#=GF ID GH123_cat
#=GF AC PF13320.10
#=GF DE Glycoside hydrolase 123, catalytic domain
#=GF PI DUF4091;
#=GF AU Aldam G;0000-0003-3039-8438
#=GF AU Mistry J;0000-0003-2479-5322
#=GF SE Pfam-B_3704 (release 24.0)
#=GF GA 23.10 23.10;
#=GF TC 23.10 23.20;
#=GF NC 22.90 22.90;
#=GF BM hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM hmmsearch -Z 75585367 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP Domain
#=GF CL CL0036
#=GF RN [1]
#=GF RM 27038508
#=GF RT The Details of Glycolipid Glycan Hydrolysis by the Structural
#=GF RT Analysis of a Family 123 Glycoside Hydrolase from Clostridium
#=GF RT perfringens.
#=GF RA Noach I, Pluvinage B, Laurie C, Abe KT, Alteen MG, Vocadlo DJ,
#=GF RA Boraston AB;
#=GF RL J Mol Biol. 2016;428:3253-3265.
#=GF RN [2]
#=GF RM 27546776
#=GF RT Structural and mechanistic insights into a Bacteroides vulgatus
#=GF RT retaining N-acetyl-beta-galactosaminidase that uses neighbouring
#=GF RT group participation.
#=GF RA Roth C, Petricevic M, John A, Goddard-Borger ED, Davies GJ,
#=GF RA Williams SJ;
#=GF RL Chem Commun (Camb). 2016;52:11096-11099.
#=GF DR INTERPRO; IPR025150;
#=GF DR SO; 0000417; polypeptide_domain;
#=GF CC This domain is found at the C terminus of protein members of the
#=GF CC glycoside hydrolase family 123, including
#=GF CC N-acetylgalactosaminidase from Clostridium perfringens. This
#=GF CC enzyme removes specific terminal N-D-acetylgalactosamine from
#=GF CC glycosphingolipids. This catalytic domain adopts an alpha/beta
#=GF CC barrel configuration with a two-stranded beta sheet and a pair
#=GF CC of alpha-helices at the C-terminal end [1,2].
#=GF SQ 1093
#=GS R6YDA1_9BACE/231-542 AC R6YDA1.1
#=GS A0A516PXL8_9ACTN/180-510 AC A0A516PXL8.1
#=GS A0A7M4DGV8_9MICO/183-511 AC A0A7M4DGV8.1
#=GS A0A6J1IJD3_CUCMA/335-604 AC A0A6J1IJD3.1
#=GS A0A0E0EDL9_9ORYZ/341-612 AC A0A0E0EDL9.1
#=GS A0A1L8WP45_9ENTE/103-441 AC A0A1L8WP45.1
#=GS A0A1Z4NMJ6_9CYAN/318-501 AC A0A1Z4NMJ6.1
#=GS A0A1I0HXA0_9FIRM/593-931 AC A0A1I0HXA0.1
#=GS A0A6P4BZ96_ARADU/332-604 AC A0A6P4BZ96.1
#=GS A0A399D8X9_9BACT/441-698 AC A0A399D8X9.1
#=GS A0A2H5WPN8_9BACT/684-922 AC A0A2H5WPN8.1
#=GS A0A4R7TER2_9ACTN/228-543 AC A0A4R7TER2.1
#=GS A0A5J4ZNI3_9ASTE/344-614 AC A0A5J4ZNI3.1
#=GS A0A0M3CC37_9SPHI/1-95 AC A0A0M3CC37.1
#=GS A0A3R5WVN0_9FIRM/176-504 AC A0A3R5WVN0.1
#=GS Q08NH0_STIAD/254-496 AC Q08NH0.1
#=GS A0A4R4YW47_9ACTN/170-497 AC A0A4R4YW47.1
#=GS A0A7X3MJR7_9FIRM/175-504 AC A0A7X3MJR7.1
#=GS A0A3G9IK45_9BACL/7-289 AC A0A3G9IK45.1
#=GS A0A803N7C6_CHEQI/61-200 AC A0A803N7C6.1
#=GS V7ASL2_PHAVU/333-604 AC V7ASL2.1
#=GS A0A2P8EBT2_9ACTN/210-534 AC A0A2P8EBT2.1
#=GS H3GNF3_PHYRM/697-753 AC H3GNF3.1
#=GS A0A1Q8E5W8_9STRE/210-541 AC A0A1Q8E5W8.1
#=GS A0A848LRC1_9DELT/253-498 AC A0A848LRC1.1
#=GS B9Y937_9FIRM/202-538 AC B9Y937.1
#=GS A0A1I3F5C4_9SPHI/230-541 AC A0A1I3F5C4.1
#=GS A0A2I0KBN4_PUNGR/66-345 AC A0A2I0KBN4.1
#=GS A0A4Y8WPH4_9PORP/231-542 AC A0A4Y8WPH4.1
#=GS T2REF1_PAES9/4-59 AC T2REF1.1
#=GS A0A6I9TKQ5_SESIN/326-605 AC A0A6I9TKQ5.1
#=GS A0A416ESM6_9FIRM/193-530 AC A0A416ESM6.1
#=GS A0A445CC64_ARAHY/56-326 AC A0A445CC64.1
#=GS A0A8B8QE20_9MYRT/322-598 AC A0A8B8QE20.1
