#=GF ID MRP-S28
#=GF AC PF10213.13
#=GF DE Mitochondrial ribosomal subunit protein
#=GF AU Wood V;0000-0001-6330-7526
#=GF AU Coggill P;0000-0001-5731-1588
#=GF SE Wood V
#=GF GA 22.30 22.30;
#=GF TC 22.30 22.30;
#=GF NC 22.20 22.20;
#=GF BM hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM hmmsearch -E 1000 --cpu 4 -Z 75585367 HMM pfamseq
#=GF TP Family
#=GF CL CL0337
#=GF RN [1]
#=GF RM 11344316
#=GF RT Identification of four proteins from the small subunit of the
#=GF RT mammalian mitochondrial ribosome using a proteomics approach.
#=GF RA Koc EC, Burkhart W, Blackburn K, Koc H, Moseley A, Spremulli LL;
#=GF RL Protein Sci. 2001;10:471-481.
#=GF DR INTERPRO; IPR019349;
#=GF DR SO; 0100021; polypeptide_conserved_region;
#=GF CC This is a conserved region of approx. 125 residues of one of the
#=GF CC proteins that makes up the small subunit of the mitochondrial
#=GF CC ribosome. In Saccharomyces cerevisiae the protein is MRP-S24
#=GF CC whereas in humans it is MRP-S28. The human mitochondrial
#=GF CC ribosome has 29 distinct proteins in the small subunit and these
#=GF CC have homologues in, for example, Drosophila melanogaster,
#=GF CC Caenorhabditis elegans, and in the genomes of several fungi [1].
#=GF SQ 2122
#=GS A0A0C2TUG1_AMAMK/87-241 AC A0A0C2TUG1.1
#=GS A0A179H008_PURLI/202-322 AC A0A179H008.1
#=GS A0A1S7UJC3_ROSNE/182-302 AC A0A1S7UJC3.1
#=GS A0A0S3R0T3_PHAAN/256-373 AC A0A0S3R0T3.1
#=GS A0A162JHJ3_METRR/200-320 AC A0A162JHJ3.1
#=GS A0A812YF10_9DINO/132-255 AC A0A812YF10.1
#=GS A0A6P5BUX4_BOSIN/144-282 AC A0A6P5BUX4.1
#=GS A0A2H3E1C4_ARMGA/112-266 AC A0A2H3E1C4.1
#=GS A0A388JVU4_CHABU/150-252 AC A0A388JVU4.1
#=GS A0A2C5WX20_9PEZI/186-306 AC A0A2C5WX20.1
#=GS A0A2G4SMX0_RHIZD/81-199 AC A0A2G4SMX0.1
#=GS C1G3I7_PARBD/176-298 AC C1G3I7.1
#=GS A0A6P5WNT0_DURZI/286-397 AC A0A6P5WNT0.1
#=GS A0A395HK11_ASPHC/189-311 AC A0A395HK11.1
#=GS A0A0D2U1Z2_CAPO3/662-785 AC A0A0D2U1Z2.1
#=GS A0A068TQ10_COFCA/280-392 AC A0A068TQ10.1
#=GS W7K119_PLAFO/185-280 AC W7K119.1
#=GS A0A3M7QCB3_BRAPC/189-308 AC A0A3M7QCB3.1
#=GS A0A1G4IY44_9SACH/154-281 AC A0A1G4IY44.1
