#=GF ID SMN_YG-box
#=GF AC PF20635.1
#=GF DE Survival Motor Neuron, YG-box
#=GF AU Chuguransky S;0000-0002-0520-0736
#=GF SE PF060003
#=GF GA 21.30 21.30;
#=GF TC 21.30 21.30;
#=GF NC 21.20 21.20;
#=GF BM hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM hmmsearch -Z 75585367 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP Domain
#=GF RN [1]
#=GF RM 23022347
#=GF RT The survival motor neuron protein forms soluble glycine zipper
#=GF RT oligomers.
#=GF RA Martin R, Gupta K, Ninan NS, Perry K, Van Duyne GD;
#=GF RL Structure. 2012;20:1929-1939.
#=GF RN [2]
#=GF RM 22607171
#=GF RT Solution structure of the core SMN-Gemin2 complex.
#=GF RA Sarachan KL, Valentine KG, Gupta K, Moorman VR, Gledhill JM Jr,
#=GF RA Bernens M, Tommos C, Wand AJ, Van Duyne GD;
#=GF RL Biochem J. 2012;445:361-370.
#=GF DR SO; 0000417; polypeptide_domain;
#=GF CC Survival Motor Neuron (SMN) protein forms the oligomeric core of
#=GF CC a multi-protein complex that functions in spliceosomal snRNP
#=GF CC biogenesis. Mutations in the SMN gene cause spinal muscular
#=GF CC atrophy (SMA). It has three highly conserved domains: a short
#=GF CC N-terminal segment responsible for binding with high affinity to
#=GF CC Gemin2, therefore, called Gemin2-binding domain (G2-BD), a
#=GF CC central Tudor domain (Pfam:PF06003) that recognises symmetric
#=GF CC dimethylarginine (sDMA) modifications in proteins involved in
#=GF CC RNA processing, and a C-terminal domain, represented in this
#=GF CC entry, referred to as the 'YG-box' [1,2]. This domain contains
#=GF CC three overlapping motifs: GxxxGxxxG, YxxxYxxxY and
#=GF CC SxxxSxxxSxxxT. The YG-box forms helical oligomers similar to the
#=GF CC glycine zippers found in transmembrane channels. The YG-box
#=GF CC oligomers are thought to be involved in oligomerization and are
#=GF CC likely to be used directly in mediating interactions that are
#=GF CC crucial for SMN's functions [1]. It has been reported that
#=GF CC nearly half of the known SMA patient missense mutations map to
#=GF CC the SMN YG-box [1].
#=GF SQ 1479
#=GS A0A093GMN4_DRYPU/205-258 AC A0A093GMN4.1
#=GS A0A0M9EV08_FUSLA/96-146 AC A0A0M9EV08.1
#=GS A0A370TRC3_9HELO/101-162 AC A0A370TRC3.1
