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Database: Pfam
Entry: SNAPC2
LinkDB: SNAPC2
Original site: SNAPC2 
#=GF ID   SNAPC2
#=GF AC   PF11035.12
#=GF DE   Small nuclear RNA activating complex (SNAPc), subunit 2
#=GF PI   SnAPC_2_like;
#=GF AU   Pollington J;0000-0002-8158-8998
#=GF AU   Finn RD;0000-0001-8626-2148
#=GF SE   PRODOM
#=GF GA   25.50 25.50;
#=GF TC   25.90 25.80;
#=GF NC   25.40 25.40;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 75585367 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Family
#=GF RN   [1]
#=GF RM   8633057
#=GF RT   The SNAP45 subunit of the small nuclear RNA (snRNA) activating
#=GF RT   protein complex is required for RNA polymerase II and III snRNA
#=GF RT   gene transcription and interacts with the TATA box binding
#=GF RT   protein.
#=GF RA   Sadowski CL, Henry RW, Kobayashi R, Hernandez N;
#=GF RL   Proc Natl Acad Sci U S A. 1996;93:4289-4293.
#=GF RN   [2]
#=GF RM   12621023
#=GF RT   The small nuclear RNA-activating protein 190 Myb DNA binding
#=GF RT   domain stimulates TATA box-binding protein-TATA box recognition.
#=GF RA   Hinkley CS, Hirsch HA, Gu L, LaMere B, Henry RW;
#=GF RL   J Biol Chem. 2003;278:18649-18657.
#=GF RN   [3]
#=GF RM   16603380
#=GF RT   Co-expression of multiple subunits enables recombinant SNAPC
#=GF RT   assembly and function for transcription by human RNA polymerases
#=GF RT   II and III. 
#=GF RA   Hanzlowsky A, Jelencic B, Jawdekar G, Hinkley CS, Geiger JH,
#=GF RA   Henry RW; 
#=GF RL   Protein Expr Purif. 2006;48:215-223.
#=GF DR   INTERPRO; IPR021281;
#=GF DR   SO; 0100021; polypeptide_conserved_region;
#=GF CC   This family of proteins is snRNA-activating protein complex
#=GF CC   subunit 2 (SNAPc subunit 2). The SNAPc complex allows the
#=GF CC   transcription of human small nuclear RNA genes to occur by
#=GF CC   recognition of the proximal sequence element, the TATA box [1].
#=GF CC   The family functions both to specifically recognise the proximal
#=GF CC   sequence element present in the core promoters of human snRNA
#=GF CC   genes and to stimulate TBP recognition of the neighbouring TATA
#=GF CC   box present in human U6 snRNA promoters [2,3].
#=GF SQ   406
#=GS S7N195_MYOBR/288-595       AC S7N195.1
#=GS A0A485MX77_LYNPA/60-294    AC A0A485MX77.1
#=GS A0A8J6KRD0_MICOH/3-356     AC A0A8J6KRD0.1
#=GS A0A6P8NY10_GEOSA/1-310     AC A0A6P8NY10.1
#=GS A0A8I3Q680_CANLF/238-359   AC A0A8I3Q680.1
#=GS A0A6J0XYU2_ODOVR/83-373    AC A0A6J0XYU2.1
#=GS A0A8C2VA44_CHILA/3-369     AC A0A8C2VA44.1
#=GS A0A7J7UAN4_PIPKU/3-317     AC A0A7J7UAN4.1
#=GS A0A452S6M9_URSAM/3-329     AC A0A452S6M9.1
#=GS A0A8C4YHV4_9SAUR/3-401     AC A0A8C4YHV4.1
#=GS A0A8C5Y3X4_MICMU/270-389   AC A0A8C5Y3X4.1
#=GS A0A8D2GW67_UROPR/3-321     AC A0A8D2GW67.1
#=GS A0A437CD98_ORYJA/3-405     AC A0A437CD98.1
#=GS A0A6P8TQH8_GYMAC/3-442     AC A0A6P8TQH8.1
#=GS W5NYJ2_SHEEP/1-285         AC W5NYJ2.1
#=GS A0A8D0DYV5_SALMN/94-304    AC A0A8D0DYV5.1
#=GS A0A811ZAG2_NYCPR/3-328     AC A0A811ZAG2.1
#=GS A0A667XRR7_9TELE/3-583     AC A0A667XRR7.1
#=GS A0A3B1J4U5_ASTMX/3-433     AC A0A3B1J4U5.1
#=GS A0A452I276_9SAUR/3-401     AC A0A452I276.1
#=GS A0A674K0A0_TERCA/3-401     AC A0A674K0A0.1
#=GS A0A671XHU3_SPAAU/3-357     AC A0A671XHU3.1
