#=GF ID Glutenin_hmw
#=GF AC PF03157.17
#=GF DE High molecular weight glutenin subunit
#=GF AU Mifsud W;0000-0002-9805-6461
#=GF AU Bateman A;0000-0002-6982-4660
#=GF SE Pfam-B_2180 (release 6.5)
#=GF GA 50.00 50.00;
#=GF TC 50.10 50.50;
#=GF NC 49.20 49.70;
#=GF BM hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM hmmsearch -Z 75585367 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP Disordered
#=GF RN [1]
#=GF RM 11084370
#=GF RT Elastomeric proteins: biological roles, structures and
#=GF RT mechanisms.
#=GF RA Tatham AS, Shewry PR;
#=GF RL Trends Biochem Sci 2000;25:567-571.
#=GF DR INTERPRO; IPR001419;
#=GF DR SO; 0100003; intrinsically_unstructured_polypeptide_region;
#=GF CC Members of this family include high molecular weight subunits of
#=GF CC glutenin. This group of gluten proteins is thought to be largely
#=GF CC responsible for the elastic properties of gluten, and hence,
#=GF CC doughs. Indeed, glutenin high molecular weight subunits are
#=GF CC classified as elastomeric proteins, because the glutenin network
#=GF CC can withstand significant deformations without breaking, and
#=GF CC return to the original conformation when the stress is removed.
#=GF CC Elastomeric proteins differ considerably in amino acid sequence,
#=GF CC but they are all polymers whose subunits consist of elastomeric
#=GF CC domains, composed of repeated motifs, and non-elastic domains
#=GF CC that mediate cross-linking between the subunits. The elastomeric
#=GF CC domain motifs are all rich in glycine residues in addition to
#=GF CC other hydrophobic residues. High molecular weight glutenin
#=GF CC subunits have an extensive central elastomeric domain, flanked
#=GF CC by two terminal non-elastic domains that form disulphide
#=GF CC cross-links. The central elastomeric domain is characterised by
#=GF CC the following three repeated motifs: PGQGQQ, GYYPTS[P/L]QQ, GQQ.
#=GF CC It possesses overlapping beta-turns within and between the
#=GF CC repeated motifs, and assumes a regular helical secondary
#=GF CC structure with a diameter of approx. 1.9 nm and a pitch of
#=GF CC approx. 1.5 nm [see 1, fig.2].
#=GF SQ 39
#=GS A0A6G1EFI9_9ORYZ/1-122 AC A0A6G1EFI9.1
#=GS GLT5_WHEAT/600-848 AC P10388.5
#=GS I1HI01_BRADI/1-107 AC I1HI01.1
#=GS GLT1_WHEAT/1-101 AC P02861.1
#=GS J3M8K1_ORYBR/1-157 AC J3M8K1.1
#=GS A0A8I6WKF6_HORVV/392-757 AC A0A8I6WKF6.1
#=GS H9XH66_TRIUA/168-310 AC H9XH66.1
#=GS GLT0_WHEAT/282-473 AC P10387.1
#=GS GLT4_WHEAT/598-838 AC P08489.1
#=GS M8A4Z7_TRIUA/1-833 AC M8A4Z7.1
#=GS GLT0_WHEAT/465-648 AC P10387.1
#=GS GLT3_WHEAT/295-477 AC P08488.1
#=GS A0A8R7K3L0_TRIUA/174-273 AC A0A8R7K3L0.1
#=GS GLT3_WHEAT/475-660 AC P08488.1
#=GS GLT2_WHEAT/1-39 AC P02862.1
#=GS A0A7M5XE85_9CNID/1053-1641 AC A0A7M5XE85.1
#=GS A0A811RMH5_9POAL/7-154 AC A0A811RMH5.1
#=GS A0A8I6WKF6_HORVV/196-349 AC A0A8I6WKF6.1
#=GS H9XH66_TRIUA/299-447 AC H9XH66.1
#=GS A0A8R7K2K4_TRIUA/1-809 AC A0A8R7K2K4.1
#=GS A0A811SJC9_9POAL/1-117 AC A0A811SJC9.1
#=GS H9XH66_TRIUA/430-587 AC H9XH66.1
#=GS A0A8R7K2H0_TRIUA/1-118 AC A0A8R7K2H0.1
#=GS A0A8R7K3L0_TRIUA/1-199 AC A0A8R7K3L0.1
#=GS GLT4_WHEAT/1-613 AC P08489.1
#=GS A0A8I6WKF6_HORVV/1-204 AC A0A8I6WKF6.1
#=GS A0A0E0DTJ9_9ORYZ/1-129 AC A0A0E0DTJ9.1
#=GS A0A0E0HGF6_ORYNI/1-130 AC A0A0E0HGF6.1
#=GS A0A0E0A179_9ORYZ/1-130 AC A0A0E0A179.1
#=GS GL19_ORYSJ/1-130 AC P29835.2
#=GS H9XH66_TRIUA/1-190 AC H9XH66.1
#=GS GLT5_WHEAT/1-602 AC P10388.5
#=GS A0A0Q3IYX2_BRADI/1-127 AC A0A0Q3IYX2.1
