#=GF ID HSM3_N
#=GF AC PF18795.5
#=GF DE DNA mismatch repair protein HSM3, N terminal domain
#=GF AU Paladin L;0000-0003-0011-9397
#=GF AU Piovesan D;0000-0001-8210-2390
#=GF SE RepeatsDB
#=GF GA 24.00 24.00;
#=GF TC 24.00 24.30;
#=GF NC 23.90 23.90;
#=GF BM hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM hmmsearch -E 1000 -Z 75585367 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP Repeat
#=GF CL CL0020
#=GF RN [1]
#=GF RM 22334676
#=GF RT Structural basis for specific recognition of Rpt1p, an ATPase
#=GF RT subunit of 26 S proteasome, by proteasome-dedicated chaperone
#=GF RT Hsm3p.
#=GF RA Takagi K, Kim S, Yukii H, Ueno M, Morishita R, Endo Y, Kato K,
#=GF RA Tanaka K, Saeki Y, Mizushima T;
#=GF RL J Biol Chem. 2012;287:12172-12182.
#=GF DR INTERPRO; IPR041335;
#=GF DR SO; 0001068; polypeptide_repeat;
#=GF CC Hsm3 is a proteasome-dedicated chaperone that forms a base
#=GF CC precursor, Hsm3-Rpt1-Rpt2-Rpn1 [1]. Hsm3 consists of 23
#=GF CC alpha-helices forming 11 repeats similar to the HEAT repeats.
#=GF CC This entry includes the first 5 repeats at the N-terminal.
#=GF SQ 167
#=GS X0D6N4_FUSOX/19-163 AC X0D6N4.1
#=GS W3WPW3_PESFW/14-141 AC W3WPW3.1
#=GS A0A5N6JSH5_MONLA/10-148 AC A0A5N6JSH5.1
#=GS A0A0D1W9A6_9EURO/14-181 AC A0A0D1W9A6.1
#=GS G8YIA5_PICSO/46-256 AC G8YIA5.1
#=GS J3NPQ1_GAET3/11-151 AC J3NPQ1.1
#=GS A0A3E2GT82_SCYLI/7-140 AC A0A3E2GT82.1
#=GS A0A1E3QNL2_9ASCO/3-240 AC A0A1E3QNL2.1
#=GS A0A8H8BSP0_9HELO/7-161 AC A0A8H8BSP0.1
#=GS A0A7H9B0I7_ZYGMR/11-246 AC A0A7H9B0I7.1
#=GS A0A1J7IX50_9PEZI/8-137 AC A0A1J7IX50.1
#=GS B2B012_PODAN/7-148 AC B2B012.1
#=GS K0KCM9_WICCF/14-243 AC K0KCM9.1
#=GS A0A8H5QQS1_9HYPO/20-163 AC A0A8H5QQS1.1
#=GS W9HYB7_FUSOX/20-163 AC W9HYB7.1
#=GS A0A0D1WP42_EXOME/21-185 AC A0A0D1WP42.1
#=GS K1XVR3_MARBU/7-141 AC K1XVR3.1
#=GS A0A2J6S802_9HELO/7-159 AC A0A2J6S802.1
#=GS G2QDB4_MYCTT/9-143 AC G2QDB4.1
#=GS A0A0D2FSY6_9EURO/9-169 AC A0A0D2FSY6.1
#=GS HSM3_KLULA/5-239 AC Q6CLP9.1
#=GS G8C1T0_TETPH/11-246 AC G8C1T0.1
#=GS A0A8H5Z1F7_9HYPO/19-163 AC A0A8H5Z1F7.1
#=GS A0A8H4RCA5_9HELO/7-158 AC A0A8H4RCA5.1
#=GS A0A8H6BSI1_CANAX/7-168 AC A0A8H6BSI1.1
#=GS A0A8H4TYZ7_9HYPO/22-160 AC A0A8H4TYZ7.1
#=GS A0A395N180_9HYPO/22-154 AC A0A395N180.1
#=GS H1W0L4_COLHI/13-162 AC H1W0L4.1
#=GS G0W6U6_NAUDC/13-248 AC G0W6U6.1
#=GS A0A1E4U247_PACTA/8-242 AC A0A1E4U247.1
#=GS A0A420HPP0_9PEZI/12-181 AC A0A420HPP0.1
#=GS A0A0D1ZXF0_9EURO/14-200 AC A0A0D1ZXF0.1
#=GS Q7SAX5_NEUCR/18-143 AC Q7SAX5.2
#=GS A0A8J5TR12_FUSOX/19-163 AC A0A8J5TR12.1
