#=GF ID Caps_synth
#=GF AC PF05704.16
#=GF DE Capsular polysaccharide synthesis protein
#=GF AU Moxon SJ;0000-0003-4644-1816
#=GF SE Pfam-B_7575 (release 8.0)
#=GF GA 24.50 24.50;
#=GF TC 24.50 24.50;
#=GF NC 24.40 24.40;
#=GF BM hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM hmmsearch --cpu 4 -Z 75585367 -E 1000 HMM pfamseq
#=GF TP Family
#=GF CL CL0110
#=GF RN [1]
#=GF RM 11179285
#=GF RT Molecular characterization of Streptococcus pneumoniae type 4,
#=GF RT 6B, 8, and 18C capsular polysaccharide gene clusters.
#=GF RA Jiang SM, Wang L, Reeves PR;
#=GF RL Infect Immun 2001;69:1244-1255.
#=GF RN [2]
#=GF RM 9838125
#=GF RT Molecular structure of the gene cluster responsible for the
#=GF RT synthesis of the polysaccharide capsule of Streptococcus
#=GF RT pneumoniae type 33F.
#=GF RA Llull D, Lopez R, Garcia E, Munoz R;
#=GF RL Biochim Biophys Acta 1998;1443:217-224.
#=GF RN [3]
#=GF RM 10688204
#=GF RT The genome sequence of the food-borne pathogen Campylobacter
#=GF RT jejuni reveals hypervariable sequences.
#=GF RA Parkhill J, Wren BW, Mungall K, Ketley JM, Churcher C, Basham D,
#=GF RA Chillingworth T, Davies RM, Feltwell T, Holroyd S, Jagels K,
#=GF RA Karlyshev AV, Moule S, Pallen MJ, Penn CW, Quail MA, Rajandream
#=GF RA MA, Rutherford KM, van Vliet AH, Whitehead S, Barrell BG;
#=GF RL Nature 2000;403:665-668.
#=GF RN [4]
#=GF RM 7752885
#=GF RT Region II of the Haemophilus influenzae type be capsulation
#=GF RT locus is involved in serotype-specific polysaccharide synthesis.
#=GF RA Van Eldere J, Brophy L, Loynds B, Celis P, Hancock I, Carman S,
#=GF RA Kroll JS, Moxon ER;
#=GF RL Mol Microbiol 1995;15:107-118.
#=GF RN [5]
#=GF RM 10094675
#=GF RT acs1 of Haemophilus influenzae type a capsulation locus region
#=GF RT II encodes a bifunctional ribulose 5-phosphate reductase-
#=GF RT CDP-ribitol pyrophosphorylase.
#=GF RA Follens A, Veiga-da-Cunha M, Merckx R, van Schaftingen E, van
#=GF RA Eldere J;
#=GF RL J Bacteriol 1999;181:2001-2007.
#=GF DR INTERPRO; IPR008441;
#=GF DR SO; 0100021; polypeptide_conserved_region;
#=GF CC This family consists of several capsular polysaccharide
#=GF CC proteins. Capsular polysaccharide (CPS) is a major virulence
#=GF CC factor in Streptococcus pneumoniae [1].
