#=GF ID RITA
#=GF AC PF17066.9
#=GF DE RBPJ-interacting and tubulin associated protein
#=GF AU Llagostera M;0000-0001-8177-8321
#=GF AU Mitchell A;0000-0001-8655-7966
#=GF AU Finn RD;0000-0001-8626-2148
#=GF SE Manual
#=GF GA 29.00 29.00;
#=GF TC 31.90 30.60;
#=GF NC 28.40 28.40;
#=GF BM hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM hmmsearch --cpu 4 -E 1000 -Z 75585367 HMM pfamseq
#=GF TP Family
#=GF RN [1]
#=GF RM 21102556
#=GF RT RITA, a novel modulator of Notch signalling, acts via nuclear
#=GF RT export of RBP-J.
#=GF RA Wacker SA, Alvarado C, von Wichert G, Knippschild U, Wiedenmann
#=GF RA J, Clauss K, Nienhaus GU, Hameister H, Baumann B, Borggrefe T,
#=GF RA Knochel W, Oswald F;
#=GF RL EMBO J. 2011;30:43-56.
#=GF DR INTERPRO; IPR031418;
#=GF DR SO; 0100021; polypeptide_conserved_region;
#=GF CC RITA is a highly conserved protein that binds to tubulin and
#=GF CC shuttles between the cytoplasm and nucleus. It is responsible
#=GF CC for export of RBP-J/CBF-1 from the nucleus, which modulates
#=GF CC Notch-mediated transcription [1].
#=GF SQ 497
#=GS A0A7K9J097_9CORV/1-182 AC A0A7K9J097.1
#=GS A0A851K6E3_VIDCH/2-59 AC A0A851K6E3.1
#=GS A0A2U3WN13_ODORO/5-272 AC A0A2U3WN13.1
#=GS A0A7F8QCW2_LEPWE/17-187 AC A0A7F8QCW2.1
#=GS A0A7K8Z6U6_9PASS/1-181 AC A0A7K8Z6U6.1
#=GS RITA1_XENLA/9-210 AC P0CJ62.1
#=GS A0A7L1SYN6_ARAGA/1-176 AC A0A7L1SYN6.1
#=GS A0A6J3EP22_SAPAP/26-293 AC A0A6J3EP22.1
#=GS A0A4X2K1V5_VOMUR/22-291 AC A0A4X2K1V5.1
#=GS A0A7L3MNM5_9PASS/2-59 AC A0A7L3MNM5.1
#=GS A0A8B9J1C7_9PSIT/50-229 AC A0A8B9J1C7.1
#=GS A0A7K9W471_9PASS/9-204 AC A0A7K9W471.1
#=GS A0A7K6IDN5_9PASS/2-57 AC A0A7K6IDN5.1
#=GS A0A7L1L9D2_HIMHI/59-241 AC A0A7L1L9D2.1
#=GS A0A7E6CUH4_9CHIR/26-291 AC A0A7E6CUH4.1
#=GS A0A7L0PBG4_9AVES/43-243 AC A0A7L0PBG4.1
#=GS A0A7K7IXD9_LOXCU/4-202 AC A0A7K7IXD9.1
#=GS A0A2R8MP54_CALJA/26-292 AC A0A2R8MP54.1
#=GS A0A7J8BZG5_MOLMO/2-268 AC A0A7J8BZG5.1
#=GS A0A8I3PGU5_CANLF/5-272 AC A0A8I3PGU5.1
#=GS A0A5E4A3E1_MARMO/8-196 AC A0A5E4A3E1.1
#=GS A0A7J7FMJ0_DICBM/5-84 AC A0A7J7FMJ0.1
#=GS A0A7L2U918_BALRX/13-196 AC A0A7L2U918.1
