#=GF ID Hom_end_hint
#=GF AC PF05203.20
#=GF DE Hom_end-associated Hint
#=GF AU Studholme DJ;0000-0002-3010-6637
#=GF SE SCOP b.86.1.2
#=GF GA 32.10 32.10;
#=GF TC 32.10 32.10;
#=GF NC 32.00 32.00;
#=GF BM hmmbuild --hand HMM.ann SEED.ann
#=GF SM hmmsearch -Z 75585367 --cpu 4 -E 1000 HMM pfamseq
#=GF TP Domain
#=GF WK Homing_endonuclease
#=GF CL CL0363
#=GF NE PF05204;
#=GF NL G8JWX2.1/454-632
#=GF RN [1]
#=GF RM 12219083
#=GF RT Crystal structure of the intein homing endonuclease PI-SceI
#=GF RT bound to its recognition sequence.
#=GF RA Moure CM, Gimble FS, Quiocho FA;
#=GF RL Nat Struct Biol 2002;9:764-770.
#=GF DR INTERPRO; IPR007868;
#=GF DR SCOP; 1gpp; fa;
#=GF DR SO; 0000417; polypeptide_domain;
#=GF CC Homing endonucleases are encoded by mobile DNA elements that are
#=GF CC found inserted within host genes in all domains of life. The
#=GF CC crystal structure of the homing nuclease PI-Sce [1] revealed two
#=GF CC domains: an endonucleolytic centre resembling the C-terminal
#=GF CC domain of Drosophila melanogaster Hedgehog protein, and a second
#=GF CC domain containing the protein-splicing active site. This Domain
#=GF CC corresponds to the latter protein-splicing domain.
#=GF SQ 267
#=GS A0A1I0DDC1_9BACT/244-322 AC A0A1I0DDC1.1
#=GS A7TLB5_VANPO/284-715 AC A7TLB5.1
#=GS Q6BRM0_DEBHA/283-675 AC Q6BRM0.2
#=GS A0A5C0ZLU2_9SPHI/2071-2131 AC A0A5C0ZLU2.1
#=GS A0A8J6AWA9_9EUKA/83-482 AC A0A8J6AWA9.1
#=GS A0A1M6S312_9ACTN/2074-2144 AC A0A1M6S312.1
#=GS A0A8J6BF05_9EUKA/28-164 AC A0A8J6BF05.1
#=GS A0A7M1RX30_9CAUD/492-592 AC A0A7M1RX30.1
#=GS R9TRF4_9CAUD/87-211 AC R9TRF4.1
#=GS G8ZQA6_TORDC/1-456 AC G8ZQA6.1
#=GS A0A5K7YE91_9CAUD/34-125 AC A0A5K7YE91.1
#=GS A0A1G4J692_9SACH/8-526 AC A0A1G4J692.1
#=GS A0A6G8RI91_9CAUD/34-125 AC A0A6G8RI91.1
#=GS A0A376B8G5_9ASCO/284-728 AC A0A376B8G5.1
#=GS A0A2M9BSG3_9BACT/244-339 AC A0A2M9BSG3.1
#=GS A0A0B4ZZT7_9CAUD/308-349 AC A0A0B4ZZT7.1
#=GS A0A8F2FA21_9CAUD/34-125 AC A0A8F2FA21.1
#=GS A0A2T9ZE01_9FUNG/595-758 AC A0A2T9ZE01.1
#=GS G0WFK1_NAUDC/1-463 AC G0WFK1.1
#=GS A0A816EG79_9BILA/328-371 AC A0A816EG79.1
