#=GF ID   HrpE
#=GF AC   PF06188.16
#=GF DE   HrpE/YscL/FliH and V-type ATPase subunit E
#=GF AU   Moxon SJ;0000-0003-4644-1816
#=GF SE   Pfam-B_11055 (release 9.0)
#=GF GA   23.50 23.50;
#=GF TC   23.50 23.50;
#=GF NC   23.40 23.40;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch --cpu 4 -E 1000 -Z 75585367 HMM pfamseq
#=GF TP   Family
#=GF CL   CL0255
#=GF RN   [1]
#=GF RM   7579617
#=GF RT   The complete hrp gene cluster of Pseudomonas syringae pv.
#=GF RT   syringae 61 includes two blocks of genes required for harpinPss
#=GF RT   secretion that are arranged colinearly with Yersinia ysc
#=GF RT   homologs. 
#=GF RA   Huang HC, Lin RH, Chang CJ, Collmer A, Deng WL; 
#=GF RL   Mol Plant Microbe Interact 1995;8:733-746.
#=GF RN   [2]
#=GF RM   16522800
#=GF RT   Evolutionary links between FliH/YscL-like proteins from
#=GF RT   bacterial type III secretion systems and second-stalk components
#=GF RT   of the FoF1 and vacuolar ATPases. 
#=GF RA   Pallen MJ, Bailey CM, Beatson SA; 
#=GF RL   Protein Sci. 2006;15:935-941.
#=GF RN   [3]
#=GF RM   15292229
#=GF RT   Building the stator of the yeast vacuolar-ATPase: specific
#=GF RT   interaction between subunits E and G.
#=GF RA   Fethiere J, Venzke D, Diepholz M, Seybert A, Geerlof A, Gentzel
#=GF RA   M, Wilm M, Bottcher B;
#=GF RL   J Biol Chem. 2004;279:40670-40676.
#=GF DR   INTERPRO; IPR009335;
#=GF DR   SO; 0100021; polypeptide_conserved_region;
#=GF CC   This is a prokaryotic family that contains proteins of the FliH
#=GF CC   and HrpE/YscL family.       These proteins are involved in type
#=GF CC   III secretion, which is the process that drives flagellar
#=GF CC   biosynthesis and mediates bacterial-eukaryotic interactions
#=GF CC   [1-2].  This family also V-type ATPase subunit E.     This
#=GF CC   subunit appears to form a tight interaction with subunit G in
#=GF CC   the F0 complex [3]. Subunits E and G may act together as stators
#=GF CC   to prevent certain subunits from rotating with the central
#=GF CC   rotary element [3].  Pfam:PF01991 also contains V-type ATPase
#=GF CC   subunit E proteins.
#=GF SQ   88
#=GS A0A105TDL6_9PSED/1-187    AC A0A105TDL6.1
#=GS A0A0R1HY78_9LACO/56-204   AC A0A0R1HY78.1
#=GS A0A2I5T7R1_SERS3/1-191    AC A0A2I5T7R1.1
#=GS A0A3A3FG50_9BURK/28-212   AC A0A3A3FG50.1
#=GS E0SE50_DICD3/1-191        AC E0SE50.1
#=GS A0A845GZ59_9BURK/2-180    AC A0A845GZ59.1
#=GS A0A077LPW8_9PSED/1-191    AC A0A077LPW8.1
#=GS B7XKX3_ENTBH/1-187        AC B7XKX3.1
#=GS A0A0R2FCM6_9LACO/37-183   AC A0A0R2FCM6.1
#=GS Q7NUV3_CHRVO/8-202        AC Q7NUV3.1
#=GS R6GMI9_9FIRM/8-161        AC R6GMI9.1
#=GS A0A0R2AGZ0_9LACO/64-218   AC A0A0R2AGZ0.1
