#=GF ID LiaF-like_C
#=GF AC PF09922.13
#=GF DE Cell wall-active antibiotics response LiaF, C-terminal
#=GF PI DUF2154;
#=GF AU COGs;
#=GF AU Finn RD;0000-0001-8626-2148
#=GF AU Sammut SJ;0000-0003-4472-904X
#=GF SE COGs (COG4758)
#=GF GA 29.00 29.00;
#=GF TC 29.00 29.00;
#=GF NC 28.90 28.90;
#=GF BM hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM hmmsearch -Z 75585367 --cpu 4 -E 1000 HMM pfamseq
#=GF TP Repeat
#=GF CL CL0268
#=GF RN [1]
#=GF RM 16923071
#=GF RT The VraS/VraR two-component regulatory system required for
#=GF RT oxacillin resistance in community-acquired methicillin-resistant
#=GF RT Staphylococcus aureus.
#=GF RA Boyle-Vavra S, Yin S, Daum RS;
#=GF RL FEMS Microbiol Lett. 2006;262:163-171.
#=GF RN [2]
#=GF RM 19889788
#=GF RT Genetic changes associated with glycopeptide resistance in
#=GF RT Staphylococcus aureus: predominance of amino acid substitutions
#=GF RT in YvqF/VraSR.
#=GF RA Kato Y, Suzuki T, Ida T, Maebashi K;
#=GF RL J Antimicrob Chemother. 2010;65:37-45.
#=GF DR INTERPRO; IPR024425;
#=GF DR TC; 9.B.116;
#=GF DR SO; 0001068; polypeptide_repeat;
#=GF CC This domain is found in various prokaryotic proteins, including
#=GF CC cell wall-active antibiotic response proteins. This entry
#=GF CC includes protein product of the yvqF gene, LiaF, located
#=GF CC immediately upstream of vraS. It is associated with glycopeptide
#=GF CC resistance in Staphylococcus aureus [2]. This domain has been
#=GF CC described as toast rack from its structural resemblance.
#=GF SQ 2828
#=GS A0A2P8D593_9ACTN/79-157 AC A0A2P8D593.1
#=GS A0A6L9S2I6_9ACTN/91-171 AC A0A6L9S2I6.1
#=GS A0A1D7QB32_9SPHI/156-256 AC A0A1D7QB32.1
#=GS E1M8C9_9STRE/114-190 AC E1M8C9.1
#=GS A0A150LD21_9BACI/124-236 AC A0A150LD21.1
#=GS A0A7W7SR11_9ACTN/431-543 AC A0A7W7SR11.1
#=GS A0A1Q2HUD8_9CORY/397-497 AC A0A1Q2HUD8.1
#=GS A0A0A2T6X5_9BACI/142-254 AC A0A0A2T6X5.1
#=GS A0A3B0BPF7_9BACL/253-367 AC A0A3B0BPF7.1
#=GS S1RN22_9ENTE/129-241 AC S1RN22.1
#=GS A0A2P8DX22_9ACTN/133-216 AC A0A2P8DX22.1
#=GS A0A7W7FV59_9PSEU/88-172 AC A0A7W7FV59.1
#=GS D3FVT2_ALKPO/166-278 AC D3FVT2.1
