#=GF ID COBRA1
#=GF AC PF06209.17
#=GF DE Cofactor of BRCA1 (COBRA1)
#=GF AU Moxon SJ;0000-0003-4644-1816
#=GF SE Pfam-B_11228 (release 9.0)
#=GF GA 22.00 22.00;
#=GF TC 22.30 22.10;
#=GF NC 21.90 21.80;
#=GF BM hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM hmmsearch -Z 75585367 --cpu 4 -E 1000 HMM pfamseq
#=GF TP Family
#=GF RN [1]
#=GF RM 11739404
#=GF RT BRCA1-induced large-scale chromatin unfolding and
#=GF RT allele-specific effects of cancer-predisposing mutations.
#=GF RA Ye Q, Hu YF, Zhong H, Nye AC, Belmont AS, Li R;
#=GF RL J Cell Biol 2001;155:911-921.
#=GF DR INTERPRO; IPR010405;
#=GF DR SO; 0100021; polypeptide_conserved_region;
#=GF CC This family consists of several cofactor of BRCA1 (COBRA1) like
#=GF CC proteins. It is thought that COBRA1 along with BRCA1 is involved
#=GF CC in chromatin unfolding. COBRA1 is recruited to the chromosome
#=GF CC site by the first BRCT repeat of BRCA1, and is itself sufficient
#=GF CC to induce chromatin unfolding. BRCA1 mutations that enhance
#=GF CC chromatin unfolding also increase its affinity for, and
#=GF CC recruitment of, COBRA1. It is thought that that reorganisation
#=GF CC of higher levels of chromatin structure is an important
#=GF CC regulated step in BRCA1-mediated nuclear functions [1].
#=GF SQ 1305
#=GS A0A7K6J8F3_9CORV/113-456 AC A0A7K6J8F3.1
#=GS A0A2I2ZLS1_GORGO/155-497 AC A0A2I2ZLS1.1
#=GS A0A182YC87_ANOST/113-459 AC A0A182YC87.1
#=GS A0A485P7M6_LYNPA/178-521 AC A0A485P7M6.1
#=GS A0A7N6BL25_ANATE/106-449 AC A0A7N6BL25.1
#=GS A0A1X7SYJ1_AMPQE/98-247 AC A0A1X7SYJ1.1
#=GS A0A851D1R1_CALVR/1-329 AC A0A851D1R1.1
#=GS A0A851XJM0_EOLRO/114-457 AC A0A851XJM0.1
#=GS L5K7F3_PTEAL/198-388 AC L5K7F3.1
#=GS A0A8B9E277_ANSCY/64-407 AC A0A8B9E277.1
#=GS A0A8C1CI27_CYPCA/106-358 AC A0A8C1CI27.1
#=GS A0A154P946_DUFNO/118-471 AC A0A154P946.1
#=GS A0A8C3A882_CYCLU/384-471 AC A0A8C3A882.1
#=GS A0A7K5W870_9SYLV/113-456 AC A0A7K5W870.1
#=GS A0A669E0T1_ORENI/106-139 AC A0A669E0T1.1
#=GS A0A6A5EHX2_PERFL/106-449 AC A0A6A5EHX2.1
#=GS A0A7L3BLT9_PELUR/113-456 AC A0A7L3BLT9.1
#=GS A0A5N5KEA4_PANHP/106-449 AC A0A5N5KEA4.1