#=GS A0A7E6DA33_9CHIR/144-246 AC A0A7E6DA33.1
#=GS W9X121_9EURO/239-360 AC W9X121.1
#=GS A0A6I9HIB8_GEOFO/83-190 AC A0A6I9HIB8.1
#=GS A0A0L0VW24_9BASI/105-264 AC A0A0L0VW24.1
#=GS A0A151X6X6_9HYME/158-255 AC A0A151X6X6.1
#=GS A0A7L0EB39_TROML/14-84 AC A0A7L0EB39.1
#=GS A0A836JI30_9HYME/158-250 AC A0A836JI30.1
#=GS A0A512UG87_9ASCO/148-271 AC A0A512UG87.1
#=GS A0A7L0U5U2_CHOAC/14-84 AC A0A7L0U5U2.1
#=GS W7HJN4_9PEZI/417-537 AC W7HJN4.1
#=GS A0A7K6WSC3_STECA/14-84 AC A0A7K6WSC3.1
#=GS A0A2G3D006_CAPCH/307-422 AC A0A2G3D006.1
#=GS A0A7J5Z451_DISMA/153-256 AC A0A7J5Z451.1
#=GS W4KPS5_HETIT/76-235 AC W4KPS5.1
#=GS A0A1S3K3R5_LINUN/205-332 AC A0A1S3K3R5.1
#=GS A0A7K5L220_VIRAL/14-84 AC A0A7K5L220.1
#=GS Q2GTQ2_CHAGB/188-309 AC Q2GTQ2.1
#=GS A0A834JMJ9_VESVU/157-269 AC A0A834JMJ9.1
#=GS Q5AI30_CANAL/149-276 AC Q5AI30.1
#=GS A0A093HKX8_STRCA/92-192 AC A0A093HKX8.1
#=GS A0A5D2S3L3_GOSMU/286-396 AC A0A5D2S3L3.1
#=GS A0A6H5GQ78_9HEMI/9-86 AC A0A6H5GQ78.1
#=GS A0A671DTC3_RHIFE/144-250 AC A0A671DTC3.1
#=GS A0A7K9RSM7_9PASS/14-84 AC A0A7K9RSM7.1
#=GS A0A3Q1C305_AMPOC/152-258 AC A0A3Q1C305.1
#=GS A0A024W373_PLAFA/185-280 AC A0A024W373.1
#=GS A0A5N5D3C8_9PEZI/166-287 AC A0A5N5D3C8.1
#=GS A0A0R3W7P7_TAEAS/166-288 AC A0A0R3W7P7.1
#=GS A0A8H3G015_9LECA/239-365 AC A0A8H3G015.1
#=GS A0A2P5AQY1_PARAD/286-399 AC A0A2P5AQY1.1
#=GS A0A067QHC8_ZOONE/132-224 AC A0A067QHC8.1
#=GS A0A545VR67_9HYPO/190-315 AC A0A545VR67.1
#=GS A0A7R7VDW0_ASPCH/191-313 AC A0A7R7VDW0.1
#=GS A0A7K6LAF2_9CORV/14-84 AC A0A7K6LAF2.1
#=GS A0A7L3KAD8_9PASS/14-84 AC A0A7L3KAD8.1
#=GS A0A439CU87_9PEZI/178-298 AC A0A439CU87.1
#=GS A0A0N4XEB8_NIPBR/181-284 AC A0A0N4XEB8.1
#=GS A0A138ZZ51_GONPJ/163-265 AC A0A138ZZ51.1
#=GS A0A4Q4X1C7_9PEZI/176-296 AC A0A4Q4X1C7.1
#=GS A0A4T0IN61_WALIC/99-257 AC A0A4T0IN61.1
#=GS A0A2V3IW42_9FLOR/133-241 AC A0A2V3IW42.1
#=GS A0A5M9JTT8_MONFR/152-272 AC A0A5M9JTT8.1
#=GS A0A2G8KK00_STIJA/177-276 AC A0A2G8KK00.1
#=GS A0A4U6W9E8_SETVI/263-383 AC A0A4U6W9E8.1
#=GS A0A7K5M5P4_CARCD/14-84 AC A0A7K5M5P4.1
#=GS A0A7J7Z7M5_MYOMY/83-188 AC A0A7J7Z7M5.1
#=GS F8PF34_SERL3/43-196 AC F8PF34.1
#=GS A0A7K7CDU8_APHCE/14-84 AC A0A7K7CDU8.1