#=GF SQ 1093
#=GS A0A7D8UHM2_9HELO/12-208 AC A0A7D8UHM2.1
#=GS K9AHD3_9MICO/76-305 AC K9AHD3.1
#=GS A0A7K1J605_9BIFI/1-208 AC A0A7K1J605.1
#=GS R9NBX5_9FIRM/112-381 AC R9NBX5.1
#=GS A0A3R7LXP9_9EURO/19-213 AC A0A3R7LXP9.1
#=GS A0A423VP32_9PEZI/3-226 AC A0A423VP32.1
#=GS A0A3D8QPE8_9HELO/12-211 AC A0A3D8QPE8.1
#=GS A0A072P9D3_9EURO/24-206 AC A0A072P9D3.1
#=GS A0A068FKS3_9VIRU/2744-2929 AC A0A068FKS3.1
#=GS A0A542XE28_9MICO/25-123 AC A0A542XE28.1
#=GS A9BR13_DELAS/48-206 AC A9BR13.1
#=GS A0A1Q9C657_SYMMI/172-349 AC A0A1Q9C657.1
#=GS A0A086T426_ACRC1/31-259 AC A0A086T426.1
#=GS A0A8H7ARV8_9EURO/35-226 AC A0A8H7ARV8.1
#=GS G9NW02_HYPAI/3-186 AC G9NW02.1
#=GS A0A8H4EAA6_9EURO/10-197 AC A0A8H4EAA6.1
#=GS M2SJA2_COCH5/22-209 AC M2SJA2.1
#=GS A0A165DA79_EXIGL/25-210 AC A0A165DA79.1
#=GS A0A813HU02_POLGL/301-503 AC A0A813HU02.1
#=GS A0A428QAT7_9HYPO/14-219 AC A0A428QAT7.1
#=GS A0A0Q5LF24_9BURK/60-273 AC A0A0Q5LF24.1
#=GS A0A3N2N9I8_9BACT/35-308 AC A0A3N2N9I8.1
#=GS A0A1N6YBU0_9SPHI/173-281 AC A0A1N6YBU0.1
#=GS U1GL48_ENDPU/40-233 AC U1GL48.1
#=GS A0A8H4T6E6_9HYPO/13-256 AC A0A8H4T6E6.1
#=GS A3JXN9_9RHOB/2-147 AC A3JXN9.1
#=GS A0A5C8ZLS7_9GAMM/1-156 AC A0A5C8ZLS7.1
#=GS A0A1X1Q9H2_9FIRM/38-313 AC A0A1X1Q9H2.1
#=GS A0A4Z1KC91_9HELO/24-210 AC A0A4Z1KC91.1
#=GS A0A7C8MX73_9PEZI/26-245 AC A0A7C8MX73.1
#=GS F0F886_9BACT/43-314 AC F0F886.1
#=GS A0A263HDT6_9PAST/1-66 AC A0A263HDT6.1
#=GS A0A087DSZ2_9BIFI/44-326 AC A0A087DSZ2.1
#=GS A0A543EDM4_9MICO/70-304 AC A0A543EDM4.1
#=GS A0A1T4PDN9_9SPIR/11-310 AC A0A1T4PDN9.1
#=GS A0A165DXX9_EXIGL/4-186 AC A0A165DXX9.1
#=GS A0A178ATN7_9PLEO/34-210 AC A0A178ATN7.1
#=GS A0A317WAI0_9EURO/42-127 AC A0A317WAI0.1
#=GS A0A812RV95_9DINO/69-255 AC A0A812RV95.1
#=GS A0A2T3ZXS9_TRIHA/6-241 AC A0A2T3ZXS9.1
#=GS A0A0D1YVF6_9PEZI/40-247 AC A0A0D1YVF6.1
#=GS A0A7X4RVS2_9VIBR/40-231 AC A0A7X4RVS2.1
#=GS A0A849L6N3_9RHOB/70-118 AC A0A849L6N3.1
#=GS A0A0U1Q3C1_9BURK/26-182 AC A0A0U1Q3C1.1
#=GS D0GIA3_9FUSO/42-333 AC D0GIA3.1
#=GS A0A1S9CTI1_9FIRM/153-426 AC A0A1S9CTI1.1
#=GS A0A1E1LQD5_9HELO/28-217 AC A0A1E1LQD5.1
#=GS A0A2R5GP00_9STRA/352-450 AC A0A2R5GP00.1
#=GS A0A7S8IKM7_9HYPH/30-299 AC A0A7S8IKM7.1