#=GS A0A2U3X3R8_ODORO/2-345 AC A0A2U3X3R8.1
#=GS A0A8B9IK54_ANSCY/79-422 AC A0A8B9IK54.1
#=GS T1JW45_TETUR/27-371 AC T1JW45.1
#=GS A0A7K6E0X1_9PASS/110-453 AC A0A7K6E0X1.1
#=GS A0A7K8JX74_9GRUI/112-455 AC A0A7K8JX74.1
#=GS G3NGM4_GASAC/106-449 AC G3NGM4.1
#=GS A0A3S2TK35_CHISP/113-459 AC A0A3S2TK35.1
#=GS A0A0M0JJ60_9EUKA/1073-1184 AC A0A0M0JJ60.1
#=GS A0A168S1Q0_ABSGL/98-432 AC A0A168S1Q0.1
#=GS A0A8C4QQZ5_EPTBU/105-270 AC A0A8C4QQZ5.1
#=GS A0A0P7TD13_SCLFO/1-85 AC A0A0P7TD13.1
#=GS A0A3P9CT27_9CICH/106-449 AC A0A3P9CT27.1
#=GS A0A2K5RJW0_CEBIM/225-568 AC A0A2K5RJW0.1
#=GS A0A3P9PCZ6_POERE/106-449 AC A0A3P9PCZ6.1
#=GS A0A811XT46_NYCPR/107-450 AC A0A811XT46.1
#=GS A0A852HKB5_9PASS/113-456 AC A0A852HKB5.1
#=GS F6XUA1_CIOIN/104-478 AC F6XUA1.2
#=GS A0A8C2U7G2_COTJA/131-474 AC A0A8C2U7G2.1
#=GS A0A6J2MIW9_9CHIR/107-450 AC A0A6J2MIW9.1
#=GS A0A7L4MC69_GLAPT/114-457 AC A0A7L4MC69.1
#=GS A0A2K5XFN4_MANLE/97-440 AC A0A2K5XFN4.1
#=GS A0A1S2ZMB8_ERIEU/107-450 AC A0A1S2ZMB8.1
#=GS A0A452S6P7_URSAM/155-401 AC A0A452S6P7.1
#=GS R7V163_CAPTE/118-182 AC R7V163.1
#=GS A0A7K7U7I6_9CHAR/114-457 AC A0A7K7U7I6.1
#=GS A0A0Q3PTD4_AMAAE/107-450 AC A0A0Q3PTD4.1
#=GS A0A7K6C2I3_PTIVI/113-371 AC A0A7K6C2I3.1
#=GS A0A671NU06_9TELE/178-521 AC A0A671NU06.1
#=GS Q018S9_OSTTA/126-206 AC Q018S9.1
#=GS A0A0V1L543_9BILA/107-446 AC A0A0V1L543.1
#=GS M3W221_FELCA/107-450 AC M3W221.3
#=GS A0A226NGZ1_CALSU/334-418 AC A0A226NGZ1.1
#=GS A0A2T9YSK0_9FUNG/129-393 AC A0A2T9YSK0.1
#=GS A0A7L1PYK5_ORIOR/113-456 AC A0A7L1PYK5.1
#=GS A0A068RU59_9FUNG/96-422 AC A0A068RU59.1
#=GS A0A852D2H0_PASAF/113-456 AC A0A852D2H0.1
#=GS A0A851J7X5_9PASS/113-456 AC A0A851J7X5.1
#=GS A0A835XVQ2_9CHLO/119-197 AC A0A835XVQ2.1
#=GS NELFB_DROME/116-462 AC Q9Y113.1
#=GS A0A2P8YEC4_BLAGE/297-343 AC A0A2P8YEC4.1
#=GS A0A1I7SBH2_BURXY/115-461 AC A0A1I7SBH2.1
#=GS A0A087TDU6_STEMI/105-451 AC A0A087TDU6.1
#=GS A0A7L4LA54_9CORV/113-456 AC A0A7L4LA54.1
#=GS A0A0L0DKN7_THETB/206-422 AC A0A0L0DKN7.1
#=GS H3C5F1_TETNG/74-415 AC H3C5F1.1
#=GS A0A850ZSP3_SULDA/113-456 AC A0A850ZSP3.1
#=GS A0A8C8JLY5_ONCTS/95-425 AC A0A8C8JLY5.1
#=GS G3VZH1_SARHA/107-450 AC G3VZH1.2
