#=GF ID MIER1_3_C
#=GF AC PF19426.3
#=GF DE Mesoderm induction early response protein 1/3 C-terminal
#=GF PI MIER1_beta_C;
#=GF AU Bateman A;0000-0002-6982-4660
#=GF AU Chuguransky S;0000-0002-0520-0736
#=GF SE Sonnhammer ELL
#=GF GA 27.00 27.00;
#=GF TC 27.00 27.00;
#=GF NC 26.90 26.90;
#=GF BM hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM hmmsearch -Z 75585367 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP Domain
#=GF RN [1]
#=GF RM 12482978
#=GF RT Human MI-ER1 alpha and beta function as transcriptional
#=GF RT repressors by recruitment of histone deacetylase 1 to their
#=GF RT conserved ELM2 domain.
#=GF RA Ding Z, Gillespie LL, Paterno GD;
#=GF RL Mol Cell Biol. 2003;23:250-258.
#=GF RN [2]
#=GF RM 28046085
#=GF RT Differential HDAC1 and 2 Recruitment by Members of the MIER
#=GF RT Family.
#=GF RA Derwish R, Paterno GD, Gillespie LL;
#=GF RL PLoS One. 2017;12:e0169338.
#=GF RN [3]
#=GF RM 22993404
#=GF RT Rat Mcs1b is concordant to the genome-wide
#=GF RT association-identified breast cancer risk locus at human 5q11.2
#=GF RT and MIER3 is a candidate cancer susceptibility gene.
#=GF RA denDekker AD, Xu X, Vaughn MD, Puckett AH, Gardner LL, Lambring
#=GF RA CJ, Deschenes L, Samuelson DJ;
#=GF RL Cancer Res. 2012;72:6002-6012.
#=GF DR INTERPRO; IPR045787;
#=GF DR SO; 0000417; polypeptide_domain;
#=GF CC This domain is found at the C-terminal of MIER1 and MIER3. MIER1
#=GF CC is a transcriptional repressor that regulates the expression of
#=GF CC a number of genes including SP1 target genes, recruiting histone
#=GF CC deacetylase 1 (HDAC1) through its ELM2 domain. It has two
#=GF CC isoforms, alpha and beta, which differ in their C-terminal
#=GF CC domains, both of them being able to interact with HDAC1. The
#=GF CC gene encoding MIER3 has been identified as a candidate cancer
#=GF CC susceptibility gene [3]. MIER1 and 3 share two regions of high
#=GF CC homology, one at the N-terminal and the second at the
#=GF CC C-terminal, represented in this entry, which includes a short
#=GF CC region located immediately downstream of the SANT extension that
#=GF CC is 84% identical [1,2].
#=GF SQ 2065
#=GS A0A287CWR8_ICTTR/395-542 AC A0A287CWR8.1
#=GS A0A7K5ZTT5_ONYCO/340-407 AC A0A7K5ZTT5.1
#=GS A0A7L1GXQ7_9PICI/28-243 AC A0A7L1GXQ7.1