#=GS C0NIJ5_AJECG/124-175 AC C0NIJ5.1
#=GS A0A4Y8CXL1_9HELO/121-174 AC A0A4Y8CXL1.1
#=GS G3VES9_SARHA/216-281 AC G3VES9.2
#=GS A0A7K7R081_POEAT/224-276 AC A0A7K7R081.1
#=GS A0A6P7J0R9_9TELE/215-284 AC A0A6P7J0R9.1
#=GS A0A850WZ71_PIACA/192-244 AC A0A850WZ71.1
#=GS A0A183ATT3_9TREM/308-346 AC A0A183ATT3.1
#=GS A0A8C5YQ14_MARMA/204-258 AC A0A8C5YQ14.1
#=GS W5LXQ9_LEPOC/200-270 AC W5LXQ9.1
#=GS A0A2K0WVE4_GIBNY/95-143 AC A0A2K0WVE4.1
#=GS A0A6J3LC69_9HYME/169-245 AC A0A6J3LC69.1
#=GS A0A3P9NGB4_POERE/214-283 AC A0A3P9NGB4.1
#=GS A0A2V5HEV0_ASPV1/113-173 AC A0A2V5HEV0.1
#=GS Q0CL47_ASPTN/98-159 AC Q0CL47.1
#=GS A0A7L2QYD9_9PASS/223-275 AC A0A7L2QYD9.1
#=GS A0A7M7TGA9_STRPU/256-327 AC A0A7M7TGA9.1
#=GS A0A7L0FXA7_CORCN/202-254 AC A0A7L0FXA7.1
#=GS A0A2U9BSK4_SCOMX/213-282 AC A0A2U9BSK4.1
#=GS A0A8H6FDN9_9LECA/127-174 AC A0A8H6FDN9.1
#=GS A0A8H6V9C1_9EURO/104-171 AC A0A8H6V9C1.1
#=GS A0A6J1Q2P2_9HYME/229-285 AC A0A6J1Q2P2.1
#=GS A0A6J3HWA3_SAPAP/225-283 AC A0A6J3HWA3.1
#=GS T2MCS1_HYDVU/284-351 AC T2MCS1.1
#=GS A0A673HKZ4_9TELE/210-280 AC A0A673HKZ4.1
#=GS A0A8C0L6J4_CANLU/222-289 AC A0A8C0L6J4.1
#=GS A0A671XZN2_SPAAU/201-270 AC A0A671XZN2.1
#=GS A0A8H4PL38_9HYPO/78-130 AC A0A8H4PL38.1
#=GS A0A7L1TG41_ARAGA/165-217 AC A0A7L1TG41.1
#=GS A0A673KUD2_9TELE/207-277 AC A0A673KUD2.1
#=GS A0A7K8D0Z9_9CORV/204-256 AC A0A7K8D0Z9.1
#=GS A0A851MCZ4_9DEND/213-265 AC A0A851MCZ4.1
#=GS A0A7K8GY03_ORTSP/210-262 AC A0A7K8GY03.1
#=GS A0A8J0UZ22_XENLA/254-326 AC A0A8J0UZ22.1
#=GS A0A2K1QH18_9PEZI/95-161 AC A0A2K1QH18.1
#=GS A0A8H7VJW8_9FUNG/188-241 AC A0A8H7VJW8.1
#=GS A0A8J0U155_XENLA/188-258 AC A0A8J0U155.1
#=GS A0A1V6P699_PENDC/106-163 AC A0A1V6P699.1
#=GS B4LB39_DROVI/165-233 AC B4LB39.1
#=GS A0A2K5MQ66_CERAT/159-226 AC A0A2K5MQ66.1
#=GS A0A850VJT8_9CORV/223-275 AC A0A850VJT8.1
#=GS A0A8C9GL66_9PRIM/224-291 AC A0A8C9GL66.1
#=GS A0A3Q1CYA1_AMPOC/214-283 AC A0A3Q1CYA1.1
#=GS A0A151N124_ALLMI/128-197 AC A0A151N124.1
#=GS A0A7C8IHS7_9PEZI/96-149 AC A0A7C8IHS7.1
#=GS A0A7L4EF71_HIRRU/221-273 AC A0A7L4EF71.1
#=GS A0A1W2PRV5_HUMAN/226-281 AC A0A1W2PRV5.1
#=GS A0A811JVA8_9BILA/508-573 AC A0A811JVA8.1
#=GS A0A7K9VBT0_ANSSE/198-250 AC A0A7K9VBT0.1
#=GS A0A2J7RJS3_9NEOP/126-201 AC A0A2J7RJS3.1