#=GS A0A836JXC8_9HYME/118-471 AC A0A836JXC8.1
#=GS F2UII8_SALR5/140-224 AC F2UII8.1
#=GS A0A183CVC6_9BILA/38-111 AC A0A183CVC6.1
#=GS A0A091ML75_CARIC/104-447 AC A0A091ML75.1
#=GS A0A553P1I6_TIGCA/175-520 AC A0A553P1I6.1
#=GS A0A833S509_9HYME/118-471 AC A0A833S509.1
#=GS A0A7K4S6P5_COLPI/113-456 AC A0A7K4S6P5.1
#=GS A0A8C9L8T6_PAVCR/246-401 AC A0A8C9L8T6.1
#=GS B4K7Y5_DROMO/113-459 AC B4K7Y5.1
#=GS A0A0L7LM83_OPEBR/113-459 AC A0A0L7LM83.1
#=GS A0A6P6YA80_DERPT/459-805 AC A0A6P6YA80.1
#=GS A0A2V0NPC8_9CHLO/389-501 AC A0A2V0NPC8.1
#=GS A0A8C8JMM7_ONCTS/99-429 AC A0A8C8JMM7.1
#=GS A0A4P9YXS3_9FUNG/4-334 AC A0A4P9YXS3.1
#=GS A0A8J6JRW3_ELECQ/1-73 AC A0A8J6JRW3.1
#=GS A0A7K6N183_PEDTO/75-418 AC A0A7K6N183.1
#=GS A0A482VM65_9CUCU/43-389 AC A0A482VM65.1
#=GS A0A2P4SJP5_BAMTH/1-35 AC A0A2P4SJP5.1
#=GS F7AIV3_ORNAN/107-450 AC F7AIV3.2
#=GS A0A452S6M1_URSAM/155-402 AC A0A452S6M1.1
#=GS A0A6G0IJA0_LARCR/106-449 AC A0A6G0IJA0.1
#=GS B4IHN7_DROSE/114-460 AC B4IHN7.1
#=GS A0A6J0UVV9_9SAUR/107-450 AC A0A6J0UVV9.1
#=GS A0A1D2NI74_ORCCI/141-487 AC A0A1D2NI74.1
#=GS A0A8D2NXY8_ZOSLA/138-425 AC A0A8D2NXY8.1
#=GS A0A3Q0ITT1_DIACI/355-404 AC A0A3Q0ITT1.1
#=GS A0A3P7MMX9_CYLGO/33-171 AC A0A3P7MMX9.1
#=GS A0A6H5KMY2_9PHAE/152-278 AC A0A6H5KMY2.1
#=GS A0A1X7SYJ1_AMPQE/238-351 AC A0A1X7SYJ1.1
#=GS A0A7J7AP95_9COLE/110-456 AC A0A7J7AP95.1
#=GS A0A1R1YEQ3_9FUNG/128-388 AC A0A1R1YEQ3.1
#=GS A0A673ILT9_9TELE/123-466 AC A0A673ILT9.1
#=GS A0A1X2J0D5_9FUNG/98-427 AC A0A1X2J0D5.1
#=GS A0A384A6D6_BALAS/107-263 AC A0A384A6D6.1
#=GS A0A0V1L6L0_9BILA/170-392 AC A0A0V1L6L0.1
#=GS A0A8C9P553_SPEDA/141-487 AC A0A8C9P553.1
#=GS NELFB_HUMAN/107-450 AC Q8WX92.1
#=GS A0A8C4HRQ8_DICLA/106-443 AC A0A8C4HRQ8.1
#=GS A0A669DBC8_ORENI/373-471 AC A0A669DBC8.1
#=GS A0A6J2WTC5_CHACN/106-449 AC A0A6J2WTC5.1
#=GS N6TV53_DENPD/113-459 AC N6TV53.1
#=GS A0A1A6GS37_NEOLE/107-443 AC A0A1A6GS37.1
#=GS A0A7L2JUI5_CINMU/113-456 AC A0A7L2JUI5.1
#=GS A0A7L1UZD5_SITEU/112-455 AC A0A7L1UZD5.1
#=GS H3CF91_TETNG/106-449 AC H3CF91.1
#=GS B4MAE6_DROVI/112-458 AC B4MAE6.2
#=GS A0A6H5IIQ6_9HYME/117-470 AC A0A6H5IIQ6.1
#=GS A0A8J6DQZ4_GALPY/249-592 AC A0A8J6DQZ4.1