#=GS A0A239RI19_9BACT/607-917 AC A0A239RI19.1
#=GS A0A6G4UZH4_9ACTN/254-578 AC A0A6G4UZH4.1
#=GS A0A2G5E9X1_AQUCA/349-620 AC A0A2G5E9X1.1
#=GS S8GWN2_9BACT/201-534 AC S8GWN2.1
#=GS R5R2L5_9FIRM/171-501 AC R5R2L5.1
#=GS D0GLZ0_9FUSO/173-515 AC D0GLZ0.1
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#=GS A0A833VGB4_9POAL/335-602 AC A0A833VGB4.1
#=GS A0A1N6HG91_9BACT/223-533 AC A0A1N6HG91.1
#=GS A0A4U1JFG0_9DELT/281-538 AC A0A4U1JFG0.1
#=GS A0A0Q4FQS7_9SPHI/186-496 AC A0A0Q4FQS7.1
#=GS R5KMU9_9CLOT/160-491 AC R5KMU9.1
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#=GS J9Z915_LEPFM/398-616 AC J9Z915.1
#=GS A0A2T7EXW2_9POAL/340-612 AC A0A2T7EXW2.1
#=GS A0A174CV26_9CLOT/178-509 AC A0A174CV26.1
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#=GS A0A3E3K0H9_9FIRM/183-513 AC A0A3E3K0H9.1
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#=GS A0A399FED2_9DEIN/337-487 AC A0A399FED2.1
#=GS A0A328TX86_9BACL/177-506 AC A0A328TX86.1
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#=GS A0A1S3U741_VIGRR/333-604 AC A0A1S3U741.1
#=GS R6TZS2_9FIRM/174-504 AC R6TZS2.1
#=GS A0A1I5VJH6_9BACT/205-521 AC A0A1I5VJH6.1
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#=GS A0A2D1U2J0_9SPHI/220-530 AC A0A2D1U2J0.1
#=GS B2IYJ6_NOSP7/317-491 AC B2IYJ6.1
#=GS A0A2P5YUH4_GOSBA/326-596 AC A0A2P5YUH4.1
#=GS A0A6I1MMV2_9CLOT/475-786 AC A0A6I1MMV2.1
#=GS W7YP02_9BACL/174-505 AC W7YP02.1
#=GS A0A392NDV4_9FABA/1-100 AC A0A392NDV4.1
#=GS A0A2P8HV44_CHINA/228-538 AC A0A2P8HV44.1
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#=GS S8FAE7_9BACT/459-701 AC S8FAE7.1
#=GS A0A251R9I0_PRUPE/278-548 AC A0A251R9I0.1
#=GS A0A4U3KSE7_9BACT/238-548 AC A0A4U3KSE7.1
#=GS A0A1M6C3D9_9FLAO/226-538 AC A0A1M6C3D9.1
#=GS A0A0B1ZYB5_9MICO/175-507 AC A0A0B1ZYB5.1
#=GS A0A081K6Z2_9GAMM/597-775 AC A0A081K6Z2.1
#=GS U2IXF3_9SPHI/82-151 AC U2IXF3.1
#=GS A0A0H3XKC9_9MOLU/513-656 AC A0A0H3XKC9.1
#=GS A0A3S1BKZ4_9BACT/221-531 AC A0A3S1BKZ4.1
#=GS A0A329MMA0_9BACL/175-504 AC A0A329MMA0.1
#=GS A0A2J6KSA6_LACSA/317-592 AC A0A2J6KSA6.1
#=GS A0A5D2W6R8_GOSMU/334-605 AC A0A5D2W6R8.1
#=GS A0A3N4M673_9BACT/229-539 AC A0A3N4M673.1
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#=GS K6DWG7_9BACI/171-500 AC K6DWG7.1
#=GS A0A2K9NUJ8_BACTC/773-995 AC A0A2K9NUJ8.1
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#=GS R5PEL9_9BACT/139-449 AC R5PEL9.1
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#=GS A0A239LWF2_9BACT/211-521 AC A0A239LWF2.1
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#=GS A0A5B9Y430_9MOLU/394-803 AC A0A5B9Y430.1
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#=GS A0A1Y2N854_PSEAH/300-434 AC A0A1Y2N854.1
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#=GS A0A4R5DXI7_9ACTN/207-531 AC A0A4R5DXI7.1
#=GS A0A834ZPE6_9MAGN/262-531 AC A0A834ZPE6.1
#=GS R7ZYC7_9BACT/223-536 AC R7ZYC7.1
#=GS A0A2R3ZA01_9FLAO/296-606 AC A0A2R3ZA01.1
#=GS A0A142YKB2_9PLAN/217-548 AC A0A142YKB2.1
#=GS A0A4Q9DQ40_9BACL/171-500 AC A0A4Q9DQ40.1
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#=GS A0A1M6I0L1_9ACTN/968-1207 AC A0A1M6I0L1.1
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