#=GS A0A6N9PZI6_9BACL/101-213 AC A0A6N9PZI6.1
#=GS A0A3Q9UMQ2_9ACTN/106-185 AC A0A3Q9UMQ2.1
#=GS A0A291R0A4_9BACT/144-244 AC A0A291R0A4.1
#=GS A0A514JU28_9ACTN/103-182 AC A0A514JU28.1
#=GS A0A4R2NC15_9BACL/160-272 AC A0A4R2NC15.1
#=GS A0A1X4HX94_9ACTN/105-185 AC A0A1X4HX94.1
#=GS A0A1H9VS84_9BACI/115-230 AC A0A1H9VS84.1
#=GS A0A2H5XX78_9BACT/130-230 AC A0A2H5XX78.1
#=GS A0A1H7TLS9_9GAMM/92-191 AC A0A1H7TLS9.1
#=GS A0A1I3QK46_9BACL/152-264 AC A0A1I3QK46.1
#=GS A0A2L0N6V9_9ACTN/414-527 AC A0A2L0N6V9.1
#=GS W2EGK6_9ACTN/88-166 AC W2EGK6.1
#=GS A0A7L4YPE0_9ACTN/83-161 AC A0A7L4YPE0.1
#=GS A0A4Q5XM45_9DELT/35-109 AC A0A4Q5XM45.1
#=GS D1C594_SPHTD/122-203 AC D1C594.1
#=GS A0A7J9WE44_9ACTN/284-397 AC A0A7J9WE44.1
#=GS A0A0P7GPX8_9EURY/128-226 AC A0A0P7GPX8.1
#=GS A0A7X6KYP2_9CELL/391-494 AC A0A7X6KYP2.1
#=GS A0A1E5PK58_9ACTN/85-188 AC A0A1E5PK58.1
#=GS A0A2G5IWQ9_9ACTN/380-498 AC A0A2G5IWQ9.1
#=GS R6BV91_9CLOT/135-230 AC R6BV91.1
#=GS A0A0Q7QPW5_9ACTN/285-394 AC A0A0Q7QPW5.1
#=GS G4L8R5_TETHN/128-240 AC G4L8R5.1
#=GS A0A7Y9HW67_9SPHI/193-278 AC A0A7Y9HW67.1
#=GS A0A411YAX6_9ACTN/110-218 AC A0A411YAX6.1
#=GS A0A084J9P9_9CLOT/132-223 AC A0A084J9P9.1
#=GS A0A177YI69_9NOCA/84-163 AC A0A177YI69.1
#=GS A0A0N1GRP6_9ACTN/102-187 AC A0A0N1GRP6.1
#=GS A0A542E1Z3_9MICO/359-455 AC A0A542E1Z3.1
#=GS A0A1H4U523_9BACL/105-217 AC A0A1H4U523.1
#=GS H3NDP7_9LACT/135-247 AC H3NDP7.1
#=GS A0A0Q3W521_9BACI/115-230 AC A0A0Q3W521.1
#=GS A0A559IHA2_9BACL/100-212 AC A0A559IHA2.1
#=GS A0A2M9BKF9_9ACTN/386-492 AC A0A2M9BKF9.1
#=GS D1ACU9_THECD/104-174 AC D1ACU9.1
#=GS C9A4I1_ENTCA/128-240 AC C9A4I1.1
#=GS A0A6N9PZE4_9BACL/130-230 AC A0A6N9PZE4.1
#=GS A0A0K1RC95_9CORY/249-342 AC A0A0K1RC95.1
#=GS A0A239JEV1_9ACTN/375-491 AC A0A239JEV1.1
#=GS A0A841TXU8_9BACL/101-211 AC A0A841TXU8.1
#=GS A0A101V3N1_9ACTN/116-201 AC A0A101V3N1.1
#=GS A0A0T6LLR8_STRVM/98-198 AC A0A0T6LLR8.1
#=GS A0A498D9Z2_9BACI/126-239 AC A0A498D9Z2.1
#=GS F5X533_STRPX/115-228 AC F5X533.1
#=GS A0A2T0QA95_9ACTN/92-170 AC A0A2T0QA95.1
#=GS A0A1M6K519_9ACTN/106-193 AC A0A1M6K519.1
#=GS A0A4P6F2T9_9MICO/417-529 AC A0A4P6F2T9.1
#=GS A0A2N5MNN0_9BACI/131-244 AC A0A2N5MNN0.1
