GenomeNet

Database: Pfam
Entry: P22_portal
LinkDB: P22_portal
Original site: P22_portal 
#=GF ID   P22_portal
#=GF AC   PF16510.9
#=GF DE   Phage P22-like portal protein
#=GF AU   Coggill P;0000-0001-5731-1588
#=GF SE   pdb_1vt0
#=GF GA   26.10 26.10;
#=GF TC   26.30 26.30;
#=GF NC   25.10 25.80;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch --cpu 4 -Z 75585367 -E 1000 HMM pfamseq
#=GF TP   Family
#=GF RN   [1]
#=GF RM   21499245
#=GF RT   Three-dimensional structure of a viral genome-delivery portal
#=GF RT   vertex.
#=GF RA   Olia AS, Prevelige PE Jr, Johnson JE, Cingolani G;
#=GF RL   Nat Struct Mol Biol. 2011;18:597-603.
#=GF DR   INTERPRO; IPR032427;
#=GF DR   SO; 0100021; polypeptide_conserved_region;
#=GF CC   The portal protein of P22 and similar Podoviridae tail phages is
#=GF CC   a dodecameric structure consisting of a hip (2), a leg(1) and a
#=GF CC   barrel(3).  DNA viruses such as bacteriophages and herpesviruses
#=GF CC   deliver their genome into and out of the capsid through large
#=GF CC   proteinaceous assemblies, known as portal proteins. Domains 1
#=GF CC   and 3 are mostly helical and form the majority of the
#=GF CC   DNA-translocating channel. Domain 2 adopts an alpha-beta-fold
#=GF CC   characterised by two sheets of eight beta-strands, which cross
#=GF CC   each other to form a beta-barrel-like structure [1].
#=GF SQ   159
#=GS A0A1Y0ERE3_9BURK/445-723  AC A0A1Y0ERE3.1
#=GS B1M1Q7_METRJ/32-385       AC B1M1Q7.1
#=GS A1HR50_9FIRM/17-237       AC A1HR50.1
#=GS A0A345PAV3_9GAMM/42-476   AC A0A345PAV3.1
#=GS A0A7G5B886_9CAUD/58-703   AC A0A7G5B886.1
#=GS A0A0H2UYC2_SHIFL/13-679   AC A0A0H2UYC2.1
#=GS A0A328AN73_9CAUL/13-629   AC A0A328AN73.1
#=GS A0A7W6RE80_9PROT/37-192   AC A0A7W6RE80.1
#=GS V2U953_9GAMM/21-664       AC V2U953.1
#=GS A9MNM4_SALAR/14-681       AC A9MNM4.1
#=GS A0A0S9MUL5_9BURK/19-679   AC A0A0S9MUL5.1
#=GS A0A327JYD2_9HYPH/25-324   AC A0A327JYD2.1
#=GS B9TAS7_RICCO/1-347        AC B9TAS7.1
#=GS A0A0Q8BFP6_9HYPH/12-502   AC A0A0Q8BFP6.1
#=GS A0A850P9X7_9PROT/8-577    AC A0A850P9X7.1
#=GS Q76H23_9CAUD/14-681       AC Q76H23.1
#=GS A0A7G5B981_9CAUD/59-704   AC A0A7G5B981.1
#=GS B8K1H7_9CAUD/14-681       AC B8K1H7.1