#=GS A0A8C6D012_MOSMO/387-453 AC A0A8C6D012.1
#=GS A0A850U2Z4_GRUAM/332-547 AC A0A850U2Z4.1
#=GS A0A5E4CNV1_MARMO/336-550 AC A0A5E4CNV1.1
#=GS A0A6J3EI69_AYTFU/274-489 AC A0A6J3EI69.1
#=GS A0A8J1KIZ0_XENLA/352-493 AC A0A8J1KIZ0.1
#=GS A0A851MF06_9DEND/341-487 AC A0A851MF06.1
#=GS A0A437CZZ1_ORYJA/392-615 AC A0A437CZZ1.1
#=GS A0A452C4H0_BALAS/320-534 AC A0A452C4H0.1
#=GS A0A7L0B2D2_9AVES/28-243 AC A0A7L0B2D2.1
#=GS A0A2Y9Q600_DELLE/336-550 AC A0A2Y9Q600.1
#=GS A0A6J3B1K7_VICPA/432-579 AC A0A6J3B1K7.1
#=GS F6VCI0_MONDO/309-523 AC F6VCI0.3
#=GS B7NZB7_RABIT/333-547 AC B7NZB7.1
#=GS M7BK46_CHEMY/336-484 AC M7BK46.1
#=GS D7EL50_TRICA/314-368 AC D7EL50.1
#=GS A0A8P4K840_DICLA/301-525 AC A0A8P4K840.1
#=GS A0A2A3EQX3_APICC/433-490 AC A0A2A3EQX3.1
#=GS A0A6J1WFE4_GALME/308-363 AC A0A6J1WFE4.1
#=GS U3ILP3_ANAPP/352-416 AC U3ILP3.2
#=GS A0A8I4A1U9_CALJA/485-635 AC A0A8I4A1U9.1
#=GS A0A667GAM8_LYNCA/341-555 AC A0A667GAM8.1
#=GS G7NW31_MACFA/395-542 AC G7NW31.1
#=GS A0A7J8KCK6_ROUAE/160-309 AC A0A7J8KCK6.1
#=GS A0A6P6MPV0_CARAU/342-557 AC A0A6P6MPV0.1
#=GS A0A1S3QZF3_SALSA/325-426 AC A0A1S3QZF3.1
#=GS A0A7K7B270_9AVES/346-561 AC A0A7K7B270.1
#=GS M7C9R2_CHEMY/377-592 AC M7C9R2.1
#=GS A0A3Q7R0M1_VULVU/342-489 AC A0A3Q7R0M1.1
#=GS A0A7J8KCK2_ROUAE/395-544 AC A0A7J8KCK2.1
#=GS A0A3B5KAE6_TAKRU/328-539 AC A0A3B5KAE6.2
#=GS A0A7J7ZYP2_MYOMY/342-403 AC A0A7J7ZYP2.1
#=GS A0A6J1ZD99_ACIJB/358-505 AC A0A6J1ZD99.1
#=GS A0A226PJ58_COLVI/357-572 AC A0A226PJ58.1
#=GS A0A6J0AJI3_VICPA/342-489 AC A0A6J0AJI3.1
#=GS A0A7K4J9M0_GEOCA/1-200 AC A0A7K4J9M0.1
#=GS A0A834ND51_VESVU/500-573 AC A0A834ND51.1
#=GS A0A665W3U7_ECHNA/328-552 AC A0A665W3U7.1
#=GS A0A7L1EV63_SYLBO/286-472 AC A0A7L1EV63.1
#=GS A0A1U7URG1_CARSF/308-522 AC A0A1U7URG1.1
#=GS A0A8C8MEH6_ONCTS/287-497 AC A0A8C8MEH6.1
#=GS A0A7L4IU35_9PASS/414-583 AC A0A7L4IU35.1
#=GS A0A8J2MX51_COTCN/504-559 AC A0A8J2MX51.1
#=GS A0A0Q3PJ00_AMAAE/191-336 AC A0A0Q3PJ00.1
#=GS A0A7L3W1P3_9GRUI/28-243 AC A0A7L3W1P3.1
#=GS A0A7E6D9S5_9CHIR/338-552 AC A0A7E6D9S5.1
#=GS A0A6J3JDJ0_SAPAP/359-506 AC A0A6J3JDJ0.1
#=GS A0A8C3JST1_9CHAR/286-499 AC A0A8C3JST1.1
#=GS A0A8B9QCL8_APTOW/329-543 AC A0A8B9QCL8.1
#=GS A0A2K6R772_RHIRO/333-547 AC A0A2K6R772.1
#=GS A0A7K9DXW3_BARMA/231-348 AC A0A7K9DXW3.1
