GenomeNet

Database: Pfam
Entry: LZ_Tnp_IS481
LinkDB: LZ_Tnp_IS481
Original site: LZ_Tnp_IS481 
#=GF ID   LZ_Tnp_IS481
#=GF AC   PF13011.10
#=GF DE   leucine-zipper of insertion element IS481
#=GF AU   Coggill P;0000-0001-5731-1588
#=GF SE   IS_finder
#=GF GA   22.20 22.20;
#=GF TC   22.20 22.20;
#=GF NC   22.10 22.10;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch --cpu 4 -Z 75585367 -E 1000 HMM pfamseq
#=GF TP   Family
#=GF CL   CL0123
#=GF RN   [1]
#=GF RM   17065269
#=GF RT   Prevalence and sequence variants of IS481 in Bordetella
#=GF RT   bronchiseptica: implications for IS481-based detection of
#=GF RT   Bordetella pertussis.
#=GF RA   Register KB, Sanden GN;
#=GF RL   J Clin Microbiol. 2006;44:4577-4583.
#=GF DR   INTERPRO; IPR024967;
#=GF DR   SO; 0100021; polypeptide_conserved_region;
#=GF CC   This is the upstream region of the conjoined ORF AB of insertion
#=GF CC   element 481. The significance of IS481 in the detection of
#=GF CC   Bordetella pertussis is discussed in [1]. The B portion of the
#=GF CC   ORF AB carries the transposase activity in family rve,
#=GF CC   PFAM:PF00665.
#=GF SQ   1458
#=GS A0A1H8V6B6_9ACTN/2-75     AC A0A1H8V6B6.1
#=GS A0A387BM41_9MICO/1-82     AC A0A387BM41.1
#=GS A0A7S8MV50_9MICO/1-86     AC A0A7S8MV50.1
#=GS A0A1I1N6K9_9ACTN/3-72     AC A0A1I1N6K9.1
#=GS A0A6H0T7T0_9PAST/8-83     AC A0A6H0T7T0.1
#=GS K9PBL1_CYAGP/1-86         AC K9PBL1.1
#=GS X8AZ83_MYCAV/1-84         AC X8AZ83.1
#=GS A3TL46_9MICO/1-82         AC A3TL46.1
#=GS A0A543CRI3_9ACTN/1-86     AC A0A543CRI3.1
#=GS A0A0D1LQ53_9MYCO/2-53     AC A0A0D1LQ53.1
#=GS A0A1C4SV43_9ACTN/1-84     AC A0A1C4SV43.1
#=GS A0A7I7S362_9MYCO/23-108   AC A0A7I7S362.1
#=GS A0A543K8L9_9MICO/1-86     AC A0A543K8L9.1
#=GS A0A2L2BSQ5_9MICO/2-75     AC A0A2L2BSQ5.1
#=GS A0A1H4HB82_9GAMM/1-85     AC A0A1H4HB82.1
#=GS A0A4U3LK30_9ACTN/1-84     AC A0A4U3LK30.1
#=GS A0A3N0V962_9GAMM/1-85     AC A0A3N0V962.1
#=GS A0A0B6TNB4_9CORY/1-84     AC A0A0B6TNB4.1
#=GS A0A7M3LQK9_9ACTN/1-84     AC A0A7M3LQK9.1
#=GS H2JVA7_STRHJ/1-83         AC H2JVA7.1
#=GS U5ECR6_NOCAS/1-84         AC U5ECR6.1
#=GS A0A0M8TAP3_9ACTN/2-63     AC A0A0M8TAP3.1
#=GS A0A1E5NZS5_9ACTN/1-62     AC A0A1E5NZS5.1
#=GS B0RD36_CLAMS/1-83         AC B0RD36.1
#=GS A0A0F4J0L7_9ACTN/1-83     AC A0A0F4J0L7.1
#=GS A0A2S5KIQ5_9PROT/14-81    AC A0A2S5KIQ5.1
#=GS G2GPV8_9ACTN/12-96        AC G2GPV8.1
#=GS A0A6I4P8V3_9MICO/1-84     AC A0A6I4P8V3.1
#=GS A0A849BRH6_9ACTN/1-67     AC A0A849BRH6.1
#=GS K0KCZ1_SACES/1-55         AC K0KCZ1.1
#=GS A0A212TFD9_9MICO/1-82     AC A0A212TFD9.1
#=GS A0A2T0J2V1_9ACTN/1-85     AC A0A2T0J2V1.1
#=GS Q9L0E4_STRCO/21-105       AC Q9L0E4.1
#=GS A0A7W5Y5N1_9ACTN/1-83     AC A0A7W5Y5N1.1
#=GS A0A0U3D4Z1_9BURK/1-85     AC A0A0U3D4Z1.1
#=GS A0A853BSB8_9ACTN/3-87     AC A0A853BSB8.1
#=GS H2JQ55_STRHJ/1-83         AC H2JQ55.1
#=GS Q7VYA0_BORPE/1-85         AC Q7VYA0.1
#=GS A0A4P7SRV9_9MICC/1-79     AC A0A4P7SRV9.1
#=GS A0A348FWW0_9HYPH/1-86     AC A0A348FWW0.1
#=GS A0A6G3S313_9ACTN/1-84     AC A0A6G3S313.1
#=GS A0A3S8ZBJ3_9ACTO/1-82     AC A0A3S8ZBJ3.1
#=GS A0A6J4FQS2_9PROT/1-85     AC A0A6J4FQS2.1
#=GS A0A0A0JIM2_9MICO/1-51     AC A0A0A0JIM2.1
#=GS R7XRJ4_9ACTN/1-76         AC R7XRJ4.1
#=GS A0A1H3NVP4_9PSEU/8-77     AC A0A1H3NVP4.1
#=GS A0A5J6MVJ3_9PROT/1-85     AC A0A5J6MVJ3.1
#=GS A0A1A1Z6Z8_9MYCO/13-97    AC A0A1A1Z6Z8.1
#=GS A0A4S5J3K1_9HYPH/1-53     AC A0A4S5J3K1.1
#=GS A0A0K1JIP7_9MICO/1-82     AC A0A0K1JIP7.1