#=GS A0A318ZED0_9EURO/37-223 AC A0A318ZED0.1
#=GS A0A177D534_ALTAL/7-205 AC A0A177D534.1
#=GS A0A8B6DEV0_MYTGA/5-235 AC A0A8B6DEV0.1
#=GS A0A319DEU6_9EURO/23-210 AC A0A319DEU6.1
#=GS A0A6P1LZW9_9BACT/32-303 AC A0A6P1LZW9.1
#=GS A0A5D0RKP8_9RHOB/91-319 AC A0A5D0RKP8.1
#=GS A0A0L0N818_TOLOC/23-211 AC A0A0L0N818.1
#=GS A0A1H5VBB5_9FIRM/30-306 AC A0A1H5VBB5.1
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#=GS A0A0M0K5D5_9EUKA/99-241 AC A0A0M0K5D5.1
#=GS M7SDL7_EUTLA/101-208 AC M7SDL7.1
#=GS A0A0N7IE11_9VIRU/2755-3014 AC A0A0N7IE11.1
#=GS A0A7C8NDL8_9PEZI/33-222 AC A0A7C8NDL8.1
#=GS A0A1Q9F489_SYMMI/718-824 AC A0A1Q9F489.1
#=GS Q4WDN8_ASPFU/13-196 AC Q4WDN8.1
#=GS A0A1Y6CU87_9GAMM/1-236 AC A0A1Y6CU87.1
#=GS A0A812JP57_9DINO/116-270 AC A0A812JP57.1
#=GS A0A178Z4R5_9EURO/12-232 AC A0A178Z4R5.1
#=GS A0A178BBG8_9PLEO/13-205 AC A0A178BBG8.1
#=GS A0A430F6C1_9BIFI/53-299 AC A0A430F6C1.1
#=GS A0A1Y4NL82_9FIRM/30-301 AC A0A1Y4NL82.1
#=GS A0A812NML6_9DINO/16-180 AC A0A812NML6.1
#=GS A0A1E1KZK7_9HELO/24-219 AC A0A1E1KZK7.1
#=GS A0A165LZX2_EXIGL/24-152 AC A0A165LZX2.1
#=GS A0A0E9NPJ7_SAICN/600-655 AC A0A0E9NPJ7.1
#=GS A0A366W9X2_9GAMM/1-88 AC A0A366W9X2.1
#=GS A0A5J5DY53_9BIFI/49-332 AC A0A5J5DY53.1
#=GS N8VYI5_9GAMM/8-198 AC N8VYI5.1
#=GS A0A1C1CIC0_9EURO/8-244 AC A0A1C1CIC0.1
#=GS A0A2S7NLL2_9HELO/22-209 AC A0A2S7NLL2.1
#=GS N0APJ9_9BACI/1-146 AC N0APJ9.1
#=GS A0A1R3R5U4_ASPC5/16-209 AC A0A1R3R5U4.1
#=GS C4IDA9_CLOBU/22-310 AC C4IDA9.1
#=GS A0A432ZCN0_9GAMM/64-290 AC A0A432ZCN0.1
#=GS A0A239RLG9_9BACT/4-277 AC A0A239RLG9.1
#=GS A0A812PFT7_9DINO/14-176 AC A0A812PFT7.1
#=GS A0A8H3WJG5_9PEZI/6-237 AC A0A8H3WJG5.1
#=GS A0A6H0Y321_9PEZI/33-221 AC A0A6H0Y321.1
#=GS A0A8H2W508_9HELO/27-210 AC A0A8H2W508.1
#=GS A0A2P6N966_9EUKA/12-213 AC A0A2P6N966.1
#=GS A0A4Q4ZQ38_9PEZI/34-226 AC A0A4Q4ZQ38.1
#=GS G0RW05_HYPJQ/36-221 AC G0RW05.1
#=GS A0A812MKI9_SYMPI/3-174 AC A0A812MKI9.1
#=GS A0A2P4ZF74_9HYPO/32-222 AC A0A2P4ZF74.1
#=GS A0A1V6TB57_9EURO/17-215 AC A0A1V6TB57.1
#=GS A0A1L9WRV9_ASPA1/14-206 AC A0A1L9WRV9.1
#=GS A0A4P6YW22_9LACO/18-293 AC A0A4P6YW22.1
#=GS A0A428MMC7_9BACT/1001-1148 AC A0A428MMC7.1
#=GS A0A4Q3YSA5_9RHOB/98-338 AC A0A4Q3YSA5.1