#=GS A2Y665_ORYSI/1-130 AC A2Y665.1
#=GS A0A0E0PPJ6_ORYRU/1-130 AC A0A0E0PPJ6.1
#=GS A0A0Q3IIA0_BRADI/1-82 AC A0A0Q3IIA0.1
#=GS GLT3_WHEAT/1-300 AC P08488.1
#=GS A0A1E5VKG9_9POAL/1-121 AC A0A1E5VKG9.1
#=GS GLT0_WHEAT/1-291 AC P10387.1
A0A6G1EFI9_9ORYZ/1-122 .......ma---KVVFFAA..LL.A.ALVAVSAA...QLS....E..........SemrfRD....RQCLR...EVQDS.PLDACRQVLDrqltgrerfqpmf..rrpgalglrmqccQQLQ..DVSRECRCA.AIRRMVRDYEESMPA...PL..E..QGQ..RYY..GEGSSS-------------.---------------------------------......-----------..-------------------..-------........................---------------------------------.-------------------------------------------------------------...-----------------------------------------...--------...------------------------...------------------------------------...............-------------------------...------..--------..----------......-----..-..--------..-------------....-------------------------------.--.--...-------------...------------.------...----------..---------------------------.-------.----------------------...---...------------------------......----------------------------------------------------------------................-.----------------------------------------------------...---------------------------------------------------------eq.......................
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I1HI01_BRADI/1-107 .......mg---KLIFFAA..VV.A.AMVAISLA...YGE....S..........Ss.vsTQ....CQCQR...ELQES.SLELCQQFVDrqlnmvpaisqrpspspwipqeqkmwccQQLQ..QISSGCREA.AVRSIVRKYEQD---...--..-..---..---..-------------------.---------------------------------......-----------..-------------------..-------........................---------------------------------.-------------------------------------------------------------...-----------------------------------------...--------...------------------------...------------------------------------...............-------------------------...------..--------..----------......-----..-..--------..-------------....-------------------------------.--.--...-------------...------------.------...----------..---------------------------.-------.----------------------...---...------------------------......----------------------------------------------------------------................-.----------------------------------------------------...---------------------------------------------------------leaa.....................
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J3M8K1_ORYBR/1-157 .......ma---KVVFLAA..LL.A.ALVAVSAA...QLS....E..........SemrfRD....RQCMR...EVQDS.PLDACRQVLDrqvtrrggappqvrppgaaargvrmrccQQLQ..DVSRECRCA.AVRRMVRDYEESMPM...PL..E..QGQirYYG..GEGSSSEPGYYG--EGSSS.SEQGYYGEGSSSSEQGYYGEQ------------......-----------..-------------------..-------........................---------------------------------.-------------------------------------------------------------...-----------------------------------------...--------...------------------------...------------------------------------...............-------------------------...------..--------..----------......-----..-..--------..-------------....-------------------------------.--.--...-------------...------------.------...----------..---------------------------.-------.----------------------...---...------------------------......----------------------------------------------------------------................-.----------------------------------------------------...---------------------------------------------------------q........................