#=GS A0A8V5H061_MELUD/309-522 AC A0A8V5H061.1
#=GS A0A8B7JCT0_9AVES/256-471 AC A0A8B7JCT0.1
#=GS A0A7K6LA87_9CORV/412-574 AC A0A7K6LA87.1
#=GS A0A6J0UMG3_9SAUR/355-570 AC A0A6J0UMG3.1
#=GS MIER1_HUMAN/342-492 AC Q8N108.2
#=GS A0A7L1NQF0_RHICY/1-193 AC A0A7L1NQF0.1
#=GS A0A667FWM5_LYNCA/309-523 AC A0A667FWM5.1
#=GS A0A7K6GX95_9PASS/326-542 AC A0A7K6GX95.1
#=GS A0A6G1AMI5_CROCR/325-539 AC A0A6G1AMI5.1
#=GS A0A8B7INP7_9AVES/384-598 AC A0A8B7INP7.1
#=GS A0A3B3I6Q6_ORYLA/324-546 AC A0A3B3I6Q6.1
#=GS A0A6P5KSE9_PHACI/339-405 AC A0A6P5KSE9.1
#=GS A0A6G0IL90_LARCR/329-553 AC A0A6G0IL90.1
#=GS A0A384C271_URSMA/341-488 AC A0A384C271.1
#=GS A0A4U1FGP5_MONMO/403-551 AC A0A4U1FGP5.1
#=GS A0A3Q1HQ15_9TELE/370-443 AC A0A3Q1HQ15.1
#=GS A0A8B9N6W8_9AVES/395-463 AC A0A8B9N6W8.1
#=GS A0A1S3LVA7_SALSA/348-452 AC A0A1S3LVA7.1
#=GS A0A6P3YGP6_DINQU/430-487 AC A0A6P3YGP6.1
#=GS A0A851FQM1_PITSO/28-243 AC A0A851FQM1.1
#=GS W5JNC8_ANODA/285-356 AC W5JNC8.1
#=GS A0A2U3WJ58_ODORO/341-555 AC A0A2U3WJ58.1
#=GS A0A8C4B3Q8_9TELE/359-446 AC A0A8C4B3Q8.1
#=GS A0A665VSW0_ECHNA/345-448 AC A0A665VSW0.1
#=GS A0A673M375_9TELE/337-454 AC A0A673M375.1
#=GS A0A8C9BJJ4_PHOSS/335-549 AC A0A8C9BJJ4.1
#=GS A0A4Z2FQ48_9TELE/437-534 AC A0A4Z2FQ48.1
#=GS A0A493U1T8_ANAPP/356-423 AC A0A493U1T8.1
#=GS A0A8C9H0Q8_9PRIM/342-489 AC A0A8C9H0Q8.1
#=GS A0A3B1KAN4_ASTMX/281-493 AC A0A3B1KAN4.1
#=GS A0A8V0ZV15_CHICK/295-362 AC A0A8V0ZV15.1
#=GS A0A7K7J513_LOXCU/332-405 AC A0A7K7J513.1
#=GS A0A4W5Q343_9TELE/303-505 AC A0A4W5Q343.1
#=GS G1T9G1_RABIT/409-555 AC G1T9G1.3
#=GS A0A2Y9NNY8_DELLE/408-555 AC A0A2Y9NNY8.1
#=GS G5BSP9_HETGA/408-469 AC G5BSP9.1
#=GS A0A8M1FRR8_URSMA/467-613 AC A0A8M1FRR8.1
#=GS A0A7M7QIE3_NASVI/377-513 AC A0A7M7QIE3.1
#=GS A0A3Q3BZ79_HAPBU/328-537 AC A0A3Q3BZ79.1
#=GS A0A7L3KEP5_9PASS/94-267 AC A0A7L3KEP5.1
#=GS A0A674DBG2_SALTR/313-368 AC A0A674DBG2.1
#=GS F6XS83_MACMU/362-509 AC F6XS83.2
#=GS A0A7K4X0I0_9TYRA/28-243 AC A0A7K4X0I0.1
#=GS A0A8B9DT01_ANSCY/372-587 AC A0A8B9DT01.1
#=GS A0A7K9KHT2_9PASE/28-243 AC A0A7K9KHT2.1
#=GS A0A671PCR4_9TELE/319-529 AC A0A671PCR4.1
#=GS A0A6I8NWF0_ORNAN/471-531 AC A0A6I8NWF0.1
#=GS A0A315UXI4_GAMAF/550-773 AC A0A315UXI4.1
#=GS A0A7L0ZN67_9PASS/325-540 AC A0A7L0ZN67.1
#=GS A0A7K7LJD1_9AVES/28-243 AC A0A7K7LJD1.1
#=GS A0A6I9I8Q2_VICPA/395-542 AC A0A6I9I8Q2.1