#=GS E0UKK2_GLOV7/364-429 AC E0UKK2.1
#=GS A0A1R1XW24_9FUNG/1914-2109 AC A0A1R1XW24.1
#=GS A0A5B8RN55_9CAUD/6-97 AC A0A5B8RN55.1
#=GS A0A6G8RQF0_9CAUD/34-125 AC A0A6G8RQF0.1
#=GS A0A5C0ZLU2_9SPHI/1925-1980 AC A0A5C0ZLU2.1
#=GS N1J5L1_BLUG1/1500-1624 AC N1J5L1.1
#=GS L0ASJ4_9CAUD/37-133 AC L0ASJ4.1
#=GS A0A383UQ36_BLUHO/1531-1655 AC A0A383UQ36.1
#=GS A0A086TIU4_9FUNG/28-213 AC A0A086TIU4.1
#=GS A0A329RLC5_9STRA/445-558 AC A0A329RLC5.1
#=GS A0A2U3D5S9_9BACL/274-378 AC A0A2U3D5S9.1
#=GS A0A1R0GMB9_9FUNG/1913-2055 AC A0A1R0GMB9.1
#=GS A0A6G6XPK6_9VIRU/648-1044 AC A0A6G6XPK6.1
#=GS F8XU21_9PROT/162-256 AC F8XU21.1
#=GS A0A2T9YGN6_9FUNG/596-1085 AC A0A2T9YGN6.1
#=GS A0A0D2X4Y0_CAPO3/768-1237 AC A0A0D2X4Y0.1
#=GS A0A372RSX8_9GLOM/409-842 AC A0A372RSX8.1
#=GS A0A1J9P8N8_9EURO/1526-1623 AC A0A1J9P8N8.1
#=GS G8JWX2_ERECY/284-671 AC G8JWX2.1
#=GS A0A4P6XLA9_9ASCO/284-742 AC A0A4P6XLA9.1
#=GS A0A1V2LD80_CYBFA/284-778 AC A0A1V2LD80.1
#=GS A0A7C9LK87_9DEIO/349-404 AC A0A7C9LK87.1
#=GS G8BNB8_TETPH/284-799 AC G8BNB8.1
#=GS A0A126PB81_9BACT/246-324 AC A0A126PB81.1
#=GS A0A8H6RG36_9PEZI/1534-1615 AC A0A8H6RG36.1
#=GS F9ZMR9_ACICS/472-586 AC F9ZMR9.1
#=GS A0A2W7I623_9PROT/32-114 AC A0A2W7I623.1
#=GS G8ZLC3_TORDC/1-463 AC G8ZLC3.1
#=GS A0A1S8VSS7_9FUNG/870-1291 AC A0A1S8VSS7.1
#=GS A0A7H9HS91_9SACH/13-513 AC A0A7H9HS91.1
#=GS W6TTZ2_HOLOB/12-87 AC W6TTZ2.1
#=GS G7E5L8_MIXOS/284-742 AC G7E5L8.1
#=GS A0A432VA30_9HYPH/34-149 AC A0A432VA30.1
#=GS A0A4V1IUG2_9FUNG/282-717 AC A0A4V1IUG2.1
#=GS A0A7H9B6S1_ZYGMR/1-463 AC A0A7H9B6S1.1
#=GS A0A2Z6SEZ6_9GLOM/413-846 AC A0A2Z6SEZ6.1
#=GS I0AHG6_IGNAJ/229-329 AC I0AHG6.1
#=GS A0A1G4JPN0_9SACH/284-666 AC A0A1G4JPN0.1
#=GS A0A6M0L626_9PROT/203-304 AC A0A6M0L626.1
#=GS B8FA79_DESAL/3543-3590 AC B8FA79.1
#=GS A0A1S8W8Q5_9FUNG/814-1285 AC A0A1S8W8Q5.1
#=GS A0A411BAQ8_9CAUD/87-214 AC A0A411BAQ8.1
#=GS A0A317XTZ4_9BASI/279-707 AC A0A317XTZ4.1
#=GS A0A372RW14_9GLOM/638-1022 AC A0A372RW14.1
#=GS A0A397TDD6_9GLOM/1-138 AC A0A397TDD6.1
#=GS A0A2P4QS38_RHIID/409-843 AC A0A2P4QS38.1
#=GS G8DEE1_9PHYC/156-252 AC G8DEE1.1
