#=GF ID Rv2179c-like
#=GF AC PF16473.9
#=GF DE 3'-5' exoribonuclease Rv2179c-like domain
#=GF PI DUF5051;
#=GF AU Eberhardt R;0000-0001-6152-1369
#=GF SE PDB:4hvj
#=GF GA 27.00 27.00;
#=GF TC 27.00 27.00;
#=GF NC 26.90 26.90;
#=GF BM hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM hmmsearch -E 1000 --cpu 4 -Z 75585367 HMM pfamseq
#=GF TP Domain
#=GF CL CL0219
#=GF RN [1]
#=GF RM 24311791
#=GF RT Mycobacterium tuberculosis Rv2179c protein establishes a new
#=GF RT exoribonuclease family with broad phylogenetic distribution.
#=GF RA Abendroth J, Ollodart A, Andrews ES, Myler PJ, Staker BL,
#=GF RA Edwards TE, Arcus VL, Grundner C;
#=GF RL J Biol Chem. 2014;289:2139-2147.
#=GF RN [2]
#=GF RM 10581261
#=GF RT Role of exonucleolytic degradation in group I intron homing in
#=GF RT phage T4.
#=GF RA Huang YJ, Parker MM, Belfort M;
#=GF RL Genetics. 1999;153:1501-1512.
#=GF RN [3]
#=GF RM 3056918
#=GF RT Effect of DNA sequence and structure on nuclease activity of the
#=GF RT DexA protein of bacteriophage T4.
#=GF RA Gruber H, Kern G, Gauss P, Gold L;
#=GF RL J Bacteriol. 1988;170:5830-5836.
#=GF DR INTERPRO; IPR033390;
#=GF DR SO; 0000417; polypeptide_domain;
#=GF CC This is a highly divergent 3' exoribonuclease family. The
#=GF CC proteins constitute a typical RNase fold, where the active site
#=GF CC residues form a magnesium catalytic centre. The protein of the
#=GF CC solved structure readily cleaves 3' overhangs in a
#=GF CC time-dependent manner. It is similar to DEDD-type RNases and is
#=GF CC an unusual ATP-binding protein that binds ATP and dATP. It forms
#=GF CC a dimer in solution and both protomers in the asymmetric unit
#=GF CC bind a magnesium ion through Asp-6 in SwissProt:P9WJ73 [1].
#=GF CC Proteins containing this domain also include 3'-5' exonuclease
#=GF CC dexA from bacteriophage T4. It may play a role in the final step
#=GF CC of host DNA degradation, by scavenging DNA into mononucleotides
#=GF CC [2,3].
#=GF SQ 1140
#=GS A0A238VIF9_9ACTN/2-157 AC A0A238VIF9.1
#=GS A0A1C4YCF7_MICEC/3-163 AC A0A1C4YCF7.1
#=GS A0A3S5EIB8_MYCCI/1-157 AC A0A3S5EIB8.1
#=GS A0A2V1H936_9GAMM/2-175 AC A0A2V1H936.1