#=GS A0A1I3P2K8_9PLAN/173-308 AC A0A1I3P2K8.1
#=GS A0A2S7PFS6_9HELO/20-208 AC A0A2S7PFS6.1
#=GS A0A8H8TVX0_9HELO/9-200 AC A0A8H8TVX0.1
#=GS A0A3D8R2A7_9HELO/23-207 AC A0A3D8R2A7.1
#=GS A0A2T4B847_9HYPO/26-221 AC A0A2T4B847.1
#=GS E1SCB4_PANVC/41-201 AC E1SCB4.1
#=GS A0A812YTX6_9DINO/69-242 AC A0A812YTX6.1
#=GS A0A166YPT2_9PEZI/12-206 AC A0A166YPT2.1
#=GS A0A094A1Z5_9PEZI/16-209 AC A0A094A1Z5.1
#=GS A0A364KNY4_9EURO/7-205 AC A0A364KNY4.1
#=GS A0A553I636_9PEZI/35-223 AC A0A553I636.1
#=GS A0A2T4ACM7_TRIHA/7-205 AC A0A2T4ACM7.1
#=GS A0A415CEL9_9BURK/31-132 AC A0A415CEL9.1
#=GS A0A1V8T5V7_9PEZI/14-211 AC A0A1V8T5V7.1
#=GS A0A812PZF8_9DINO/37-219 AC A0A812PZF8.1
#=GS A0A4S5BQ57_9BURK/32-209 AC A0A4S5BQ57.1
#=GS A0A165DXV3_EXIGL/22-213 AC A0A165DXV3.1
#=GS A0A066WXA9_COLSU/32-245 AC A0A066WXA9.1
#=GS A0A0F9X5T8_TRIHA/14-265 AC A0A0F9X5T8.1
#=GS A0A828RRG0_9FIRM/1-250 AC A0A828RRG0.1
#=GS A0A0A6ULS4_ACTUT/346-596 AC A0A0A6ULS4.1
#=GS A0A1B8DXT7_9PEZI/19-208 AC A0A1B8DXT7.1
#=GS R5ZBB7_9CLOT/22-307 AC R5ZBB7.1
#=GS A0A2S7Q816_9HELO/16-204 AC A0A2S7Q816.1
#=GS A0A8H4SX94_9HYPO/23-238 AC A0A8H4SX94.1
#=GS A0A1S9CTC8_9FIRM/154-430 AC A0A1S9CTC8.1
#=GS A0A1V6RD13_9EURO/21-203 AC A0A1V6RD13.1
#=GS A0A2S2FAU6_9GAMM/37-327 AC A0A2S2FAU6.1
#=GS E3G988_ENTLS/13-297 AC E3G988.1
#=GS A0A4Q4VDQ1_9PEZI/31-228 AC A0A4Q4VDQ1.1
#=GS Q0P9B7_CAMJE/28-327 AC Q0P9B7.1
#=GS A0A5P2G627_9BACT/25-280 AC A0A5P2G627.1
#=GS A0A420YBT8_9PEZI/28-213 AC A0A420YBT8.1
#=GS A0A1J9S211_9PEZI/24-212 AC A0A1J9S211.1
#=GS A0A2J7ZGT6_9CHLO/37-236 AC A0A2J7ZGT6.1
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#=GS W6RX20_9CLOT/29-301 AC W6RX20.1
#=GS A0A139IKX2_9PEZI/16-205 AC A0A139IKX2.1
#=GS A0A1W2TX09_ROSNE/44-237 AC A0A1W2TX09.1
#=GS A0A0R1ZI74_9LACO/5-283 AC A0A0R1ZI74.1
#=GS A0A3M2T692_9EURO/19-221 AC A0A3M2T692.1
#=GS R5QJW0_9FIRM/185-480 AC R5QJW0.1
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#=GS A0A4Z0YCW2_9PEZI/26-242 AC A0A4Z0YCW2.1
#=GS A0A0U1M0V4_TALIS/12-218 AC A0A0U1M0V4.1
#=GS A0A812JVZ0_9DINO/59-231 AC A0A812JVZ0.1
#=GS G4CKK7_9NEIS/307-596 AC G4CKK7.1
#=GS C7NDZ8_LEPBD/15-329 AC C7NDZ8.1
#=GS A0A1Q9JSS0_9FIRM/48-327 AC A0A1Q9JSS0.1
