#=GF ID   Dna2_Rift
#=GF AC   PF21123.1
#=GF DE   Dna2 Rift barrel domain
#=GF AU   Bateman A;0000-0002-6982-4660
#=GF SE   ECOD:EF23981
#=GF GA   27.00 27.00;
#=GF TC   27.00 27.00;
#=GF NC   26.90 26.90;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -E 1000 -Z 75585367 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Domain
#=GF CL   CL0105
#=GF RC   Paper describing PDB structure 5ean
#=GF RN   [1]
#=GF RM   26491943
#=GF RT   Dna2 nuclease-helicase structure, mechanism and regulation by
#=GF RT   Rpa.
#=GF RA   Zhou C, Pourmal S, Pavletich NP;
#=GF RL   Elife. 2015; [Epub ahead of print]
#=GF DR   SO; 0000417; polypeptide_domain;
#=GF CC   This entry represents a Rift barrel domain found in the Dna2
#=GF CC   protein [1]. This domain lies between the nuclease and helicase
#=GF CC   domains [1]. The Dna2 nuclease-helicase maintains genomic
#=GF CC   integrity by processing DNA double-strand breaks, Okazaki
#=GF CC   fragments and stalled replication forks. Dna2 requires ssDNA
#=GF CC   ends, and is dependent on the ssDNA-binding protein Rpa, which
#=GF CC   controls cleavage polarity.
#=GF SQ   1004
#=GS A0A1J1IZ91_9DIPT/497-593    AC A0A1J1IZ91.1
#=GS A0A091FAZ0_CORBR/438-535    AC A0A091FAZ0.1
#=GS A0A094EZV5_9PEZI/954-1050   AC A0A094EZV5.1
#=GS A0A4S2KTU1_9HYME/1684-1784  AC A0A4S2KTU1.1
#=GS A0A673GIU0_9TELE/452-549    AC A0A673GIU0.1
#=GS F7CAD7_MACMU/469-566        AC F7CAD7.3
#=GS A0A665UBK3_ECHNA/443-543    AC A0A665UBK3.1
#=GS DNA2_RAT/469-566            AC D3ZG52.1
#=GS A0A3E2HPR0_SCYLI/941-1036   AC A0A3E2HPR0.1
#=GS A0A0F8VC65_9EURO/947-1045   AC A0A0F8VC65.1
#=GS A0A0P7X118_SCLFO/327-424    AC A0A0P7X118.1
#=GS A0A671YLP7_SPAAU/436-532    AC A0A671YLP7.1
#=GS A0A0J7KRV7_LASNI/481-584    AC A0A0J7KRV7.1
#=GS A0A673GI13_9TELE/462-559    AC A0A673GI13.1
#=GS A0A8V0ZYK8_CHICK/438-535    AC A0A8V0ZYK8.1
#=GS A0A670ZQF6_PSETE/470-567    AC A0A670ZQF6.1
#=GS A0A6J0UUN4_9SAUR/471-568    AC A0A6J0UUN4.1
#=GS A0A7N4UYF8_SARHA/501-598    AC A0A7N4UYF8.1
#=GS A0A226P4G3_COLVI/458-555    AC A0A226P4G3.1
#=GS A0A1S3F7B2_DIPOR/470-567    AC A0A1S3F7B2.1
#=GS A0A6J2V8J1_CHACN/698-795    AC A0A6J2V8J1.1
#=GS A0A8V5GK90_MELUD/434-531    AC A0A8V5GK90.1
#=GS A0A670ZQL8_PSETE/385-482    AC A0A670ZQL8.1
#=GS A0A8C8AGL0_9STRI/468-565    AC A0A8C8AGL0.1
#=GS A0A094CSI9_9PEZI/954-1050   AC A0A094CSI9.1
#=GS A0A2T4AAB6_TRIHA/802-898    AC A0A2T4AAB6.1
#=GS A0A7N6FDI9_ANATE/788-888    AC A0A7N6FDI9.1
#=GS A0A2U3XBV4_LEPWE/469-566    AC A0A2U3XBV4.1