#=GS A0A1E4USF0_9PSED/1-191    AC A0A1E4USF0.1
#=GS A0A7S8C6J6_9HYPH/2-157    AC A0A7S8C6J6.1
#=GS A0A2S5KQQ5_9PROT/1-202    AC A0A2S5KQQ5.1
#=GS A0A8H9Z1G4_9PSED/1-186    AC A0A8H9Z1G4.1
#=GS A0A8J3EI71_9RHOB/2-204    AC A0A8J3EI71.1
#=GS Q887C4_PSESM/1-187        AC Q887C4.1
#=GS A0A0A2W1R2_BEABA/1-202    AC A0A0A2W1R2.1
#=GS A0A6I4MWT5_9ACTN/4-189    AC A0A6I4MWT5.1
#=GS A0A4Q0YP62_9GAMM/16-195   AC A0A4Q0YP62.1
#=GS A0A506UAK6_9HYPH/97-249   AC A0A506UAK6.1
#=GS A0A545U3K6_9GAMM/9-178    AC A0A545U3K6.1
#=GS R9KIK1_9FIRM/55-161       AC R9KIK1.1
#=GS A0A8J7L205_9FIRM/45-167   AC A0A8J7L205.1
#=GS A0A6M8MQV2_9PSED/1-187    AC A0A6M8MQV2.1
#=GS A0A4R1NFB3_9GAMM/1-106    AC A0A4R1NFB3.1
#=GS A0A845SEI8_9GAMM/45-201   AC A0A845SEI8.1
#=GS A0A095XG12_9FIRM/1-104    AC A0A095XG12.1
#=GS A0A3D9H2M9_9PROT/10-195   AC A0A3D9H2M9.1
#=GS VATE_CHLTR/4-151          AC O84312.1
#=GS A0A1Y4J5E3_9FIRM/31-154   AC A0A1Y4J5E3.1
#=GS D8IZY4_HERSS/21-193       AC D8IZY4.1
#=GS A0A0X1T870_PSEAA/1-139    AC A0A0X1T870.1
#=GS A0A0X1T642_PSEAA/2-177    AC A0A0X1T642.1
#=GS Q2SH65_HAHCH/7-193        AC Q2SH65.1
#=GS A0A1H3Y2W1_9GAMM/1-191    AC A0A1H3Y2W1.1
#=GS A0A0R2B993_SECCO/58-201   AC A0A0R2B993.1
#=GS A0A421DQ63_9GAMM/1-191    AC A0A421DQ63.1
#=GS A0A494X842_9BURK/7-188    AC A0A494X842.1
#=GS A0A3R8QRJ6_9CORY/220-342  AC A0A3R8QRJ6.1
#=GS A0A1X7E058_TRICW/7-193    AC A0A1X7E058.1
#=GS A0A0G4K0Y1_9GAMM/1-191    AC A0A0G4K0Y1.1
#=GS W0V4P9_9BURK/3-175        AC W0V4P9.1
#=GS A0A3A8U707_9BACT/46-138   AC A0A3A8U707.1
#=GS A0A1I7LWD0_9BURK/64-219   AC A0A1I7LWD0.1
#=GS A0A7X4LNU6_9VIBR/13-204   AC A0A7X4LNU6.1
#=GS A0A0M2K9K8_9GAMM/1-190    AC A0A0M2K9K8.1
#=GS A0A1Y6J2F9_9VIBR/1-202    AC A0A1Y6J2F9.1
#=GS E0WTJ3_9ENTR/25-198       AC E0WTJ3.1
#=GS A0A014M1T2_9GAMM/1-190    AC A0A014M1T2.1
#=GS A0A1G9J582_9PSED/1-191    AC A0A1G9J582.1
#=GS L8JG65_9GAMM/5-148        AC L8JG65.1
#=GS A0A0M9GGP5_9PSED/2-137    AC A0A0M9GGP5.1
#=GS A0A853IH53_9GAMM/2-153    AC A0A853IH53.1
#=GS I1SBD1_PECAS/1-191        AC I1SBD1.1
#=GS C4K5N0_HAMD5/1-109        AC C4K5N0.1
#=GS A0A1C3ER38_9GAMM/22-195   AC A0A1C3ER38.1
#=GS A0A4Q2J394_9BURK/22-209   AC A0A4Q2J394.1
#=GS A0A261UTA3_9BORD/1-192    AC A0A261UTA3.1
#=GS A0A1R1LDP4_9GAMM/3-192    AC A0A1R1LDP4.1
#=GS A0A1W6B2N1_9GAMM/6-197    AC A0A1W6B2N1.1
#=GS R7L027_9FIRM/44-163       AC R7L027.1
#=GS A0A3E2N789_9CLOT/45-138   AC A0A3E2N789.1
#=GS A0A261GS70_9GAMM/6-193    AC A0A261GS70.1
#=GS A0A1Z5ICH6_9LACO/57-212   AC A0A1Z5ICH6.1
#=GS B2VGB7_ERWT9/1-190        AC B2VGB7.1
#=GS C2KWS2_9FIRM/35-153       AC C2KWS2.1
#=GS A0A089RC34_9ENTR/5-202    AC A0A089RC34.1
#=GS A0A845SEI8_9GAMM/1-55     AC A0A845SEI8.1