#=GS A0A813HYK3_POLGL/357-614 AC A0A813HYK3.1
#=GS A0A2T3AEA2_9PEZI/19-218 AC A0A2T3AEA2.1
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#=GS W5II64_SCAIO/35-317 AC W5II64.1
#=GS A0A2W6MWP3_9HELI/1-183 AC A0A2W6MWP3.1
#=GS A0A813FKP1_POLGL/1-210 AC A0A813FKP1.1
#=GS V5FWM7_BYSSN/9-206 AC V5FWM7.1
#=GS A0A1L9PFT1_ASPVE/2-204 AC A0A1L9PFT1.1
#=GS A0A3N6RM31_9CYAN/1-150 AC A0A3N6RM31.1
#=GS A0A6G8BW29_9BURK/26-255 AC A0A6G8BW29.1
#=GS A0A1Y4HVB6_9ACTN/39-304 AC A0A1Y4HVB6.1
#=GS A0A1I0RNA7_9FIRM/32-303 AC A0A1I0RNA7.1
#=GS A0A507R2W2_MONPU/25-208 AC A0A507R2W2.1
#=GS A0A8H4TV27_9HYPO/9-204 AC A0A8H4TV27.1
#=GS A0A0M0JK83_9EUKA/154-311 AC A0A0M0JK83.1
#=GS A0A1M7Y261_9DELT/2-159 AC A0A1M7Y261.1
#=GS C7DD67_9RHOB/1-175 AC C7DD67.1
#=GS A0A2S4L062_9HYPO/22-206 AC A0A2S4L062.1
#=GS A0A2J7ZMU2_9CHLO/48-222 AC A0A2J7ZMU2.1
#=GS A0A8H5ZXU1_ASPBU/12-198 AC A0A8H5ZXU1.1
#=GS F3Y9W0_MELPT/28-109 AC F3Y9W0.1
#=GS A0A1B8D4C4_9PEZI/275-475 AC A0A1B8D4C4.1
#=GS A0A0U5G345_ASPCI/21-205 AC A0A0U5G345.1
#=GS A0A4R8QXN2_COLTR/28-250 AC A0A4R8QXN2.1
#=GS A0A093WZK5_9PEZI/18-208 AC A0A093WZK5.1
#=GS A0A8H7CE39_9AGAR/8-203 AC A0A8H7CE39.1
#=GS A0A1I6VAL7_9SPHI/35-140 AC A0A1I6VAL7.1
#=GS A0A813D7M3_POLGL/112-222 AC A0A813D7M3.1
#=GS A0A2A3K0S2_9RHOB/63-228 AC A0A2A3K0S2.1
#=GS A0A1L7XGI3_9HELO/5-206 AC A0A1L7XGI3.1
#=GS A0A2N9QVY2_9PHYC/29-192 AC A0A2N9QVY2.1
#=GS A0A2V1DGW0_9PLEO/21-227 AC A0A2V1DGW0.1
#=GS A0A7H8R1S1_9EURO/11-208 AC A0A7H8R1S1.1
#=GS B8LDK7_THAPS/148-339 AC B8LDK7.1
#=GS A0A0Q9IXE0_9HYPH/1-153 AC A0A0Q9IXE0.1
#=GS A0A1Q9ECZ7_SYMMI/552-725 AC A0A1Q9ECZ7.1
#=GS A0A150V419_9PEZI/15-204 AC A0A150V419.1
#=GS A0A2J7ZGZ6_9CHLO/1-139 AC A0A2J7ZGZ6.1
#=GS A0A139HD86_9PEZI/17-224 AC A0A139HD86.1
#=GS A0A1Q9DN42_SYMMI/8-112 AC A0A1Q9DN42.1
#=GS A0A4Q4W4C7_9PEZI/32-153 AC A0A4Q4W4C7.1
#=GS A0A179V0Q3_BLAGS/12-108 AC A0A179V0Q3.1
#=GS A0A085JA76_9GAMM/41-206 AC A0A085JA76.1
#=GS A0A2J8A1P3_9CHLO/27-216 AC A0A2J8A1P3.1
#=GS A0A075AXQ4_ROZAC/1-248 AC A0A075AXQ4.1
#=GS A0A812Q7I7_9DINO/30-184 AC A0A812Q7I7.1
#=GS A0A1V1TNH0_9FUNG/23-252 AC A0A1V1TNH0.1
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