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Database: Pfam
Entry: LYRIC
LinkDB: LYRIC
Original site: LYRIC 
#=GF ID   LYRIC
#=GF AC   PF15686.9
#=GF DE   Lysine-rich CEACAM1 co-isolated protein family
#=GF AU   Eberhardt R;0000-0001-6152-1369
#=GF AU   Coggill P;0000-0001-5731-1588
#=GF AU   Hetherington K;
#=GF SE   Jackhmmer:Q86UE4
#=GF GA   30.00 30.00;
#=GF TC   30.60 30.00;
#=GF NC   28.40 29.80;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -E 1000 -Z 75585367 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Family
#=GF RN   [1]
#=GF RM   14980505
#=GF RT   3D3/lyric: a novel transmembrane protein of the endoplasmic
#=GF RT   reticulum and nuclear envelope, which is also present in the
#=GF RT   nucleolus.
#=GF RA   Sutherland HG, Lam YW, Briers S, Lamond AI, Bickmore WA;
#=GF RL   Exp Cell Res. 2004;294:94-105.
#=GF RN   [2]
#=GF RM   15383321
#=GF RT   Identification of a novel protein, LYRIC, localized to tight
#=GF RT   junctions of polarized epithelial cells.
#=GF RA   Britt DE, Yang DF, Yang DQ, Flanagan D, Callanan H, Lim YP, Lin
#=GF RA   SH, Hixson DC;
#=GF RL   Exp Cell Res. 2004;300:134-148.
#=GF RN   [3]
#=GF RM   18440304
#=GF RT   LYRIC/AEG-1 overexpression modulates BCCIPalpha protein levels
#=GF RT   in prostate tumor cells.
#=GF RA   Ash SC, Yang DQ, Britt DE;
#=GF RL   Biochem Biophys Res Commun. 2008;371:333-338.
#=GF DR   INTERPRO; IPR031402;
#=GF DR   SO; 0100021; polypeptide_conserved_region;
#=GF CC   LYRIC is a family of proteins found in eukaryotes. It is a
#=GF CC   type-1b membrane protein with a single transmembrane domain and
#=GF CC   localises to the endoplasmic reticulum and the nuclear envelope.
#=GF CC   It is also found in the nucleolus, suggesting functional
#=GF CC   relationships between these two cellular compartments [1]. It is
#=GF CC   found to be colocalised with tight junction proteins ZO-1 and
#=GF CC   occludin in polarised epithelial cells, suggesting that LYRIC is
#=GF CC   part of the tight junction complex [2]. LYRIC has been shown to
#=GF CC   promote tumour cell migration and invasion by activating the
#=GF CC   transcription factor NF-kappaB [3].
#=GF SQ   1306