#=GS A0A0A0RS84_9CAUD/1-174 AC A0A0A0RS84.1
#=GS A0A0I9U2S7_9MYCO/1-160 AC A0A0I9U2S7.1
#=GS D3DAW5_9ACTN/3-162 AC D3DAW5.1
#=GS A0A5P8PLW1_9CAUD/97-230 AC A0A5P8PLW1.1
#=GS A0A7S9SSG1_9CAUD/6-191 AC A0A7S9SSG1.1
#=GS A0A1Q4HM33_9MYCO/1-157 AC A0A1Q4HM33.1
#=GS A0A0Q5VS89_9ACTN/2-157 AC A0A0Q5VS89.1
#=GS A0A4Y5NWW1_9CAUD/4-227 AC A0A4Y5NWW1.1
#=GS A0A7G5AY19_9CAUD/3-195 AC A0A7G5AY19.1
#=GS G0J398_CYCMS/1-165 AC G0J398.1
#=GS A0A1M5R0T9_9ACTN/5-160 AC A0A1M5R0T9.1
#=GS E5E3Z9_9CAUD/3-196 AC E5E3Z9.1
#=GS E1X237_HALMS/2-192 AC E1X237.1
#=GS A0A545AJQ0_9ACTN/5-163 AC A0A545AJQ0.1
#=GS A0A8J7KMY2_9ACTN/3-161 AC A0A8J7KMY2.1
#=GS A0A0Q5TEI1_9BACT/7-177 AC A0A0Q5TEI1.1
#=GS A0A239HKL4_9BACT/11-181 AC A0A239HKL4.1
#=GS A0A559MJC7_9HELO/8-202 AC A0A559MJC7.1
#=GS F4YXP6_9CAUD/1-174 AC F4YXP6.1
#=GS A0A0C5KKU4_9CAUD/1-173 AC A0A0C5KKU4.1
#=GS A0A1X1R4U0_MYCFA/1-157 AC A0A1X1R4U0.1
#=GS A0A097IH84_9CORY/1-156 AC A0A097IH84.1
#=GS A0A1G8V4T2_9ACTN/53-197 AC A0A1G8V4T2.1
#=GS A0A0H5CVH3_9PSEU/1-158 AC A0A0H5CVH3.1
#=GS A0A6F8XYK5_9ACTN/7-140 AC A0A6F8XYK5.1
#=GS A0A0J6WB66_9MYCO/1-157 AC A0A0J6WB66.1
#=GS D4DVW2_SEROD/3-195 AC D4DVW2.1
#=GS A0A7I9Y0G6_9MYCO/1-157 AC A0A7I9Y0G6.1
#=GS A0A2T0SKR9_9PSEU/1-159 AC A0A2T0SKR9.1
#=GS A0A1I2GJ55_9ACTN/12-167 AC A0A1I2GJ55.1
#=GS A0A7W7WS95_9ACTN/3-162 AC A0A7W7WS95.1
#=GS A0A7S9SPF2_9CAUD/6-191 AC A0A7S9SPF2.1
#=GS A0A1H9HBT6_9BACT/2-200 AC A0A1H9HBT6.1
#=GS A0A4Q7ZPA3_9ACTN/3-160 AC A0A4Q7ZPA3.1
#=GS A0A810P2N2_9ACTN/3-139 AC A0A810P2N2.1
#=GS A0A873WIE9_9CAUD/1-137 AC A0A873WIE9.1
#=GS A0A1X1RE52_MYCBE/1-160 AC A0A1X1RE52.1
#=GS S2ZIE9_9CORY/1-156 AC S2ZIE9.1
#=GS A0A367ADH0_9ACTN/4-158 AC A0A367ADH0.1
#=GS A0A344L773_9PSEU/1-156 AC A0A344L773.1
#=GS A0A097J0N8_BPR03/3-203 AC A0A097J0N8.1
#=GS A0A073B950_9PSEU/1-157 AC A0A073B950.1
#=GS A0A8E7G1D2_9CAUD/25-209 AC A0A8E7G1D2.1
#=GS A0A4D5ZD75_9CAUD/106-287 AC A0A4D5ZD75.1
#=GS A0A1C8HU89_9CAUD/46-197 AC A0A1C8HU89.1
#=GS E3G2Q8_ENTLS/554-732 AC E3G2Q8.1
#=GS A0A1Q8CR87_9PSEU/1-156 AC A0A1Q8CR87.1
#=GS A0A840CUX7_9BACT/4-164 AC A0A840CUX7.1
#=GS A0A133ZC64_9CORY/4-159 AC A0A133ZC64.1
#=GS A0A7S5UXG1_9CAUD/2-169 AC A0A7S5UXG1.1
#=GS A0A2U1T7J1_9CORY/1-156 AC A0A2U1T7J1.1