#=GS A0A3P8WJP1_CYNSE/301-516 AC A0A3P8WJP1.1
#=GS A0A2K6A4M4_MANLE/362-509 AC A0A2K6A4M4.1
#=GS A0A7L2L658_9PASS/28-243 AC A0A7L2L658.1
#=GS A0A6J0E3H9_PERMB/315-477 AC A0A6J0E3H9.1
#=GS A0A226NG71_CALSU/301-373 AC A0A226NG71.1
#=GS A0A7K8LL07_9GRUI/325-539 AC A0A7K8LL07.1
#=GS A0A5J5N4Y4_MUNRE/392-538 AC A0A5J5N4Y4.1
#=GS A0A834XU22_9HYME/504-565 AC A0A834XU22.1
#=GS A0A8B9Z3X0_9AVES/326-399 AC A0A8B9Z3X0.1
#=GS A0A851WPQ4_CORMO/397-567 AC A0A851WPQ4.1
#=GS A0A672TGX7_STRHB/337-550 AC A0A672TGX7.1
#=GS A0A6J1ZEF0_ACIJB/432-579 AC A0A6J1ZEF0.1
#=GS A0A7K8PI18_COCCO/325-540 AC A0A7K8PI18.1
#=GS A0A8D2K1S5_THEGE/342-489 AC A0A8D2K1S5.1
#=GS L8ILH2_9CETA/388-534 AC L8ILH2.1
#=GS A0A668VPD7_OREAU/324-548 AC A0A668VPD7.1
#=GS A0A7K5VDW2_9CORV/335-550 AC A0A7K5VDW2.1
#=GS A0A669AWN8_ORENI/324-548 AC A0A669AWN8.1
#=GS A0A8C6QM65_NANGA/331-480 AC A0A8C6QM65.1
#=GS W5PML5_SHEEP/393-539 AC W5PML5.1
#=GS A0A8D2PCK1_ZOSLA/350-565 AC A0A8D2PCK1.1
#=GS A0A8D0G0K1_STROC/344-411 AC A0A8D0G0K1.1
#=GS A0A851W1I5_9PASS/333-410 AC A0A851W1I5.1
#=GS A0A7J8A9F3_PIPKU/342-409 AC A0A7J8A9F3.1
#=GS A0A6P6IQR6_PUMCO/342-492 AC A0A6P6IQR6.1
#=GS A0A340WTC4_LIPVE/336-550 AC A0A340WTC4.1
#=GS A0A7L1Y2N8_9AVES/341-486 AC A0A7L1Y2N8.1
#=GS A0A8I3QEI6_CANLF/342-489 AC A0A8I3QEI6.1
#=GS A0A8B9Z7N9_9AVES/344-417 AC A0A8B9Z7N9.1
#=GS A0A7K5SFY0_LANLU/1-216 AC A0A7K5SFY0.1
#=GS A0A2Y9R4Y2_TRIMA/315-461 AC A0A2Y9R4Y2.1
#=GS A0A2K5EXA1_AOTNA/390-537 AC A0A2K5EXA1.1
#=GS A0A6I9NXZ9_9TELE/352-421 AC A0A6I9NXZ9.1
#=GS A0A6J1QTF4_9HYME/428-490 AC A0A6J1QTF4.1
#=GS A0A7K9V1P2_ANSSE/28-243 AC A0A7K9V1P2.1
#=GS A0A8D2K1G0_THEGE/395-458 AC A0A8D2K1G0.1
#=GS A0A1S3QY19_SALSA/324-425 AC A0A1S3QY19.1
#=GS A0A6P6EPT6_OCTDE/294-355 AC A0A6P6EPT6.1
#=GS A0A6P4ZK88_BRABE/322-375 AC A0A6P4ZK88.1
#=GS A0A1A7ZH98_NOTFU/328-551 AC A0A1A7ZH98.1
#=GS A0A7J7ZYZ7_MYOMY/342-409 AC A0A7J7ZYZ7.1
#=GS A0A8C2VAI4_CHILA/312-366 AC A0A8C2VAI4.1
#=GS A0A091IT77_EGRGA/325-540 AC A0A091IT77.1
#=GS A0A3Q0GBX3_ALLSI/279-494 AC A0A3Q0GBX3.1
#=GS A0A452S2M7_URSAM/291-438 AC A0A452S2M7.1
#=GS A0A8C6UUW5_9GOBI/330-542 AC A0A8C6UUW5.1
#=GS A0A8C4WW65_EPTBU/308-360 AC A0A8C4WW65.1
#=GS F6VBD1_HORSE/359-426 AC F6VBD1.2
#=GS A0A4Y2AQB8_ARAVE/58-119 AC A0A4Y2AQB8.1
#=GS A0A099ZZG6_CHAVO/325-540 AC A0A099ZZG6.1