#=GS A0A239K087_9BURK/14-166   AC A0A239K087.1
#=GS A0A0L7TH51_9GAMM/1-190    AC A0A0L7TH51.1
#=GS A0A085G7Z3_9GAMM/1-202    AC A0A085G7Z3.1
#=GS G8Q3R7_PSEO1/1-187        AC G8Q3R7.1
#=GS A0A5R9LDM4_9ENTR/1-190    AC A0A5R9LDM4.1
#=GS A0A1L3GGD5_SYNAC/8-155    AC A0A1L3GGD5.1
#=GS A0A853I0N5_9GAMM/3-191    AC A0A853I0N5.1
#=GS A0A0C7P523_DEFTU/24-221   AC A0A0C7P523.1
#=GS A0A655MYE5_CHLTH/4-151    AC A0A655MYE5.1
#=GS F2JTE6_MARM1/5-206        AC F2JTE6.1
#=GS A0A5S9QZF0_9GAMM/12-151   AC A0A5S9QZF0.1
#=GS A0A443IAA6_9GAMM/1-202    AC A0A443IAA6.1
#=GS R7IS01_9CLOT/32-160       AC R7IS01.1
#=GS A0A810PT36_9FIRM/8-123    AC A0A810PT36.1
#=GS A0A427K9Y4_9GAMM/1-194    AC A0A427K9Y4.1
#=GS A0A6M8U6N6_9GAMM/1-202    AC A0A6M8U6N6.1
#=GS X5EAF6_9CORY/211-338      AC X5EAF6.1
#=GS A0A839K166_9FIRM/45-186   AC A0A839K166.1
A0A105TDL6_9PSED/1-187               .....................................................MLLRRKIELRADLPGLPS.LLMPHQTLL..DC.G..Q.AQ.Q.MLTQAHSKVDALLRAAH...T..A..S......E.......AA.CE....-.......-...........-.......-K...A.......R.S........E...........F.W...............GM......A....NA....Q..LA.Q.WA.TQ..H.S.....A...Q...C..QALE....S...NAT....QV..V....NQAL....L...RLLDE...V..P......H..T......S.R..I...TA.L...L.AQ....L........L..RV...Q....CP.S....L...STV.L..R....CHP....DAQ....ED....IQQ.WLS....T....HV....DN.....VW....Q....L..EP...DESLPPLSLVLVSEHGDLHID....WFTTRDALL.....................................................
A0A0R1HY78_9LACO/56-204              .........................klkyftelkdslnqsiivaqeaadkvkn------------------.---------..NS.Q..ReAE.I.INQEAQKQATDIVNAAN...E..K..A......D.......QL.VN....G.......A...........V.......EQ...A.......K.R........L...........-.A...............IE......T....DD....L..KK.G.VR.VF..R.Q.....R...L...E..VMLD....T...QLE....VV..K....GGDW....D...DL---...-..-......-..-......-.-..-...--.-...-.--....-........-..--...-....--.-....-...---.-..-....---....---....--....---.---....-....--....--.....--....-....-..--...---------------------....---------ltqdssfdelkraieqseldnangqevnsnsqapvsenqsaa...........
A0A2I5T7R1_SERS3/1-191               .....................................................MLTRRKLALVAGMDAEDV.GLIKAERLQ..QH.W..L.GL.D.VLAQARQQSTALIEEAR...Q..Q..A......Q.......DV.IL....R.......T...........T.......EQ...A.......E.Q........Q...........F.W...............RQ......A....DD....I..LR.G.WQ.QE..R.D.....E...M...E..AYLA....S...QAG....QI..L....ADAM....T...QLLTD...V..P......D..P......Q.R..H...QA.L...L.RQ....L........L..RT...Q....GG.E....G...RGM.L..Y....CHP....HRK....AD....VTA.WLD....E....HA....HL.....GW....K....L..NG...DDTLAEDALKLVTPQGVMTLS....WQQAVDQLL.....................................................