#=GS A0A367YL46_9ASCO/7-241 AC A0A367YL46.1
#=GS A0A0D2Y5B1_FUSO4/19-163 AC A0A0D2Y5B1.1
#=GS A0A1Q2YB31_9ASCO/12-232 AC A0A1Q2YB31.1
#=GS A0A4Z1JHK7_9HELO/9-132 AC A0A4Z1JHK7.1
#=GS A0A423W3W3_9PEZI/19-159 AC A0A423W3W3.1
#=GS M7U829_BOTF1/10-136 AC M7U829.1
#=GS A0A1Y2WKD0_9PEZI/11-151 AC A0A1Y2WKD0.1
#=GS A0A6P8APN8_MAGGR/6-137 AC A0A6P8APN8.1
#=GS HSM3_PICST/15-256 AC A3LY92.2
#=GS A0A2V1BMX3_9HELO/7-161 AC A0A2V1BMX3.1
#=GS A0A7H9HMA3_9SACH/10-245 AC A0A7H9HMA3.1
#=GS A0A8J5QDY9_9ASCO/9-244 AC A0A8J5QDY9.1
#=GS R8BX98_PHAM7/8-138 AC R8BX98.1
#=GS G3B0U2_CANTC/15-218 AC G3B0U2.1
#=GS A0A2S7QMN1_9HELO/2-152 AC A0A2S7QMN1.1
#=GS A0A1S7HRZ5_9SACH/10-245 AC A0A1S7HRZ5.1
#=GS A0A5N5K251_9PEZI/8-136 AC A0A5N5K251.1
#=GS HSM3_DEBHA/13-261 AC Q6BU68.2
#=GS A0A420YHB8_9PEZI/9-137 AC A0A420YHB8.1
#=GS A0A1G4KH38_9SACH/40-274 AC A0A1G4KH38.1
#=GS A0A2J6SSU6_9HELO/7-159 AC A0A2J6SSU6.1
#=GS A0A5E8C6R2_9ASCO/193-423 AC A0A5E8C6R2.1
#=GS W9CMZ9_SCLBF/12-139 AC W9CMZ9.1
#=GS A0A8H5NWZ6_9HYPO/20-163 AC A0A8H5NWZ6.1
#=GS A0A7D8YX06_9HELO/12-153 AC A0A7D8YX06.1
#=GS A0A1G4MF65_LACFM/11-244 AC A0A1G4MF65.1
#=GS A0A1E1LMM7_9HELO/7-162 AC A0A1E1LMM7.1
#=GS A0A2J6QIC2_9HELO/8-159 AC A0A2J6QIC2.1
#=GS A0A8H6BSI1_CANAX/167-225 AC A0A8H6BSI1.1
#=GS A0A8H5MU96_9HYPO/20-163 AC A0A8H5MU96.1
#=GS A0A1X7R0N3_9SACH/12-256 AC A0A1X7R0N3.1
#=GS A0A4Z1KX34_9HELO/10-130 AC A0A4Z1KX34.1
#=GS A0A8H6LH97_FUSOX/19-163 AC A0A8H6LH97.1
#=GS A0A3N4K3I7_9PEZI/16-190 AC A0A3N4K3I7.1
#=GS A0A545A5W4_9PEZI/9-141 AC A0A545A5W4.1
#=GS J7R387_KAZNA/5-240 AC J7R387.1
#=GS A0A559M4U1_9HELO/12-161 AC A0A559M4U1.1
#=GS G3AV79_SPAPN/4-233 AC G3AV79.1
#=GS G4NIC2_MAGO7/6-137 AC G4NIC2.1
#=GS A0A1V1TSE7_9FUNG/13-145 AC A0A1V1TSE7.1
#=GS A0A4C2EDP0_9SACH/10-245 AC A0A4C2EDP0.1
#=GS A0A5N5KQ87_9PEZI/8-135 AC A0A5N5KQ87.1
#=GS A0A1Y2UVM1_9PEZI/12-151 AC A0A1Y2UVM1.1
#=GS A0A5M9K519_MONFR/10-134 AC A0A5M9K519.1
#=GS A0A3D8RTQ4_9HELO/18-148 AC A0A3D8RTQ4.1
#=GS A0A1E4SFQ0_9ASCO/6-246 AC A0A1E4SFQ0.1
#=GS A0A2T3AU41_AMORE/10-156 AC A0A2T3AU41.1
#=GS W9W6J5_9EURO/22-170 AC W9W6J5.1
#=GS A0A384J4D2_BOTFB/10-136 AC A0A384J4D2.1
#=GS A0A8A3P9S7_9HELO/10-160 AC A0A8A3P9S7.1
#=GS A0A1E4TA59_9ASCO/99-252 AC A0A1E4TA59.1
#=GS A0A395J6P1_9HELO/10-128 AC A0A395J6P1.1
#=GS A0A507ANM6_9PEZI/16-141 AC A0A507ANM6.1
#=GS G8JUA4_ERECY/8-242 AC G8JUA4.1
#=GS Q6C9Q3_YARLI/2-219 AC Q6C9Q3.1
#=GS A0A1L0B914_9ASCO/12-256 AC A0A1L0B914.1
#=GS W7MHZ6_GIBM7/20-159 AC W7MHZ6.1
#=GS I2JUH2_DEKBR/14-248 AC I2JUH2.2