#=GS A0A0R1VN30_9LACO/36-162 AC A0A0R1VN30.1
#=GS A0A0N9R0K9_CEV01/529-934 AC A0A0N9R0K9.1
#=GS A0A0L0G3W8_9EUKA/49-159 AC A0A0L0G3W8.1
#=GS A0A2I2EY52_ASPCN/1526-1666 AC A0A2I2EY52.1
#=GS A0A553DR05_9FLAO/232-340 AC A0A553DR05.1
#=GS V6LXG4_9EUKA/4-178 AC V6LXG4.1
#=GS A0A836C412_9CHLO/90-250 AC A0A836C412.1
#=GS D6CTL1_THIA3/331-402 AC D6CTL1.1
#=GS I0K7N6_9BACT/253-340 AC I0K7N6.1
#=GS A0A1E4RQA6_9ASCO/283-765 AC A0A1E4RQA6.1
#=GS A0A397GDQ6_9GLOM/1034-1470 AC A0A397GDQ6.1
#=GS C6HTZ2_9BACT/315-397 AC C6HTZ2.1
#=GS Q5B4K7_EMENI/1512-1640 AC Q5B4K7.1
#=GS A3LP04_PICST/283-730 AC A3LP04.2
#=GS A0A2T9ZE01_9FUNG/1894-2009 AC A0A2T9ZE01.1
#=GS A0A8H7GRG2_9ASCO/244-702 AC A0A8H7GRG2.1
#=GS L1KI73_9ACTN/223-281 AC L1KI73.1
#=GS A0A8J6C0Q5_9EUKA/49-134 AC A0A8J6C0Q5.1
#=GS A0A8J6B6S3_9EUKA/917-1037 AC A0A8J6B6S3.1
#=GS A0A3P3VNX0_9GAMM/62-105 AC A0A3P3VNX0.1
#=GS G8ZQA5_TORDC/12-474 AC G8ZQA5.1
#=GS A0A2G5BDK3_COERN/528-893 AC A0A2G5BDK3.1
#=GS L7RCI5_9VIRU/857-1126 AC L7RCI5.1
#=GS A0A1S2VRN5_9BACT/243-328 AC A0A1S2VRN5.1
#=GS A0A1G4M6H5_LACFM/170-746 AC A0A1G4M6H5.1
#=GS S4TRC9_9CAUD/34-121 AC S4TRC9.1
#=GS A0A397SPX4_9GLOM/415-856 AC A0A397SPX4.1
#=GS A0A1E4TBF3_9ASCO/282-687 AC A0A1E4TBF3.1
#=GS A0A288DFE1_9BACT/1054-1113 AC A0A288DFE1.1
#=GS A0A1R0GMB9_9FUNG/596-1090 AC A0A1R0GMB9.1
#=GS A0A437MC52_9PROT/38-113 AC A0A437MC52.1
#=GS A7IX33_PBCVN/439-828 AC A7IX33.1
#=GS A0A0N9R2V4_CEV01/649-738 AC A0A0N9R2V4.1
#=GS A0A367YP60_9ASCO/284-775 AC A0A367YP60.1
#=GS A0A2J7ZK30_9CHLO/1042-1127 AC A0A2J7ZK30.1
#=GS A0A4C2E911_9SACH/284-738 AC A0A4C2E911.1
#=GS N2C0G3_9ACTN/36-386 AC N2C0G3.1
#=GS I2GXM6_TETBL/1-463 AC I2GXM6.1
#=GS A0A2P4Q1D3_RHIID/649-1026 AC A0A2P4Q1D3.1
#=GS A0A7D7FD40_9CAUD/87-216 AC A0A7D7FD40.1
#=GS A0A5E8C592_9ASCO/487-606 AC A0A5E8C592.1
#=GS A1ZUM1_9BACT/19-89 AC A1ZUM1.1
#=GS A0A5K0UA21_9VIRU/214-331 AC A0A5K0UA21.1
#=GS A0A835SDK4_CHLIN/763-1156 AC A0A835SDK4.1
#=GS E3T596_CROVB/141-526 AC E3T596.1
#=GS B9XA08_PEDPL/492-603 AC B9XA08.1
#=GS B6JY11_SCHJY/285-759 AC B6JY11.2
#=GS A0A1E3P9G0_WICAA/599-963 AC A0A1E3P9G0.1