#=GS A0A8H8D1I3_9EURO/125-176 AC A0A8H8D1I3.1
#=GS A0A2K6SG17_SAIBB/221-269 AC A0A2K6SG17.1
#=GS A0A8C8D3C6_ONCTS/212-281 AC A0A8C8D3C6.1
#=GS A0A2T7A9I4_TUBBO/142-200 AC A0A2T7A9I4.1
#=GS A0A673V5R8_SURSU/187-258 AC A0A673V5R8.1
#=GS A0A6J3L8I4_9HYME/183-259 AC A0A6J3L8I4.1
#=GS A0A8B9DT19_ANSCY/200-270 AC A0A8B9DT19.1
#=GS U9TQX1_RHIID/290-348 AC U9TQX1.1
#=GS A0A0R3P9M8_ANGCS/1-20 AC A0A0R3P9M8.1
#=GS A0A2K6S4M6_SAIBB/222-290 AC A0A2K6S4M6.1
#=GS A0A3Q0IUJ3_DIACI/195-262 AC A0A3Q0IUJ3.1
#=GS A0A8P0SXI0_CANLF/221-282 AC A0A8P0SXI0.1
#=GS A0A2K6LQI6_RHIBE/188-268 AC A0A2K6LQI6.1
#=GS A0A7K7FKK7_CHIMN/205-257 AC A0A7K7FKK7.1
#=GS A0A8K1LFM2_9PASS/201-268 AC A0A8K1LFM2.1
#=GS A0A8D2FPG7_THEGE/226-285 AC A0A8D2FPG7.1
#=GS A0A1D5RJY4_MACMU/226-289 AC A0A1D5RJY4.2
#=GS A0A6P8X2Z8_GYMAC/215-284 AC A0A6P8X2Z8.1
#=GS A0A8B9GG75_9PSIT/193-262 AC A0A8B9GG75.1
#=GS A0A834K8E8_VESGE/187-253 AC A0A834K8E8.1
#=GS A0A8C8IN55_ONCTS/205-273 AC A0A8C8IN55.1
#=GS A0A8R2M5B3_BOMMO/204-262 AC A0A8R2M5B3.1
#=GS A0A1Z5SVE4_HORWE/98-148 AC A0A1Z5SVE4.1
#=GS A0A094F3E9_9PEZI/109-162 AC A0A094F3E9.1
#=GS A0A0F0IIS2_ASPPU/112-167 AC A0A0F0IIS2.1
#=GS A0A3S1B926_ELYCH/223-288 AC A0A3S1B926.1
#=GS A0A834P235_VESPE/187-255 AC A0A834P235.1
#=GS A0A671PVE2_9TELE/209-279 AC A0A671PVE2.1
#=GS A0A672RPI7_SINGR/210-280 AC A0A672RPI7.1
#=GS A0A4Q4ULJ8_9PEZI/95-150 AC A0A4Q4ULJ8.1
#=GS A0A444V6W0_ACIRT/48-138 AC A0A444V6W0.1
#=GS A0A7L1BZ07_9PASS/222-274 AC A0A7L1BZ07.1
#=GS A0A4D9E991_9SAUR/285-364 AC A0A4D9E991.1
#=GS A0A1V4J5W3_PATFA/203-262 AC A0A1V4J5W3.1
#=GS A0A2B7ZHH9_9EURO/142-191 AC A0A2B7ZHH9.1
#=GS A0A835CY63_9HYME/199-259 AC A0A835CY63.1
#=GS A0A673HLM4_9TELE/186-256 AC A0A673HLM4.1
#=GS W9HX65_FUSOX/95-143 AC W9HX65.1
#=GS A0A8C3VUV6_9CETA/226-292 AC A0A8C3VUV6.1
#=GS A0A4Z2BE55_9TELE/210-278 AC A0A4Z2BE55.1
#=GS A0A4Q4SYS9_9PEZI/95-146 AC A0A4Q4SYS9.1
#=GS A0A7K7XBK6_9PASS/178-230 AC A0A7K7XBK6.1
#=GS S4RJW4_PETMA/214-287 AC S4RJW4.1
#=GS R1EVL7_BOTPV/143-196 AC R1EVL7.1
#=GS A0A3P9AC98_ESOLU/217-286 AC A0A3P9AC98.2
#=GS A0A8H4WSL4_9HYPO/95-143 AC A0A8H4WSL4.1
#=GS A0A673L0K6_9TELE/207-277 AC A0A673L0K6.1
#=GS A0A665SVZ6_ECHNA/215-284 AC A0A665SVZ6.1
#=GS A0A100I9R7_ASPNG/119-175 AC A0A100I9R7.1
#=GS A0A1J7IJ87_9PEZI/88-150 AC A0A1J7IJ87.1
