9BRAS/1-147 AC A0A6D2J2A4.1
#=GS A0A6D2HFD0_9BRAS/97-272 AC A0A6D2HFD0.1
#=GS A0A6D2KYX1_9BRAS/52-224 AC A0A6D2KYX1.1
#=GS A0A2J6KUY9_LACSA/18-192 AC A0A2J6KUY9.1
#=GS A0A6D2JJB5_9BRAS/1-133 AC A0A6D2JJB5.1
#=GS A0A6D2JYU9_9BRAS/55-134 AC A0A6D2JYU9.1
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#=GS A0A6D2IKM1_9BRAS/42-178 AC A0A6D2IKM1.1
#=GS A0A803M6M9_CHEQI/11-196 AC A0A803M6M9.1
#=GS A0A6D2IW96_9BRAS/1-102 AC A0A6D2IW96.1
#=GS A0A087GW55_ARAAL/1-172 AC A0A087GW55.1
#=GS A0A392TUD9_9FABA/4-55 AC A0A392TUD9.1
#=GS A0A6D2KVD5_9BRAS/46-368 AC A0A6D2KVD5.1
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#=GS A0A251SF26_HELAN/113-305 AC A0A251SF26.1
#=GS A0A6D2JGI4_9BRAS/79-366 AC A0A6D2JGI4.1
#=GS A0A6D2LAI7_9BRAS/201-431 AC A0A6D2LAI7.1
#=GS A0A6D2K6W9_9BRAS/120-192 AC A0A6D2K6W9.1
#=GS D7MVF6_ARALL/100-300 AC D7MVF6.1
#=GS A0A6D2JN73_9BRAS/26-152 AC A0A6D2JN73.1
#=GS A0A6D2JIR4_9BRAS/3-118 AC A0A6D2JIR4.1
#=GS A0A6D2KEH7_9BRAS/1-96 AC A0A6D2KEH7.1
#=GS A0A6D2K0F4_9BRAS/44-128 AC A0A6D2K0F4.1
#=GS A0A6D2IY82_9BRAS/8-176 AC A0A6D2IY82.1
#=GS A0A6D2I2J4_9BRAS/9-64 AC A0A6D2I2J4.1
#=GS A0A484N267_9ASTE/2-174 AC A0A484N267.1
#=GS A0A5N6LG24_9ASTR/60-236 AC A0A5N6LG24.1
#=GS A0A6D2KNX3_9BRAS/43-244 AC A0A6D2KNX3.1
#=GS A0A6D2IAM9_9BRAS/1-91 AC A0A6D2IAM9.1
#=GS A0A803NCX5_CHEQI/36-327 AC A0A803NCX5.1
#=GS A0A6D2K447_9BRAS/8-371 AC A0A6D2K447.1
#=GS A0A087FZ25_ARAAL/971-1169 AC A0A087FZ25.1
#=GS A0A251V142_HELAN/44-230 AC A0A251V142.1
#=GS A0A6D2KAR5_9BRAS/88-169 AC A0A6D2KAR5.1
#=GS A0A803N3G9_CHEQI/34-117 AC A0A803N3G9.1
#=GS A0A2P5X6Y3_GOSBA/54-216 AC A0A2P5X6Y3.1
#=GS A0A6D2HZ49_9BRAS/14-107 AC A0A6D2HZ49.1
#=GS A0A087FX67_ARAAL/5-107 AC A0A087FX67.1
#=GS A0A565BUR8_9BRAS/35-206 AC A0A565BUR8.1
#=GS A0A0J7YNK8_BETVV/6-123 AC A0A0J7YNK8.1
#=GS A0A6D2HPN9_9BRAS/1-61 AC A0A6D2HPN9.1
#=GS A0A0D3A087_BRAOL/1-68 AC A0A0D3A087.1
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#=GS A0A6D2KVQ8_9BRAS/1-84 AC A0A6D2KVQ8.1
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#=GS A0A6D2K2X7_9BRAS/1-120 AC A0A6D2K2X7.1
#=GS A0A6D2IS91_9BRAS/256-446 AC A0A6D2IS91.1
#=GS A0A6D2J1A1_9BRAS/19-97 AC A0A6D2J1A1.1
#=GS A0A6D2L0N0_9BRAS/77-182 AC A0A6D2L0N0.1
#=GS A0A0D3DLZ9_BRAOL/115-318 AC A0A0D3DLZ9.1
#=GS A0A6D2KB68_9BRAS/5-193 AC A0A6D2KB68.1
#=GS A0A6D2JIK9_9BRAS/89-211 AC A0A6D2JIK9.1
#=GS A0A484MPC0_9ASTE/43-217 AC A0A484MPC0.1
#=GS A0A6D2K4V3_9BRAS/1-157 AC A0A6D2K4V3.1
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#=GS A0A087FZG1_ARAAL/1168-1499 AC A0A087FZG1.1
#=GS A0A251UMM7_HELAN/109-306 AC A0A251UMM7.1
#=GS A0A6D2JW54_9BRAS/78-206 AC A0A6D2JW54.1
#=GS A0A6J0L2R1_RAPSA/163-269 AC A0A6J0L2R1.1
#=GS A0A6D2JGR0_9BRAS/1-226 AC A0A6D2JGR0.1
#=GS A0A6D2JYM2_9BRAS/1-228 AC A0A6D2JYM2.1
#=GS A0A6D2JIQ9_9BRAS/255-337 AC A0A6D2JIQ9.1
#=GS A0A803N0B8_CHEQI/56-229 AC A0A803N0B8.1
#=GS A0A6D2KMH0_9BRAS/358-517 AC A0A6D2KMH0.1
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#=GS A0A392NS86_9FABA/2-171 AC A0A392NS86.1
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#=GS A0A5N6PKR0_9ASTR/43-228 AC A0A5N6PKR0.1
#=GS A0A6D2K6R9_9BRAS/2-113 AC A0A6D2K6R9.1
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#=GS A0A067L2X6_JATCU/45-158 AC A0A067L2X6.1
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#=GS A0A5N6LCG7_9ASTR/13-145 AC A0A5N6LCG7.1
#=GS A0A6D2J344_9BRAS/339-390 AC A0A6D2J344.1
#=GS A0A6D2ICE1_9BRAS/1-237 AC A0A6D2ICE1.1
#=GS A0A2J6JIV6_LACSA/16-138 AC A0A2J6JIV6.1
#=GS A0A6D2KYL1_9BRAS/85-249 AC A0A6D2KYL1.1
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#=GS A0A6D2HU12_9BRAS/30-119 AC A0A6D2HU12.1
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#=GS A0A2P5X9Y2_GOSBA/32-225 AC A0A2P5X9Y2.1
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#=GS A0A6D2IWA7_9BRAS/77-400 AC A0A6D2IWA7.1
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#=GS A0A2P5X922_GOSBA/205-401 AC A0A2P5X922.1
#=GS A0A6D2J7J3_9BRAS/1-76 AC A0A6D2J7J3.1
#=GS A0A5N6LLC8_9ASTR/2-146 AC A0A5N6LLC8.1
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#=GS A0A2P5WIK8_GOSBA/26-235 AC A0A2P5WIK8.1
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