#=GS A0A851F6C6_PITSO/1-159     AC A0A851F6C6.1
#=GS A0A7J8C3B5_ROUAE/6-164     AC A0A7J8C3B5.1
#=GS A0A7K6B677_UPUEP/1-159     AC A0A7K6B677.1
#=GS A0A8D2HPI9_UROPR/6-430     AC A0A8D2HPI9.1
#=GS A0A673V689_SURSU/6-454     AC A0A673V689.1
#=GS A0A7K5G9X4_9AVES/1-159     AC A0A7K5G9X4.1
#=GS A0A553R1K0_9TELE/5-382     AC A0A553R1K0.1
#=GS A0A7L2BCM8_9GRUI/1-159     AC A0A7L2BCM8.1
#=GS A0A8D0EUF9_STROC/331-376   AC A0A8D0EUF9.1
#=GS A0A7L1J480_SMUAF/1-118     AC A0A7L1J480.1
#=GS A0A6P9C4R4_PANGU/6-500     AC A0A6P9C4R4.1
#=GS A0A8C0F428_BUBBB/84-225    AC A0A8C0F428.1
#=GS A0A8L2UIC6_RAT/6-452       AC A0A8L2UIC6.1
#=GS A0A7K6LUX6_9CORV/1-159     AC A0A7K6LUX6.1
#=GS A0A8C9X6I3_SANLU/253-309   AC A0A8C9X6I3.1
#=GS A0A8C6CT82_MOSMO/6-348     AC A0A8C6CT82.1
#=GS A0A8M1FH83_URSMA/6-429     AC A0A8M1FH83.1
#=GS A0A7N5JGN3_AILME/6-452     AC A0A7N5JGN3.1
#=GS A0A8C9ML21_SERCA/90-355    AC A0A8C9ML21.1
#=GS A0A8J0VHY5_XENLA/5-411     AC A0A8J0VHY5.1
#=GS A0A3P9NSS9_POERE/5-419     AC A0A3P9NSS9.1
#=GS A0A2Y9QK37_TRIMA/6-432     AC A0A2Y9QK37.1
#=GS A0A4D9F4D6_9SAUR/196-366   AC A0A4D9F4D6.1
#=GS A0A6J2WP10_CHACN/5-387     AC A0A6J2WP10.1
#=GS A0A663DT17_AQUCH/6-468     AC A0A663DT17.1
#=GS A0A2K6PJY0_RHIRO/6-349     AC A0A2K6PJY0.1
#=GS A0A7F8RLF9_LEPWE/300-375   AC A0A7F8RLF9.1
#=GS A0A2K6PJY0_RHIRO/344-391   AC A0A2K6PJY0.1
#=GS A0A6G1PMZ3_9TELE/4-387     AC A0A6G1PMZ3.1
#=GS A0A7L3AMJ4_9AVES/6-325     AC A0A7L3AMJ4.1
#=GS A0A093QAD0_9PASS/1-304     AC A0A093QAD0.1
#=GS A0A672MEK9_SINGR/165-255   AC A0A672MEK9.1
#=GS A0A6G0HRP1_LARCR/5-58      AC A0A6G0HRP1.1
#=GS A0A8J6K4D6_ELECQ/5-237     AC A0A8J6K4D6.1
#=GS A0A8J4KTB7_EUDCH/1-159     AC A0A8J4KTB7.1
#=GS A0A7N6C018_ANATE/123-328   AC A0A7N6C018.1
#=GS A0A7K9P136_9CORV/6-439     AC A0A7K9P136.1
#=GS A0A455C8G5_PHYMC/12-343    AC A0A455C8G5.1
#=GS A0A1U7T1X9_CARSF/6-450     AC A0A1U7T1X9.1
#=GS A0A6P3R4D4_PTEVA/6-347     AC A0A6P3R4D4.1
#=GS S7PXU4_MYOBR/14-347        AC S7PXU4.1
#=GS A0A8C5X0P0_9PASS/128-370   AC A0A8C5X0P0.1
#=GS A0A6P3FLK6_OCTDE/6-423     AC A0A6P3FLK6.1
#=GS A0A8C3H871_CHRPI/6-367     AC A0A8C3H871.1
#=GS A0A8B9S1U5_APTOW/6-470     AC A0A8B9S1U5.1
#=GS A0A8V0Y9Z7_CHICK/6-441     AC A0A8V0Y9Z7.1