#=GS A0A066VR57_9AGAM/76-234 AC A0A066VR57.1
#=GS RT35_BOVIN/144-282 AC Q2YDF6.1
#=GS A0A2I0IWF6_PUNGR/116-232 AC A0A2I0IWF6.1
#=GS A0A851EIE8_9CORV/14-84 AC A0A851EIE8.1
#=GS A0A8C8BE42_9STRI/147-249 AC A0A8C8BE42.1
#=GS A0A814K225_9BILA/148-246 AC A0A814K225.1
#=GS A0A093Q508_9PASS/92-196 AC A0A093Q508.1
#=GS C1EEY3_MICCC/301-407 AC C1EEY3.1
#=GS A0A0Q3TWF3_AMAAE/108-211 AC A0A0Q3TWF3.1
#=GS A0A7K7VBV0_EUDEL/14-84 AC A0A7K7VBV0.1
#=GS B4IYH8_DROGR/156-262 AC B4IYH8.1
#=GS A0A7K4PTV6_MELMO/14-84 AC A0A7K4PTV6.1
#=GS A0A0E9NJ62_SAICN/90-210 AC A0A0E9NJ62.1
#=GS A0A3Q1JBI1_ANATE/152-259 AC A0A3Q1JBI1.1
#=GS A0A8X7MWJ5_9BASI/115-304 AC A0A8X7MWJ5.1
#=GS A0A0V0VI01_9BILA/778-900 AC A0A0V0VI01.1
#=GS A0A3Q4HU90_NEOBR/144-248 AC A0A3Q4HU90.1
#=GS A0A2J6T1N0_9HELO/172-293 AC A0A2J6T1N0.1
#=GS A0A1U7VQ18_NICSY/101-203 AC A0A1U7VQ18.1
#=GS A0A2U9BW72_SCOMX/152-282 AC A0A2U9BW72.1
#=GS G0VBS6_NAUCC/154-282 AC G0VBS6.1
#=GS C1MYD3_MICPC/1-111 AC C1MYD3.1
#=GS A0A7L2GRC6_NYCGR/14-84 AC A0A7L2GRC6.1
#=GS A0A5N6SU84_ASPPS/191-313 AC A0A5N6SU84.1
#=GS A0A851A994_SULDA/14-84 AC A0A851A994.1
#=GS A0A2P6NSV6_9EUKA/589-686 AC A0A2P6NSV6.1
#=GS A0A8H4H0S4_9EURO/189-311 AC A0A8H4H0S4.1
#=GS A0A1E4S556_CYBJN/140-271 AC A0A1E4S556.1
#=GS A0A167LX69_CALVF/51-200 AC A0A167LX69.1
#=GS G0SY02_RHOT2/91-247 AC G0SY02.1
#=GS Y7952_DICDI/1071-1187 AC Q54WN8.1
#=GS A8WJC6_CAEBR/185-286 AC A8WJC6.2
#=GS A0A5C3LBX6_9AGAR/99-254 AC A0A5C3LBX6.1
#=GS A0A814L4G4_9BILA/148-246 AC A0A814L4G4.1
#=GS A0A8C6G2L0_MOSMO/144-250 AC A0A8C6G2L0.1
#=GS Q9LJQ6_ARATH/283-404 AC Q9LJQ6.1
#=GS A0A5A7Q5X3_STRAF/299-420 AC A0A5A7Q5X3.1
#=GS A0A8B9M0U5_9AVES/158-257 AC A0A8B9M0U5.1
#=GS A0A6J5UZG3_PRUAR/284-402 AC A0A6J5UZG3.1
#=GS A0A3N4KFN5_9PEZI/72-195 AC A0A3N4KFN5.1
#=GS A0A667YC07_9TELE/152-259 AC A0A667YC07.1
#=GS A0A5C6PC47_9TELE/112-213 AC A0A5C6PC47.1
#=GS A0A835GI89_SPOEX/159-261 AC A0A835GI89.1
#=GS A0A7K9C8K1_9PICI/14-84 AC A0A7K9C8K1.1
#=GS A0A067MD32_9AGAM/90-245 AC A0A067MD32.1
#=GS A0A7L1GHI3_9PICI/14-84 AC A0A7L1GHI3.1
#=GS A0A8B7Z0B1_ACAPL/177-279 AC A0A8B7Z0B1.1