#=GS A0A2T0S9R4_9ACTN/3-160 AC A0A2T0S9R4.1
#=GS A0A229UKP5_9BACL/1-177 AC A0A229UKP5.1
#=GS A0A4R4X0R8_9ACTN/71-188 AC A0A4R4X0R8.1
#=GS A0A7Y9MDU7_9MICO/8-178 AC A0A7Y9MDU7.1
#=GS A0A482J1Q2_9CAUD/2-179 AC A0A482J1Q2.1
#=GS A0A0H4IPM9_9CAUD/1-187 AC A0A0H4IPM9.1
#=GS A0A6G2W4D1_9ACTN/66-173 AC A0A6G2W4D1.1
#=GS A0A7W7T0L3_9PSEU/77-178 AC A0A7W7T0L3.1
#=GS A0A370I581_9NOCA/8-164 AC A0A370I581.1
#=GS A0A083ZZI4_9GAMM/2-179 AC A0A083ZZI4.1
#=GS A0A0C1WUY1_9ACTN/85-189 AC A0A0C1WUY1.1
#=GS A0A563W2K8_9CYAN/5-178 AC A0A563W2K8.1
#=GS A0A1A0MA55_9MYCO/1-157 AC A0A1A0MA55.1
#=GS A0A7S5UQA4_9CAUD/1-171 AC A0A7S5UQA4.1
#=GS A0A411BJZ4_9CAUD/8-180 AC A0A411BJZ4.1
#=GS A0A0N7JYU4_9PSEU/1-156 AC A0A0N7JYU4.1
#=GS A0A7G9UYV0_9CAUD/4-173 AC A0A7G9UYV0.1
#=GS U3GVV8_9CORY/1-158 AC U3GVV8.1
#=GS A0A2C9CXS0_9CAUD/2-217 AC A0A2C9CXS0.1
#=GS A0A2Z5HT79_9CAUD/6-198 AC A0A2Z5HT79.1
#=GS H9C0Y4_9CAUD/3-172 AC H9C0Y4.1
#=GS A0A4Y9PC34_9ACTN/2-156 AC A0A4Y9PC34.1
#=GS A0A076N1J6_AMYME/1-155 AC A0A076N1J6.1
#=GS A0A1H5Z123_9RHOO/7-175 AC A0A1H5Z123.1
#=GS A0A1A3BYM2_9MYCO/1-157 AC A0A1A3BYM2.1
#=GS A0A255SWZ4_9BACT/25-184 AC A0A255SWZ4.1
#=GS X5I2N3_BPKP2/7-169 AC X5I2N3.1
#=GS A0A2U3MX50_9GAMM/7-177 AC A0A2U3MX50.1
#=GS A0A6B8W2T8_9CORY/9-164 AC A0A6B8W2T8.1
#=GS A0A8F2IF84_9CAUD/69-169 AC A0A8F2IF84.1
#=GS A0A1Z4EJX4_9MYCO/1-161 AC A0A1Z4EJX4.1
#=GS A0A0H3JI80_ECO57/641-813 AC A0A0H3JI80.2
#=GS A0A7U0G978_9CAUD/2-202 AC A0A7U0G978.1
#=GS A0A7T8J166_9CAUD/5-199 AC A0A7T8J166.1
#=GS A0A4R2DCI6_9NOCA/1-157 AC A0A4R2DCI6.1
#=GS A0A4S8PFZ7_9ACTN/3-167 AC A0A4S8PFZ7.1
#=GS A0A5S9ER34_9CAUD/15-185 AC A0A5S9ER34.1
#=GS A0A1T5MAT3_9BACT/2-165 AC A0A1T5MAT3.1
#=GS A0A0D8HPP9_RHOSX/1-157 AC A0A0D8HPP9.1
#=GS Q8NNL4_CORGL/1-156 AC Q8NNL4.1
#=GS A0A1V6MMZ6_9ACTN/77-191 AC A0A1V6MMZ6.1
#=GS A0A0F6TDB3_9CORY/1-156 AC A0A0F6TDB3.1
#=GS A0A809SBX1_9PROT/1-156 AC A0A809SBX1.1
#=GS A0A8J4EBP1_9ACTN/3-156 AC A0A8J4EBP1.1
#=GS A0A0K2YFX9_9NOCA/1-157 AC A0A0K2YFX9.1
#=GS A0A2S1PGP3_9CAUD/5-196 AC A0A2S1PGP3.1
#=GS F5IWI4_9BACT/4-164 AC F5IWI4.1
#=GS A0A1A8ZX45_9ACTN/3-163 AC A0A1A8ZX45.1
#=GS A0A2T0H0V6_ACTMO/1-156 AC A0A2T0H0V6.1
#=GS A0A286EUA5_9ACTN/1-156 AC A0A286EUA5.1