#=GS A0A1E5RZZ1_9ASCO/5-243 AC A0A1E5RZZ1.1
#=GS G8BKT1_CANPC/7-237 AC G8BKT1.1
#=GS A0A448YM04_BRENA/17-247 AC A0A448YM04.1
#=GS A0A2S7NW05_9HELO/10-160 AC A0A2S7NW05.1
#=GS A0A0D2HHV4_9EURO/16-173 AC A0A0D2HHV4.1
#=GS A0A4Y8D6Z0_9HELO/10-141 AC A0A4Y8D6Z0.1
#=GS G8ZT38_TORDC/13-248 AC G8ZT38.1
#=GS A7F6C7_SCLS1/10-143 AC A7F6C7.1
#=GS A0A8H5QCY3_GIBSU/20-162 AC A0A8H5QCY3.1
#=GS F9F377_FUSOF/19-163 AC F9F377.1
#=GS A0A8H6ENL7_9HELO/10-141 AC A0A8H6ENL7.1
#=GS A0A8H5YX78_9HYPO/20-163 AC A0A8H5YX78.1
#=GS C5MJI1_CANTT/7-170 AC C5MJI1.1
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#=GS A0A1E3P3Q5_WICAA/13-242 AC A0A1E3P3Q5.1
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#=GS N1RKD2_FUSC4/19-163 AC N1RKD2.1
#=GS A0A376B1E4_9ASCO/5-243 AC A0A376B1E4.1
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#=GS A0A099NWY2_PICKU/12-240 AC A0A099NWY2.1
#=GS A0A367YK75_9ASCO/7-241 AC A0A367YK75.1
#=GS A0A4Z1HNE0_9HELO/10-141 AC A0A4Z1HNE0.1
#=GS J4TY38_SACK1/10-246 AC J4TY38.1
#=GS A7TKI4_VANPO/11-246 AC A7TKI4.1
#=GS A0A1E4S349_CYBJN/9-235 AC A0A1E4S349.1
#=GS G2YY21_BOTF4/10-136 AC G2YY21.1
#=GS G3B0U1_CANTC/27-232 AC G3B0U1.1
#=GS A0A2T4GTJ5_FUSCU/20-160 AC A0A2T4GTJ5.1
#=GS H2ASR7_KAZAF/5-232 AC H2ASR7.1
#=GS A0A8H7X9Q6_9HELO/7-160 AC A0A8H7X9Q6.1
#=GS A0A8H8U132_9HELO/9-159 AC A0A8H8U132.1
#=GS C4QVS6_KOMPG/6-247 AC C4QVS6.1
#=GS W1QFJ1_OGAPD/5-232 AC W1QFJ1.1
#=GS A0A1E3PFK3_9ASCO/6-240 AC A0A1E3PFK3.1
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#=GS HSM3_YEAST/10-246 AC P38348.1
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#=GS HSM3_CANAL/7-241 AC Q59PP0.1
#=GS G2R0B9_THETT/13-139 AC G2R0B9.1
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#=GS C5E349_LACTC/11-243 AC C5E349.1
#=GS A0A4Z1H6X3_9HELO/10-143 AC A0A4Z1H6X3.1
#=GS A0A8H2VZE6_9HELO/10-159 AC A0A8H2VZE6.1
#=GS A0A8H5IY29_9HYPO/20-163 AC A0A8H5IY29.1
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#=GS A0A0C7N1Z6_9SACH/11-246 AC A0A0C7N1Z6.1
#=GS A0A1L7XKS8_9HELO/7-159 AC A0A1L7XKS8.1
X0D6N4_FUSOX/19-163 ........................................................aell-SHLTELHE.PGN..E...SAP.LN----N.K.LFDDV..ELQLT-PSNIPI.........IQPTLLPPLMSLL....KTTT...Q..DPTS...LS....VV.F.SLTTKLLSPF.SFTQCL.SLGGAESLVSALQ..SP.LP.GANLLAL.NIIQk.....aAS..S.PAEvdsL...AS....L.P...EVVEELLR.I.-.-.-.---...--..-----------....-..--...--..-----------..--.--.--.-----....--------------.-----..------..---..---.---------......-------------------wlsspdadvg.........................................