#=GS A0A7K5FJF6_PROAR/197-249 AC A0A7K5FJF6.1
#=GS A0A8V0YAK2_CHICK/171-240 AC A0A8V0YAK2.1
#=GS A0A7K6U877_9AVES/201-254 AC A0A7K6U877.1
#=GS A0A8C9JSH8_PANTA/224-290 AC A0A8C9JSH8.1
#=GS A0A851Z672_9AVES/220-272 AC A0A851Z672.1
#=GS A0A3N0YYN0_ANAGA/217-287 AC A0A3N0YYN0.1
#=GS A0A851VWJ1_9PASS/221-272 AC A0A851VWJ1.1
#=GS A0A7L2W3U9_PANHA/198-250 AC A0A7L2W3U9.1
#=GS A0A8C7BHR6_NEOVI/155-222 AC A0A8C7BHR6.1
#=GS A0A2I3FYS9_NOMLE/183-261 AC A0A2I3FYS9.1
#=GS A0A8C9QNC2_SPEDA/225-284 AC A0A8C9QNC2.1
#=GS G3P8S9_GASAC/211-280 AC G3P8S9.1
#=GS A0A0L0FI13_9EUKA/340-389 AC A0A0L0FI13.1
#=GS A0A672YGV8_9TELE/213-283 AC A0A672YGV8.1
#=GS A0A674GCL4_TAEGU/204-264 AC A0A674GCL4.1
#=GS A0A852CKG3_9PICI/201-254 AC A0A852CKG3.1
#=GS A0A8C0L418_CANLU/222-289 AC A0A8C0L418.1
#=GS A0A0D9RT05_CHLSB/226-293 AC A0A0D9RT05.1
#=GS U3ITT1_ANAPP/191-261 AC U3ITT1.2
#=GS A0A179GXY1_PURLI/88-148 AC A0A179GXY1.1
#=GS A0A218V8K2_9PASE/208-279 AC A0A218V8K2.1
#=GS A0A8H7K432_BIOOC/85-138 AC A0A8H7K432.1
#=GS A0A6P8PLS0_GEOSA/226-296 AC A0A6P8PLS0.1
#=GS A0A0A0MXR7_PONAB/208-275 AC A0A0A0MXR7.1
#=GS A0A8C6WAP4_NANGA/222-289 AC A0A8C6WAP4.1
#=GS A0A8H3EXE5_9LECA/130-178 AC A0A8H3EXE5.1
#=GS A0A074WAR3_9PEZI/107-161 AC A0A074WAR3.1
#=GS A0A8H3WM07_9PEZI/97-158 AC A0A8H3WM07.1
#=GS A0A8C4QQJ9_EPTBU/214-279 AC A0A8C4QQJ9.1
#=GS A0A1J1HU11_9DIPT/169-231 AC A0A1J1HU11.1
#=GS A0A2J6T1B0_9HELO/106-162 AC A0A2J6T1B0.1
#=GS A0A6P5DJB6_BOSIN/218-285 AC A0A6P5DJB6.1
#=GS A0A7L0DCN8_9CHAR/238-290 AC A0A7L0DCN8.1
#=GS F6TME2_HORSE/223-290 AC F6TME2.2
#=GS A0A8J6E4P5_GALPY/217-275 AC A0A8J6E4P5.1
#=GS A0A8D2ATP8_SCIVU/188-262 AC A0A8D2ATP8.1
#=GS A0A1U7LTB9_NEOID/127-176 AC A0A1U7LTB9.1
#=GS A0A7K5NY82_CHRMC/218-270 AC A0A7K5NY82.1
#=GS A0A850ZL45_9PASS/201-253 AC A0A850ZL45.1
#=GS A0A8C8IEZ5_ONCTS/186-254 AC A0A8C8IEZ5.1
#=GS H3CWZ8_TETNG/216-285 AC H3CWZ8.1
#=GS A0A2U3ZIR5_ODORO/155-221 AC A0A2U3ZIR5.1
#=GS A0A8H4W063_9HELO/120-181 AC A0A8H4W063.1
#=GS A0A7K4LGE7_9AVES/189-241 AC A0A7K4LGE7.1
#=GS A0A1J9P7B0_9EURO/133-182 AC A0A1J9P7B0.1
#=GS A0A815CNA7_9BILA/41-84 AC A0A815CNA7.1
#=GS B6HSC7_PENRW/93-149 AC B6HSC7.1
#=GS A0A6P5LES9_PHACI/216-281 AC A0A6P5LES9.1
#=GS A0A8C3Y540_CATUS/195-265 AC A0A8C3Y540.1
