#=GF ID Med4
#=GF AC PF10018.13
#=GF DE Vitamin-D-receptor interacting Mediator subunit 4
#=GF PI VDRIP;
#=GF AU KOGs;
#=GF AU Finn RD;0000-0001-8626-2148
#=GF AU Sammut SJ;0000-0003-4472-904X
#=GF SE KOGs (KOG4552)
#=GF GA 26.90 26.90;
#=GF TC 26.90 26.90;
#=GF NC 26.80 26.80;
#=GF BM hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM hmmsearch -Z 75585367 --cpu 4 -E 1000 HMM pfamseq
#=GF TP Family
#=GF WK MED4
#=GF WK Mediator_(coactivator)
#=GF RN [1]
#=GF RM 10235266
#=GF RT Ligand-dependent transcription activation by nuclear receptors
#=GF RT requires the DRIP complex.
#=GF RA Rachez C, Lemon BD, Suldan Z, Bromleigh V, Gamble M, Naar AM,
#=GF RA Erdjument-Bromage H, Tempst P, Freedman LP;
#=GF RL Nature. 1999;398:824-828.
#=GF RN [2]
#=GF RM 10235267
#=GF RT Composite co-activator ARC mediates chromatin-directed
#=GF RT transcriptional activation.
#=GF RA Naar AM, Beaurang PA, Zhou S, Abraham S, Solomon W, Tjian R;
#=GF RL Nature. 1999;398:828-832.
#=GF RN [3]
#=GF RM 15175151
#=GF RT A unified nomenclature for protein subunits of mediator
#=GF RT complexes linking transcriptional regulators to RNA polymerase
#=GF RT II.
#=GF RA Bourbon HM, Aguilera A, Ansari AZ, Asturias FJ, Berk AJ,
#=GF RA Bjorklund S, Blackwell TK, Borggrefe T, Carey M, Carlson M,
#=GF RA Conaway JW, Conaway RC, Emmons SW, Fondell JD, Freedman LP,
#=GF RA Fukasawa T, Gustafsson CM, Han M, He X, Herman PK, Hinnebusch
#=GF RA AG, Holmberg S,
#=GF RL Mol Cell. 2004;14:553-557.
#=GF DR INTERPRO; IPR019258;
#=GF DR SO; 0100021; polypeptide_conserved_region;
#=GF CC Members of this family function as part of the Mediator (Med)
#=GF CC complex, which links DNA-bound transcriptional regulators and
#=GF CC the general transcription machinery, particularly the RNA
#=GF CC polymerase II enzyme. They play a role in basal transcription by
#=GF CC mediating activation or repression according to the specific
#=GF CC complement of transcriptional regulators bound to the promoter
#=GF CC [1][2].
#=GF SQ 2122
#=GS C5M757_CANTT/106-286 AC C5M757.1
#=GS A0A2G9TS73_TELCI/73-162 AC A0A2G9TS73.1
#=GS A0A1R1PLM6_ZANCU/51-185 AC A0A1R1PLM6.1
#=GS G4N0T5_MAGO7/30-304 AC G4N0T5.1
#=GS A0A5A7PST4_STRAF/101-258 AC A0A5A7PST4.1