#=GS Q6FQS3_CANGA/285-698 AC Q6FQS3.1
#=GS A0A1S7HAW7_9SACH/284-738 AC A0A1S7HAW7.1
#=GS G8C1W5_TETPH/1-463 AC G8C1W5.1
#=GS A0A061HE76_BLUGR/368-494 AC A0A061HE76.1
#=GS A0A086TIS7_9FUNG/1-116 AC A0A086TIS7.1
#=GS A0A8J6EAH1_9EUKA/53-383 AC A0A8J6EAH1.1
#=GS A0A2T9Z5W9_9FUNG/595-753 AC A0A2T9Z5W9.1
#=GS J7RJ26_KAZNA/284-757 AC J7RJ26.1
#=GS A0A8J6E4M0_9EUKA/53-383 AC A0A8J6E4M0.1
#=GS A0A0C7N7Q2_9SACH/10-529 AC A0A0C7N7Q2.1
#=GS A0A1L0DCU1_9ASCO/244-292 AC A0A1L0DCU1.1
#=GS A0A2I1GLX1_9GLOM/408-598 AC A0A2I1GLX1.1
#=GS A0A541CKZ5_9PROT/35-154 AC A0A541CKZ5.1
#=GS A0A1Y1WCU2_9FUNG/283-740 AC A0A1Y1WCU2.1
#=GS Q2S6J9_SALRD/231-335 AC Q2S6J9.1
#=GS A0A7H9HU35_9SACH/17-514 AC A0A7H9HU35.1
#=GS A0A1X7QY67_9SACH/284-788 AC A0A1X7QY67.1
#=GS A0A015K856_RHIIW/300-420 AC A0A015K856.1
#=GS U7Q1H8_SPOS1/262-759 AC U7Q1H8.1
#=GS A0A0N9R1K5_CEV01/55-442 AC A0A0N9R1K5.1
#=GS A0A1Q2YLF7_9ASCO/280-805 AC A0A1Q2YLF7.1
#=GS A0A411AV32_9CAUD/8-121 AC A0A411AV32.1
#=GS A0A345J3R8_9PROT/205-302 AC A0A345J3R8.1
#=GS A0A5P8PNG6_9CAUD/34-125 AC A0A5P8PNG6.1
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#=GS A0A288DFR5_9BACT/224-280 AC A0A288DFR5.1
#=GS A0A3D9H1E6_9PROT/521-577 AC A0A3D9H1E6.1
#=GS A0A6M0IHJ4_9BACT/208-306 AC A0A6M0IHJ4.1
#=GS A5DXZ0_LODEL/280-699 AC A5DXZ0.1
#=GS A0A167X1Y2_9PEZI/262-747 AC A0A167X1Y2.1
#=GS A0A4V0I5Z4_9BACT/301-373 AC A0A4V0I5Z4.1
#=GS A0A1S7HNG5_9SACH/1-463 AC A0A1S7HNG5.1
#=GS A0A0J6WV84_9FIRM/33-158 AC A0A0J6WV84.1
#=GS A0A0D2X4Y0_CAPO3/1840-1998 AC A0A0D2X4Y0.1
#=GS Q6CL64_KLULA/284-692 AC Q6CL64.1
#=GS A0A8H3WWM7_GIGMA/69-215 AC A0A8H3WWM7.1
#=GS A0A512UMN1_9ASCO/283-551 AC A0A512UMN1.1
#=GS J7RZB8_KAZNA/1-458 AC J7RZB8.1
#=GS A0A8J6DY71_9EUKA/239-606 AC A0A8J6DY71.1
#=GS A0A514ZZ56_9BACT/243-331 AC A0A514ZZ56.1
#=GS A6QC64_SULNB/206-309 AC A6QC64.1
#=GS A0A839HD93_9GAMM/195-286 AC A0A839HD93.1
#=GS A0A2D3WG09_9PROT/206-321 AC A0A2D3WG09.1
#=GS A0A0D2H4V5_9EURO/358-833 AC A0A0D2H4V5.1
#=GS J8LQN6_SACAR/1-464 AC J8LQN6.1
#=GS A0A0P0YNX5_9PHYC/116-217 AC A0A0P0YNX5.1
#=GS C5M9I6_CANTT/244-713 AC C5M9I6.1
