#=GF ID DNA_ligase_C
#=GF AC PF17879.5
#=GF DE DNA ligase C-terminal domain
#=GF AU El-Gebali S;0000-0003-1378-5495
#=GF SE ECOD:EUF00596
#=GF GA 25.00 25.00;
#=GF TC 25.10 25.80;
#=GF NC 24.50 24.70;
#=GF BM hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM hmmsearch --cpu 4 -Z 75585367 -E 1000 HMM pfamseq
#=GF TP Domain
#=GF CL CL0021
#=GF RN [1]
#=GF RM 8653795
#=GF RT Crystal structure of an ATP-dependent DNA ligase from
#=GF RT bacteriophage T7.
#=GF RA Subramanya HS, Doherty AJ, Ashford SR, Wigley DB;
#=GF RL Cell 1996;85:607-615.
#=GF DR INTERPRO; IPR041559;
#=GF DR SO; 0000417; polypeptide_domain;
#=GF CC This is the C-terminal domain found in ATP-Dependent DNA Ligase
#=GF CC from Bacteriophage T7. This domain has no ligase activity,
#=GF CC however together with the N-terminal domain they bind to
#=GF CC double-stranded DNA consistent with the idea that the
#=GF CC DNA-binding site is between the domains in the intact protein.
#=GF CC Furthermore, although the fold of domain 2 is very similar to a
#=GF CC number of other proteins that bind single-stranded DNA, this
#=GF CC domain does not bind to single-stranded DNA but instead has a
#=GF CC high affinity for double-stranded DNA [1].
#=GF SQ 158
#=GS A0A2H1UJF2_9CAUD/248-353 AC A0A2H1UJF2.1
#=GS A0A0E3JJ87_9CAUD/179-238 AC A0A0E3JJ87.1
#=GS B3VCY6_9CAUD/238-356 AC B3VCY6.1
#=GS Q859H1_9CAUD/257-315 AC Q859H1.1
#=GS A0A2K9VGU5_9CAUD/238-298 AC A0A2K9VGU5.1
#=GS B6Z9F0_9CAUD/296-330 AC B6Z9F0.1
#=GS A0A5B9NGP4_9CAUD/249-309 AC A0A5B9NGP4.1
#=GS A0A2Z5H3H0_9CAUD/242-343 AC A0A2Z5H3H0.1
#=GS A0A886T1P8_9CAUD/253-361 AC A0A886T1P8.1
#=GS A0A7D5G6I3_9CAUD/183-242 AC A0A7D5G6I3.1
#=GS A0A7D5G6I3_9CAUD/239-271 AC A0A7D5G6I3.1
#=GS A0A2P1CKW2_9CAUD/241-302 AC A0A2P1CKW2.1
#=GS Q4TVY0_9CAUD/226-287 AC Q4TVY0.1
#=GS A0A1V0E685_9CAUD/242-302 AC A0A1V0E685.1
#=GS A0A2D0PEK9_9CAUD/248-353 AC A0A2D0PEK9.1
#=GS A0A5B9NGP4_9CAUD/308-338 AC A0A5B9NGP4.1
#=GS A0A2D0Z343_9CAUD/226-287 AC A0A2D0Z343.1
#=GS Q778M4_BPT3/247-306 AC Q778M4.1
#=GS A0A514U6B1_9CAUD/249-309 AC A0A514U6B1.1
#=GS A0A1I9SEC7_9CAUD/242-302 AC A0A1I9SEC7.1
#=GS A0A1B2AN92_9CAUD/239-353 AC A0A1B2AN92.1
#=GS A0A873WKN7_9CAUD/273-371 AC A0A873WKN7.1
#=GS A0A286P069_9CAUD/250-349 AC A0A286P069.1