#=GS A0A8C9YA68_SANLU/328-552 AC A0A8C9YA68.1
#=GS A0A6I8PNJ0_ORNAN/471-531 AC A0A6I8PNJ0.1
#=GS A0A484DBE3_PERFV/328-552 AC A0A484DBE3.1
#=GS A0A7L1A3W6_9PASS/334-549 AC A0A7L1A3W6.1
#=GS A0A8C8JFR1_ONCTS/361-471 AC A0A8C8JFR1.1
#=GS A0A6I9KHY4_CHRAS/309-523 AC A0A6I9KHY4.1
#=GS A0A3Q3FQJ3_9LABR/346-563 AC A0A3Q3FQJ3.1
#=GS A0A671E4P8_RHIFE/342-489 AC A0A671E4P8.1
#=GS A0A232F9C3_9HYME/405-470 AC A0A232F9C3.1
#=GS A0A6J0UM07_9SAUR/307-454 AC A0A6J0UM07.1
#=GS A0A8C8CKR7_ONCTS/320-540 AC A0A8C8CKR7.1
#=GS A0A674F029_SALTR/328-548 AC A0A674F029.1
#=GS A0A674EY56_SALTR/333-542 AC A0A674EY56.1
#=GS A0A7K7X3Z9_9PASS/332-395 AC A0A7K7X3Z9.1
#=GS A0A7E6DT46_9CHIR/347-413 AC A0A7E6DT46.1
#=GS A0A6P4YYE4_BRABE/322-375 AC A0A6P4YYE4.1
#=GS A0A2Y9QZF8_TRIMA/409-555 AC A0A2Y9QZF8.1
#=GS A0A674EY58_SALTR/304-524 AC A0A674EY58.1
#=GS A0A8C3C1V9_CAIMO/309-524 AC A0A8C3C1V9.1
#=GS G5E705_LOXAF/386-453 AC G5E705.1
#=GS A0A7K6ANR9_UPUEP/325-540 AC A0A7K6ANR9.1
#=GS A0A8C2V7E2_CHILA/343-397 AC A0A8C2V7E2.1
#=GS A0A7K7U1B2_9CHAR/28-109 AC A0A7K7U1B2.1
#=GS A0A3B3H4A8_ORYLA/327-397 AC A0A3B3H4A8.1
#=GS A0A7L3IE05_9PASS/325-540 AC A0A7L3IE05.1
#=GS A0A2I3TRZ1_PANTR/395-544 AC A0A2I3TRZ1.1
#=GS A0A8J7NQ80_ATRSP/363-571 AC A0A8J7NQ80.1
#=GS A0A0P7XC95_SCLFO/381-438 AC A0A0P7XC95.1
#=GS A0A452F2D5_CAPHI/357-503 AC A0A452F2D5.1
#=GS A0A8C7IQU5_ONCKI/361-473 AC A0A8C7IQU5.1
#=GS A0A6P3IA01_BISBI/417-563 AC A0A6P3IA01.1
#=GS A0A4W2E0Z7_BOBOX/357-503 AC A0A4W2E0Z7.1
#=GS A0A7K9XRL1_9GRUI/325-540 AC A0A7K9XRL1.1
#=GS A0A6P6CWV7_PTEVA/315-462 AC A0A6P6CWV7.1
#=GS A0A7K8IDB6_9PASS/400-574 AC A0A7K8IDB6.1
#=GS A0A8C5U5M0_9PASS/267-477 AC A0A8C5U5M0.1
#=GS U3E8E9_CALJA/359-506 AC U3E8E9.1
#=GS A0A8D0E3F1_SALMN/299-450 AC A0A8D0E3F1.1
#=GS A0A6P6KAM2_CARAU/338-403 AC A0A6P6KAM2.1
#=GS H2TXB6_TAKRU/324-384 AC H2TXB6.2
#=GS A0A8B9VBV2_9AVES/336-551 AC A0A8B9VBV2.1
#=GS A0A6J3EM00_AYTFU/336-551 AC A0A6J3EM00.1
#=GS A0A091QWK7_MERNU/341-409 AC A0A091QWK7.1
#=GS A0A663DW63_AQUCH/372-586 AC A0A663DW63.1