#=GS A0A7K5RLV5_LANLU/1-175 AC A0A7K5RLV5.1
#=GS A0A7K9PVQ2_9CORV/1-178 AC A0A7K9PVQ2.1
#=GS D3Z228_MOUSE/1-96 AC D3Z228.1
#=GS A0A8B8Z9T6_BALMU/26-293 AC A0A8B8Z9T6.1
#=GS A0A2K5L349_CERAT/26-293 AC A0A2K5L349.1
#=GS A0A8C5LS13_9ANUR/1-210 AC A0A8C5LS13.1
#=GS A0A7K9EK89_BARMA/1-181 AC A0A7K9EK89.1
#=GS A0A667GPB7_LYNCA/26-293 AC A0A667GPB7.1
#=GS A0A8C9ME50_PANTA/2-269 AC A0A8C9ME50.1
#=GS A0A7K4KNT9_9AVES/1-180 AC A0A7K4KNT9.1
#=GS A0A7L3KCR4_9PASS/1-178 AC A0A7L3KCR4.1
#=GS A0A7K4QBW2_MELMO/43-230 AC A0A7K4QBW2.1
#=GS RITA1_RAT/1-258 AC Q2KJ10.1
#=GS A0A7K9VBR6_ANSSE/1-181 AC A0A7K9VBR6.1
#=GS A0A8B8DX24_CRAVI/62-250 AC A0A8B8DX24.1
#=GS A0A8J6KFJ9_ELECQ/1-194 AC A0A8J6KFJ9.1
#=GS A0A7K9U3F9_9AVES/1-174 AC A0A7K9U3F9.1
#=GS A0A7K5FFV4_PROAR/6-55 AC A0A7K5FFV4.1
#=GS A0A5E4A3Y7_MARMO/2-103 AC A0A5E4A3Y7.1
#=GS A0A7K6W1M8_STECA/1-171 AC A0A7K6W1M8.1
#=GS A0A7K9KW30_9PASS/48-235 AC A0A7K9KW30.1
#=GS A0A8C4LMF4_EQUAS/35-298 AC A0A8C4LMF4.1
#=GS A0A6J3PSC4_TURTR/5-272 AC A0A6J3PSC4.1
#=GS A0A8C0BNF5_9AVES/58-246 AC A0A8C0BNF5.1
#=GS A0A7L2RWS3_9PASS/1-181 AC A0A7L2RWS3.1
#=GS A0A7L2HEN6_SAGSE/22-231 AC A0A7L2HEN6.1
#=GS A0A8C9BUS3_PHOSS/26-293 AC A0A8C9BUS3.1
#=GS A0A7K4Z063_BUCAB/17-212 AC A0A7K4Z063.1
#=GS A0A7M4EHL1_CROPO/61-254 AC A0A7M4EHL1.1
#=GS L8I2P4_9CETA/2-269 AC L8I2P4.1
#=GS A0A851Z183_9AVES/25-217 AC A0A851Z183.1
#=GS A0A1S3A3S8_ERIEU/2-258 AC A0A1S3A3S8.1
#=GS A0A6P5D6S5_BOSIN/26-293 AC A0A6P5D6S5.1
#=GS A0A7L4AED8_9AVES/1-54 AC A0A7L4AED8.1
#=GS F7GKN3_MONDO/2-255 AC F7GKN3.2
#=GS A0A852DRI0_PASAF/2-59 AC A0A852DRI0.1
#=GS A0A852KFV9_UROIN/2-55 AC A0A852KFV9.1
#=GS G3I6U2_CRIGR/1-258 AC G3I6U2.1
#=GS A0A4W3HSZ6_CALMI/1-288 AC A0A4W3HSZ6.1
#=GS A0A7K7ZV35_9PASE/1-178 AC A0A7K7ZV35.1
#=GS A0A2K5C5X2_AOTNA/2-62 AC A0A2K5C5X2.1
#=GS A0A8D2FN94_THEGE/26-293 AC A0A8D2FN94.1
#=GS A0A5G2QRW1_PIG/26-293 AC A0A5G2QRW1.1
#=GS A0A7L1MLE8_BOMGA/2-250 AC A0A7L1MLE8.1
#=GS A0A7K5N7Q7_CHRMC/45-242 AC A0A7K5N7Q7.1
#=GS A0A7L4BHV4_9CHAR/1-182 AC A0A7L4BHV4.1
#=GS A0A7K8QLZ0_9PASS/44-236 AC A0A7K8QLZ0.1
#=GS A0A8C9BVP4_PHOSS/5-272 AC A0A8C9BVP4.1