#=GS A0A8H4EVB3_GIGMA/84-203 AC A0A8H4EVB3.1
#=GS A0A7L0XYE2_TYRSA/14-84 AC A0A7L0XYE2.1
#=GS A0A094BT27_9PEZI/162-283 AC A0A094BT27.1
#=GS A0A8M1H393_URSMA/146-246 AC A0A8M1H393.1
#=GS A0A7L3A2K7_9PASE/14-84 AC A0A7L3A2K7.1
#=GS A0A7K4TMX5_9SYLV/14-84 AC A0A7K4TMX5.1
#=GS A0A0C9M294_BLOB1/216-336 AC A0A0C9M294.1
#=GS A0A5N6Q1H4_9ASTR/290-411 AC A0A5N6Q1H4.1
#=GS A0A852BH00_9CORV/14-84 AC A0A852BH00.1
#=GS A0A1S7HEA7_9SACH/152-279 AC A0A1S7HEA7.1
#=GS A0A5Q4C7T9_9PEZI/193-313 AC A0A5Q4C7T9.1
#=GS A0A1I7V8I5_LOALO/187-321 AC A0A1I7V8I5.1
#=GS A0A814K242_9BILA/148-246 AC A0A814K242.1
#=GS A0A507R0X9_MONPU/201-323 AC A0A507R0X9.1
#=GS A0A4E0RRM9_FASHE/130-257 AC A0A4E0RRM9.1
#=GS A0A166FIB3_9AGAM/27-181 AC A0A166FIB3.1
#=GS A0A2R8ZN99_PANPA/141-246 AC A0A2R8ZN99.1
#=GS A0A093R1V7_PHACA/92-192 AC A0A093R1V7.1
#=GS A0A8H7JCY1_9PLEO/185-305 AC A0A8H7JCY1.1
#=GS A0A8C6ADM5_MARMA/120-247 AC A0A8C6ADM5.1
#=GS E3N0J3_CAERE/184-285 AC E3N0J3.1
#=GS A0A1E3I5L6_9TREE/93-234 AC A0A1E3I5L6.1
#=GS A0A7L2PZV7_9PASS/14-84 AC A0A7L2PZV7.1
#=GS A0A0D2AC94_EXOME/260-381 AC A0A0D2AC94.1
#=GS A0A425BL79_9PEZI/114-235 AC A0A425BL79.1
#=GS A0A2S7QIG4_9HELO/152-272 AC A0A2S7QIG4.1
#=GS A0A225W785_9STRA/129-221 AC A0A225W785.1
#=GS A0A4D9CXK4_9STRA/170-259 AC A0A4D9CXK4.1
#=GS A0A8H6C8A3_9LECA/192-313 AC A0A8H6C8A3.1
#=GS G5C2Q9_HETGA/114-215 AC G5C2Q9.1
#=GS A0A484B613_DRONA/162-265 AC A0A484B613.1
#=GS A0A7J6SHL5_PEROL/185-268 AC A0A7J6SHL5.1
#=GS A0A7K7GR08_ERIRU/14-84 AC A0A7K7GR08.1
#=GS A0A8J1VLK7_9TREE/483-633 AC A0A8J1VLK7.1
#=GS A0A317XTV4_9BASI/96-249 AC A0A317XTV4.1
#=GS A0A4Y9YQS7_9APHY/86-227 AC A0A4Y9YQS7.1
#=GS A0A0B2V610_TOXCA/234-358 AC A0A0B2V610.1
#=GS A0A2T2P7T2_CORCC/187-308 AC A0A2T2P7T2.1
#=GS A0A6P7Z3S3_9AMPH/128-225 AC A0A6P7Z3S3.1
#=GS K7E5E2_MONDO/202-306 AC K7E5E2.2
#=GS K5XDX6_PHACS/43-196 AC K5XDX6.1
#=GS A0A7L3GIF0_9AVES/14-84 AC A0A7L3GIF0.1
#=GS A0A0K0E450_STRER/175-290 AC A0A0K0E450.1
#=GS A0A1B8ED69_9PEZI/162-283 AC A0A1B8ED69.1
#=GS A0A6P7YYW9_9AMPH/87-185 AC A0A6P7YYW9.1
#=GS A0A6P3XH88_DINQU/153-248 AC A0A6P3XH88.1
#=GS A0A8A3PAN3_9HELO/152-272 AC A0A8A3PAN3.1
