#=GF ID   Opacity
#=GF AC   PF02462.19
#=GF DE   Opacity family porin protein
#=GF AU   Bateman A;0000-0002-6982-4660
#=GF SE   Pfam-B_2356 (release 5.4)
#=GF GA   21.00 21.00;
#=GF TC   21.00 21.00;
#=GF NC   20.90 20.90;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 75585367 --cpu 4 -E 1000 HMM pfamseq
#=GF TP   Family
#=GF WK   Opacity_porins
#=GF CL   CL0193
#=GF RN   [1]
#=GF RM   3093085
#=GF RT   Opacity genes in Neisseria gonorrhoeae: control of phase and
#=GF RT   antigenic variation. 
#=GF RA   Stern A, Brown M, Nickel P, Meyer TF; 
#=GF RL   Cell 1986;47:61-71.
#=GF RN   [2]
#=GF RM   10036728
#=GF RT   The role of neisserial Opa proteins in interactions with host
#=GF RT   cells. 
#=GF RA   Dehio C, Gray-Owen SD, Meyer TF; 
#=GF RL   Trends Microbiol 1998;6:489-495.
#=GF DR   INTERPRO; IPR003394;
#=GF DR   SCOP; 1p4t; fa;
#=GF DR   SO; 0100021; polypeptide_conserved_region;
#=GF CC   Pathogenic Neisseria spp. possess a repertoire of phase-variable
#=GF CC   Opacity proteins that mediate various pathogen--host cell
#=GF CC   interactions [2]. These proteins are integral membrane proteins
#=GF CC   related to other porins.
#=GF SQ   89
#=GS A0A2M8RX90_9PAST/53-198   AC A0A2M8RX90.1
#=GS A0A0W0ZVH2_9GAMM/64-206   AC A0A0W0ZVH2.1
#=GS J5MM32_PASMD/56-193       AC J5MM32.1
#=GS Y1457_HAEIN/51-178        AC Q57201.1
#=GS A0A4R1KWK4_9PAST/54-183   AC A0A4R1KWK4.1
#=GS A6VML1_ACTSZ/55-191       AC A6VML1.1
#=GS A0A1M6HTY1_9BACT/465-592  AC A0A1M6HTY1.1
#=GS A0A3P2A1J2_9NEIS/73-194   AC A0A3P2A1J2.1
#=GS Y414_HAEIN/4-70           AC Q57392.1
#=GS A0A4R1G5E3_9PAST/55-177   AC A0A4R1G5E3.1
#=GS A6VMK9_ACTSZ/55-202       AC A6VMK9.1
#=GS A0A1E3W3H1_9HYPH/6-75     AC A0A1E3W3H1.1
#=GS Q9CM19_PASMU/53-186       AC Q9CM19.1
#=GS A0A4R2N8P7_9PAST/50-186   AC A0A4R2N8P7.1
#=GS A0A1T0CPN1_9GAMM/66-216   AC A0A1T0CPN1.1
#=GS A0A0H4IWD4_NEIG1/48-237   AC A0A0H4IWD4.1
#=GS F2BFZ3_9NEIS/95-231       AC F2BFZ3.1
#=GS A0A4R6V836_9PAST/53-181   AC A0A4R6V836.1
#=GS A0A5E7YXN8_9BACT/206-331  AC A0A5E7YXN8.1
#=GS D4DUM0_NEIEG/56-193       AC D4DUM0.1
#=GS I3D7W8_9PAST/49-177       AC I3D7W8.1
#=GS A0A2S5AJD9_9PAST/53-198   AC A0A2S5AJD9.1
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#=GS Q5F6N6_NEIG1/48-235       AC Q5F6N6.2
#=GS A0A254T7B0_9BURK/27-191   AC A0A254T7B0.1
#=GS A0A1T0A9E4_9GAMM/54-211   AC A0A1T0A9E4.1
#=GS A0A2M8RZT6_9PAST/53-189   AC A0A2M8RZT6.1
#=GS A0A1V3J3F9_9PAST/53-182   AC A0A1V3J3F9.1
#=GS A0A379C7D1_9PAST/65-197   AC A0A379C7D1.1
#=GS Q6MBH2_PARUW/9-138        AC Q6MBH2.1
#=GS A0A448TVK6_9PAST/82-216   AC A0A448TVK6.1
#=GS A0A1T0A111_9GAMM/54-175   AC A0A1T0A111.1
#=GS A0A0H4IV74_NEIG1/49-226   AC A0A0H4IV74.1
#=GS A0A376BM79_9NEIS/70-200   AC A0A376BM79.1
#=GS A0A378UH36_BERDE/53-189   AC A0A378UH36.1
#=GS A0A0H4J5B4_NEIG1/48-229   AC A0A0H4J5B4.1
#=GS A0A7C9FRR2_9BACT/60-217   AC A0A7C9FRR2.1
#=GS A0A4R2MU83_9PAST/63-146   AC A0A4R2MU83.1
#=GS G4CML1_9NEIS/61-185       AC G4CML1.1
#=GS A0A511N0Q1_DEIC1/316-436  AC A0A511N0Q1.1
#=GS A0A448TVJ3_9PAST/92-233   AC A0A448TVJ3.1
#=GS A0A7T1HZV3_9SYNE/61-213   AC A0A7T1HZV3.1
#=GS F9Q7Y0_9PAST/12-140       AC F9Q7Y0.1
#=GS A0A1N7FR51_9GAMM/58-199   AC A0A1N7FR51.1
#=GS G4CMU4_9NEIS/109-241      AC G4CMU4.1