A0A8I6WKF6_HORVV/392-757 .......gh----------..--.-.--------...---....-..........-....--....-----...-----.----------............................----..---------.---------------...--..-..---..---..-------------------.---------------------------------......-----------..-------------------..-------........................---------------------------------.-------------------------------------------------------------...-----------------------------------------...--------...------------------------...------------------------------------...............--------------------GQQLV...QGQQQG..QGQQGHYPsmTSPHQTGQGQ......KGYYP..SaiSPQQSGQG..QQGYQPSGASSQG....SVQGACQHSTSSPQQQAQGCQASSPKQGLGSlYY.PSgayTQQKPGQGYNPGGtspLHQQGGGFGGGL.TTEQPQ...-GGKQPFHCQ..QTTVSPHQGQQTT--VSPHQGQQTTVSpHQGQQTTvSPHQGQQTT--VSPHQGQQTT-...-VS...PHQGQQTT---VSPHPGQQ----T......TVSPHQGQQT---TVSPHP--GQQT-----TVSPHQGQQT--TVSPHQGQQT--TVSPHQGQQT................TvSPHQGQQT--TVSPHQGQQTT-----VSPHQGQQPGEQPCGFPGQQ--TTVS...LHHGQQSNE--LYYGSPYHVSVEQPSASLKVAKAQQLAAQLPAMCRLEGGGGLLASQ.........................
H9XH66_TRIUA/168-310 .........----------..--.-.--------...---....-..........-....--....-----...-----.----------............................----..---------.---------------...--..-..---..---..-------------------.---------------------------------......-----------..-------------------..-------........................---------------------------------.-------------------------------------------------------------...-----------------------------------------...--------...------------------------...------------------------------------...............-------------------------...--QQPG..QGQQGYYR..TSLQQPGQGQqigqwqQGYYP..T..SPQHPGQG..QQPGQVQKIGQGQ...qPEKGQQLGQEQQIGQGQQPGQGQQPGQGQQG.YY.PT...SLQQPRQGQQPGQ...WQQPGQGQQGYY.PTSLQQ...PGQGQQGHYP..ASQHQPGQGQQ----------------.-------.----------------------...---...------------------------......----------------------------------------------------------------................-.----------------------------------------------------...---------------------------------------------------------.........................
GLT0_WHEAT/282-473 .......as----------..--.-.--------...---....-..........-....--....-----...-----.----------............................----..---------.---------------...--..-..---..---..-------------------.---------------------------------......-----------..-------------------..-------........................---------------------------------.-------------------------------------------------------------...-----------------------------------------...--------...-----------QQQPGQGQQGHYP...ASQQQPGQGQQGHYPASQQQPGQGQQGHYPASQQEP...............---------------GQGQQGQIPA...SQQQPG..QGQQGHYP..ASLQQPGQGQ......QGHYP..T..SLQQLGQG..QQTGQ--------....PGQKQQPGQGQQTGQGQQPEQEQQPGQGQQG.YY.PT...SLQQPGQG-----...-QQQGQGQQGYY.PTSLQQ...PGQGQQGHYP..ASLQQPGQGQ-PGQRQQP---------.-------.----------------------...---...------------------------......----------------------------------------------------------------................-.----------------------------------------------------...---------------------------------------------------------g........................
GLT4_WHEAT/598-838 .......ql----------..--.-.--------...---....-..........-....--....-----...-----.----------............................----..---------.---------------...--..-..---..---..-------------------.---------------------------------......-----------..-------------------..-------........................---------------------------------.-------------------------------------------------------------...-----------------------------------------...--------...------------------------...------------------------------------...............-------------------------...------..--------..----------......-----..-..--------..-------------....-------------------------------.--.--...-------------...------------.------...----------..------------------GQGQQGQQP.GQ---GQ.QPAQGQQGQQPGQGQQGQQPGQ...GQQ...PGQGQPWYYPTSPQESGQGQQPGQwqqpgqWQQPGQGQPGYYLTSPLQLGQGQQGYYPTSLQQPGQGQQPGQWQQSGQGQHGYYPTSP------................Q.LSGQGQRPGQWLQPGQGQQGYYPTSPQQSGQGQQLGQWLQPGQGQQGYYPTSlqqTGQGQQSGQGQQGYYSSYHVSVEHQAASLKVAKAQQLAAQLPAMCRLEGGDALSASQ.........................
