#=GF ID SMODS
#=GF AC PF18144.5
#=GF DE Second Messenger Oligonucleotide or Dinucleotide Synthetase domain
#=GF AU Iyer LM;0000-0002-4844-2022
#=GF AU Aravind L;0000-0003-0771-253X
#=GF AU Burroughs AM;0000-0002-2229-8771
#=GF AU El-Gebali S;0000-0003-1378-5495
#=GF SE Laks
#=GF GA 26.50 30.00;
#=GF TC 26.50 30.00;
#=GF NC 26.40 29.90;
#=GF BM hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM hmmsearch -Z 75585367 --cpu 4 -E 1000 HMM pfamseq
#=GF TP Domain
#=GF CL CL0260
#=GF RN [1]
#=GF RM 26590262
#=GF RT Comparative genomic analyses reveal a vast, novel network of
#=GF RT nucleotide-centric systems in biological conflicts, immunity and
#=GF RT signaling.
#=GF RA Burroughs AM, Zhang D, Schaffer DE, Iyer LM, Aravind L;
#=GF RL Nucleic Acids Res. 2015;43:10633-10654.
#=GF RN [2]
#=GF RM 22500802
#=GF RT Coordinated regulation of accessory genetic elements produces
#=GF RT cyclic di-nucleotides for V. cholerae virulence.
#=GF RA Davies BW, Bogard RW, Young TS, Mekalanos JJ;
#=GF RL Cell. 2012;149:358-370.
#=GF DR SO; 0000417; polypeptide_domain;
#=GF CC Nucleotide synthetase enzyme of the DNA polymerase beta
#=GF CC superfamily. Experimental studies have demonstrated cGAMP
#=GF CC synthetase activity in the Vibrio cholerae DncV protein, a
#=GF CC member of the SMODS family. The diversity inherent to the SMODS
#=GF CC family suggests members of the family could generate a range of
#=GF CC nucleotides, cyclic and/or linear. The nucleotide second
#=GF CC messengers generated by the SMODS domains are predicted to
#=GF CC activate effectors in a class of conflict systems reliant on the
#=GF CC production and sensing of the nucleotide second messengers [1]
#=GF CC [2].
#=GF SQ 862
#=GS A0A4U1H8M3_9DELT/9-177 AC A0A4U1H8M3.1
#=GS A0A3R9YE69_9ENTE/1-166 AC A0A3R9YE69.1
#=GS F2JRK3_CELLD/1-86 AC F2JRK3.1
#=GS A0A3N2BGK3_9MICO/1-165 AC A0A3N2BGK3.1
#=GS A0A1C2GRX8_9SPHI/10-174 AC A0A1C2GRX8.1
#=GS A0A6N9YPK4_9ACTN/1-164 AC A0A6N9YPK4.1
#=GS A0A1M6BEK2_9VIBR/7-158 AC A0A1M6BEK2.1
#=GS M5F971_9HYPH/1-166 AC M5F971.1
#=GS A0A196PZ00_9RHOB/2-166 AC A0A196PZ00.1
#=GS A0A2L0A7W5_9SPHN/2-165 AC A0A2L0A7W5.1