#=GS A0A443HVH1_BYSSP/33-282 AC A0A443HVH1.1
#=GS A0A850ZYP5_SULDA/23-101 AC A0A850ZYP5.1
#=GS A0A162NIQ3_9PEZI/30-298 AC A0A162NIQ3.1
#=GS A0A7H9B6L0_ZYGMR/84-265 AC A0A7H9B6L0.1
#=GS A0A7K4PGI7_MELMO/23-101 AC A0A7K4PGI7.1
#=GS A0A852DFL3_PASAF/23-101 AC A0A852DFL3.1
#=GS J8LI13_SACAR/67-263 AC J8LI13.1
#=GS A0A2G4SQY9_RHIZD/39-210 AC A0A2G4SQY9.1
#=GS A0A2V1BRM6_9HELO/30-268 AC A0A2V1BRM6.1
#=GS A0A183IYS8_9BILA/18-156 AC A0A183IYS8.1
#=GS A0A4Q7JHT7_METCM/72-329 AC A0A4Q7JHT7.1
#=GS G8ZY06_TORDC/29-206 AC G8ZY06.1
#=GS A0A6J1CQ51_MOMCH/120-298 AC A0A6J1CQ51.1
#=GS B4QKB3_DROSI/39-216 AC B4QKB3.1
#=GS A0A0V1P4V6_9BILA/50-187 AC A0A0V1P4V6.1
#=GS A0A2R5GDX2_9STRA/92-286 AC A0A2R5GDX2.1
#=GS A0A6H0XVD9_9PEZI/30-250 AC A0A6H0XVD9.1
#=GS A0A7K8D474_9CORV/23-101 AC A0A7K8D474.1
#=GS A0A4S4LFX5_9AGAM/35-202 AC A0A4S4LFX5.1
#=GS A0A2A9PLZ8_9HYPO/30-295 AC A0A2A9PLZ8.1
#=GS A0A8E2AYJ1_9APHY/36-196 AC A0A8E2AYJ1.1
#=GS A0A0T6ATC3_9SCAR/42-239 AC A0A0T6ATC3.1
#=GS MED4_KLULA/62-239 AC Q6CJA3.1
#=GS A0A8C8XV52_PANLE/63-206 AC A0A8C8XV52.1
#=GS A0A7K8PUQ2_COCCO/23-101 AC A0A7K8PUQ2.1
#=GS A0A0L8GC00_OCTBM/43-207 AC A0A0L8GC00.1
#=GS A0A091WNC8_OPIHO/31-174 AC A0A091WNC8.1
#=GS A0A5F8AL23_MACMU/93-236 AC A0A5F8AL23.1
#=GS A0A120E8P8_9BASI/84-282 AC A0A120E8P8.1
#=GS A0A1V8UX52_9PEZI/30-258 AC A0A1V8UX52.1
#=GS K1VW41_TRIAC/47-212 AC K1VW41.1
#=GS A0A672JDE9_SALFA/49-191 AC A0A672JDE9.1
#=GS A0A6J3B2Q7_VICPA/63-206 AC A0A6J3B2Q7.1
#=GS A0A7K5RX32_LANLU/23-101 AC A0A7K5RX32.1
#=GS G4VC00_SCHMA/38-196 AC G4VC00.1
#=GS A0A8C9J7H6_PANTA/63-206 AC A0A8C9J7H6.1
#=GS A0A081CIJ0_PSEA2/60-289 AC A0A081CIJ0.1
#=GS A0A7J9GAC7_9ROSI/198-385 AC A0A7J9GAC7.1
#=GS U3K0Q9_FICAL/1-142 AC U3K0Q9.2
#=GS E3M4B5_CAERE/47-248 AC E3M4B5.1
#=GS A0A316Z9I2_9BASI/71-253 AC A0A316Z9I2.1
#=GS A0A851K7U3_VIDCH/23-101 AC A0A851K7U3.1
#=GS A0A5C7HS70_9ROSI/147-331 AC A0A5C7HS70.1
#=GS A0A7L0L194_9SYLV/23-101 AC A0A7L0L194.1
#=GS A0A8C8DGH0_ONCTS/45-187 AC A0A8C8DGH0.1
#=GS B9SGS3_RICCO/110-275 AC B9SGS3.1
#=GS A0A0H1BII4_9EURO/33-303 AC A0A0H1BII4.1
#=GS A0A1V1SV13_9FUNG/30-312 AC A0A1V1SV13.1
#=GS A0A074WJS9_9PEZI/30-259 AC A0A074WJS9.1
#=GS A0A067NVT8_PLEOS/2-114 AC A0A067NVT8.1