W3WPW3_PESFW/14-141 ..........................................ldkhldqliadptlasni---------.---..-...---.-------.K.LFDNV..TLQLTEVNIPPL.........-IPRLLPKITEIL....KQYQ...-..--QD...PA....IL.C.ELAIKLLGPL.TFTQVM.ALASEDAIIQAMR..SP.AP.SANLLAM.AVLE.......KA..-.---...-...--....-.-...--------.-.-.-.-.---...--..-----------....-..--...--..-----------..--.--.--.-----....--------------.-----..------..---..---.---------......-------------------aqspgeaailatlknivanfvvq............................
A0A5N6JSH5_MONLA/10-148 ..........................................................kl----EELEA.HLQ..E...LVR.SPDTPIDtK.LFDAV..ELQLTEYNISPL.........-IPKLLPTITQIL....LTTQ...-..--QD...PT....VL.A.SLSVKLLQPI.TFPQAL.ELASEDALILALR..SP.IP.AANILAI.TIIQ.......KA..T.---...-...--....-.-...--------.-.-.-.-.---...--..-----------....-..--...--..-----------..--.--.--.-----....--------------.-----..------..---..---.---------......-------------------kspnhvallsnmkgvvenyirtwlsnphv......................
A0A0D1W9A6_9EURO/14-181 ............................................evfahlaavesepqtq---------.---..-...---.----LLDeD.LLKRAerSLDLSTPKDL--.........-LWRLLETGERLL....QILQ...-..--QD...PR....PL.T.RLLERNVSLL.PFDELK.ATISAEKLEEGLN..SP.SA.PVQLLCL.AYLRk.....aAD..S.PSGasfV...AA....S.S...SLVQCLIT.VwL.S.T.EST...EVgeRSLEGIEALLA....V..DS...HD..SI---------..--.--.--.-----....--------------.-----..------..---..---.---------......-------------------tmlatngsl..........................................
G8YIA5_PICSO/46-256 ..................................................mleerkvtge---------.---..-...---.-------.-.-----..------------.........QLGRVVLAVNGVL....NDGE...Y.aELDP...EG....EV.V.NMLRKVLMGM.RMADIL.QLYSPEFVINGLQ..GG.-P.GVSCMVV.DVLAak...adED..A.TVE...L...MR....G.T...LVMTVLLK.K.L.F.C.SDC...GV..EFESRCENLIK....V..LVa.sRS..PVASGMLLGRE.fCD.FY.RT.VKTQR....GSKVFT-LMDYILL.LLPAGirSRTPIP..KDI..YIF.SKSECGLTG......A---LDEYLYVQYYVKL--aa.................................................
J3NPQ1_GAET3/11-151 ......................................................teleel-------EK.HLD..D...LTE.KPDTPIDaE.LFDRV..ELQLT-EANIPN.........IMPRLLPKLASIL....KVYQ...-..--LD...PL....VL.C.SLALKLLQAT.SFTQIF.TITSEADIVEALR..SP.AA.SANTLAM.AILGk.....aSA..S.PSE...-...--....-.-...--------.-.-.-.-.---...--..-----------....-..--...--..-----------..--.--.--.-----....--------------.-----..------..---..---.---------......-------------------vsilaastllvteflkcwlsapqve..........................
A0A3E2GT82_SCYLI/7-140 .........................................tgleeleshirqliddpst---------.---..-...---.---PLNA.K.LFDEV..QLQLTEANVAPL.........-IPRLLPSITQVL....PVYE...-..--KD...PT....IL.C.SLAIKLLQPV.TFTQCL.QLASEEALSQALR..SP.AP.AANILAI.TVIE.......KAarS.PSD...T...--....-.-...--------.-.-.-.-.---...--..-----------....-..--...--..-----------..--.--.--.-----....--------------.-----..------..---..---.---------......-------------------ailsimkgviedflrtw..................................
A0A1E3QNL2_9ASCO/3-240 .........................................................sdh---LSVLTN.HIS..K...SLE.LNTPLDE.Q.LIHSA..LSELGATRITAA.........DFGTFPQTVYALI....DSPH...L..ATVD...PN....LA.IrNVISAVLSLTtTFETVS.TLVPLPLVLKGLK..AP.--.PFQKLIIeDVVA.......--..R.SGD...Y...LA....G.T...EVYRALGA.L.Y.F.D.PET...AL..DIVELIQNTLV....L..LVkapSN..HLVRRRIGSSAdvAQ.II.DA.VVLTG....ALLGRIRLMDLMLS.FLPLF..PESQFA..TQW..YTH.QP-SAFQSE......--DVLFVGNLIRYYTGLLD...................................................
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