#=GS A0A316TUC2_9BACT/1-165 AC A0A316TUC2.1
#=GS S5ZK92_9CREN/1-147 AC S5ZK92.1
#=GS A0A1E8FU73_9MICC/1-163 AC A0A1E8FU73.1
#=GS A0A3G2TCU2_9FLAO/1-170 AC A0A3G2TCU2.1
#=GS A0A173ZRM0_SARVE/1-166 AC A0A173ZRM0.1
#=GS S1QYG4_9ENTE/1-132 AC S1QYG4.1
#=GS U4V5X2_9HYPH/1-130 AC U4V5X2.1
#=GS A0A1M5RCY4_9CLOT/1-155 AC A0A1M5RCY4.1
#=GS A0A1A9BNS6_9ACTN/2-163 AC A0A1A9BNS6.1
#=GS A0A7V8K816_9GAMM/2-168 AC A0A7V8K816.1
#=GS A0A4V2VN67_PELSC/8-169 AC A0A4V2VN67.1
#=GS A0A378YTE6_9NOCA/3-156 AC A0A378YTE6.1
#=GS A0A0A0HH43_9RHOB/19-181 AC A0A0A0HH43.1
#=GS A0A4T3EXS9_9SPHN/17-178 AC A0A4T3EXS9.1
#=GS A7HU63_PARL1/2-165 AC A7HU63.1
#=GS A0A5C5BA51_9MICO/3-165 AC A0A5C5BA51.1
#=GS A0A6G8QDR3_9ACTN/7-169 AC A0A6G8QDR3.1
#=GS A0A7W9FKX7_9HYPH/1-160 AC A0A7W9FKX7.1
#=GS A0A251XLC8_CLAMM/1-156 AC A0A251XLC8.1
#=GS A0A1C9VJU1_9BURK/2-166 AC A0A1C9VJU1.1
#=GS A0A0G2ZIR3_9DELT/1-171 AC A0A0G2ZIR3.1
#=GS A0A250IL41_9DELT/9-173 AC A0A250IL41.1
#=GS A0A7J8H4V7_ROUAE/20-170 AC A0A7J8H4V7.1
#=GS A0A654DZ90_9BACT/3-168 AC A0A654DZ90.1
#=GS A0A1N6PPT2_9HYPH/1-130 AC A0A1N6PPT2.1
#=GS A0A8C9USC9_SPEDA/1-152 AC A0A8C9USC9.1
#=GS A0A4R6YH82_9GAMM/19-187 AC A0A4R6YH82.1
#=GS A0A4R3VJU4_PELSC/1-163 AC A0A4R3VJU4.1
#=GS A0A4Q2UY91_9BACT/1-164 AC A0A4Q2UY91.1
#=GS A0A2N6PGH6_9MICO/1-165 AC A0A2N6PGH6.1
#=GS A0A270B919_9SPHN/1-163 AC A0A270B919.1
#=GS A9UZS3_MONBE/860-1010 AC A9UZS3.1
#=GS A0A1V9GAN7_9BACT/2-163 AC A0A1V9GAN7.1
#=GS S0LD19_ENTAV/1-159 AC S0LD19.1
#=GS A0A4R1UC93_9SPHN/1-167 AC A0A4R1UC93.1
#=GS A0A5C6TX93_9SPHN/4-158 AC A0A5C6TX93.1
#=GS A0A316DW60_9FLAO/1-174 AC A0A316DW60.1
#=GS A0A2C6C5Z5_9GAMM/1-164 AC A0A2C6C5Z5.1
#=GS A0A0B4X9H1_9HYPH/1-160 AC A0A0B4X9H1.1
#=GS A0A1Q8ISX2_9BURK/1-161 AC A0A1Q8ISX2.1
#=GS A0A517XQS8_9BACT/3-158 AC A0A517XQS8.1
#=GS A0A1M5S0B4_9ACTN/3-159 AC A0A1M5S0B4.1
#=GS A0A023D4F9_ACIMT/1-169 AC A0A023D4F9.1
#=GS A0A160KVT4_9MICO/5-158 AC A0A160KVT4.1
#=GS M7Y7G6_9BACT/1-163 AC M7Y7G6.1
#=GS A0A495VYA0_9PSEU/2-164 AC A0A495VYA0.1
#=GS A0A5D0RPR2_9RHOB/11-160 AC A0A5D0RPR2.1
#=GS A0A1M6MLT4_9FLAO/5-151 AC A0A1M6MLT4.1
#=GS A0A1H2Z3V5_9PSED/99-198 AC A0A1H2Z3V5.1
#=GS A0A7X1P602_9PROT/18-179 AC A0A7X1P602.1
#=GS A0A5Q0EL33_9GAMM/1-164 AC A0A5Q0EL33.1