#=GS A0A8J7T9T0_ATRSP/209-422   AC A0A8J7T9T0.1
#=GS A0A672MEK9_SINGR/251-324   AC A0A672MEK9.1
#=GS H0YB56_HUMAN/1-224         AC H0YB56.1
#=GS A0A8C5W554_MICMU/39-209    AC A0A8C5W554.1
#=GS A0A8C6XE61_NAJNA/6-484     AC A0A8C6XE61.1
#=GS A0A8K1GFV9_9PASS/19-201    AC A0A8K1GFV9.1
#=GS A0A6I9YIM7_9SAUR/6-486     AC A0A6I9YIM7.1
#=GS A0A2K6C570_MACNE/6-347     AC A0A2K6C570.1
#=GS A0A7K9W9J7_9PASS/1-159     AC A0A7K9W9J7.1
#=GS A0A8C3I544_CHRPI/9-168     AC A0A8C3I544.1
#=GS A0A7K6JD86_9CORV/1-159     AC A0A7K6JD86.1
#=GS A0A6J0SX19_9SAUR/6-457     AC A0A6J0SX19.1
#=GS A0A8J6K4W3_ELECQ/5-235     AC A0A8J6K4W3.1
#=GS A0A091U7S2_PHORB/1-305     AC A0A091U7S2.1
#=GS A0A7K5L289_VIRAL/6-438     AC A0A7K5L289.1
#=GS W5MUJ8_LEPOC/225-406       AC W5MUJ8.1
#=GS A0A8C8J885_ONCTS/5-326     AC A0A8C8J885.1
#=GS A0A7K8T0W3_9AVES/1-159     AC A0A7K8T0W3.1
#=GS A0A663ML87_ATHCN/152-288   AC A0A663ML87.1
#=GS A0A6P7JXG5_9TELE/4-389     AC A0A6P7JXG5.1
#=GS A0A8C6CU78_MOSMO/6-454     AC A0A8C6CU78.1
#=GS A0A7K9F3T7_STEPR/1-159     AC A0A7K9F3T7.1
#=GS A0A663EUI3_AQUCH/108-245   AC A0A663EUI3.1
#=GS M4AAN5_XIPMA/197-271       AC M4AAN5.2
#=GS A0A6A5F0Y0_PERFL/6-414     AC A0A6A5F0Y0.1
#=GS A0A7K7IAH1_LOXCU/6-439     AC A0A7K7IAH1.1
#=GS A0A665TTU0_ECHNA/332-374   AC A0A665TTU0.1
#=GS A0A8D2E5G5_THEGE/6-423     AC A0A8D2E5G5.1
#=GS A0A6I9LEC3_PERMB/6-423     AC A0A6I9LEC3.1
#=GS A0A672KQ64_SINGR/311-375   AC A0A672KQ64.1
#=GS A0A8C0YGD5_CYPCA/5-377     AC A0A8C0YGD5.1
#=GS A0A8C8IK51_ONCTS/317-383   AC A0A8C8IK51.1
#=GS A0A1A6GQ64_NEOLE/1-68      AC A0A1A6GQ64.1
#=GS A0A8M1FE30_URSMA/6-346     AC A0A8M1FE30.1
#=GS A0A673V7Z2_SURSU/6-453     AC A0A673V7Z2.1
#=GS A0A8B9NNS1_APTOW/6-469     AC A0A8B9NNS1.1
#=GS A0A8I3P0S5_CANLF/6-425     AC A0A8I3P0S5.1
#=GS A0A8C6NVK9_NOTFU/5-326     AC A0A8C6NVK9.1
#=GS A0A5F9CDR1_RABIT/15-376    AC A0A5F9CDR1.1
#=GS A0A851ZDA7_9AVES/1-160     AC A0A851ZDA7.1
#=GS A0A8C5VP72_MICMU/36-206    AC A0A8C5VP72.1
#=GS A0A7F8K3H3_DELLE/6-423     AC A0A7F8K3H3.1
#=GS A0A8C3RUH9_CHESE/6-470     AC A0A8C3RUH9.1
#=GS A0A493U3X5_ANAPP/140-438   AC A0A493U3X5.1
#=GS A0A7N8XA14_9TELE/233-294   AC A0A7N8XA14.1
#=GS A0A3P8YHH9_ESOLU/181-344   AC A0A3P8YHH9.2