#=GS A0A6G0WE44_9STRA/94-302 AC A0A6G0WE44.1
#=GS A0A3P7P558_DIBLA/392-464 AC A0A3P7P558.1
#=GS A0A851MVQ4_9DEND/74-417 AC A0A851MVQ4.1
#=GS A0A5N5SQZ2_9CRUS/1-97 AC A0A5N5SQZ2.1
#=GS A0A226PKQ4_COLVI/334-418 AC A0A226PKQ4.1
#=GS A0A8J4WKQ5_9TREM/108-243 AC A0A8J4WKQ5.1
#=GS A0A6Q2Y4R1_ESOLU/106-268 AC A0A6Q2Y4R1.1
#=GS A0A7M7KV31_VARDE/102-293 AC A0A7M7KV31.1
#=GS A0A0K0E3U8_STRER/113-479 AC A0A0K0E3U8.1
#=GS A0A671S7R3_9TELE/121-464 AC A0A671S7R3.1
#=GS A0A8B9X8V0_BOSMU/158-271 AC A0A8B9X8V0.1
#=GS F6V4I3_HORSE/107-470 AC F6V4I3.2
#=GS A0A3P8T9J0_AMPPE/106-449 AC A0A3P8T9J0.1
#=GS A0A672ZVF4_9TELE/106-338 AC A0A672ZVF4.1
#=GS A0A7L0AWU6_9AVES/75-418 AC A0A7L0AWU6.1
#=GS A0A8J4F7S5_9CHLO/447-572 AC A0A8J4F7S5.1
#=GS A0A150GPS5_GONPE/304-424 AC A0A150GPS5.1
#=GS A0A3Q3MSB2_9TELE/106-462 AC A0A3Q3MSB2.2
#=GS Q32NK8_XENLA/107-450 AC Q32NK8.1
#=GS A0A5K4FE84_SCHMA/314-384 AC A0A5K4FE84.1
#=GS A0A4W2BSJ9_BOBOX/158-499 AC A0A4W2BSJ9.1
#=GS A0A7K5J2N0_TOXRE/113-456 AC A0A7K5J2N0.1
#=GS A0A2Z6Q3B9_9GLOM/110-479 AC A0A2Z6Q3B9.1
#=GS A0A7K5TZJ8_CEPOR/113-456 AC A0A7K5TZJ8.1
#=GS A0A8I3PHJ8_CANLF/107-450 AC A0A8I3PHJ8.1
#=GS K7GCD0_PELSI/2-345 AC K7GCD0.1
#=GS A0A8C9XKR8_SANLU/106-381 AC A0A8C9XKR8.1
#=GS A0A1V9ZPX2_9STRA/106-307 AC A0A1V9ZPX2.1
#=GS A0A2T7NLR3_POMCA/105-444 AC A0A2T7NLR3.1
#=GS A0A7K4WJN5_9TYRA/113-456 AC A0A7K4WJN5.1
#=GS A0A7K8MGF8_9CORV/112-455 AC A0A7K8MGF8.1
#=GS A0A8J5V904_9HYME/275-418 AC A0A8J5V904.1
#=GS A0A7K7R9W2_9PASS/113-226 AC A0A7K7R9W2.1
#=GS A0A8C7IZQ4_ONCKI/106-457 AC A0A8C7IZQ4.1
#=GS A0A665W4G7_ECHNA/106-450 AC A0A665W4G7.1
#=GS A0A168NCU2_MUCCL/100-429 AC A0A168NCU2.1
#=GS A0A2P6V340_9CHLO/122-335 AC A0A2P6V340.1
#=GS A0A7L2ZSU5_9PASE/113-456 AC A0A7L2ZSU5.1
#=GS A0A7L1IEL4_SMUAF/112-455 AC A0A7L1IEL4.1
#=GS A0A671YSA3_SPAAU/106-446 AC A0A671YSA3.1
#=GS A0A0V1I1D8_9BILA/107-452 AC A0A0V1I1D8.1
#=GS A0A663EUU6_AQUCH/107-450 AC A0A663EUU6.1
#=GS A0A852FD78_PEUTA/113-456 AC A0A852FD78.1
#=GS A0A183S7V1_SCHSO/98-246 AC A0A183S7V1.1
#=GS A0A7L3NSJ2_9AVES/50-393 AC A0A7L3NSJ2.1
#=GS A0A8J4BR10_9CHLO/283-404 AC A0A8J4BR10.1
#=GS A0A5A9P3L1_9TELE/106-449 AC A0A5A9P3L1.1