#=GS A0A8H4FFX5_COLGL/30-283 AC A0A8H4FFX5.1
#=GS A0A7K9YIF0_9GALL/52-195 AC A0A7K9YIF0.1
#=GS A0A8C4RWI8_ERPCA/32-176 AC A0A8C4RWI8.1
#=GS A0A7K5MNA6_CARCD/23-101 AC A0A7K5MNA6.1
#=GS A0A6A6ME80_HEVBR/50-231 AC A0A6A6ME80.1
#=GS A0A8J4MXM3_EUDMI/23-101 AC A0A8J4MXM3.1
#=GS A0A8H7URC5_9FUNG/43-215 AC A0A8H7URC5.1
#=GS A0A8I5Y634_RAT/63-206 AC A0A8I5Y634.1
#=GS A0A1L9SQW2_9EURO/33-288 AC A0A1L9SQW2.1
#=GS A0A8X7MM95_9BASI/69-291 AC A0A8X7MM95.1
#=GS A0A7K7RKK7_9PASS/23-101 AC A0A7K7RKK7.1
#=GS A0A0H2S3T4_9AGAM/34-217 AC A0A0H2S3T4.1
#=GS A0A3B6KMN2_WHEAT/128-316 AC A0A3B6KMN2.1
#=GS A0A5N7BKI8_9EURO/33-279 AC A0A5N7BKI8.1
#=GS A5DAX2_PICGU/97-273 AC A5DAX2.2
#=GS A0A1A8U2J1_NOTFU/46-188 AC A0A1A8U2J1.1
#=GS A0A8W8II50_CRAGI/16-187 AC A0A8W8II50.1
#=GS A0A6A3WR86_9STRA/49-210 AC A0A6A3WR86.1
#=GS A0A7K8HGV6_9CORV/23-101 AC A0A7K8HGV6.1
#=GS A0A8H6FV72_9LECA/30-252 AC A0A8H6FV72.1
#=GS M5XCS4_PRUPE/108-292 AC M5XCS4.1
#=GS A0A8C9NJZ8_SERCA/31-173 AC A0A8C9NJZ8.1
#=GS A0A395HYK6_ASPHC/33-319 AC A0A395HYK6.1
#=GS H2Q7J9_PANTR/63-206 AC H2Q7J9.1
#=GS T0KPK6_COLGC/30-283 AC T0KPK6.1
#=GS A0A7K9U5E3_9AVES/22-100 AC A0A7K9U5E3.1
#=GS A0A6J5WM71_PRUAR/108-292 AC A0A6J5WM71.1
#=GS A0A8H3FWQ5_9LECA/68-278 AC A0A8H3FWQ5.1
#=GS A0A852NQ88_9PASS/23-101 AC A0A852NQ88.1
#=GS A0A8B9E6V6_ANSCY/54-197 AC A0A8B9E6V6.1
#=GS A0A8H6T536_9AGAR/41-197 AC A0A8H6T536.1
#=GS A0A4Y9YFK0_9AGAM/84-261 AC A0A4Y9YFK0.1
#=GS A0A5M3MJ87_CONPW/34-215 AC A0A5M3MJ87.1
#=GS A0A1S3HDT9_LINUN/44-192 AC A0A1S3HDT9.1
#=GS T5A3Y4_OPHSC/30-274 AC T5A3Y4.1
#=GS A0A7M4E1A5_CROPO/49-192 AC A0A7M4E1A5.1
#=GS A0A0R0GT44_SOYBN/109-282 AC A0A0R0GT44.1
#=GS A0A2G5BGE5_COERN/1-164 AC A0A2G5BGE5.1
#=GS A0A7L1HTL2_9CHAR/23-101 AC A0A7L1HTL2.1
#=GS H2MGB4_ORYLA/46-188 AC H2MGB4.2
#=GS B0W034_CULQU/24-115 AC B0W034.1
#=GS A0A8J5QLL9_9ASCO/116-298 AC A0A8J5QLL9.1
#=GS A0A0E9NFH2_SAICN/39-214 AC A0A0E9NFH2.1
#=GS A0A0F8AYH7_CERFI/30-280 AC A0A0F8AYH7.1
#=GS A0A7K9AIM0_DRONO/24-102 AC A0A7K9AIM0.1
#=GS MED4_CAEEL/47-247 AC Q23523.2
#=GS A0A7K5PA33_9CORV/23-101 AC A0A7K5PA33.1
#=GS G7LC42_MEDTR/118-294 AC G7LC42.1
#=GS A0A851FGA0_PITSO/23-101 AC A0A851FGA0.1
#=GS H1V0P3_COLHI/3-103 AC H1V0P3.1
#=GS A0A2Y9DLY5_TRIMA/63-206 AC A0A2Y9DLY5.1