#=GS A0A7K9A773_9PASS/1-159     AC A0A7K9A773.1
#=GS A0A7L2CIN9_9PASS/1-159     AC A0A7L2CIN9.1
#=GS G1P6W3_MYOLU/6-422         AC G1P6W3.1
#=GS A0A673KNR9_9TELE/5-111     AC A0A673KNR9.1
#=GS H2QWH0_PANTR/6-423         AC H2QWH0.1
#=GS A0A3Q2ZDM2_KRYMA/4-395     AC A0A3Q2ZDM2.1
#=GS A0A2K6EYS2_PROCO/322-367   AC A0A2K6EYS2.1
#=GS A0A8C3UHY3_CATUS/70-368    AC A0A8C3UHY3.1
#=GS A0A3Q7SZK0_VULVU/1-276     AC A0A3Q7SZK0.1
#=GS A0A7L3J9H2_THACH/1-118     AC A0A7L3J9H2.1
#=GS A0A7K7E7E2_9SYLV/1-159     AC A0A7K7E7E2.1
#=GS A0A2K6PK02_RHIRO/6-423     AC A0A2K6PK02.1
#=GS A0A6G0HRP1_LARCR/54-350    AC A0A6G0HRP1.1
#=GS A0A0P7UQQ3_SCLFO/2-177     AC A0A0P7UQQ3.1
#=GS A0A8C6M4C0_NOTFU/94-246    AC A0A8C6M4C0.1
#=GS Q24JZ4_BOVIN/6-425         AC Q24JZ4.1
#=GS A0A8C8ZJH7_PROSS/1-327     AC A0A8C8ZJH7.1
#=GS A0A3P8YHH9_ESOLU/5-95      AC A0A3P8YHH9.2
#=GS A0A8C8AFR0_9STRI/6-447     AC A0A8C8AFR0.1
#=GS A0A7L0NLL5_9PASS/1-158     AC A0A7L0NLL5.1
#=GS A0A5F7Z912_MACMU/6-131     AC A0A5F7Z912.1
#=GS A0A6P6HRI2_PUMCO/1-303     AC A0A6P6HRI2.1
#=GS A0A8C3H871_CHRPI/363-407   AC A0A8C3H871.1
#=GS A0A3Q7QEU0_CALUR/6-325     AC A0A3Q7QEU0.1
#=GS A0A8C6XD26_NAJNA/6-381     AC A0A8C6XD26.1
#=GS A0A8B7IGH3_9AVES/107-499   AC A0A8B7IGH3.1
#=GS A0A452HQD6_9SAUR/6-447     AC A0A452HQD6.1
#=GS A0A8B9DBC6_ANSCY/6-466     AC A0A8B9DBC6.1
#=GS A0A8B7RF11_HIPAR/6-450     AC A0A8B7RF11.1
#=GS A0A1L8FZL5_XENLA/5-244     AC A0A1L8FZL5.1
#=GS A0A643CBF6_BALPH/1-211     AC A0A643CBF6.1
#=GS A0A3Q7U9G4_VULVU/1-200     AC A0A3Q7U9G4.1
#=GS A0A8C6HEG7_MUSSI/6-344     AC A0A8C6HEG7.1
#=GS A0A7K4TI19_9CHAR/1-159     AC A0A7K4TI19.1
#=GS A0A485MK74_LYNPA/70-116    AC A0A485MK74.1
#=GS A0A7J6C866_9TELE/5-397     AC A0A7J6C866.1
#=GS A0A7K8E2Z2_LEURO/1-137     AC A0A7K8E2Z2.1
#=GS A0A671FD58_RHIFE/6-421     AC A0A671FD58.1
#=GS A0A091HVZ0_BUCRH/1-305     AC A0A091HVZ0.1
#=GS A0A8M6YWB0_DANRE/5-448     AC A0A8M6YWB0.1
#=GS A0A6J2NBL1_9CHIR/6-453     AC A0A6J2NBL1.1
#=GS A0A6I8S7P1_XENTR/5-216     AC A0A6I8S7P1.2
#=GS A0A7K4LIC2_9AVES/1-158     AC A0A7K4LIC2.1
#=GS A0A2K6TVS8_SAIBB/6-423     AC A0A2K6TVS8.1
#=GS A0A7K6XHP1_9PASE/1-159     AC A0A7K6XHP1.1
#=GS A0A8C9CAX8_PHOSS/6-423     AC A0A8C9CAX8.1