#=GS A0A4V1BX17_9GAMM/14-681   AC A0A4V1BX17.1
#=GS A0A437LZ95_9PROT/12-583   AC A0A437LZ95.1
#=GS A0A328TRB9_9GAMM/14-681   AC A0A328TRB9.1
#=GS A0A1S6XJ02_9HYPH/26-602   AC A0A1S6XJ02.1
#=GS A0A5Q2WB33_9CAUD/11-659   AC A0A5Q2WB33.1
#=GS I3PUX6_9CAUD/29-687       AC I3PUX6.1
#=GS A0A1R0FAB0_9HYPH/31-195   AC A0A1R0FAB0.1
#=GS A0A6F9EWF6_9CAUD/16-692   AC A0A6F9EWF6.1
#=GS A0A345P9A5_9GAMM/49-692   AC A0A345P9A5.1
#=GS A0A327JLM8_9HYPH/1-132    AC A0A327JLM8.1
#=GS A0A5C0CBW5_9CAUD/14-681   AC A0A5C0CBW5.1
#=GS A0A327JPK0_9HYPH/7-268    AC A0A327JPK0.1
#=GS I1TEI6_9CAUD/13-680       AC I1TEI6.1
#=GS C4K6U6_HAMD5/15-691       AC C4K6U6.1
#=GS W8EHI6_9CAUD/11-691       AC W8EHI6.1
#=GS A0A7L7SY56_9CAUD/16-695   AC A0A7L7SY56.1
#=GS A8HNY9_9CAUD/46-706       AC A8HNY9.1
#=GS A0A7G5B8V7_9CAUD/58-703   AC A0A7G5B8V7.1
#=GS A0A291LCE5_9CAUD/18-698   AC A0A291LCE5.1
#=GS B9UDK1_9CAUD/14-681       AC B9UDK1.1
#=GS A0A513ZX07_9CAUD/14-681   AC A0A513ZX07.1
#=GS Q716H2_BPSFV/15-693       AC Q716H2.1
#=GS A0A7D7JZ89_9CAUD/14-681   AC A0A7D7JZ89.1
#=GS B6SCV6_9CAUD/15-691       AC B6SCV6.1
#=GS A0A0F5JU01_9BURK/2-481    AC A0A0F5JU01.1
#=GS A0A327JSL6_9HYPH/25-324   AC A0A327JSL6.1
#=GS A0A0N7CFL0_BPP22/14-681   AC A0A0N7CFL0.1
#=GS A0A5C0CBZ0_9CAUD/14-681   AC A0A5C0CBZ0.1
#=GS A0A328TUL6_9GAMM/1-503    AC A0A328TUL6.1
#=GS A0A252BJ69_9PROT/18-508   AC A0A252BJ69.1
#=GS A0A2D1GLJ6_9CAUD/13-679   AC A0A2D1GLJ6.1
#=GS A0A7C9VFE3_9BRAD/42-723   AC A0A7C9VFE3.1
#=GS A0A023D6G2_ACIMT/19-512   AC A0A023D6G2.1
#=GS K0PTG5_9HYPH/16-657       AC K0PTG5.1
#=GS A0A7G5AYW9_9CAUD/1-65     AC A0A7G5AYW9.1
#=GS A0A5M8P6J6_9HYPH/45-209   AC A0A5M8P6J6.1
#=GS A0A0Q5YQ93_9HYPH/32-419   AC A0A0Q5YQ93.1
#=GS PORTL_BPAPS/15-691        AC Q9T1S9.1
#=GS A0A134CHQ1_9FIRM/9-236    AC A0A134CHQ1.1
#=GS U6C855_9CAUD/21-692       AC U6C855.1
#=GS A0A327JID8_9HYPH/5-110    AC A0A327JID8.1
#=GS E3I2Q6_RHOVT/30-650       AC E3I2Q6.1
#=GS A0A8E1C3H6_9SPHN/29-692   AC A0A8E1C3H6.1
#=GS A0A7U3VYG6_9CAUD/17-696   AC A0A7U3VYG6.1
#=GS D0J409_COMT2/224-502      AC D0J409.1
#=GS A0A0Q8BFP6_9HYPH/521-677  AC A0A0Q8BFP6.1
#=GS A0A4P7KW29_9GAMM/3-679    AC A0A4P7KW29.1