#=GS A0A073K219_9BACI/128-240 AC A0A073K219.1
#=GS A0A1R3T7A0_9BACT/151-250 AC A0A1R3T7A0.1
#=GS A0A1V2RH95_9ACTN/117-225 AC A0A1V2RH95.1
#=GS W9DRG8_9PSEU/129-204 AC W9DRG8.1
#=GS A0A2N0ZED9_9BACI/128-241 AC A0A2N0ZED9.1
#=GS C4L303_EXISA/115-226 AC C4L303.1
#=GS A0A3G9IZM5_9BACL/251-365 AC A0A3G9IZM5.1
#=GS A0A396QKX4_9FIRM/128-214 AC A0A396QKX4.1
#=GS A0A418KTM9_9ACTN/364-480 AC A0A418KTM9.1
#=GS A0A511Z6Y1_9BACL/115-230 AC A0A511Z6Y1.1
#=GS A0A0D3VCN1_9BACL/100-212 AC A0A0D3VCN1.1
#=GS A0A1M7QUV8_9ACTN/583-681 AC A0A1M7QUV8.1
#=GS A0A2A5RNF6_9LACT/79-183 AC A0A2A5RNF6.1
#=GS A0A4V2L0H7_9ALTE/95-192 AC A0A4V2L0H7.1
#=GS E0DIL0_9CORY/135-232 AC E0DIL0.1
#=GS A0A2A9F8G6_9PSEU/107-184 AC A0A2A9F8G6.1
#=GS A0A2W7Q8Y6_9BACT/131-228 AC A0A2W7Q8Y6.1
#=GS A0A7W3MZA6_9ACTN/107-181 AC A0A7W3MZA6.1
#=GS A0A073B0S0_9PSEU/303-416 AC A0A073B0S0.1
#=GS A0A1H5ZE72_9ACTN/346-462 AC A0A1H5ZE72.1
#=GS I0H592_ACTM4/140-223 AC I0H592.1
#=GS A0A1I1V0F5_9DELT/85-160 AC A0A1I1V0F5.1
#=GS A0A1H3MEH7_9ACTN/500-613 AC A0A1H3MEH7.1
#=GS R6IBB3_9FIRM/135-230 AC R6IBB3.1
#=GS A0A8J3X4W1_9ACTN/449-561 AC A0A8J3X4W1.1
#=GS A0A1C5CYV4_9ACTN/108-194 AC A0A1C5CYV4.1
#=GS A0A7W7WTU1_9PSEU/99-176 AC A0A7W7WTU1.1
#=GS A0A8J2UJ50_9BACT/230-329 AC A0A8J2UJ50.1
#=GS A0A2Z3MRT4_9BACT/140-229 AC A0A2Z3MRT4.1
#=GS R7A3L2_9CLOT/94-190 AC R7A3L2.1
#=GS W9DN58_9PSEU/351-466 AC W9DN58.1
#=GS A0A1Y0IID1_9BACL/146-258 AC A0A1Y0IID1.1
#=GS A0A4V2VPF4_PELSC/144-221 AC A0A4V2VPF4.1
#=GS A0A2P4UJA9_9ACTN/76-163 AC A0A2P4UJA9.1
#=GS I6Y500_ARAPF/97-181 AC I6Y500.1
#=GS A0A0J6CRS7_9BACI/125-238 AC A0A0J6CRS7.1
#=GS A0A0M0GJB0_SPOGL/159-271 AC A0A0M0GJB0.1
#=GS A0A2A9F806_9PSEU/320-433 AC A0A2A9F806.1
#=GS D6ZFK1_SEGRD/103-188 AC D6ZFK1.1
#=GS A0A3S1BPD5_9BACL/205-319 AC A0A3S1BPD5.1
#=GS W7T0L8_9PSEU/91-191 AC W7T0L8.1
#=GS A0A3E2NM67_9SPHI/170-259 AC A0A3E2NM67.1
#=GS A0A0L0JZV4_9ACTN/326-441 AC A0A0L0JZV4.1
#=GS A0A221MFX8_9BACI/142-254 AC A0A221MFX8.1
#=GS A0A0X1RV18_9BACL/114-229 AC A0A0X1RV18.1
#=GS A0A0F0GQU5_LENAE/91-160 AC A0A0F0GQU5.1
#=GS A0A1I2MRZ6_9BACL/150-261 AC A0A1I2MRZ6.1