M8A4Z7_TRIUA/1-833 .........MTKRLVLFAA..VV.V.ALVALTAS...EGE....A..........S....GQ....LQCER...ELQEH.SLKTCRQVVD............................QQLR..DVSPECQPV.VVGPVARQYEQQVVV...PP..K..GGS..FYP..GETTPPQQLQQSILWGIPA.LLRRYYLNVTSPQQVSYYPGQASSQRPGQGQQP......GQGQQEYYLTS..PQQSGQWQQPGQGQSGYYP..TSPQQSGqeqpgyyptspwqpgqlqqptqgqQRQQPGQGQQLRQGQQGQQSGQGQPRYYPTSSQ.QPGQLQQLGQGQQGQQPERGQQGQQSGQGQQLGQGQQGQQPGQKQQSGQGQQGYYPISPQQ...LGQGQQSGQGQLGYYPTSPQQSGQGQSGYYPTSAQQAGQLQqsaQEQQLGQE...QQDQQPGQGRQGQQSGQRQQDQQS...EQGQQPGQRQPGYYSTSPQQLGQGQPRYYPTSPQQPgqeqqprqlqqpeqgQQGQQPEQGQQGQQQGQGEQGQQPGqgqQGQQPG..QGQPGYYP..TSPQQSGQGQ......PGYYP..T..SPQQSGQL..QQPAQGQQPGQEQ....--QGQQPGQGQQGQQPG---QGQQPGQGQPG.YY.PT...SPQQSGQGQQLGQ...WQQSGQGQPGHY.LTSPLQ...PGQGQPGYYP..TSPQQIGQGQQLGQLQQPTQGQQGQQS.GQGQQGQ.QPGQGQQGQQPGQGQQGQQPGQ...GQQ...PGQGQPGYYPTSLQQSGQGQQPGQ......WQQPGQGQPGYYPTSSLQPGQGQQGYYPTSQQQAGQGPQPGQWQQSGQGQQGYYPTSPQQSGQGqqpgqwlqlgyyltspQ.QLGQGQQPRQWLQPRQGQQGYYPTSPQQSRQGQQL------GQVQQGYYPTS...---PQQSGQGQQGYDSPYHVSAEHQAASLKVAKAQQLAAQLPAMCRLEGGDALLASQ.........................
GLT0_WHEAT/465-648 .........----------..--.-.--------...---....-..........-....--....-----...-----.----------............................----..---------.---------------...--..-..---..---..-------------------.---------------------------------......-----------..-------------------..-------........................---------------------------------.-------------------------------------------------------------...-----------------------------------------...--------...------------------------...------------------------------------...............-------------------------...------..--------..----------......-----..-..--------..-------------....-------------------------------.--.--...-------------...------------.------...----------..---------------------------.-------.------QPGQRQQPGQGQHPEQ...GKQ...PGQGQQGYYPTSPQQPGQG-----......----------------QQLGQGQQGYYPTSPQQPGQGQQP------GQGQQGHCPTSPQQSGQA................Q.QPGQGQQIGQVQQPGQGQQGYYPTSVQQPGQGQQSGQGQQSGQGHQ------...PGQGQQSGQEQQGYDSPYHVSAEQQAASPMVAKAQQPATQLPTVCRMEGGDALSASQ.........................
GLT3_WHEAT/295-477 ........s----------..--.-.--------...---....-..........-....--....-----...-----.----------............................----..---------.---------------...--..-..---..---..-------------------.---------------------------------......-----------..-------------------..-------........................---------------------------------.-------------------------------------------------------------...-----------------------------------------...--------...-----------QQQPAQGQQGHYP...ASQQQPGQGQQGHYPASQQQPGQGQQGHYPASQQEP...............---------------GQGQQGQIPA...SQQQPG..QGQQGHYP..ASLQQPG--Q......QGHYP..T..SLQQLGQG..QQIGQ--------....PGQKQQPGQGQQTGQGQQPEQEQQPGQGQQG.YY.PT...SLQQPGQG-----...-QQQGQGQQGYY.PTSLQQ...PGQGQQGHYP..ASLQQPGQGQ-----------------.-------.----------------------...---...------------------------......----------------------------------------------------------------................-.----------------------------------------------------...---------------------------------------------------------gq.......................