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A0A2Y9R4Y2_TRIMA/315-461 ................................QTRFGKKKYNLHPG........VT....DYMDRLLD..ESES...A..A..S...S.......RA.PSp.....pP.....T.....AS-..........-..--.--.-...---.-...-N.S..SNS....Q..S.E....K....E--.....-.-..--.....-.....-.-.-..--.-.....-..---.-----.---.--....----.---.--..--...-.--.-----..---..--........-....-..--------.-----..-----..-..---..-..--..----.-.-..-.----------.------.--..-..--..-----........-.--.--.--.-------.----------...------..-----...--------dgtvsnsnqngvssngpgeilskedvkveglhvngptggnkkplhadtdtngyetdnlttdpklahmtarnendldekserpakrrrvnsngkes................
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A0A3P9BSS4_9CICH/350-414 ................................QTRLGKRKYNLHPG........VT....DYMDRLLD..ETES...A..T..S...S.......RA.ASp.....pP.....T.....TSN..........S..--.--.-...---.-...--.-..---....-..-.-....-....---.....-.-..--.....-.....-.-.-..--.-.....-..---.-----.---.--....----.---.--..--...-.--.-----..---..--........-....-..--------.-----..-----..-..---..-..--..----.-.-..-.----------.------.--..-..--..-----........-.--.--.--.-------.----------...------..-----...--------sashseredsssqngvashtv..........................................................................................
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A0A4X2LTY1_VOMUR/309-523 ................................QTRFGKKRYNHHPG........VT....DYMDRLVD..ETEA...L..G..G...A.......VN.SS.......A.....L.....TSN..........-..RT.EP.L...PDQ.Q...LS.I..LNS....F..T.A....S....DLT.....A.L..TN.....S.....V.A.T..VC.N.....S..PDV.NCLDD.SFP.PL....GNLP.RGQ.VN..HV...P.VV.TEELL..NLP..SN........G....E..SDCFNLFE.TGFYH..SELNP..M..NIC..G..EE..SERP.A.K..R.LKMGISVPES.FINDVS.VN..N..LG..VDFEN........H.TH.HI.TS.AKMAVSV.ADFSSLSANE...TNGFIS..SHTLH...QHTALHSE...............................................................................................................
A0A8I3Q6Q5_CANLF/341-555 ................................QTRFGKKRYNHHPG........VT....DYMDRLVD..ETEA...L..G..S...T.......VN.SS.......A.....L.....TSN..........-..RP.EP.L...PDQ.Q...LN.I..LNS....F..T.A....S....DLT.....A.L..TN.....S.....V.A.T..VC.N.....P..TDV.NCLDD.SFP.PL....GNTP.RGQ.VN..HV...P.VV.TEELL..TLP..SN........G....E..SDCFNLFE.TGFYH..SELNP..M..NMC..S..EE..SERP.A.K..R.LKMGIAVPES.FMNEVS.VN..N..LG..VDFEN........H.TH.HI.TS.AKMAVSV.ADFGSLSASE...TNGFIG..AHALH...QHAALHSE...............................................................................................................
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