#=GS F6R4Q7_CIOIN/11-314 AC F6R4Q7.2
#=GS A0A8C5KK19_JACJA/1-259 AC A0A8C5KK19.1
#=GS A0A4W2E5V4_BOBOX/26-293 AC A0A4W2E5V4.1
#=GS A0A851CCR4_CALVR/1-179 AC A0A851CCR4.1
#=GS A0A8I5TGZ7_PONAB/25-292 AC A0A8I5TGZ7.1
#=GS A0A8B9XXJ7_BOSMU/26-293 AC A0A8B9XXJ7.1
#=GS A0A7L4GAB3_9COLU/1-181 AC A0A7L4GAB3.1
#=GS A0A7L1BKB4_9PASS/1-177 AC A0A7L1BKB4.1
#=GS A0A7K5QLU5_9PASE/18-233 AC A0A7K5QLU5.1
#=GS A0A8B9S930_APTOW/16-295 AC A0A8B9S930.1
#=GS A0A7K8TTB0_OCEOC/53-236 AC A0A7K8TTB0.1
#=GS A0A803VIT4_FICAL/8-184 AC A0A803VIT4.1
#=GS A0A6P9APL5_PANGU/15-177 AC A0A6P9APL5.1
#=GS A0A8B9RU41_9AVES/68-267 AC A0A8B9RU41.1
#=GS A0A8C8XQ18_PANLE/26-293 AC A0A8C8XQ18.1
#=GS A0A7L0SPK9_PODPO/1-48 AC A0A7L0SPK9.1
#=GS A0A7J7QTF1_PIPKU/2-268 AC A0A7J7QTF1.1
#=GS A0A2Y9ELS6_PHYMC/5-272 AC A0A2Y9ELS6.1
#=GS A0A6J2MWU2_9CHIR/5-270 AC A0A6J2MWU2.1
#=GS A0A7L1AMN8_GYMTI/1-178 AC A0A7L1AMN8.1
#=GS A0A8C3KSK7_9CHAR/95-289 AC A0A8C3KSK7.1
#=GS A0A7K4SA56_COLPI/1-181 AC A0A7K4SA56.1
#=GS A0A0D9S427_CHLSB/26-293 AC A0A0D9S427.1
#=GS A0A7L1EY01_SYLBO/1-177 AC A0A7L1EY01.1
#=GS I3M3K9_ICTTR/2-265 AC I3M3K9.1
#=GS A0A673VDR4_SURSU/26-292 AC A0A673VDR4.1
#=GS A0A340Y5W6_LIPVE/5-272 AC A0A340Y5W6.1
#=GS A0A7K6CGD0_PTIVI/1-178 AC A0A7K6CGD0.1
#=GS A0A852E2N6_VIDMA/4-210 AC A0A852E2N6.1
#=GS A0A7L2R3F5_9PASS/1-178 AC A0A7L2R3F5.1
#=GS A0A851BUC0_PICGY/1-178 AC A0A851BUC0.1
#=GS A0A5J5N4I6_MUNRE/2-173 AC A0A5J5N4I6.1
#=GS A0A2R9A207_PANPA/26-293 AC A0A2R9A207.1
#=GS A0A2K6U434_SAIBB/26-293 AC A0A2K6U434.1
#=GS A0A7L3LHZ8_9CHAR/48-222 AC A0A7L3LHZ8.1
#=GS A0A7L3H2C7_9PASS/2-57 AC A0A7L3H2C7.1
#=GS A0A484GJQ1_SOUCH/5-272 AC A0A484GJQ1.1
#=GS H3AMQ4_LATCH/1-291 AC H3AMQ4.1
#=GS A0A2F0BM70_ESCRO/1-213 AC A0A2F0BM70.1
#=GS A0A2Y9LCQ9_DELLE/5-272 AC A0A2Y9LCQ9.1
#=GS A0A672UVT3_STRHB/9-58 AC A0A672UVT3.1
#=GS A0A8C5RKK3_LATLA/2-250 AC A0A8C5RKK3.1
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#=GS A0A384BYB1_URSMA/5-272 AC A0A384BYB1.1
#=GS A0A7L4LIM7_9CORV/2-196 AC A0A7L4LIM7.1
#=GS A0A8J5ZMR3_GALPY/135-201 AC A0A8J5ZMR3.1
#=GS A0A7L3A6I2_9PASE/1-178 AC A0A7L3A6I2.1
#=GS A0A7L3SBX0_RISTR/1-56 AC A0A7L3SBX0.1