#=GS A0A369XWX4_9FUSO/6-182 AC A0A369XWX4.1
#=GS A0A0S2K9B9_9GAMM/4-162 AC A0A0S2K9B9.1
#=GS A0A416R2Y6_9FIRM/6-150 AC A0A416R2Y6.1
#=GS A0A4Q3YU79_9RHOB/1-157 AC A0A4Q3YU79.1
#=GS A0A2V5KIF0_9BACL/2-162 AC A0A2V5KIF0.1
#=GS A0A0U2YXT8_9MICC/1-165 AC A0A0U2YXT8.1
#=GS A0A6I7LW52_9BACT/1-175 AC A0A6I7LW52.1
#=GS A0A1Y0GZJ8_9BACT/3-165 AC A0A1Y0GZJ8.1
#=GS A0A089NA13_9BACL/6-173 AC A0A089NA13.1
#=GS A0A2T0UXZ5_9MICO/1-156 AC A0A2T0UXZ5.1
#=GS E3BGI1_9VIBR/1-159 AC E3BGI1.1
#=GS A3VLJ5_9RHOB/13-176 AC A3VLJ5.1
#=GS T0GN38_9SPHN/1-170 AC T0GN38.1
#=GS W9GM28_9MICO/1-165 AC W9GM28.1
#=GS I3ZJB8_TERRK/6-173 AC I3ZJB8.1
#=GS A0A810L9L9_9ACTN/1-163 AC A0A810L9L9.1
#=GS A0A1U7DDK1_9RHOB/18-188 AC A0A1U7DDK1.1
#=GS A0A0Q2XES3_MYCGO/1-165 AC A0A0Q2XES3.1
#=GS A0A2P6MJM7_9BACI/2-131 AC A0A2P6MJM7.1
#=GS A0A1Y4CRC9_9DELT/1-165 AC A0A1Y4CRC9.1
#=GS A0A329YU50_9MICC/2-165 AC A0A329YU50.1
#=GS A0A0D7CKJ4_9ACTN/8-174 AC A0A0D7CKJ4.1
#=GS Q08TK0_STIAD/1-128 AC Q08TK0.1
#=GS A0A850D2J0_9ACTN/1-161 AC A0A850D2J0.1
#=GS A0A421BLA6_9RHOB/11-176 AC A0A421BLA6.1
#=GS A0A7W7CAD9_9PSEU/1-173 AC A0A7W7CAD9.1
#=GS A0A1H0JB36_9HYPH/1-164 AC A0A1H0JB36.1
#=GS A0A1H8U6T4_9PROT/1-164 AC A0A1H8U6T4.1
#=GS F6B750_DESCC/1-113 AC F6B750.1
#=GS A0A6I1QNC3_9CHLR/8-168 AC A0A6I1QNC3.1
#=GS A0A0D8HLS2_9ACTN/1-164 AC A0A0D8HLS2.1
#=GS A0A095WT54_9HYPH/1-165 AC A0A095WT54.1
#=GS L9KL74_TUPCH/707-863 AC L9KL74.1
#=GS A0A395LID6_9SPHN/1-163 AC A0A395LID6.1
#=GS A0A4R6F3Q6_9BURK/1-166 AC A0A4R6F3Q6.1
#=GS A0A8C3H9A1_CHRPI/7-180 AC A0A8C3H9A1.1
#=GS A0A2P7AK91_9HYPH/16-158 AC A0A2P7AK91.1
#=GS Q0ABP9_ALKEH/1-164 AC Q0ABP9.1
#=GS A0A0D1JNB0_9MYCO/1-177 AC A0A0D1JNB0.1
#=GS A0A418YKA2_9GAMM/1-167 AC A0A418YKA2.1
#=GS OAS2_BOVIN/11-159 AC F1N3B8.1
#=GS A0A259TU13_9BACT/2-163 AC A0A259TU13.1
#=GS A0A562VPE8_9DELT/10-173 AC A0A562VPE8.1
#=GS A0A1P8FA80_9CHLR/1-157 AC A0A1P8FA80.1
#=GS A0A159Z2I2_9RHOB/19-181 AC A0A159Z2I2.1
#=GS A0A1X0UMU1_9NOCA/1-166 AC A0A1X0UMU1.1
#=GS A0A1Q3GXU8_9BACT/4-159 AC A0A1Q3GXU8.1
#=GS D9QZI0_LACSW/7-164 AC D9QZI0.1
#=GS A0A2N4UCW1_9BURK/1-163 AC A0A2N4UCW1.1
#=GS A0A109CF45_9BURK/2-166 AC A0A109CF45.1