#=GS A0A0D5NKF4_9BACL/231-345 AC A0A0D5NKF4.1
#=GS A0A1H4XGE0_9ACTN/354-472 AC A0A1H4XGE0.1
#=GS D3FBZ6_CONWI/78-177 AC D3FBZ6.1
#=GS A0A385NJZ9_9BACI/129-242 AC A0A385NJZ9.1
#=GS I3U0M2_ENTFD/136-248 AC I3U0M2.1
#=GS A0A4R5TX30_9MICC/437-525 AC A0A4R5TX30.1
#=GS S5TGC7_9CORY/90-196 AC S5TGC7.1
#=GS I6ZNL5_MELRP/151-230 AC I6ZNL5.1
#=GS A0A8J3R211_9ACTN/101-199 AC A0A8J3R211.1
#=GS A0A7X3FGF0_9BACL/223-337 AC A0A7X3FGF0.1
#=GS A0A1H9UXN6_9ACTN/107-185 AC A0A1H9UXN6.1
#=GS A0A6S6RB48_9FIRM/193-286 AC A0A6S6RB48.1
#=GS A0A5C8NCM8_9ACTN/329-440 AC A0A5C8NCM8.1
#=GS A0A2I0SHB3_9ACTN/336-455 AC A0A2I0SHB3.1
#=GS A0A6I4IPW7_9SPHI/177-262 AC A0A6I4IPW7.1
#=GS A0A841PKY8_9BACL/129-242 AC A0A841PKY8.1
#=GS A0A2V5K0C5_9BACL/100-212 AC A0A2V5K0C5.1
#=GS A0A2U3CA04_9ACTN/90-184 AC A0A2U3CA04.1
#=GS A0A0R1RRF6_9LACO/144-225 AC A0A0R1RRF6.1
#=GS A0A1K2FRV9_9ACTN/102-176 AC A0A1K2FRV9.1
#=GS A0A3N9U364_9BACI/111-224 AC A0A3N9U364.1
#=GS A0A8J2ZYW1_9BACL/148-260 AC A0A8J2ZYW1.1
#=GS A0A6I6SHP7_9ACTN/103-184 AC A0A6I6SHP7.1
#=GS A0A7K1XT98_9SPHI/173-273 AC A0A7K1XT98.1
#=GS A0A1I4XBP8_9ACTN/88-165 AC A0A1I4XBP8.1
#=GS A0A399FZA5_9ACTN/83-160 AC A0A399FZA5.1
#=GS F4H2L1_CELFA/366-484 AC F4H2L1.1
#=GS A0A2P8CR03_9ACTN/79-156 AC A0A2P8CR03.1
#=GS A0A7H1B6L1_9ACTN/109-185 AC A0A7H1B6L1.1
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#=GS A0A4V1NXP2_9BACL/149-261 AC A0A4V1NXP2.1
#=GS A0A229UIV0_9BACL/106-218 AC A0A229UIV0.1
#=GS A0A1L8RCK1_9ENTE/128-240 AC A0A1L8RCK1.1
#=GS A0A1B1ZA91_9BACI/127-240 AC A0A1B1ZA91.1
#=GS A0A5J6F828_9ACTN/115-202 AC A0A5J6F828.1
#=GS A0A8J8GAN3_9BACI/127-234 AC A0A8J8GAN3.1
#=GS A0A060LYV1_9BACI/120-232 AC A0A060LYV1.1
#=GS A0A4P8XMT4_9BACL/244-358 AC A0A4P8XMT4.1
#=GS F7XNC6_METZD/122-226 AC F7XNC6.1
#=GS A0A4U9K760_9SPHI/186-286 AC A0A4U9K760.1
#=GS R5TC64_9CLOT/128-220 AC R5TC64.1
#=GS A0A7W3LPZ5_ACTNM/101-185 AC A0A7W3LPZ5.1
#=GS A0A2S0KK29_9ACTN/95-170 AC A0A2S0KK29.1
#=GS C0Z626_BREBN/173-285 AC C0Z626.1
#=GS A0A066YZD3_9ACTN/129-232 AC A0A066YZD3.1
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#=GS A0A4Q9DFR4_9BACL/102-214 AC A0A4Q9DFR4.1