A0A8R7K3L0_TRIUA/174-273 .........----------..--.-.--------...---....-..........-....--....-----...-----.----------............................----..---------.---------------...--..-..---..---..-------------------.---------------------------------......GQEQPGYYPTS..PWQPGQLQQPTQGQ-----..-------........................QRQQPGQGQQLRQGQQGQQSGQGQPRYYPTSSQ.QPGQLQQLGQGQQGQQPERGQQGQQSGQGQQLGQGQQGQQPG-------------------...-----------------------------------------...--------...------------------------...------------------------------------...............-------------------------...------..--------..----------......-----..-..--------..-------------....-------------------------------.--.--...-------------...------------.------...----------..---------------------------.-------.----------------------...---...------------------------......----------------------------------------------------------------................-.----------------------------------------------------...---------------------------------------------------------.........................
GLT3_WHEAT/475-660 .......qg----------..--.-.--------...---....-..........-....--....-----...-----.----------............................----..---------.---------------...--..-..---..---..-------------------.---------------------------------......-----------..-------------------..-------........................---------------------------------.-------------------------------------------------------------...-----------------------------------------...--------...------------------------...------------------------------------...............-------------------------...------..--------..----------......-----..-..--------..-------------....-------------------------------.--.--...-------------...------------.------...----------..---------------------------.-------.------QPGQRQQPGQGQHPEQ...GQQ...PGQGQQGYYPTSPQQPGQG-----......----------------QQLGQGQQGYYPTSPQQPGQGQQP------GQGQQGHCPMSPQQTGQA................Q.QLGQGQQIGQVQQPGQGQQGYYPTSLQQPGQGQQSGQGQQSGQGHQ------...PGQGQQSGQEKQGYDSPYHVSAEQQAASPMVAKAQQPATQLPTVCRMEGGDALSASQ.........................
GLT2_WHEAT/1-39 ........l----------..--.-.--------...---....-..........-....--....-----...-----.----------............................----..---------.---------------...--..-..---..---..-------------------.---------------------------------......-----------..-------------------..-------........................---------------------------------.-------------------------------------------------------------...-----------------------------------------...--------...------------------------...------------------------------------...............-------------------------...------..--------..----------......-----..-..--------..-------------....-------------------------------.--.--...-------------...------------.------...----------..---------------------------.-------.----------------------...---...------------------------......----------------------------------------------------------------................-.----------------------------------------------------...-------------------VSVEHQAARLKVAKAQQLAAQLPAMCRLEGGDALSASQ.........................
A0A7M5XE85_9CNID/1053-1641 .....qvfe----------..--.-.--------...---....-..........-....--....-----...-----.----------............................----..---------.---------------...--..-..---..---..-------------------.---------------------------------......-----------..------------------P..TKVEQVF........................EPTKVEQVWKPTEVKQVSEPTEVEHVSKPTEVE.QVCEPTIKEQVSEPSEVEQVSESTKVEQASEPTKVEQVSEPTEVKQVSAPTEVEHVSEPTK...INQVSKPSEVEQVSKPTEVSKSTEVGKLSKPTEVEKVSEPT...EVEHVSEPskvKEVSEPSKVKKVSEPTKVEQASEStkvEQASEPTKVEQVSEPSEVEQVSEPTKVEQVSEPTKV...............DQVSEPTKVEQVSEPTEVKQVSKPT..kLEHEPT..EVEEFFEP..TKVDQVSEPT......KVEQV..T..EPTKVEQV..SEPTKVEQVSEPT...kVEQVSEPTKVEQVSEPTEVEQVFEPTKVEQV.SE.PT...KVEQASEPTKVDQ...ASEPTKVEQVSE.PTKVEQvsePTKVDQASEP..TKVEQVSEPTKVDQVSEPTKVEQVSEP.TEVEQVS.EPTEVEQASEPTKVDQASEPTK...VEQvsePTKVEQASEPTKVDQASEPTKVEQ......VSEPTKVEQ------VSEPTKVEQVFEPTKVEQASEPTKVEQVSEPTKVDQVSEPTKVEQVSEPt.............kvE.QVSEPTKVEQVSEPTEAEQVFEPTKVEQVSEPTKVEQVSEPSEVEQVSEPTK...---------------------------------------------------------vehaskpteve..............
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