#=GS A0A2K8PIH6_STRLA/1-83     AC A0A2K8PIH6.1
#=GS A0A1X2C9B8_9MYCO/1-83     AC A0A1X2C9B8.1
#=GS A0A7W4YL66_9MICO/1-84     AC A0A7W4YL66.1
#=GS A0A6A7MG33_9PROT/2-44     AC A0A6A7MG33.1
#=GS A0A4Q7YST2_9BACT/1-85     AC A0A4Q7YST2.1
#=GS A0A1H3P023_9PSEU/6-74     AC A0A1H3P023.1
#=GS A0A1Q2CVR3_9ACTN/1-84     AC A0A1Q2CVR3.1
#=GS A0A840WH29_9ACTN/3-68     AC A0A840WH29.1
#=GS A0A1H4GUH5_9GAMM/1-84     AC A0A1H4GUH5.1
#=GS A0A853CH60_9ACTN/1-83     AC A0A853CH60.1
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#=GS I4BSL2_MYCCN/1-84         AC I4BSL2.1
#=GS A0A4R6KQP9_9ACTN/1-60     AC A0A4R6KQP9.1
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#=GS A0A059W860_STRA9/19-105   AC A0A059W860.1
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#=GS Q6ADW2_LEIXX/1-85         AC Q6ADW2.1
#=GS A0A1H5AX77_9ACTN/1-85     AC A0A1H5AX77.1
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#=GS A0A4Q0ITU6_9BACT/1-83     AC A0A4Q0ITU6.1
#=GS Q7VSW4_BORPE/1-85         AC Q7VSW4.1
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#=GS Q7VZL1_BORPE/1-85         AC Q7VZL1.1
#=GS A0A7V8K5R2_9GAMM/1-111    AC A0A7V8K5R2.1
#=GS A0A0J6XMF7_9ACTN/1-64     AC A0A0J6XMF7.1
#=GS Q7W005_BORPE/1-85         AC Q7W005.1
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#=GS Q7TT94_BORPE/1-85         AC Q7TT94.1
#=GS A0A448KF96_9ACTO/1-83     AC A0A448KF96.1
#=GS A0A0M4QKU7_9PSEU/10-97    AC A0A0M4QKU7.1
#=GS U2EJC4_9GAMM/1-85         AC U2EJC4.1
#=GS B5H4S9_STRE2/14-99        AC B5H4S9.1
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#=GS A0A6N9HC51_9MICO/1-84     AC A0A6N9HC51.1
#=GS A0A346Y2I0_9ACTN/3-87     AC A0A346Y2I0.1
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#=GS D6K5Q9_9ACTN/13-97        AC D6K5Q9.1
#=GS A0A255GZL4_9ACTN/15-97    AC A0A255GZL4.1
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#=GS U2TWL5_9ACTN/1-82         AC U2TWL5.1
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#=GS A0A221RCM5_9MICC/1-38     AC A0A221RCM5.1
#=GS A0A448NZL1_9ACTN/1-82     AC A0A448NZL1.1
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#=GS A0A1I1PAP9_9ACTN/3-76     AC A0A1I1PAP9.1
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#=GS A0A161VL52_9HYPH/1-69     AC A0A161VL52.1
#=GS A0A1Z4ILP6_9CYAN/103-180  AC A0A1Z4ILP6.1
#=GS B0REE1_CLAMS/1-84         AC B0REE1.1
#=GS A0A6N7ZC67_9PSEU/1-50     AC A0A6N7ZC67.1
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#=GS A0A4Y9FVD0_9MICO/1-84     AC A0A4Y9FVD0.1
#=GS A0A1D9BHJ8_9NEIS/1-85     AC A0A1D9BHJ8.1
#=GS A0A426UJI4_9ACTN/1-85     AC A0A426UJI4.1
#=GS A0A4Q7UU35_PSEST/1-84     AC A0A4Q7UU35.1
#=GS Q7VZ51_BORPE/1-85         AC Q7VZ51.1
#=GS A0A348G3K0_9HYPH/1-86     AC A0A348G3K0.1
#=GS A0A1G7V4A5_9MICO/1-84     AC A0A1G7V4A5.1
#=GS X8B323_MYCAV/1-84         AC X8B323.1
#=GS A0A327MDL5_9PROT/1-73     AC A0A327MDL5.1
#=GS A0A1C5IGR0_9ACTN/1-85     AC A0A1C5IGR0.1
#=GS A0A6I6S8I1_9ACTN/1-84     AC A0A6I6S8I1.1
#=GS E8THK3_MESCW/1-78         AC E8THK3.1
#=GS D5UBZ5_CELFN/1-82         AC D5UBZ5.1
#=GS A0A5C1Y8F2_9MICO/1-82     AC A0A5C1Y8F2.1
#=GS K0IIJ5_NITGG/15-97        AC K0IIJ5.1
#=GS A0A1Z4EG40_9MYCO/23-109   AC A0A1Z4EG40.1
#=GS Q5YUI7_NOCFA/1-75         AC Q5YUI7.1
#=GS A0A4P6U2I6_STRSO/1-84     AC A0A4P6U2I6.1
#=GS A0A554X9S7_9BURK/1-85     AC A0A554X9S7.1
#=GS A0A3S8ZAF1_9ACTO/1-82     AC A0A3S8ZAF1.1
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