#=GS A0A238LK90_9RHOB/2-166 AC A0A238LK90.1
#=GS A0A7D3WST1_9BACT/1-161 AC A0A7D3WST1.1
#=GS A0A1Z9YVM8_9GAMM/1-168 AC A0A1Z9YVM8.1
#=GS A0A2G8LFD3_STIJA/9-141 AC A0A2G8LFD3.1
#=GS A0A345HRA1_9ACTN/1-165 AC A0A345HRA1.1
#=GS A0A1T4W7I5_9GAMM/1-169 AC A0A1T4W7I5.1
#=GS A0A1E3L0P4_9BACL/3-154 AC A0A1E3L0P4.1
#=GS A0A1H6M2G9_9GAMM/1-164 AC A0A1H6M2G9.1
#=GS A0A0M9ZQ86_9ACTN/3-165 AC A0A0M9ZQ86.1
#=GS A0A1S1R298_9ACTN/78-237 AC A0A1S1R298.1
#=GS A0A0T5NNJ6_9RHOB/15-176 AC A0A0T5NNJ6.1
#=GS K0IZR5_AMPXN/6-203 AC K0IZR5.1
#=GS A0A2S4XN56_9ACTN/2-161 AC A0A2S4XN56.1
#=GS A0A2V3TS59_9HYPH/4-104 AC A0A2V3TS59.1
#=GS A0A7Y9QXA0_9BURK/5-69 AC A0A7Y9QXA0.1
#=GS A0A8J2TY90_9MICO/1-172 AC A0A8J2TY90.1
#=GS A0A3N4Z538_9MICO/4-165 AC A0A3N4Z538.1
#=GS A0A2V3DME1_9MICC/1-155 AC A0A2V3DME1.1
#=GS A6DSC3_9BACT/1-163 AC A6DSC3.1
#=GS A0A0D7KC58_9BURK/2-166 AC A0A0D7KC58.1
#=GS A0A5E4P424_9HYPH/2-163 AC A0A5E4P424.1
#=GS Q9PA02_XYLFA/1-98 AC Q9PA02.1
#=GS W1DMT1_KLEPN/1-160 AC W1DMT1.1
#=GS A0A0A1YR01_9PSED/1-160 AC A0A0A1YR01.1
#=GS F3NPL5_9ACTN/1-165 AC F3NPL5.1
#=GS I3TV72_TISMK/2-166 AC I3TV72.1
#=GS Q8ZSK4_NOSS1/3-172 AC Q8ZSK4.1
#=GS A0A2W7MJG1_9BACI/1-161 AC A0A2W7MJG1.1
#=GS A0A5J5GBT2_9BACL/1-167 AC A0A5J5GBT2.1
#=GS A0A1I4ABN3_9FIRM/6-189 AC A0A1I4ABN3.1
#=GS I2GU28_9BACT/10-175 AC I2GU28.1
#=GS A0A0M3BSD3_9HYPH/1-160 AC A0A0M3BSD3.1
#=GS A0A8J3QK48_9ACTN/2-157 AC A0A8J3QK48.1
#=GS A0A2C7A8J2_9PROT/2-165 AC A0A2C7A8J2.1
#=GS A0A0B3RFK6_9RHOB/18-188 AC A0A0B3RFK6.1
#=GS A0A271KNT9_9HYPH/1-163 AC A0A271KNT9.1
#=GS A0A161U3V2_9MICO/1-165 AC A0A161U3V2.1
#=GS A0A5R8QH44_9FIRM/2-158 AC A0A5R8QH44.1
#=GS A0A1S1Q861_9ACTN/80-239 AC A0A1S1Q861.1
#=GS A0A2L0WGD3_9HYPH/1-163 AC A0A2L0WGD3.1
#=GS A0A3L8P3N4_9ACTN/1-164 AC A0A3L8P3N4.1
#=GS A0A4V3Z808_9ACTN/74-233 AC A0A4V3Z808.1
#=GS A0A5C6TWC9_9SPHN/2-164 AC A0A5C6TWC9.1
#=GS A0A327NDJ3_9BACT/9-179 AC A0A327NDJ3.1
#=GS H0WPE7_OTOGA/11-159 AC H0WPE7.1
#=GS A0A3A9FMM3_9BACT/1-165 AC A0A3A9FMM3.1
#=GS A0A5C5XF41_9PLAN/12-175 AC A0A5C5XF41.1
#=GS A0A372GKM9_9ACTN/8-157 AC A0A372GKM9.1
#=GS A0A2S7WL66_9FLAO/13-176 AC A0A2S7WL66.1
#=GS A0A1I5PY20_9FIRM/7-189 AC A0A1I5PY20.1
#=GS A0A0A7EHX2_9GAMM/1-166 AC A0A0A7EHX2.1