#=GS G5DA97_9CAUD/13-679       AC G5DA97.1
#=GS A0A192Y630_9CAUD/14-681   AC A0A192Y630.1
#=GS A0A5Q2WBN0_9CAUD/27-645   AC A0A5Q2WBN0.1
#=GS A0A7G5BA45_9CAUD/56-704   AC A0A7G5BA45.1
#=GS A0A239LSN7_9BURK/14-682   AC A0A239LSN7.1
#=GS Q6V7P2_9CAUD/430-695      AC Q6V7P2.1
#=GS A0A257J6V2_9PROT/13-552   AC A0A257J6V2.1
#=GS D0IZ05_COMT2/430-708      AC D0IZ05.1
#=GS I2B9R4_SHIBC/1-553        AC I2B9R4.1
#=GS A0A8J7GVV6_9ENTR/14-680   AC A0A8J7GVV6.1
#=GS E6WS65_PSEUU/38-645       AC E6WS65.1
#=GS A0A1U9JSG7_9HYPH/30-194   AC A0A1U9JSG7.1
#=GS A4JD29_BURVG/15-668       AC A4JD29.1
#=GS A0A011VME8_9HYPH/12-502   AC A0A011VME8.1
#=GS A0A4P8NFW7_9CAUD/38-714   AC A0A4P8NFW7.1
#=GS A0A0E3GMB1_9CAUD/31-684   AC A0A0E3GMB1.1
#=GS J7SJJ5_MORMO/14-681       AC J7SJJ5.1
#=GS A0A328TUY9_9GAMM/3-682    AC A0A328TUY9.1
#=GS F8TUN9_9CAUD/23-188       AC F8TUN9.1
#=GS A0A511B021_9PROT/35-229   AC A0A511B021.1
#=GS A0A7T2GKN3_9SPHN/30-713   AC A0A7T2GKN3.1
#=GS A0A5Q2EZY6_9CAUD/16-695   AC A0A5Q2EZY6.1
#=GS C8CLI5_9CAUD/18-643       AC C8CLI5.1
#=GS A0A1R3Y5N6_9CAUD/14-681   AC A0A1R3Y5N6.1
#=GS A0A5C0CC85_9CAUD/1-204    AC A0A5C0CC85.1
#=GS Q2G3Y5_NOVAD/32-678       AC Q2G3Y5.1
#=GS A0A0Q8QW75_9SPHN/12-664   AC A0A0Q8QW75.1
#=GS A0A511B123_9PROT/1-285    AC A0A511B123.1
#=GS A0A6F9EXW6_9CAUD/16-692   AC A0A6F9EXW6.1
#=GS A0A069PEW2_9BURK/19-697   AC A0A069PEW2.1
#=GS A0A6G8R5E6_9CAUD/12-672   AC A0A6G8R5E6.1
#=GS A0A3G3M838_9CAUD/15-693   AC A0A3G3M838.1
#=GS A0A6C0R185_9CAUD/18-698   AC A0A6C0R185.1
#=GS A0A5B8LI10_9SPHN/33-672   AC A0A5B8LI10.1
#=GS A0A192Y9V5_9CAUD/14-681   AC A0A192Y9V5.1
#=GS A1URF8_BARBK/31-613       AC A1URF8.1
#=GS A0A3G8F342_9CAUD/18-699   AC A0A3G8F342.1
#=GS A0A545TSX3_9PROT/31-672   AC A0A545TSX3.1
#=GS A0A7L8ZHS7_9CAUD/14-681   AC A0A7L8ZHS7.1
#=GS A0A0F5PE23_9SPHN/19-686   AC A0A0F5PE23.1
#=GS A0A7W6BPH2_9SPHN/21-180   AC A0A7W6BPH2.1
#=GS A0A1I2TNZ8_9HYPH/34-425   AC A0A1I2TNZ8.1
#=GS A0A0N7CFG3_BPP22/14-681   AC A0A0N7CFG3.1
#=GS A0A6B3UK93_9CAUL/13-633   AC A0A6B3UK93.1
#=GS A0A271KE88_9HYPH/20-669   AC A0A271KE88.1
#=GS I6R968_9CAUD/14-681       AC I6R968.1
#=GS A0A844H0I0_9RHOB/14-631   AC A0A844H0I0.1
#=GS A0A8J2VRE9_9RHOB/27-685   AC A0A8J2VRE9.1