#=GS A0A2Y9PTY8_DELLE/315-412    AC A0A2Y9PTY8.1
#=GS F7CAF2_MACMU/469-566        AC F7CAF2.3
#=GS A0A8I3MML8_CANLF/469-566    AC A0A8I3MML8.1
#=GS A0A2K5I689_COLAP/425-522    AC A0A2K5I689.1
#=GS A0A6J3ATT9_VICPA/504-601    AC A0A6J3ATT9.1
#=GS A0A8H3U7A5_VENIN/956-1054   AC A0A8H3U7A5.1
#=GS A0A4Q4UB43_9PEZI/900-996    AC A0A4Q4UB43.1
#=GS A0A4W4EBI7_ELEEL/417-513    AC A0A4W4EBI7.1
#=GS A0A673GFK9_9TELE/432-529    AC A0A673GFK9.1
#=GS A0A6P7HRH0_9TELE/786-886    AC A0A6P7HRH0.1
#=GS A0A6G1P7R7_9TELE/797-897    AC A0A6G1P7R7.1
#=GS A0A1V1TU42_9FUNG/905-1001   AC A0A1V1TU42.1
#=GS A0A7R7VEN4_ASPCH/928-1026   AC A0A7R7VEN4.1
#=GS A0A671YJL3_SPAAU/438-538    AC A0A671YJL3.1
#=GS A0A3Q7NRT6_CALUR/469-558    AC A0A3Q7NRT6.1
#=GS A0A8C1H1V0_CYPCA/427-511    AC A0A8C1H1V0.1
#=GS A0A2I3RGW0_PANTR/436-533    AC A0A2I3RGW0.1
#=GS A0A4Q4U4W6_9PEZI/874-970    AC A0A4Q4U4W6.1
#=GS A0A653BZV2_CALMS/691-788    AC A0A653BZV2.1
#=GS S0DPN2_GIBF5/880-976        AC S0DPN2.1
#=GS A0A8C4Y2E6_9SAUR/433-520    AC A0A8C4Y2E6.1
#=GS A0A3M2S1D3_9HYPO/804-900    AC A0A3M2S1D3.1
#=GS A0A7J8G6K5_ROUAE/467-564    AC A0A7J8G6K5.1
#=GS A0A4Z1HVZ0_9HELO/911-1009   AC A0A4Z1HVZ0.1
#=GS A0A672SI85_SINGR/765-862    AC A0A672SI85.1
#=GS H3B0T2_LATCH/337-434        AC H3B0T2.1
#=GS G1RMB2_NOMLE/453-554        AC G1RMB2.2
#=GS A0A315V1F3_GAMAF/728-828    AC A0A315V1F3.1
#=GS A0A452F7M6_CAPHI/470-567    AC A0A452F7M6.1
#=GS A0A671QYH0_9TELE/764-861    AC A0A671QYH0.1
#=GS A0A8C9NC09_SERCA/625-717    AC A0A8C9NC09.1
#=GS A0A8C3U330_CATUS/440-537    AC A0A8C3U330.1
#=GS A0A8D2QHY0_ZONAL/622-719    AC A0A8D2QHY0.1
#=GS A0A671QYI5_9TELE/507-604    AC A0A671QYI5.1
#=GS A0A8C9NAL2_SERCA/468-565    AC A0A8C9NAL2.1
#=GS M7UBE8_BOTF1/910-1008       AC M7UBE8.1
#=GS A0A8H6VLK4_9PEZI/1017-1127  AC A0A8H6VLK4.1
#=GS A0A2Y9E3E8_TRIMA/501-598    AC A0A2Y9E3E8.1
#=GS C5FU61_ARTOC/883-981        AC C5FU61.1
#=GS A0A0D9R5G9_CHLSB/469-566    AC A0A0D9R5G9.1
#=GS A0A8H4W686_9HELO/961-1057   AC A0A8H4W686.1
#=GS A0A428QV20_9HYPO/804-900    AC A0A428QV20.1
#=GS A0A669CFR3_ORENI/870-970    AC A0A669CFR3.1
#=GS A0A8V5GJ85_MELUD/469-566    AC A0A8V5GJ85.1
#=GS A0A0G2ERT3_9EURO/772-873    AC A0A0G2ERT3.1
#=GS A0A4Q7JYM8_METCM/867-964    AC A0A4Q7JYM8.1
#=GS A0A8C7ML87_ONCKI/452-550    AC A0A8C7ML87.1
#=GS R7YHW3_CONA1/937-1034       AC R7YHW3.1
#=GS G0T1I0_RHOT2/720-832        AC G0T1I0.1
#=GS A0A3R7SQB9_PENVA/828-932    AC A0A3R7SQB9.1
#=GS A0A484DPB3_PERFV/808-908    AC A0A484DPB3.1
#=GS A0A0U1LQK8_TALIS/931-1027   AC A0A0U1LQK8.1