#=GS A0A445HC60_GLYSO/109-282 AC A0A445HC60.1
#=GS A0A8D2AP75_SCIVU/63-206 AC A0A8D2AP75.1
#=GS A0A3M7NUT2_9EURO/36-112 AC A0A3M7NUT2.1
#=GS A0A1R3HSU4_9ROSI/50-231 AC A0A1R3HSU4.1
#=GS A0A2I0RJF2_9PEZI/30-275 AC A0A2I0RJF2.1
#=GS A0A836D264_SHEEP/63-206 AC A0A836D264.1
#=GS MED4_RAT/63-206 AC Q561Q8.1
#=GS A0A3P7E2P7_WUCBA/40-157 AC A0A3P7E2P7.1
#=GS A0A4Q9PTC7_9APHY/83-247 AC A0A4Q9PTC7.1
#=GS A0A6J1UV48_9SAUR/49-192 AC A0A6J1UV48.1
#=GS V2XEX7_MONRO/49-214 AC V2XEX7.1
#=GS A0A7I3ZKE5_PHYPA/25-197 AC A0A7I3ZKE5.1
#=GS A0A1S2YSU7_CICAR/117-289 AC A0A1S2YSU7.1
#=GS A0A662YI38_9STRA/138-323 AC A0A662YI38.1
#=GS A0A7L1Q7N4_9PASS/23-101 AC A0A7L1Q7N4.1
#=GS A0A5B6UJ41_9ROSI/198-385 AC A0A5B6UJ41.1
#=GS A0A3Q7U561_VULVU/63-206 AC A0A3Q7U561.1
#=GS S8DJY2_9LAMI/127-291 AC S8DJY2.1
#=GS A0A2H1A115_CANAR/109-298 AC A0A2H1A115.1
#=GS A0A401H5D0_9APHY/50-230 AC A0A401H5D0.1
#=GS A0A7K4V4J3_9EMBE/23-101 AC A0A7K4V4J3.1
#=GS W9Z0F3_9EURO/33-270 AC W9Z0F3.1
#=GS A0A2G2ZFG0_CAPAN/213-377 AC A0A2G2ZFG0.1
#=GS A0A8H5JSU6_9HYPO/30-331 AC A0A8H5JSU6.1
#=GS A0A1R2CFB5_9CILI/34-178 AC A0A1R2CFB5.1
#=GS A0A7D9NJS9_XENTR/60-202 AC A0A7D9NJS9.2
#=GS A0A1B9GBZ1_9TREE/62-231 AC A0A1B9GBZ1.1
#=GS A0A1L9WPN9_ASPA1/33-321 AC A0A1L9WPN9.1
#=GS A0A814EFL5_9BILA/53-243 AC A0A814EFL5.1
#=GS A0A7L4ISF1_9PASS/23-101 AC A0A7L4ISF1.1
#=GS A0A7K8FVN3_9CORV/23-101 AC A0A7K8FVN3.1
#=GS A0A852II92_9PICI/23-101 AC A0A852II92.1
#=GS S0DNH8_GIBF5/30-332 AC S0DNH8.1
#=GS A0A086SXK8_ACRC1/30-317 AC A0A086SXK8.1
#=GS A0A2P5I3I6_9PEZI/30-301 AC A0A2P5I3I6.1
#=GS A0A2K5CYL3_AOTNA/63-206 AC A0A2K5CYL3.1
#=GS A0A7K6YZ67_ALCTO/23-101 AC A0A7K6YZ67.1
#=GS A0A1Y1WVY3_9FUNG/45-221 AC A0A1Y1WVY3.1
#=GS A0A6F9AZ09_9TELE/2-126 AC A0A6F9AZ09.1
#=GS A0A8C5TPM4_9PASS/1-142 AC A0A8C5TPM4.1
#=GS A0A1U8FYI3_CAPAN/123-292 AC A0A1U8FYI3.1
#=GS A0A5N6RN09_9ROSI/120-299 AC A0A5N6RN09.1
#=GS A0A5A7RJB3_STRAF/43-231 AC A0A5A7RJB3.1
#=GS A0A1Y2B1T7_9TREE/54-227 AC A0A1Y2B1T7.1
#=GS B0XGK5_CULQU/76-191 AC B0XGK5.1
#=GS A0A7K7E7V8_9SYLV/23-101 AC A0A7K7E7V8.1
#=GS A0A8J2K6P1_9HEXA/30-194 AC A0A8J2K6P1.1
#=GS A0A1U7LTB8_NEOID/38-181 AC A0A1U7LTB8.1
#=GS A0A6P7XLY4_9AMPH/46-188 AC A0A6P7XLY4.1