#=GS B6Z9F0_9CAUD/241-301 AC B6Z9F0.1
#=GS A0A6B9RGV4_9CAUD/297-328 AC A0A6B9RGV4.1
#=GS A0A140IET2_9CAUD/211-310 AC A0A140IET2.1
#=GS A0A2P1CKW2_9CAUD/299-330 AC A0A2P1CKW2.1
#=GS W6PUN9_9CAUD/299-338 AC W6PUN9.1
#=GS A0A0E3M0Z9_9CAUD/239-298 AC A0A0E3M0Z9.1
#=GS A0A7G8LJ71_9CAUD/241-300 AC A0A7G8LJ71.1
#=GS A0A2D2W637_9CAUD/249-350 AC A0A2D2W637.1
#=GS A0A4D6DS25_9CAUD/247-356 AC A0A4D6DS25.1
#=GS L0HR90_9CAUD/241-302 AC L0HR90.1
#=GS A0A6M3WH15_9CAUD/230-289 AC A0A6M3WH15.1
#=GS A0A192Y7U4_9CAUD/238-346 AC A0A192Y7U4.1
#=GS A0A7G9UTD0_9CAUD/238-331 AC A0A7G9UTD0.1
#=GS A0A1I9SEC7_9CAUD/298-330 AC A0A1I9SEC7.1
#=GS I6QA03_9CAUD/241-302 AC I6QA03.1
#=GS A0A1C9M238_9CAUD/253-313 AC A0A1C9M238.1
#=GS K4PB10_9CAUD/296-330 AC K4PB10.1
#=GS A0A6M5C8I2_9CAUD/242-350 AC A0A6M5C8I2.1
#=GS A0A2K9VGU5_9CAUD/297-327 AC A0A2K9VGU5.1
#=GS A0A088FA25_9CAUD/304-338 AC A0A088FA25.1
#=GS W6PEE2_9CAUD/249-354 AC W6PEE2.1
#=GS A0A2S1GSW3_9CAUD/258-359 AC A0A2S1GSW3.1
#=GS I6QA03_9CAUD/299-330 AC I6QA03.1
#=GS A0ZXK2_9CAUD/301-332 AC A0ZXK2.1
#=GS Q0E5Y7_9CAUD/233-328 AC Q0E5Y7.1
#=GS A0A7S6R9F3_9CAUD/243-336 AC A0A7S6R9F3.1
#=GS E1XU86_9CAUD/298-330 AC E1XU86.1
#=GS A0A7G7YB52_9CAUD/242-336 AC A0A7G7YB52.1
#=GS A0A6G6AFY1_9CAUD/250-310 AC A0A6G6AFY1.1
#=GS A0A5J6T8V7_9CAUD/241-301 AC A0A5J6T8V7.1
#=GS A0A5Q2F5J9_9CAUD/243-339 AC A0A5Q2F5J9.1
#=GS A0A0S2MVL5_9CAUD/258-370 AC A0A0S2MVL5.1
#=GS A0A6M3TA32_9CAUD/256-352 AC A0A6M3TA32.1
#=GS A0A8F2F3Q0_9CAUD/253-352 AC A0A8F2F3Q0.1
#=GS A0A5P8NKC3_9CAUD/238-298 AC A0A5P8NKC3.1
#=GS A0A0D3QHD3_9CAUD/240-340 AC A0A0D3QHD3.1
#=GS A0A6M3TDE9_9CAUD/230-289 AC A0A6M3TDE9.1
#=GS A0A059VFT5_9CAUD/257-316 AC A0A059VFT5.1
#=GS A0A898KAJ2_9CAUD/249-308 AC A0A898KAJ2.1
#=GS G0YQ50_9CAUD/295-326 AC G0YQ50.1
#=GS A0A192Y9B2_9CAUD/240-333 AC A0A192Y9B2.1
#=GS A0A0A0YX67_9CAUD/230-288 AC A0A0A0YX67.1
#=GS A0A2Z4QIW6_9CAUD/233-329 AC A0A2Z4QIW6.1
#=GS A0A0E3JJ87_9CAUD/234-268 AC A0A0E3JJ87.1
#=GS A0A3S9U842_9CAUD/238-357 AC A0A3S9U842.1
#=GS A0A219YH94_9CAUD/241-337 AC A0A219YH94.1
#=GS A0A7G9UTP0_9CAUD/254-313 AC A0A7G9UTP0.1
#=GS A0A1J0MEN1_9CAUD/243-304 AC A0A1J0MEN1.1
#=GS A0A678ZRW6_9CAUD/239-351 AC A0A678ZRW6.1
#=GS A0A8E5FP43_9CAUD/301-332 AC A0A8E5FP43.1