A0A3A3FG50_9BURK/28-212              .........................gvrrgivkadelglgdlaqsivddarve------------------.---------..--.-..-.AA.R.TMEEARMQAATMIEEAR...A..A..M......A.......RE.KE....A.......V...........A.......EQ...A.......E.Q........A...........V.W...............RE......A....AA....Y..QS.Q.YE.RR..L.A.....L...F...T..EALE....E...HAL....DV..V....RKAF....T...MLSAK...L..P......A..R......E.K..I...QS.T...V.CT....L........M..SE...A....GQ.L....P...DCT.L..H....VNA....QDL....EG....LQA.---....S....QE....DI.....PW....P....L..QA...DAALRPGECLLVAERGTWRAS....FEGSVQALL.....................................................
E0SE50_DICD3/1-191                   .....................................................MLTRRCLKLVAGTDVQEA.ELIRVEQLQ..QH.Q..R.GL.A.VMAEARQQADALLDEAR...Q..Q..A......H.......EA.IA....V.......A...........T.......GQ...A.......E.Q........Q...........F.W...............RQ......A....DE....I..LR.G.WQ.QE..R.E.....Q...M...E..NWLV....A...RCG....QL..L....TDAM....T...QILKA...V..P......D..A......E.R..Y...PA.L...L.RQ....L........L..RT...Q....GG.E....G...RGT.L..Y....CHP....DSQ....AD....VAA.WLT....E....HS....HL.....GW....K....L..SS...DDALAQDTLKLITAQGVMTLS....WQRAVEQLL.....................................................
A0A845GZ59_9BURK/2-180               ................................................ndfcv------------ASITTD.TLLRTEHGL..WR.S..D.AL.A.LTLDARSAATRILDEAR...R..E..A......E.......QL.RL....RaadearaA...........V.......RD...A.......E.H........Q...........A.L...............AR......A....AA....Q..LQ.L.LE.QR..H.A.....T...L...L..DGAQ....A...MVI....DL..A....LALF....D...RALAE...T..T......P..R......E.R..L...EA.C...C.RR....L........L..QE...T...pRS.P....G...QPV.L..Y....LHP....DDR....DL....---.---....A....PP....DP.....AW....E....C..KT...DATLARGACRLEA--------....---------dggewradft...........................................
A0A077LPW8_9PSED/1-191               .....................................................MLTRRTLTFPGDRHTVTG.SLLPRELFD..DC.R..L.AE.Q.LVQQAQAQARQILDQAR...S..E..A......L.......LL.GR....Q.......A...........E.......EQ...A.......R.A........E...........V.L...............EQ......S....LA....L..LE.D.LR.DQ..H.Q.....R...R...E..AAML....E...VAR....EL..V....SAAV....Q...QVLNE...Q..P......P..L......Q.R..I...EA.V...L.GH....L........L..SA...Q....PD.E....P...LAR.L..H....CHP....ERL....EE....LAT.CLQ....H....GG....RE.....GW....S....L..QG...DPRLAADALSLRTERGEFNLD....WHSLVQHVL.....................................................
B7XKX3_ENTBH/1-187                   .....................................................MLCRYTIELLKDATHVQS.SLILREELA..NW.K..Q.AD.Q.LLNRANAQADELISLAE...E..K..C......E.......AL.LE....-.......-...........-.......-K...V.......S.L........E...........V.W...............QR......A....DA....Q..FK.R.WE.HD..R.Q.....E...M...Y..DSLE....H...YAT....SI..T....NQAI....R...CLLDE...T..V......A..Q......Q.R..L...GA.L...L.KH....L........M..AN...Q....IQ.E....V...NAT.L..L....CHP....HDL....EE....VKQ.FFV....R....HT....ST.....RW....K....L..QA...DDTTPLQTLVLKTDEGDFRIS....WNSMIE---aff..................................................