#=GS A0A068VF01_COFCA/80-255 AC A0A068VF01.1
#=GS A5DYN7_LODEL/103-290 AC A5DYN7.1
#=GS A0A315AP18_PRUYE/108-292 AC A0A315AP18.1
#=GS A0A852B2N4_9CORV/23-101 AC A0A852B2N4.1
#=GS A0A8E2EJH3_9PEZI/30-258 AC A0A8E2EJH3.1
#=GS A0A8C6HQG1_MUSSI/61-204 AC A0A8C6HQG1.1
#=GS A0A2A2JUG2_9BILA/1-154 AC A0A2A2JUG2.1
#=GS A0A420HTD8_9PEZI/30-287 AC A0A420HTD8.1
#=GS A0A7K7YJ67_THRLU/23-101 AC A0A7K7YJ67.1
#=GS G0RBP6_HYPJQ/30-283 AC G0RBP6.1
#=GS A0A8C6SCD4_9GOBI/46-183 AC A0A8C6SCD4.1
#=GS A0A8H5LXK4_9AGAR/59-224 AC A0A8H5LXK4.1
#=GS A0A8B7Y4R1_ACAPL/52-199 AC A0A8B7Y4R1.1
#=GS A0A319ENF7_ASPSB/33-282 AC A0A319ENF7.1
#=GS A0A4Y7TFW1_9AGAR/35-211 AC A0A4Y7TFW1.1
#=GS A0A8B8AB28_CRAVI/43-214 AC A0A8B8AB28.1
#=GS A0A2I4HLQ7_JUGRE/123-303 AC A0A2I4HLQ7.1
#=GS A0A4Q2DDI9_9AGAR/35-212 AC A0A4Q2DDI9.1
#=GS A0A1V9Y7Z7_9STRA/49-223 AC A0A1V9Y7Z7.1
#=GS A0A066XEJ7_COLSU/30-298 AC A0A066XEJ7.1
#=GS A0A811K1S2_9BILA/80-213 AC A0A811K1S2.1
#=GS A0A7E4WBV9_PANRE/46-240 AC A0A7E4WBV9.1
#=GS A0A6G1EBH2_9ORYZ/92-286 AC A0A6G1EBH2.1
#=GS A0A5C3M6E7_9AGAR/32-206 AC A0A5C3M6E7.1
#=GS A0A8B8KW43_ABRPR/116-288 AC A0A8B8KW43.1
#=GS A0A8R2H444_ACYPI/34-204 AC A0A8R2H444.1
#=GS A7TQ98_VANPO/72-281 AC A7TQ98.1
#=GS A8N9B6_COPC7/35-204 AC A8N9B6.2
#=GS E4US56_ARTGP/33-278 AC E4US56.1
#=GS A0A1Y3BQZ2_EURMA/19-197 AC A0A1Y3BQZ2.1
#=GS A0A2I0X870_9ASPA/129-311 AC A0A2I0X870.1
#=GS A0A8H5PX59_GIBSU/31-332 AC A0A8H5PX59.1
#=GS A0A0D2AF04_9PEZI/30-261 AC A0A0D2AF04.1
#=GS A0A1G4JJI1_9SACH/52-242 AC A0A1G4JJI1.1
#=GS A0A090L5X0_STRRB/50-174 AC A0A090L5X0.1
#=GS A0A444EAU9_ENSVE/129-311 AC A0A444EAU9.1
#=GS A0A5N5NY41_9PEZI/30-298 AC A0A5N5NY41.1
#=GS A0A8K0MGS9_9ROSA/125-307 AC A0A8K0MGS9.1
#=GS A0A850ZFF0_9PASS/23-101 AC A0A850ZFF0.1
#=GS A0A367XN20_9ASCO/107-287 AC A0A367XN20.1
#=GS A0A8C6DQN8_MOSMO/63-206 AC A0A8C6DQN8.1
#=GS A0A3L6QVF1_PANMI/125-315 AC A0A3L6QVF1.1
#=GS A0A8H3I547_9LECA/30-250 AC A0A8H3I547.1
#=GS A0A8H7QA75_9FUNG/49-227 AC A0A8H7QA75.1
#=GS A0A2P4YTT3_9STRA/46-225 AC A0A2P4YTT3.1
#=GS G0WGU6_NAUDC/106-323 AC G0WGU6.1
#=GS A0A4P1REU2_LUPAN/120-279 AC A0A4P1REU2.1
#=GS A0A672SLH2_SINGR/90-232 AC A0A672SLH2.1
#=GS E2LXE3_MONPE/1-101 AC E2LXE3.1
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