#=GS A0A2P5HXR1_9PEZI/1556-1644 AC A0A2P5HXR1.1
#=GS A7TIB9_VANPO/1-463 AC A7TIB9.1
#=GS A0A1Y5RRB6_9RHOB/32-140 AC A0A1Y5RRB6.1
#=GS A0A397UUE2_9GLOM/514-753 AC A0A397UUE2.1
#=GS A0A0A7LLQ8_9BACT/244-327 AC A0A0A7LLQ8.1
#=GS A0A1E3NMZ3_9ASCO/284-777 AC A0A1E3NMZ3.1
#=GS A0A1S7HNM7_9SACH/284-738 AC A0A1S7HNM7.1
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#=GS A0A1X2HHI8_SYNRA/1333-1829 AC A0A1X2HHI8.1
#=GS A0A2Z4LWQ9_9FLAO/1820-1894 AC A0A2Z4LWQ9.1
#=GS U9W5T1_9CYAN/226-319 AC U9W5T1.1
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#=GS A0A8J6E3W2_9EUKA/179-263 AC A0A8J6E3W2.1
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#=GS A0A8J6B186_9EUKA/1877-2274 AC A0A8J6B186.1
#=GS A0A1D2VFN5_9ASCO/284-685 AC A0A1D2VFN5.1
#=GS A0A8J6E9I3_9EUKA/132-295 AC A0A8J6E9I3.1
#=GS A0A7H9HRD0_9SACH/284-708 AC A0A7H9HRD0.1
#=GS A0A433DJ58_9FUNG/1515-1632 AC A0A433DJ58.1
#=GS A0A8J6AQZ6_9EUKA/366-696 AC A0A8J6AQZ6.1
#=GS A0A1S1Y7K3_9GAMM/229-308 AC A0A1S1Y7K3.1
#=GS A0A1E1GE23_9CAUD/386-499 AC A0A1E1GE23.1
#=GS VATA_YEAST/284-736 AC P17255.3
#=GS A0A076HKJ9_9BACT/244-331 AC A0A076HKJ9.1
#=GS A0A2H3NPZ9_9BACT/231-325 AC A0A2H3NPZ9.1
#=GS M3K3J1_CANMX/284-733 AC M3K3J1.1
#=GS A0A4C2E658_9SACH/1-463 AC A0A4C2E658.1
#=GS A0A7H9B2H1_ZYGMR/11-470 AC A0A7H9B2H1.1
#=GS A0A7H9HWX5_9SACH/17-520 AC A0A7H9HWX5.1
#=GS A8BML4_GIAIC/5-439 AC A8BML4.1
#=GS G0VAU9_NAUCC/3-104 AC G0VAU9.1
#=GS HO_YEAST/1-464 AC P09932.2
#=GS A0A5C6S2X4_9BACT/242-328 AC A0A5C6S2X4.1
#=GS A0A8J6B364_9EUKA/243-352 AC A0A8J6B364.1
#=GS J4U3C4_SACK1/1-464 AC J4U3C4.1
#=GS A0A2T9YGN6_9FUNG/1895-1999 AC A0A2T9YGN6.1
#=GS A0A2I1FXS8_9GLOM/642-1019 AC A0A2I1FXS8.1
#=GS A0A1G4MEZ8_LACFM/12-542 AC A0A1G4MEZ8.1
#=GS U7UMX0_9FIRM/43-169 AC U7UMX0.1
#=GS A0A7H9B0L7_ZYGMR/12-558 AC A0A7H9B0L7.1
#=GS H2APW1_KAZAF/284-774 AC H2APW1.1
#=GS A0A0D2HES5_9EURO/357-849 AC A0A0D2HES5.1
#=GS A0A512UMM1_9ASCO/7-158 AC A0A512UMM1.1
#=GS A0A2P7TWC8_9SPHI/241-348 AC A0A2P7TWC8.1
#=GS A0A8J6E2C4_9EUKA/383-469 AC A0A8J6E2C4.1
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