#=GS A0A6J2G461_9PASS/61-258 AC A0A6J2G461.2
#=GS A0A7M7N3F1_STRPU/16-204 AC A0A7M7N3F1.1
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#=GS A0A7L0XI08_TYRSA/1-181 AC A0A7L0XI08.1
#=GS A0A7L3PQN8_9DEND/1-49 AC A0A7L3PQN8.1
#=GS A0A6G1A8K0_CROCR/26-295 AC A0A6G1A8K0.1
#=GS RITA1_HUMAN/2-269 AC Q96K30.1
#=GS A0A7K8NYN3_COCCO/1-179 AC A0A7K8NYN3.1
#=GS A0A7K8RQQ0_9PASS/9-205 AC A0A7K8RQQ0.1
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#=GS A0A7L2QFU9_9PASS/1-178 AC A0A7L2QFU9.1
#=GS A0A6A1Q3Y0_BALPH/33-273 AC A0A6A1Q3Y0.1
#=GS A0A8J4L4Z1_EUDCH/1-181 AC A0A8J4L4Z1.1
#=GS A0A7L3LHZ8_9CHAR/2-49 AC A0A7L3LHZ8.1
#=GS A0A670ZVS7_PSETE/2-251 AC A0A670ZVS7.1
#=GS A0A7K6FQI2_9CORV/40-233 AC A0A7K6FQI2.1
#=GS A0A851XB65_EOLRO/1-166 AC A0A851XB65.1
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#=GS A0A2K5ZIB5_MANLE/26-293 AC A0A2K5ZIB5.1
#=GS G3R4H5_GORGO/26-293 AC G3R4H5.2
#=GS A0A851J2D9_9PASS/1-178 AC A0A851J2D9.1
#=GS A0A851K6E3_VIDCH/43-235 AC A0A851K6E3.1
#=GS A0A8D0EHK1_STROC/10-262 AC A0A8D0EHK1.1
#=GS A0A8C8YD50_PROSS/26-293 AC A0A8C8YD50.1
#=GS A0A6P3GJM1_BISBI/20-287 AC A0A6P3GJM1.1
#=GS A0A663EIW2_AQUCH/17-70 AC A0A663EIW2.1
#=GS A0A6J8APM1_MYTCO/16-158 AC A0A6J8APM1.1
#=GS A0A3L8Q5P3_CHLGU/25-202 AC A0A3L8Q5P3.1
#=GS A0A852DRI0_PASAF/43-197 AC A0A852DRI0.1
#=GS A0A7J7S2P0_MYOMY/2-257 AC A0A7J7S2P0.1
#=GS H0VUL1_CAVPO/2-270 AC H0VUL1.1
#=GS A0A852C0Y8_9PICI/43-233 AC A0A852C0Y8.1
#=GS A0A7K6SR84_CALNI/46-241 AC A0A7K6SR84.1
#=GS A0A852I2T6_9PASS/2-58 AC A0A852I2T6.1
#=GS A0A7K8ZEC2_9PASS/9-207 AC A0A7K8ZEC2.1
#=GS A0A8C4TXE6_FALTI/123-315 AC A0A8C4TXE6.1
#=GS B3S297_TRIAD/5-161 AC B3S297.1
#=GS A0A485PQQ0_LYNPA/5-104 AC A0A485PQQ0.1
#=GS A0A7K9KW30_9PASS/1-59 AC A0A7K9KW30.1
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#=GS A0A6J3PSY4_TURTR/26-131 AC A0A6J3PSY4.1
#=GS A0A1S3HLD6_LINUN/27-200 AC A0A1S3HLD6.1
#=GS A0A1A6G0A1_NEOLE/29-276 AC A0A1A6G0A1.1
#=GS G1U3W2_RABIT/23-282 AC G1U3W2.3
#=GS H0WPF5_OTOGA/2-269 AC H0WPF5.1
#=GS A0A7L2LM18_9SYLV/1-178 AC A0A7L2LM18.1
#=GS A0A7K6Z8K1_ALCTO/1-181 AC A0A7K6Z8K1.1