#=GS A0A2S1GTA3_9CAUD/248-342 AC A0A2S1GTA3.1
#=GS A0A088F909_9CAUD/21-82 AC A0A088F909.1
#=GS A0A7G9IRC3_9CAUD/224-321 AC A0A7G9IRC3.1
#=GS W6PUN9_9CAUD/246-306 AC W6PUN9.1
#=GS Q9T141_9CAUD/247-307 AC Q9T141.1
#=GS A0A0K2FH23_9CAUD/253-361 AC A0A0K2FH23.1
#=GS A0A3Q9WST1_9CAUD/236-337 AC A0A3Q9WST1.1
#=GS A0A384WXV4_9CAUD/243-351 AC A0A384WXV4.1
#=GS F0V6X3_9CAUD/241-357 AC F0V6X3.1
#=GS A0A5B9NGG6_9CAUD/238-357 AC A0A5B9NGG6.1
#=GS A0A385IGP4_9CAUD/250-347 AC A0A385IGP4.1
#=GS A0A172JGA1_9CAUD/253-365 AC A0A172JGA1.1
#=GS A0A1L7DS10_9CAUD/256-357 AC A0A1L7DS10.1
#=GS A0A160SVL5_9CAUD/258-318 AC A0A160SVL5.1
#=GS Q778M4_BPT3/303-336 AC Q778M4.1
#=GS A0A514U6B1_9CAUD/308-338 AC A0A514U6B1.1
#=GS A0A5P8NKC3_9CAUD/294-327 AC A0A5P8NKC3.1
#=GS A0A1C9M238_9CAUD/309-341 AC A0A1C9M238.1
#=GS D1L2U1_9CAUD/242-302 AC D1L2U1.1
#=GS A0A385IFI8_9CAUD/243-340 AC A0A385IFI8.1
#=GS A0A3G8F375_9CAUD/299-334 AC A0A3G8F375.1
#=GS A0A6G6AFY1_9CAUD/306-338 AC A0A6G6AFY1.1
#=GS A0A1P8L668_9CAUD/256-357 AC A0A1P8L668.1
#=GS Q3YJZ5_BPK1F/298-330 AC Q3YJZ5.1
#=GS L0HR90_9CAUD/299-330 AC L0HR90.1
#=GS A0A4P6PME4_9CAUD/237-333 AC A0A4P6PME4.1
#=GS A0A3G8F375_9CAUD/242-302 AC A0A3G8F375.1
#=GS A0A2S1PGT2_9CAUD/233-336 AC A0A2S1PGT2.1
#=GS E9KIE5_9CAUD/230-288 AC E9KIE5.1
#=GS B3VCI2_9CAUD/301-332 AC B3VCI2.1
#=GS Q9T141_9CAUD/306-336 AC Q9T141.1
#=GS K4PB10_9CAUD/241-301 AC K4PB10.1
#=GS D2EBR9_9CAUD/228-323 AC D2EBR9.1
#=GS G0YQ50_9CAUD/238-298 AC G0YQ50.1
#=GS A0A5J6T8V7_9CAUD/296-330 AC A0A5J6T8V7.1
#=GS D1L2U1_9CAUD/301-331 AC D1L2U1.1
#=GS A0A7D7F094_9CAUD/230-322 AC A0A7D7F094.1
#=GS A0A3Q9WU78_9CAUD/242-351 AC A0A3Q9WU78.1
#=GS A0A3S5IBH6_9CAUD/240-341 AC A0A3S5IBH6.1
#=GS H9YAF5_9CAUD/226-287 AC H9YAF5.1
#=GS A0A4Y5TVJ5_9CAUD/241-342 AC A0A4Y5TVJ5.1
#=GS A0A898KAJ2_9CAUD/304-338 AC A0A898KAJ2.1
#=GS A0ZXK2_9CAUD/243-304 AC A0ZXK2.1
#=GS A0A2K9VJY1_9CAUD/297-330 AC A0A2K9VJY1.1
#=GS Q3YJZ5_BPK1F/242-302 AC Q3YJZ5.1
#=GS A0A7G8LJS7_9CAUD/258-360 AC A0A7G8LJS7.1
#=GS A0A172JGD4_9CAUD/245-346 AC A0A172JGD4.1
#=GS A0A5Q2WBS8_9CAUD/242-302 AC A0A5Q2WBS8.1
#=GS I6Q8U8_9CAUD/301-332 AC I6Q8U8.1
#=GS A0A7S6R7G5_9CAUD/241-301 AC A0A7S6R7G5.1
#=GS A0A6B9RGV4_9CAUD/239-299 AC A0A6B9RGV4.1
#=GS E9KIE5_9CAUD/282-318 AC E9KIE5.1