#=GS A0A290ZMQ6_9RHOO/18-179 AC A0A290ZMQ6.1
#=GS A0A0Q6C8P2_9HYPH/15-164 AC A0A0Q6C8P2.1
#=GS A0A8J3ZQI2_9ACTN/1-158 AC A0A8J3ZQI2.1
#=GS A0A4T2A585_9RHOB/19-181 AC A0A4T2A585.1
#=GS A0A5B8IZ42_9RHOB/29-190 AC A0A5B8IZ42.1
#=GS A0A372K6A7_9BURK/14-190 AC A0A372K6A7.1
#=GS W5TCL0_9NOCA/1-147 AC W5TCL0.1
#=GS A3U001_PSEBH/19-181 AC A3U001.1
#=GS A0A066UED6_9GAMM/1-162 AC A0A066UED6.1
#=GS M0D0R9_HALPD/1-132 AC M0D0R9.1
#=GS A0A1G7V9D5_9RHOO/1-162 AC A0A1G7V9D5.1
#=GS A0A328Z002_9FLAO/87-195 AC A0A328Z002.1
#=GS A0A4Y8RDR2_9HYPH/15-185 AC A0A4Y8RDR2.1
#=GS A0A1Q3GUK3_9BACT/9-176 AC A0A1Q3GUK3.1
#=GS Q6ARQ4_DESPS/1-159 AC Q6ARQ4.1
#=GS A0A1I4H8P9_9RHOB/1-168 AC A0A1I4H8P9.1
#=GS A0A0Q6Z6I8_9BRAD/19-181 AC A0A0Q6Z6I8.1
#=GS A0A0J1DFB3_9BURK/24-186 AC A0A0J1DFB3.1
#=GS A0A074KX99_9BACT/1-164 AC A0A074KX99.1
#=GS A0A420E797_9ALTE/1-159 AC A0A420E797.1
#=GS Q3J4T7_CERS4/1-132 AC Q3J4T7.1
#=GS A0A2A2GPX1_9HELI/1-159 AC A0A2A2GPX1.1
#=GS A0A840RN37_9BURK/1-156 AC A0A840RN37.1
#=GS A0A1B3PHP7_9BURK/1-166 AC A0A1B3PHP7.1
#=GS A0A257L4F0_9BACT/96-196 AC A0A257L4F0.1
#=GS A0A4W2E5R9_BOBOX/11-159 AC A0A4W2E5R9.1
#=GS A0A2S5A602_9FLAO/1-179 AC A0A2S5A602.1
#=GS A0A2S0N362_9BURK/1-161 AC A0A2S0N362.1
#=GS A0A2M6VA11_9BURK/1-161 AC A0A2M6VA11.1
#=GS A0A1X6ZD61_9RHOB/19-181 AC A0A1X6ZD61.1
#=GS A0A4U8Z4H3_METTU/2-165 AC A0A4U8Z4H3.1
#=GS A0A0L1JKH1_9RHOB/19-181 AC A0A0L1JKH1.1
#=GS R9MP45_9FIRM/96-196 AC R9MP45.1
#=GS A0A498R7G6_9FIRM/1-166 AC A0A498R7G6.1
#=GS A0A1I1JF22_9RHOB/15-176 AC A0A1I1JF22.1
#=GS A0A6P5D527_BOSIN/11-164 AC A0A6P5D527.1
#=GS A0A3F2UES9_9HYPH/1-163 AC A0A3F2UES9.1
#=GS A0A5B9D814_9ARCH/3-166 AC A0A5B9D814.1
#=GS A0A7G9BL17_9SPHI/10-175 AC A0A7G9BL17.1
#=GS K6YPG2_9ALTE/1-167 AC K6YPG2.1
#=GS A0A1Z4JPG7_LEPBY/1-164 AC A0A1Z4JPG7.1
#=GS G1TAA7_RABIT/340-498 AC G1TAA7.2
#=GS A8ZTW1_DESOH/15-177 AC A8ZTW1.1
#=GS A0A4S2UQC7_9ACTN/15-179 AC A0A4S2UQC7.1
#=GS A3TSK8_PSEBH/1-165 AC A3TSK8.1
#=GS A0A2N8KEP7_9BURK/2-166 AC A0A2N8KEP7.1
#=GS A0A4R6K4L6_9ACTN/1-161 AC A0A4R6K4L6.1
#=GS A0A6L7F4D8_9ACTN/1-165 AC A0A6L7F4D8.1
#=GS C6XK73_HIRBI/11-186 AC C6XK73.1
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