A0A0R2FCM6_9LACO/37-183              .....qitldqnkslteqlssaneklkyfndlkdslnqsiivaqeaadkvrsn------------------.---------..SQ.K..E.AE.I.INREAQKQANDIVSEAT...E..K..A......N.......QL.IQ....E.......A...........S.......KR...A.......Q.-........T...........L.A...............VE......T....DD....L..KK.S.TR.VF..R.Q.....R...L...Q..VMLE....S...QLE....EI..K....SDNW....N...NLLKD...D..G......T..S......-.-..-...--.-...-.--....-........-..--...-....--.-....-...---.-..-....---....---....--....---.---....-....--....--.....--....-....-..--...---------------------....---------sydeiqqviaagsl.......................................
Q7NUV3_CHRVO/8-202                   ..........................................itklpgnaplg------------------.PIIPAGDLA..DY.I..E.AS.E.IIEQAREQAKSIIQDGE...K..K..I......E.......NL.CE....M.......Y...........E.......EI...S.......E.A........-...........A.WqdglknleqqapalrQQ......A....VA....N..VV.E.WL.IA..E.Q.....E...L...E..HKII....E...RLE....GQ..L....CDIL....I...KVFKE...Y..Y......G..Q......Q.N..E...SQ.L...L.IN....L........L..RE...RvralLD.S....E...EGV.L..Y....VCP....EQY....EE....LKQ.ALI....S....F-....--.....--....-....-..--...---------------------....---------pklliesdasimagkallqtplvilslslneq.....................
R6GMI9_9FIRM/8-161                   .........................................lvssikkdgids------------------.---------..AN.Q..Q.AA.A.ILADARKQADAIVAEAK...S..Q..A......D.......KL.RD....D.......A...........-.......-K...A.......E.I........D...........V.F...............KT......S....-A....Q..LS.A.QQ.AK..R.D.....AvlaF...R..QEIQ....K...EFE....KI..L....AAD-....-...-----...V..G......K..A......L.D..Q...QT.L...A.RL....I........Q..AA...V....Q-.-....-...---.-..-....---....---....--....---.---....-....--....--.....--....-....-..--...---------------------....---------gedvsgyavevgqvtdgirqqlaqelkngleirpskkvgagfrlaakd.....
A0A0R2AGZ0_9LACO/64-218              ...............................kdslnqsilvaqeaadkvksna------------------.---------..-Q.K..E.AD.I.TLREAQKQATDIVSEAN...E..K..A......N.......QL.IS....N.......A...........A.......DS...-.......T.R........K...........L.T...............VE......T....ND....L..KK.Q.TR.VF..R.Q.....R...L...Q..VMLE....S...QLG....VV..T....SDDW....D...DLLKE...S..-......D..V......S.S..Y...DE.I...Q.KV....L........G..KT...L....DN.E....G...NQS.V..N....SEP....ASE....--....---.---....-....--....--.....--....-....-..--...---------------------....---------vaeqpadtqtveepvndaaaa................................
A0A1E4USF0_9PSED/1-191               .....................................................MLASRSLTLTPNRSTVNE.PLLRREVLA..QS.L..L.AE.E.LLDDARAQAQAIFDTAQ...A..E..V......Q.......AL.RQ....R.......C...........E.......AE...A.......R.A........E...........V.W...............KQ......A....QG....L..LD.D.LR.QQ..R.E.....V...T...L..ASIV....E...AAQ....EL..V....QQAL....E...IVLDE...L..P......D..D......K.K..V...SA.V...L.RQ....L........T..LA...I....SN.E....E...SAL.I..Y....CHP....DQL....TQ....LAH.SLQ....E....QG....QR.....GW....T....L..RG...EPSLAPDALSLRTEQGDFSLS....WSALQQH--iw...................................................
A0A7S8C6J6_9HYPH/2-157               .....................................lrlstaaasrpdvfpa-----------------D.GILKADRLA..RL.K..D.AE.S.IEKTARREAARCLRRAR...E..E..A......R.......AI.RR....K.......A...........R.......ET...G.......H.A........E...........G.L...............AR......F....SE....A..IA.R.VG.EA..R.T.....R...L...E..GEL-....-...--D....TL..L....RQAL....H...GVLGR...M..P......A..E......D.W..L...SA.V...L.DD....V........L..HE...L....HG.E....E...EIV.I..M....AHP....ASM....RA....LSA.ALA....A....LK....--.....--....-....-..--...---------------------....---------rrnrdlva.............................................
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