#=GS A0A2I6PFU9_9CAUD/4-202 AC A0A2I6PFU9.1
#=GS A0A238VNA1_9PSEU/1-155 AC A0A238VNA1.1
#=GS A0A1L7XD59_9HELO/33-181 AC A0A1L7XD59.1
#=GS A0A1H9JLX5_9HYPH/12-61 AC A0A1H9JLX5.1
#=GS A0A8E7L412_9CAUD/27-220 AC A0A8E7L412.1
#=GS A0A8H6EGX1_9HELO/8-79 AC A0A8H6EGX1.1
#=GS A0A8H8U7J0_9HELO/8-202 AC A0A8H8U7J0.1
#=GS A0A060AI39_9CAUD/5-197 AC A0A060AI39.1
#=GS A0A6C0U705_9GAMM/5-183 AC A0A6C0U705.1
#=GS W5TIR2_9NOCA/27-183 AC W5TIR2.1
#=GS A0A850DI32_9MYCO/1-157 AC A0A850DI32.1
#=GS A0A7M3TYM8_9CAUD/25-216 AC A0A7M3TYM8.1
#=GS A0A8J3HIE3_9ACTN/3-163 AC A0A8J3HIE3.1
#=GS A0A1H3PZM9_9PSEU/1-156 AC A0A1H3PZM9.1
#=GS W4M8Q8_9BACT/6-179 AC W4M8Q8.1
#=GS M4QQL8_9CAUD/1-180 AC M4QQL8.1
#=GS A0A239NC81_9ACTN/3-164 AC A0A239NC81.1
#=GS A0A328TPY7_9GAMM/1-76 AC A0A328TPY7.1
#=GS A0A0K1RA30_9CORY/1-155 AC A0A0K1RA30.1
#=GS A0A0B8NAD4_9NOCA/1-157 AC A0A0B8NAD4.1
#=GS A0A1A9BLV7_9ACTN/77-191 AC A0A1A9BLV7.1
#=GS Q0RFL7_FRAAA/3-162 AC Q0RFL7.1
#=GS A0A873WTQ6_9CAUD/3-203 AC A0A873WTQ6.1
#=GS M3TB79_GORML/1-156 AC M3TB79.1
#=GS A0A0F0HHM2_LENAE/1-159 AC A0A0F0HHM2.1
#=GS A0A562I4J9_MICOL/3-163 AC A0A562I4J9.1
#=GS A0A1T4UVC6_9GAMM/2-178 AC A0A1T4UVC6.1
#=GS A0A7T8EPA7_9CAUD/125-318 AC A0A7T8EPA7.1
#=GS A0A381H642_CITKO/2-179 AC A0A381H642.1
#=GS A0A1H5XWV3_9GAMM/38-225 AC A0A1H5XWV3.1
#=GS A0A2A9DP65_9CORY/1-156 AC A0A2A9DP65.1
#=GS A0A0D0JQW2_9NOCA/1-160 AC A0A0D0JQW2.1
#=GS A0A6N4VAQ0_9MYCO/1-157 AC A0A6N4VAQ0.1
#=GS A0A0B5A4R1_9CAUD/6-182 AC A0A0B5A4R1.1
#=GS A0A2D0YLQ0_9CAUD/24-219 AC A0A2D0YLQ0.1
#=GS A0A0J7L5M1_LASNI/2-173 AC A0A0J7L5M1.1
#=GS C3PHH7_CORA7/1-156 AC C3PHH7.1
#=GS A0A1S1QNY6_9ACTN/3-162 AC A0A1S1QNY6.1
#=GS A0A164GH06_9NOCA/1-157 AC A0A164GH06.1
#=GS A0A7I7RR76_9MYCO/1-155 AC A0A7I7RR76.1
#=GS A0A1H0R2Z3_9ACTN/11-165 AC A0A1H0R2Z3.1
#=GS A0A1I0Y2F2_9ACTN/5-190 AC A0A1I0Y2F2.1
#=GS A0A5C4U6P5_9CORY/1-156 AC A0A5C4U6P5.1
#=GS A0A562VAY9_9ACTN/2-162 AC A0A562VAY9.1
#=GS A0A5J6T3X5_9CAUD/2-181 AC A0A5J6T3X5.1
#=GS A0A0P6Y9G2_9CHLR/5-175 AC A0A0P6Y9G2.1
#=GS A0A3A4JL47_9NOCA/1-157 AC A0A3A4JL47.1
#=GS A0A7W7PS79_9ACTN/11-193 AC A0A7W7PS79.1
#=GS A0A7W7MT90_9ACTN/3-161 AC A0A7W7MT90.1
#=GS A0A482MHD1_9CAUD/2-174 AC A0A482MHD1.1