#=GS A0A1A5YFU3_9BACL/239-353 AC A0A1A5YFU3.1
#=GS A0A1C4XD75_MICEC/64-182 AC A0A1C4XD75.1
#=GS A0A0Q9YFY9_9BACI/124-237 AC A0A0Q9YFY9.1
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#=GS A0A257IYC1_9BACT/52-153 AC A0A257IYC1.1
#=GS I8UC29_9ALTE/128-204 AC I8UC29.1
#=GS R7MG63_9CLOT/127-220 AC R7MG63.1
#=GS A0A1Q8CV91_9PSEU/87-183 AC A0A1Q8CV91.1
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#=GS A0A345HSW2_9ACTN/374-490 AC A0A345HSW2.1
#=GS A0A1Q5E1L2_9ACTN/314-409 AC A0A1Q5E1L2.1
#=GS A0A1C6M4T5_9ACTN/115-215 AC A0A1C6M4T5.1
#=GS A0A553K0V1_9ACTN/127-207 AC A0A553K0V1.1
#=GS A0A1U9ZQV9_9ACTN/85-171 AC A0A1U9ZQV9.1
#=GS A0A2H9VP74_9SPHI/177-268 AC A0A2H9VP74.1
#=GS A0A511J960_9CELL/414-524 AC A0A511J960.1
#=GS A0A7D5MNN4_9BACT/138-237 AC A0A7D5MNN4.1
#=GS A0A1G9G486_9ACTN/84-170 AC A0A1G9G486.1
#=GS A0A5B8VK08_9BACT/177-276 AC A0A5B8VK08.1
#=GS A0A0Q7ZMQ3_9ACTN/96-183 AC A0A0Q7ZMQ3.1
#=GS A0A7W7W694_9ACTN/97-197 AC A0A7W7W694.1
#=GS A0A7H8S9J4_9BACI/117-207 AC A0A7H8S9J4.1
#=GS A0A4Q7KKU0_9PSEU/101-178 AC A0A4Q7KKU0.1
#=GS A0A318LT92_9PSEU/112-214 AC A0A318LT92.1
#=GS C8NE27_9LACT/129-241 AC C8NE27.1
#=GS A0A264W004_9BACL/115-229 AC A0A264W004.1
#=GS A0A167GT52_9BACL/216-330 AC A0A167GT52.1
#=GS A0A7W9HFB1_9PSEU/118-218 AC A0A7W9HFB1.1
#=GS A0A150XGW2_9BACT/131-218 AC A0A150XGW2.1
#=GS A0A2Z2KTH8_9BACL/101-212 AC A0A2Z2KTH8.1
#=GS A0A150WXH8_ROSEK/127-228 AC A0A150WXH8.1
#=GS A0A3N2PHT0_9ACTN/477-587 AC A0A3N2PHT0.1
#=GS F6FWV9_ISOV2/327-441 AC F6FWV9.1
#=GS A0A0P6WYP7_9BACI/155-267 AC A0A0P6WYP7.1
#=GS A0A7V8NMB4_9BACT/30-134 AC A0A7V8NMB4.1
#=GS A0A7L5DVQ6_9SPHI/167-250 AC A0A7L5DVQ6.1
#=GS A0A559IWY8_9BACL/250-364 AC A0A559IWY8.1
#=GS A0A223KXU0_9BACI/113-226 AC A0A223KXU0.1
#=GS A0A553FF01_9GAMM/92-193 AC A0A553FF01.1
#=GS A0A078KMS7_9FIRM/126-199 AC A0A078KMS7.1
#=GS U1JRC2_9GAMM/93-196 AC U1JRC2.1
#=GS A0A4R8R2X8_9MYCO/289-369 AC A0A4R8R2X8.1
#=GS A0A3M0IL21_9ACTN/105-201 AC A0A3M0IL21.1
#=GS A0A840EVR1_9ACTN/311-409 AC A0A840EVR1.1
#=GS D1A7T7_THECD/25-127 AC D1A7T7.1
#=GS A0A7Y6UGU6_9DELT/86-165 AC A0A7Y6UGU6.1
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