#=GS A0A3Q0KHC9_SCHMA/157-276 AC A0A3Q0KHC9.1
#=GS A0A420I2Q4_9PEZI/212-333 AC A0A420I2Q4.1
#=GS A0A1J9RTL1_9PEZI/165-286 AC A0A1J9RTL1.1
#=GS A0A087HAL0_ARAAL/280-401 AC A0A087HAL0.1
#=GS A0A8C5K9F6_JACJA/106-225 AC A0A8C5K9F6.1
#=GS A0A395H0M9_9EURO/191-313 AC A0A395H0M9.1
#=GS A0A8B8A7X2_CRAVI/161-285 AC A0A8B8A7X2.1
#=GS A0A162PWZ0_PHYB8/91-209 AC A0A162PWZ0.1
#=GS A0A1S9D5E5_ASPOZ/191-313 AC A0A1S9D5E5.1
#=GS A0A1Q8RCU1_9PEZI/195-315 AC A0A1Q8RCU1.1
#=GS A0A1D1VBK6_RAMVA/162-262 AC A0A1D1VBK6.1
#=GS A0A851CXU9_CALVR/14-84 AC A0A851CXU9.1
#=GS A0A7L1QVQ0_9PASS/14-84 AC A0A7L1QVQ0.1
#=GS A0A1S3BW85_CUCME/282-396 AC A0A1S3BW85.1
#=GS A0A1D5P7Q3_CHICK/207-307 AC A0A1D5P7Q3.2
#=GS A0A8H6F5D4_CANAX/149-276 AC A0A8H6F5D4.1
#=GS A0A7J7IFD5_9RHOD/89-185 AC A0A7J7IFD5.1
#=GS A0A7L2SBQ1_9PASS/14-84 AC A0A7L2SBQ1.1
#=GS A0A0D2S5G3_GOSRA/117-232 AC A0A0D2S5G3.1
#=GS A0A5C3PTE5_9APHY/102-254 AC A0A5C3PTE5.1
#=GS A0A852KB53_UROIN/14-84 AC A0A852KB53.1
#=GS A0A7M7HF69_STRPU/180-274 AC A0A7M7HF69.1
#=GS A0A0C9YBR6_9AGAR/98-251 AC A0A0C9YBR6.1
#=GS A0A8B7W9A3_CASCN/82-183 AC A0A8B7W9A3.1
#=GS K8ERU1_9CHLO/244-349 AC K8ERU1.1
#=GS U3JPW0_FICAL/83-184 AC U3JPW0.1
#=GS A0A7L0IBU8_AREIN/14-84 AC A0A7L0IBU8.1
#=GS A0A6I9IRP7_VICPA/111-195 AC A0A6I9IRP7.1
#=GS A0A367L1R8_9HYPO/188-308 AC A0A367L1R8.1
#=GS A0A3N0XLJ8_ANAGA/76-186 AC A0A3N0XLJ8.1
#=GS A0A397GD51_9EURO/189-311 AC A0A397GD51.1
#=GS A0A218V8X2_9PASE/83-190 AC A0A218V8X2.1
#=GS A0A1E3NMU7_9ASCO/194-324 AC A0A1E3NMU7.1
#=GS A0A8H4Q9Q4_9HYPO/190-311 AC A0A8H4Q9Q4.1
#=GS A0A7J8G097_MOLMO/148-250 AC A0A7J8G097.1
#=GS A0A7K9XY24_9GRUI/14-84 AC A0A7K9XY24.1
#=GS A0A8B8A7D3_CRAVI/161-284 AC A0A8B8A7D3.1
#=GS A0A8D2GG84_THEGE/141-247 AC A0A8D2GG84.1
#=GS A0A6J1UXC5_9SAUR/147-244 AC A0A6J1UXC5.1
#=GS A0A5N5L9W9_9PEZI/190-310 AC A0A5N5L9W9.1
#=GS A0A8E0VKC6_9TREM/152-275 AC A0A8E0VKC6.1
#=GS E2A1Y3_CAMFO/156-253 AC E2A1Y3.1
#=GS A0A1X1BIE8_9APIC/148-246 AC A0A1X1BIE8.1
#=GS A0A7L4IXM2_9PASS/14-84 AC A0A7L4IXM2.1
#=GS A0A0C3CWS0_HEBCY/51-204 AC A0A0C3CWS0.1
#=GS A0A453FK74_AEGTS/53-157 AC A0A453FK74.1
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