#=GS A0A1I1B804_9PSEU/1-156 AC A0A1I1B804.1
#=GS A0A3G3M4A4_9CAUD/1-162 AC A0A3G3M4A4.1
#=GS A0A7S9XEX8_9CAUD/6-191 AC A0A7S9XEX8.1
#=GS A0A1S6L1X3_9CAUD/19-203 AC A0A1S6L1X3.1
#=GS A0A6V8L5K4_9ACTN/3-163 AC A0A6V8L5K4.1
#=GS A0A3G8JGN2_9ACTN/1-156 AC A0A3G8JGN2.1
#=GS M1NNI4_9CORY/1-156 AC M1NNI4.1
#=GS A0A379JHN9_9NOCA/1-157 AC A0A379JHN9.1
#=GS A0A2S0WH98_9CORY/1-156 AC A0A2S0WH98.1
#=GS A0A1M2YHL5_9ARCH/13-181 AC A0A1M2YHL5.1
#=GS A0A1L7CYS3_9CORY/1-157 AC A0A1L7CYS3.1
#=GS A0A514A053_9CAUD/57-249 AC A0A514A053.1
#=GS A0A2H5BGK2_9CAUD/110-303 AC A0A2H5BGK2.1
#=GS A0A2D2W6X4_9CAUD/95-217 AC A0A2D2W6X4.1
#=GS A0A653FV92_9CAUD/641-816 AC A0A653FV92.1
#=GS A0A8J8H2D5_9ACTN/3-163 AC A0A8J8H2D5.1
#=GS A0A4Y6E7S9_9CAUD/4-223 AC A0A4Y6E7S9.1
#=GS A0A5B8NVY0_9CORY/1-164 AC A0A5B8NVY0.1
#=GS A0A7Y0JNW8_9ACTN/3-160 AC A0A7Y0JNW8.1
#=GS Q56EZ1_9CAUD/5-196 AC Q56EZ1.1
#=GS A0A1X1TG95_9MYCO/1-157 AC A0A1X1TG95.1
#=GS A0A6F8YD51_9ACTN/3-162 AC A0A6F8YD51.1
#=GS A0A1Q4YTP1_9PSEU/1-159 AC A0A1Q4YTP1.1
#=GS A0A263D8M3_9PSEU/1-156 AC A0A263D8M3.1
#=GS A0A5A7SCL7_9NOCA/1-157 AC A0A5A7SCL7.1
#=GS A0A0J1GIX5_9GAMM/1-184 AC A0A0J1GIX5.1
#=GS A0A1H0JLE5_9PSEU/1-158 AC A0A1H0JLE5.1
#=GS A0A1L7CTQ3_9CORY/1-163 AC A0A1L7CTQ3.1
#=GS A0A1G8D4U3_9NOCA/1-157 AC A0A1G8D4U3.1
#=GS A0A5C2H5J8_9CAUD/1-173 AC A0A5C2H5J8.1
#=GS A0A1H0FPB1_9BACT/4-196 AC A0A1H0FPB1.1
#=GS A0A2V4B3T6_9PSEU/1-156 AC A0A2V4B3T6.1
#=GS Q4JWB4_CORJK/1-164 AC Q4JWB4.1
#=GS A0A1A9HMH7_9BURK/12-185 AC A0A1A9HMH7.1
#=GS W9ALU1_MYCCO/1-156 AC W9ALU1.1
#=GS A0A328TQM4_9GAMM/1-39 AC A0A328TQM4.1
#=GS Q6QGK0_BPT5/6-191 AC Q6QGK0.1
#=GS C8XCV4_NAKMY/11-166 AC C8XCV4.1
#=GS A0A0Q2R1X9_MYCGO/1-157 AC A0A0Q2R1X9.1
#=GS V5XFX6_MYCNE/1-157 AC V5XFX6.1
#=GS A0A292Z4E8_9PSEU/1-156 AC A0A292Z4E8.1
#=GS A0A7L8ZF18_9CAUD/73-184 AC A0A7L8ZF18.1
#=GS F9ZCG5_ODOSD/3-163 AC F9ZCG5.1
#=GS L0LBV6_9CAUD/1-175 AC L0LBV6.1
#=GS A0A345MJQ4_BPBSP/2-176 AC A0A345MJQ4.1
#=GS A0A2N3XX06_SACSN/1-155 AC A0A2N3XX06.1
#=GS A0A5Q3Q482_9PSEU/1-156 AC A0A5Q3Q482.1
#=GS G7CE43_MYCT3/1-164 AC G7CE43.1
#=GS A0A4Y6EIJ8_9CAUD/3-167 AC A0A4Y6EIJ8.1
#=GS A0A1C5HNK4_9ACTN/3-163 AC A0A1C5HNK4.1
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