#=GS A0A7J8DNY2_MOLMO/469-566    AC A0A7J8DNY2.1
#=GS A0A8D2N618_ZONAL/332-429    AC A0A8D2N618.1
#=GS A0A6I8NDF9_ORNAN/470-567    AC A0A6I8NDF9.1
#=GS A0A060WFC6_ONCMY/821-919    AC A0A060WFC6.1
#=GS A0A2Y9PKX8_DELLE/505-602    AC A0A2Y9PKX8.1
#=GS A0A428PEK3_9HYPO/804-900    AC A0A428PEK3.1
#=GS A0A8B8VIV3_BALMU/505-602    AC A0A8B8VIV3.1
#=GS DNA2_MOUSE/470-567          AC Q6ZQJ5.2
#=GS A0A2K5I687_COLAP/453-550    AC A0A2K5I687.1
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#=GS A0A8C9CH84_PHOSS/504-601    AC A0A8C9CH84.1
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#=GS R1EHX7_BOTPV/210-307        AC R1EHX7.1
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#=GS A0A167Z8S4_9EURO/992-1090   AC A0A167Z8S4.1
#=GS G0SAN0_CHATD/943-1039       AC G0SAN0.1
#=GS A0A671KZN1_9TELE/501-597    AC A0A671KZN1.1
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#=GS A0A8C5AII8_GADMO/795-894    AC A0A8C5AII8.1
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#=GS A0A3A3A4D0_9EURO/956-1053   AC A0A3A3A4D0.1
#=GS A0A094BGN9_9PEZI/953-1049   AC A0A094BGN9.1
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#=GS A0A2C5ZX04_9HYPO/869-965    AC A0A2C5ZX04.1
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#=GS A0A8C0JHH9_CHEAB/433-528    AC A0A8C0JHH9.1
#=GS A0A384JVX2_BOTFB/910-1008   AC A0A384JVX2.1
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#=GS C5GKH3_AJEDR/952-1055       AC C5GKH3.2
#=GS A0A8J6EAA2_ELECQ/309-406    AC A0A8J6EAA2.1
#=GS A0A2S7PTC9_9HELO/908-1004   AC A0A2S7PTC9.1
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#=GS A0A337SJM8_FELCA/469-566    AC A0A337SJM8.2
#=GS A0A6P5JIC7_PHACI/472-569    AC A0A6P5JIC7.1
#=GS A0A8D2KAY8_THEGE/469-566    AC A0A8D2KAY8.1
#=GS A0A8C6Z1X1_NOTPE/438-535    AC A0A8C6Z1X1.1
#=GS A0A8D0G3H1_SPHPU/418-515    AC A0A8D0G3H1.1
#=GS A0A1V8UI20_9PEZI/1047-1158  AC A0A1V8UI20.1
#=GS A0A1V8UH92_9PEZI/1046-1157  AC A0A1V8UH92.1
#=GS A0A672Y999_9TELE/421-520    AC A0A672Y999.1
#=GS A0A8D2AS67_SCIVU/470-567    AC A0A8D2AS67.1
#=GS A0A5N4A5D1_PHOPY/663-759    AC A0A5N4A5D1.1
#=GS A0A6J1ZMQ8_ACIJB/428-525    AC A0A6J1ZMQ8.1
#=GS A0A135LP99_PENPA/953-1053   AC A0A135LP99.1
#=GS A0A4W3HUD7_CALMI/421-518    AC A0A4W3HUD7.1
#=GS A0A482X9Y9_LAOST/672-763    AC A0A482X9Y9.1
#=GS H2Q1Z5_PANTR/422-519        AC H2Q1Z5.2
#=GS A0A369GQ89_9HYPO/822-917    AC A0A369GQ89.1
#=GS C0NJJ9_AJECG/945-1042       AC C0NJJ9.1
#=GS H9GG35_ANOCA/490-587        AC H9GG35.2
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