#=GS A0A448TVL1_9PAST/79-210   AC A0A448TVL1.1
#=GS A0A0H4IV81_NEIG1/48-229   AC A0A0H4IV81.1
#=GS E7S101_9BURK/73-207       AC E7S101.1
#=GS A0A1B8PKF2_MORNO/57-210   AC A0A1B8PKF2.1
#=GS T1CZ43_9HELI/107-274      AC T1CZ43.1
#=GS OPA_HAEIN/1-121           AC P45088.1
#=GS V9H5L2_9NEIS/70-200       AC V9H5L2.1
#=GS A0A5Q3S951_9NEIS/53-186   AC A0A5Q3S951.1
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#=GS A0A066UJK8_9GAMM/57-200   AC A0A066UJK8.1
#=GS D5V8X9_MORCB/75-235       AC D5V8X9.1
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#=GS A0A448TUM2_9PAST/71-200   AC A0A448TUM2.1
#=GS D4DUL8_NEIEG/56-193       AC D4DUL8.1
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#=GS A0A379C7P6_9PAST/54-195   AC A0A379C7P6.1
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#=GS A0A1A7NNX4_9PAST/55-196   AC A0A1A7NNX4.1
#=GS A0A3S4ZAP6_9NEIS/55-192   AC A0A3S4ZAP6.1
#=GS A0A220S3J8_9NEIS/81-219   AC A0A220S3J8.1
#=GS A0A0H4IT81_NEIG1/49-235   AC A0A0H4IT81.1
#=GS D8IAQ7_BRAP9/324-459      AC D8IAQ7.1
#=GS Q5FAF4_NEIG1/48-227       AC Q5FAF4.2
#=GS A0A377HXS1_HAEPH/51-180   AC A0A377HXS1.1
#=GS A0A379C841_9PAST/51-189   AC A0A379C841.1
#=GS A0A448TVK8_9PAST/57-204   AC A0A448TVK8.1
#=GS A0A4R1G0I1_9PAST/50-181   AC A0A4R1G0I1.1
#=GS A0A7X0H3N7_9BACT/95-238   AC A0A7X0H3N7.1
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A0A2M8RX90_9PAST/53-198              ..........................................................................................................................VGYKFV...D..W.....R...L....A..L..D....Y.....T....H....Y....G...N.V.K.KSytdvde.....................lgdsisgSG.ELK..T.H.S.........................................................F...G...L..S..A..I....Y....D..I...S....L...D....T.....P......I..K..PY....V..G.....A.....R..L..Glnn...........................................................................lkwtEN...ST....E.......T.......T....S.....S....V.......K.......T....S...T...S.N.S...............ES.ST..K.F..G...Y....GVF.....A..GATY..E..F...A..P...N...WS....LN........GA.L........E....Y............N.......R......L............G...........K.............I........E............D...........V...........K...........F......N...........Q......Y....G.....A.....K..VGLRYEF.......................................
A0A0W0ZVH2_9GAMM/64-206              ..........................................................................................................................VGYQSN...T..I.....R...Y....E..L..Q....Y.....T....-....Y....L...Y.V.D.TNqysvny......................kkaldiDG.GTK..A.N.I.........................................................L...M...A..N..L..Y....Y....D..F..pE....V...L....T.....Q......I..S..PF....L..G.....V.....G..I..G..................................................................................YA...FM....H.......A.......T....L.....N....S.......T.......S....R...F...K.K.Ph............fnID.QN..S.F..A...Y....QGT.....A..GLTY..N..F...R..K...N...FA....VN........TA.Y........R....Y............T.......A......T............T...........D.............Ks......nW............G...........K...........N...........L......Q...........A......H....M.....G.....N..IGVIYRF.......................................
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