#=GS A0A6G8IF13_9BURK/36-703   AC A0A6G8IF13.1
#=GS A0A328B6H2_9CAUL/15-625   AC A0A328B6H2.1
#=GS A0A7W6P272_9HYPH/16-681   AC A0A7W6P272.1
#=GS A0A191ZDD2_9CAUD/9-658    AC A0A191ZDD2.1
#=GS A0A088CQ69_9CAUD/16-695   AC A0A088CQ69.1
#=GS A0A6B9WWI1_9CAUD/18-699   AC A0A6B9WWI1.1
#=GS A0A506UM67_9PROT/22-516   AC A0A506UM67.1
#=GS A0A345PAQ8_9GAMM/45-689   AC A0A345PAQ8.1
#=GS A0A0M4RCZ3_9CAUD/14-681   AC A0A0M4RCZ3.1
#=GS A0A095TF03_9GAMM/14-680   AC A0A095TF03.1
#=GS A0A5C1ANL2_9BACT/37-690   AC A0A5C1ANL2.1
#=GS A0A4D6DZ66_9CAUD/18-699   AC A0A4D6DZ66.1
#=GS A0A0S2F7S8_LYSAN/13-621   AC A0A0S2F7S8.1
#=GS A0A4R5MFQ4_9BURK/59-610   AC A0A4R5MFQ4.1
#=GS A0A6H0X5R7_9CAUD/12-672   AC A0A6H0X5R7.1
#=GS A0A328B139_9CAUL/13-635   AC A0A328B139.1
#=GS A0A8E7L3H0_9CAUD/18-697   AC A0A8E7L3H0.1
#=GS Q9AYZ9_BPHK6/15-693       AC Q9AYZ9.1
#=GS Q8HAE3_BPST6/14-681       AC Q8HAE3.1
#=GS A0A098GEQ4_TATMI/34-692   AC A0A098GEQ4.1
#=GS A0A1I3S9W5_9HYPH/32-685   AC A0A1I3S9W5.1
#=GS I2B9R9_SHIBC/15-89        AC I2B9R9.1
#=GS E7C9T6_9CAUD/14-681       AC E7C9T6.1
#=GS A0A149Q823_9PROT/14-505   AC A0A149Q823.1
#=GS A0A384ZRR8_9CAUD/38-723   AC A0A384ZRR8.1
#=GS A0A085FST3_9HYPH/50-685   AC A0A085FST3.1
#=GS A0A5C0CCJ7_9CAUD/14-681   AC A0A5C0CCJ7.1
#=GS A0A501X0D3_9RHOB/56-695   AC A0A501X0D3.1
#=GS PORTL_BPP22/14-681        AC P26744.2
#=GS A0A3N5CND2_9SPHN/32-688   AC A0A3N5CND2.1
#=GS Q2A0C0_9CAUD/15-692       AC Q2A0C0.1
#=GS A0A0R0CH29_9GAMM/16-658   AC A0A0R0CH29.1
#=GS A0A2Z3HP59_9CAUL/24-559   AC A0A2Z3HP59.1
#=GS A0A5B9N910_9CAUD/10-696   AC A0A5B9N910.1
#=GS A5VW74_9CAUD/16-695       AC A5VW74.1
#=GS A0A7G5B9V8_9CAUD/19-690   AC A0A7G5B9V8.1
#=GS A0A5M6ICT8_9PROT/39-208   AC A0A5M6ICT8.1
#=GS A0A2H4FNE2_9CAUD/14-681   AC A0A2H4FNE2.1
#=GS A0A7L8G4H2_9VIRU/53-675   AC A0A7L8G4H2.1
#=GS F8TUN9_9CAUD/272-666      AC F8TUN9.1
#=GS A0A367ZVX9_9HYPH/36-198   AC A0A367ZVX9.1
#=GS J6LDK3_9RHOB/25-661       AC J6LDK3.1
#=GS T1IEM9_RHOPR/190-855      AC T1IEM9.1
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#=GS A0A3G8F2Z2_9CAUD/32-726   AC A0A3G8F2Z2.1
#=GS A0A4V1BWK8_9GAMM/14-681   AC A0A4V1BWK8.1
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