#=GS A0A093GVK0_GAVST/75-418 AC A0A093GVK0.1
#=GS A0A4Y2THK6_ARAVE/105-179 AC A0A4Y2THK6.1
#=GS A0A673V8X2_SURSU/155-498 AC A0A673V8X2.1
#=GS A0A1I7VW20_LOALO/116-468 AC A0A1I7VW20.1
#=GS A0A1Y2GW95_9FUNG/98-436 AC A0A1Y2GW95.1
#=GS A0A4W5QLP0_9TELE/106-438 AC A0A4W5QLP0.1
#=GS A0A8C4NTI6_DICLA/133-476 AC A0A8C4NTI6.1
#=GS A0A6V7U6Z3_9BILA/124-425 AC A0A6V7U6Z3.1
#=GS A0A8C4STR2_ERPCA/106-449 AC A0A8C4STR2.1
#=GS A0A671YU52_SPAAU/125-468 AC A0A671YU52.1
#=GS A0A0R3WNR7_HYDTA/278-352 AC A0A0R3WNR7.1
#=GS A0A1X7UNQ6_AMPQE/98-434 AC A0A1X7UNQ6.1
#=GS A0A8C4PQT8_EQUAS/96-437 AC A0A8C4PQT8.1
#=GS A0A7K5C0X2_MOTAL/112-455 AC A0A7K5C0X2.1
#=GS A0A7R8V0T2_HERIL/113-459 AC A0A7R8V0T2.1
#=GS A0A0R3UKW4_MESCO/289-376 AC A0A0R3UKW4.1
#=GS A0A6J1QDW0_9HYME/118-471 AC A0A6J1QDW0.1
#=GS A0A8H3WW77_GIGMA/87-446 AC A0A8H3WW77.1
#=GS A0A7K7CE00_APHCE/113-456 AC A0A7K7CE00.1
#=GS A0A7K7P9C6_ACRAR/113-456 AC A0A7K7P9C6.1
#=GS A0A8C3PX25_CHRPC/107-450 AC A0A8C3PX25.1
#=GS A0A250WQ75_9CHLO/265-386 AC A0A250WQ75.1
#=GS A0A384A6D6_BALAS/458-637 AC A0A384A6D6.1
#=GS A0A7L1RRX7_9PASS/113-456 AC A0A7L1RRX7.1
#=GS A0A7K8J594_9PASS/113-456 AC A0A7K8J594.1
#=GS A0A2K5IS68_COLAP/118-437 AC A0A2K5IS68.1
#=GS A0A8C6P3K6_NOTFU/106-449 AC A0A8C6P3K6.1
#=GS A0A8C7XF42_9TELE/106-468 AC A0A8C7XF42.1
#=GS A0A2U3V524_TURTR/107-450 AC A0A2U3V524.1
#=GS A0A553QTQ8_9TELE/106-433 AC A0A553QTQ8.1
#=GS A0A4W6G3C2_LATCA/106-449 AC A0A4W6G3C2.1
#=GS A0A7K7M0S4_9PASS/113-456 AC A0A7K7M0S4.1
#=GS A0A2S2PYE5_9HEMI/118-464 AC A0A2S2PYE5.1
#=GS A0A3Q1I024_ANATE/106-449 AC A0A3Q1I024.2
#=GS A0A183B522_9TREM/61-212 AC A0A183B522.1
#=GS A0A096NWN1_PAPAN/248-591 AC A0A096NWN1.3
#=GS A0A8C6P3E4_NOTFU/106-449 AC A0A8C6P3E4.1
#=GS A0A3B3D2B9_ORYME/106-449 AC A0A3B3D2B9.1
#=GS A0A6A0GSY4_HYAAZ/107-453 AC A0A6A0GSY4.1
#=GS L8YDR5_TUPCH/238-425 AC L8YDR5.1
#=GS A0A7L4BJB2_9CHAR/113-456 AC A0A7L4BJB2.1
#=GS A0A7K8TL41_OCEOC/113-456 AC A0A7K8TL41.1
#=GS A0A668UMS8_OREAU/106-449 AC A0A668UMS8.1
#=GS A0A8C5Q187_9ANUR/107-450 AC A0A8C5Q187.1
#=GS A0A7K8AHF2_9CORV/113-456 AC A0A7K8AHF2.1
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