#=GS A0A672YI43_9TELE/4-391     AC A0A672YI43.1
#=GS A0A2R9A6H7_PANPA/6-416     AC A0A2R9A6H7.1
#=GS L8ISA6_9CETA/6-416         AC L8ISA6.1
#=GS A0A7K5E313_POLCE/1-159     AC A0A7K5E313.1
#=GS A0A852F2U8_PEUTA/1-159     AC A0A852F2U8.1
#=GS A0A669EH20_ORENI/5-153     AC A0A669EH20.1
#=GS A0A673KFQ6_9TELE/5-430     AC A0A673KFQ6.1
#=GS A0A7K4ZPC8_9AVES/1-159     AC A0A7K4ZPC8.1
#=GS A0A8C7CXA5_ONCKI/5-323     AC A0A8C7CXA5.1
#=GS A0A3Q1EMY4_9TELE/291-343   AC A0A3Q1EMY4.1
#=GS A0A7K6PLN3_9CORV/1-159     AC A0A7K6PLN3.1
#=GS A0A3Q1B1K4_AMPOC/5-417     AC A0A3Q1B1K4.1
#=GS A0A6J3Q9R6_TURTR/6-432     AC A0A6J3Q9R6.1
#=GS A0A6P8QR62_GEOSA/5-233     AC A0A6P8QR62.1
#=GS A0A091NSN7_APAVI/2-85      AC A0A091NSN7.1
#=GS A0A8C5MZ15_9ANUR/233-427   AC A0A8C5MZ15.1
#=GS A0A8C8RTR1_9SAUR/16-192    AC A0A8C8RTR1.1
#=GS A0A2Y9QJ48_TRIMA/6-424     AC A0A2Y9QJ48.1
#=GS A0A8B9FX32_9PSIT/6-445     AC A0A8B9FX32.1
#=GS A0A096LSJ5_POEFO/295-372   AC A0A096LSJ5.1
#=GS A0A671PA70_9TELE/153-375   AC A0A671PA70.1
#=GS A0A8B7RAL3_HIPAR/336-387   AC A0A8B7RAL3.1
#=GS A0A7L1SKD2_ARAGA/1-159     AC A0A7L1SKD2.1
#=GS A0A8C5H382_9TELE/4-391     AC A0A8C5H382.1
#=GS A0A8D2HK04_UROPR/377-420   AC A0A8D2HK04.1
#=GS A0A8C5RNF1_LATLA/6-457     AC A0A8C5RNF1.1
#=GS A0A7J5XTS5_DISMA/4-375     AC A0A7J5XTS5.1
#=GS A0A7J8C376_ROUAE/6-431     AC A0A7J8C376.1
#=GS A0A8C3UI06_CATUS/70-330    AC A0A8C3UI06.1
#=GS A0A2K5QSV1_CEBIM/320-367   AC A0A2K5QSV1.1
#=GS A0A3Q7TJI4_VULVU/1-224     AC A0A3Q7TJI4.1
#=GS A0A7L2SEX0_9PASS/6-340     AC A0A7L2SEX0.1
#=GS A0A8J6GZA7_MICOH/6-400     AC A0A8J6GZA7.1
#=GS A0A8J4KMJ4_APTPA/1-159     AC A0A8J4KMJ4.1
#=GS A0A7J5XAR4_DISMA/5-362     AC A0A7J5XAR4.1
#=GS A0A8D2QHF4_ZONAL/1-225     AC A0A8D2QHF4.1
#=GS A0A8C8AJ09_9STRI/110-255   AC A0A8C8AJ09.1
#=GS A0A671TYT4_SPAAU/6-158     AC A0A671TYT4.1
#=GS A0A5F9D9R0_RABIT/63-369    AC A0A5F9D9R0.1
#=GS A0A8C5FZA3_9TELE/5-396     AC A0A8C5FZA3.1
#=GS A0A3P9PT53_POERE/4-248     AC A0A3P9PT53.1
#=GS A0A7K9EP09_BARMA/1-159     AC A0A7K9EP09.1
#=GS A0A7F8K6X1_DELLE/6-431     AC A0A7F8K6X1.1
#=GS A0A6J0YML8_ODOVR/6-348     AC A0A6J0YML8.1
#=GS A0A2I3N5T8_PAPAN/321-368   AC A0A2I3N5T8.1
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