#=GS A0A1V0E685_9CAUD/301-331 AC A0A1V0E685.1
#=GS A0A7T6ZLU9_9CAUD/270-329 AC A0A7T6ZLU9.1
#=GS A0A7S6L0Y6_9CAUD/226-326 AC A0A7S6L0Y6.1
#=GS A0A5J6DAT2_9CAUD/237-339 AC A0A5J6DAT2.1
#=GS B4YQE2_9CAUD/240-333 AC B4YQE2.1
#=GS A0A249Y2U0_9CAUD/309-343 AC A0A249Y2U0.1
#=GS A0A7S6R7G5_9CAUD/296-330 AC A0A7S6R7G5.1
#=GS A0A2D0Z6D6_9CAUD/226-287 AC A0A2D0Z6D6.1
#=GS A0A2K9VJY1_9CAUD/241-300 AC A0A2K9VJY1.1
#=GS A0A7G9UTP0_9CAUD/309-343 AC A0A7G9UTP0.1
#=GS A0A218M4E0_9CAUD/232-295 AC A0A218M4E0.1
#=GS A0A0E3M0Z9_9CAUD/294-328 AC A0A0E3M0Z9.1
#=GS V5YTS9_9CAUD/238-352 AC V5YTS9.1
#=GS A0A2S1GSJ6_9CAUD/243-340 AC A0A2S1GSJ6.1
#=GS A0A8E5FP43_9CAUD/243-304 AC A0A8E5FP43.1
#=GS A0A385IFF0_9CAUD/254-360 AC A0A385IFF0.1
#=GS DNLI_BPT7/241-349 AC P00969.1
#=GS A0A2U7NLZ3_9CAUD/243-304 AC A0A2U7NLZ3.1
#=GS A0A1J0MEN1_9CAUD/301-332 AC A0A1J0MEN1.1
#=GS A0A7G8L165_9CAUD/242-348 AC A0A7G8L165.1
#=GS A0A088F909_9CAUD/76-110 AC A0A088F909.1
#=GS A0A0P0LM15_9CAUD/241-340 AC A0A0P0LM15.1
#=GS A0A5Q2WBS8_9CAUD/299-334 AC A0A5Q2WBS8.1
#=GS A0A249Y2U0_9CAUD/254-313 AC A0A249Y2U0.1
#=GS A0A7L7SMS6_9CAUD/237-345 AC A0A7L7SMS6.1
#=GS A0A088FA25_9CAUD/249-308 AC A0A088FA25.1
#=GS I6Q8U8_9CAUD/243-304 AC I6Q8U8.1
#=GS A0A7T6ZLU9_9CAUD/323-359 AC A0A7T6ZLU9.1
#=GS A0A6M3TE53_9CAUD/230-289 AC A0A6M3TE53.1
#=GS E1XU86_9CAUD/241-302 AC E1XU86.1
#=GS A0A1B0TR50_9CAUD/252-349 AC A0A1B0TR50.1
#=GS B3VCI2_9CAUD/243-304 AC B3VCI2.1
#=GS A0A6M3T8T9_9CAUD/258-357 AC A0A6M3T8T9.1
A0A2H1UJF2_9CAUD/248-353 .........PDDSMDGIVVGLNWGTEGLANEGKVIGFEVLL.E.SGRVVSANNLTQALMDEFTQKV.L--T.G...M...SV.G......E....ME..A.F.-VG.DT.S.....KE.P..........YNPYGGWAIQVNYMEETPDGSLRHPSFGCW-r......
A0A0E3JJ87_9CAUD/179-238 .........PECEADGIIQGVNWGTEGLANEGKVIGFSVLL.E.TGRLVDANNISRALMDEFTANV.KA--.-...-...--.-......-....--..-.-.---.--.-.....--.-..........-------------------------------hge....
B3VCY6_9CAUD/238-356 .........PENEADGVVVGLNWGTPGLANEGKVIGFEVLL.E.SGRVVSANNISQALMEEFTAKV.KAHT.M...C...AN.G......C....RM..S.K.DVGmDN.H.....SC.AgkcaydqhpsNNPYEGWACQIKYMEETPDGSLRHPTV----rqm....
Q859H1_9CAUD/257-315 .........PDDNEDGFIQDVIWGTKGLANEGKVIGFKVLL.E.SGHVVNACKISRALMDEFTDT-.----.-...-...--.-......-....--..-.-.---.--.-.....--.-..........-------------------------------etrlp..