#=GS A0A2K6CHF1_MACNE/226-293 AC A0A2K6CHF1.1
#=GS A0A452HTL2_9SAUR/253-336 AC A0A452HTL2.1
#=GS A0A8J1J1C0_XENTR/354-434 AC A0A8J1J1C0.1
#=GS A0A5J5DG92_9PERO/211-277 AC A0A5J5DG92.1
#=GS A0A3Q2VKC1_HAPBU/221-290 AC A0A3Q2VKC1.1
#=GS A0A6J1Q4Q9_9HYME/184-252 AC A0A6J1Q4Q9.1
#=GS A0A4U5UW09_COLLU/219-288 AC A0A4U5UW09.1
#=GS A0A437D069_ORYJA/215-284 AC A0A437D069.1
#=GS A0A8C5LIP7_9ANUR/204-273 AC A0A8C5LIP7.1
#=GS A0A671PVH1_9TELE/210-280 AC A0A671PVH1.1
#=GS A0A8C9GSK1_9PRIM/188-261 AC A0A8C9GSK1.1
#=GS A0A7K9Q8M4_IRECY/203-256 AC A0A7K9Q8M4.1
#=GS A0A835NNY6_9PASS/199-257 AC A0A835NNY6.1
#=GS A0A6J3L7T2_9HYME/169-245 AC A0A6J3L7T2.1
#=GS A0A2K5MPS6_CERAT/188-261 AC A0A2K5MPS6.1
#=GS A0A7L4I1C4_SCOUM/214-266 AC A0A7L4I1C4.1
#=GS F2TXC8_SALR5/219-278 AC F2TXC8.1
#=GS A0A0G2JQN8_HUMAN/93-148 AC A0A0G2JQN8.1
#=GS B9EL39_SALSA/212-281 AC B9EL39.1
#=GS A0A182YIC9_ANOST/222-291 AC A0A182YIC9.1
#=GS A0A8H7PQ53_MORIS/160-209 AC A0A8H7PQ53.1
#=GS A0A8C8EF17_9STRI/194-264 AC A0A8C8EF17.1
#=GS A0A8H3XG80_GIGMA/195-249 AC A0A8H3XG80.1
#=GS A0A7L4IYQ4_9PASS/225-277 AC A0A7L4IYQ4.1
#=GS A0A261BR26_9PELO/134-193 AC A0A261BR26.1
#=GS A0A2I0UN88_LIMLA/194-264 AC A0A2I0UN88.1
#=GS A0A7L0XCG9_TYRSA/205-257 AC A0A7L0XCG9.1
#=GS A0A5N6ZSZ5_9EURO/109-171 AC A0A5N6ZSZ5.1
#=GS A0A8C5LYL1_9ANUR/302-384 AC A0A8C5LYL1.1
#=GS A0A232EP79_9HYME/182-250 AC A0A232EP79.1
#=GS A0A2K6LSA6_RHIBE/159-226 AC A0A2K6LSA6.1
#=GS A0A7L0M7Z3_9PSIT/195-246 AC A0A7L0M7Z3.1
#=GS C6H7W3_AJECH/124-175 AC C6H7W3.1
#=GS A0A7K7T9U4_9TYRA/192-242 AC A0A7K7T9U4.1
#=GS A0A670IWR7_PODMU/205-275 AC A0A670IWR7.1
#=GS A0A6P6NER3_CARAU/210-280 AC A0A6P6NER3.1
#=GS B4MXF5_DROWI/154-226 AC B4MXF5.1
#=GS A0A8J6FHA1_ELECQ/160-230 AC A0A8J6FHA1.1
#=GS A0A2I3T3Q2_PANTR/229-284 AC A0A2I3T3Q2.1
#=GS U3KCW5_FICAL/194-264 AC U3KCW5.2
#=GS A0A267DTA2_9PLAT/162-215 AC A0A267DTA2.1
#=GS A0A7L2YHJ5_JACJC/208-260 AC A0A7L2YHJ5.1
#=GS G1TT42_RABIT/203-270 AC G1TT42.2
#=GS A0A2K6CHC9_MACNE/226-285 AC A0A2K6CHC9.1
#=GS A0A1V6T619_9EURO/110-173 AC A0A1V6T619.1
#=GS A0A091REU8_9GRUI/198-250 AC A0A091REU8.1
#=GS S2IVN7_MUCC1/198-246 AC S2IVN7.1
#=GS A0A674IAY6_TERCA/204-284 AC A0A674IAY6.1
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