#=GS A0A7J7QTH0_PIPKU/2-105 AC A0A7J7QTH0.1
#=GS A0A7L0DBX5_9CHAR/43-239 AC A0A7L0DBX5.1
#=GS A0A8C2YUA1_CHILA/37-304 AC A0A8C2YUA1.1
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#=GS A0A7K9B442_DRONO/1-61 AC A0A7K9B442.1
#=GS A0A212DB31_CEREH/88-250 AC A0A212DB31.1
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#=GS A0A287BD58_PIG/5-272 AC A0A287BD58.2
#=GS A0A8B6ZMY8_ORYAF/21-284 AC A0A8B6ZMY8.1
#=GS A0A8C6AA34_MARMA/2-265 AC A0A8C6AA34.1
#=GS A0A7K5EP26_POLCE/1-177 AC A0A7K5EP26.1
#=GS A0A8D2N5Q4_ZONAL/12-264 AC A0A8D2N5Q4.1
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#=GS A0A3M6TMT7_POCDA/1-80 AC A0A3M6TMT7.1
#=GS A0A6P3F0G7_OCTDE/37-299 AC A0A6P3F0G7.1
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#=GS A0A8B9J1C7_9PSIT/3-63 AC A0A8B9J1C7.1
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#=GS A7RSW9_NEMVE/2-114 AC A7RSW9.1
#=GS A0A8C6Z170_NOTPE/69-308 AC A0A8C6Z170.1
#=GS A0A8U8BUQ9_GEOPR/11-254 AC A0A8U8BUQ9.1
#=GS G7N5P8_MACMU/2-269 AC G7N5P8.1
#=GS A0A7K6H587_9PASS/2-59 AC A0A7K6H587.1
#=GS A0A8C6YIW3_NAJNA/3-246 AC A0A8C6YIW3.1
#=GS F6Y0D0_MOUSE/1-91 AC F6Y0D0.1
#=GS A0A7K8IUS7_9PASS/4-59 AC A0A7K8IUS7.1
#=GS A0A7L3J650_THACH/1-181 AC A0A7L3J650.1
#=GS A0A8C6ID47_MUSSI/1-253 AC A0A8C6ID47.1
#=GS A0A7K6J637_9CORV/1-178 AC A0A7K6J637.1
#=GS G1QH09_NOMLE/26-198 AC G1QH09.3
#=GS G5AKW5_HETGA/2-269 AC G5AKW5.1
#=GS A0A6P8S1A5_GEOSA/1-246 AC A0A6P8S1A5.1
#=GS A0A7J7QSR8_PIPKU/2-268 AC A0A7J7QSR8.1
#=GS A0A7L4I7S3_SCOUM/29-212 AC A0A7L4I7S3.1
#=GS A0A7K4KZK7_9AVES/1-180 AC A0A7K4KZK7.1
#=GS A0A2K5S5Z2_CEBIM/2-269 AC A0A2K5S5Z2.1
#=GS A0A210Q8Z0_MIZYE/18-176 AC A0A210Q8Z0.1
#=GS A0A7L4H5E2_PODST/44-215 AC A0A7L4H5E2.1
#=GS A0A7N9CXQ4_MACFA/2-269 AC A0A7N9CXQ4.1
#=GS A0A384BX13_URSMA/36-303 AC A0A384BX13.1
#=GS A0A7J7QSW0_PIPKU/26-292 AC A0A7J7QSW0.1
#=GS A0A7J8H5L5_ROUAE/2-269 AC A0A7J8H5L5.1
#=GS A0A7K8SFX1_9AVES/2-196 AC A0A7K8SFX1.1
#=GS A0A7L1DY56_OENON/1-178 AC A0A7L1DY56.1
#=GS A0A7L1NNY4_RHICY/2-49 AC A0A7L1NNY4.1
#=GS A0A6P4YL48_BRABE/4-192 AC A0A6P4YL48.1
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