A0A2K9VGU5_9CAUD/238-298 .........PNDEADGIIQGVNWGTPGLANEGKVIGFSVLL.E.TGRLVDANNISRALMDEFTANV.KEH-.-...-...--.-......-....--..-.-.---.--.-.....--.-..........-------------------------------gee....
B6Z9F0_9CAUD/296-330 ...nieget--------------------------------.-.----------------------.----.-...-...--.-......-....--..-.-.---.--.-.....--.-..........--YYNGHACQVAYMEETPDGSLRHPSFVMFR.......
A0A5B9NGP4_9CAUD/249-309 .........PNDEADGIIQGVNWGTPGLANEGKVIGFSVLL.E.TGRLVDANNISRALMGEFTANV.KEH-.-...-...--.-......-....--..-.-.---.--.-.....--.-..........-------------------------------gee....
A0A2Z5H3H0_9CAUD/242-343 .........PEDEADGVVVGLNWGTPGLANEGKVIGFQVQL.E.NGVTVDANNISQDLMDEFTKRV.KEYT.T...E...C-.-......-....--..-.-.NAN.EA.G.....CW.Y..........MNPYEGWQCQVKFMEYTEDGSLRHPSWDC--wr.....
A0A886T1P8_9CAUD/253-361 .........PEETIDGTVCGLVWGTPGKANEGKVIGFEVLL.E.DGMVVNACGLTEEQKEEFTTNV.KEDT.L...A...AV.G......I....FT..P.Y.GIG.GN.E.....PC.F..........DNPYEGWQCEVLFMERFTDGSLRHPSFKCWR.......
A0A7D5G6I3_9CAUD/183-242 .........PSEEADGHVVRPIWGTEGLANEGMVIGFDVML.E.NGMEVSATNISRALMSEFTENV.KS--.-...-...--.-......-....--..-.-.---.--.-.....--.-..........-------------------------------dpd....
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A0A2P1CKW2_9CAUD/241-302 .........PEQEADGIIQGVNWGTKGLANEGKVIGFSVLL.E.SGRLVDANNVSRVLMDEFTANV.KEH-.-...-...--.-......-....--..-.-.---.--.-.....--.-..........-------------------------------gady...
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A0A1V0E685_9CAUD/242-302 .........PNDEADGIIQGVNWGTPGLANEGKVIGFSVLL.E.TGRLVDANNISRALMDEFTANV.KEH-.-...-...--.-......-....--..-.-.---.--.-.....--.-..........-------------------------------gee....
A0A2D0PEK9_9CAUD/248-353 .........PDDSMDGIVVGLNWGTEGLANEGKVIGFEVLL.E.SGRVVSANNLTQALMDEFTQKV.L--T.G...M...SV.G......E....LE..A.F.-VG.DT.S.....EE.P..........YNPYGGWAIQVNYMEETPDGSLRHPSFGCW-r......
A0A5B9NGP4_9CAUD/308-338 .......ee--------------------------------.-.----------------------.----.-...-...--.-......-....--..-.-.---.--.-.....--.-..........--YYNGWSCQIGYMEETKDGSLRHPSFTCFR.......
A0A2D0Z343_9CAUD/226-287 .........PEGEIDGNVVGVNWGTVGLANEGKVIGFQVLL.E.NGVVVDANGITQEQMEEYTNLI.Y---.-...-...--.-......-....--..-.-.---.--.-.....--.-..........-------------------------------ktghdd.
Q778M4_BPT3/247-306 .........PECEADGIIQGVNWGTEGLANEGKVIGFSVLL.E.TGRLVDANNISRALMDEFTSNV.KA--.-...-...--.-......-....--..-.-.---.--.-.....--.-..........-------------------------------hge....
A0A514U6B1_9CAUD/249-309 .........PNDEADGIIQGVNWGTPGLANEGKVIGFSVLL.E.TGRLVDANNISRALMEEFTTNV.KEH-.-...-...--.-......-....--..-.-.---.--.-.....--.-..........-------------------------------geg....
A0A1I9SEC7_9CAUD/242-302 .........PSEEADGHVVRPVWGTEGLANEGLVIGFDVML.E.NGMEVSATNISRALMSEFTENV.KS--.-...-...--.-......-....--..-.-.---.--.-.....--.-..........-------------------------------dpdy...
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