#=GS A0A2U9AW28_SCOMX/3-379     AC A0A2U9AW28.1
#=GS A0A4W6EB41_LATCA/3-267     AC A0A4W6EB41.1
#=GS A0A7M3R703_SPIER/37-201    AC A0A7M3R703.1
#=GS A0A673VNT9_SURSU/3-351     AC A0A673VNT9.1
#=GS A0A485MX77_LYNPA/3-62      AC A0A485MX77.1
#=GS A0A151PHC8_ALLMI/1-166     AC A0A151PHC8.1
#=GS G3N6L3_GASAC/2-147         AC G3N6L3.1
#=GS A0A498MT79_LABRO/3-304     AC A0A498MT79.1
#=GS A0A6I9K5M0_CHRAS/3-312     AC A0A6I9K5M0.1
#=GS G1Q4U5_MYOLU/3-318         AC G1Q4U5.1
#=GS A0A4W4FHE5_ELEEL/3-466     AC A0A4W4FHE5.1
#=GS Q28HR8_XENTR/3-411         AC Q28HR8.1
#=GS A0A8D0DYV5_SALMN/3-96      AC A0A8D0DYV5.1
#=GS A0A8I6SQM1_CIMLE/18-117    AC A0A8I6SQM1.1
#=GS A0A672ZFH7_9TELE/3-511     AC A0A672ZFH7.1
#=GS A0A2Z6S623_9GLOM/101-294   AC A0A2Z6S623.1
#=GS SNPC2_HUMAN/3-334          AC Q13487.1
#=GS A0A1S3GJW3_DIPOR/3-62      AC A0A1S3GJW3.1
#=GS A0A665V9S3_ECHNA/3-526     AC A0A665V9S3.1
#=GS A0A8B9NHX8_9AVES/3-300     AC A0A8B9NHX8.1
#=GS A0A3Q1B9C4_AMPOC/3-305     AC A0A3Q1B9C4.1
#=GS A0A2K5WF91_MACFA/54-342    AC A0A2K5WF91.2
#=GS A0A315UVI9_GAMAF/65-264    AC A0A315UVI9.1
#=GS A0A0L7LCG8_OPEBR/8-109     AC A0A0L7LCG8.1
#=GS A0A4W6E7A3_LATCA/14-373    AC A0A4W6E7A3.1
#=GS A0A8C7BE37_NEOVI/3-338     AC A0A8C7BE37.1
#=GS A0A8C6R4E1_NANGA/11-299    AC A0A8C6R4E1.1
#=GS A0A087Y219_POEFO/3-455     AC A0A087Y219.2
#=GS A0A8C4L7R9_EQUAS/3-352     AC A0A8C4L7R9.1
#=GS A0A673FQ21_9TELE/1-111     AC A0A673FQ21.1
#=GS A0A8V5HBL6_MELUD/3-296     AC A0A8V5HBL6.1
#=GS A0A6J2NCP1_9CHIR/72-393    AC A0A6J2NCP1.2
#=GS A0A4Z2FM69_9TELE/3-538     AC A0A4Z2FM69.1
#=GS A0A8C3WV01_9CETA/3-328     AC A0A8C3WV01.1
#=GS A0A672ZF20_9TELE/42-337    AC A0A672ZF20.1
#=GS A0A3B3B969_ORYME/3-404     AC A0A3B3B969.1
#=GS A0A210QP06_MIZYE/7-191     AC A0A210QP06.1
#=GS A0A8C1AT91_CYPCA/3-407     AC A0A8C1AT91.1
#=GS A0A3P8ZUS0_ESOLU/3-537     AC A0A3P8ZUS0.1
#=GS A0A2K6D964_MACNE/3-331     AC A0A2K6D964.1
#=GS G1TL34_RABIT/106-437       AC G1TL34.3
#=GS A0A8C0QQA7_CHEAB/3-360     AC A0A8C0QQA7.1
#=GS A0A3Q3MHT2_9TELE/3-74      AC A0A3Q3MHT2.1
#=GS A0A8C9K6E5_PANTA/29-307    AC A0A8C9K6E5.1
#=GS A0A8B7THK0_HIPAR/3-322     AC A0A8B7THK0.1
#=GS H0X7W9_OTOGA/3-312         AC H0X7W9.1
#=GS A0A812EKT6_SEPPH/3-119     AC A0A812EKT6.1
#=GS A0A7J7UAI9_PIPKU/3-114     AC A0A7J7UAI9.1
#=GS A0A8C6A693_MARMA/3-321     AC A0A8C6A693.1
#=GS A0A6P8U5X2_GYMAC/3-441     AC A0A6P8U5X2.1
#=GS A0A7J7XKE5_MYOMY/3-320     AC A0A7J7XKE5.1
#=GS G3TPB8_LOXAF/3-337         AC G3TPB8.1
#=GS A0A3Q7NEX1_CALUR/3-331     AC A0A3Q7NEX1.1
#=GS A0A0P7XSG3_SCLFO/39-438    AC A0A0P7XSG3.1
#=GS A0A3P9BSN9_9CICH/3-479     AC A0A3P9BSN9.1
#=GS A0A7J8BVK0_ROUAE/60-261    AC A0A7J8BVK0.1
#=GS A0A8C3G5F1_CYCLU/3-368     AC A0A8C3G5F1.1
#=GS A0A8C5Y3X4_MICMU/3-249     AC A0A8C5Y3X4.1
#=GS Q3T0I6_BOVIN/3-341         AC Q3T0I6.1
#=GS H2SIN9_TAKRU/3-417         AC H2SIN9.3
#=GS H2NXD0_PONAB/3-334         AC H2NXD0.1
#=GS A0A3P8G7I2_9TREM/18-151    AC A0A3P8G7I2.1
#=GS A0A8C0C2S7_BALMU/3-344     AC A0A8C0C2S7.1
#=GS A0A672PPN1_SINGR/1-357     AC A0A672PPN1.1
#=GS A0A5A9PQF0_9TELE/3-455     AC A0A5A9PQF0.1
#=GS A0A8C4EIM9_DICLA/3-543     AC A0A8C4EIM9.1
#=GS G3HRR8_CRIGR/1-252         AC G3HRR8.1
#=GS A0A7K6DGQ7_9PASS/57-227    AC A0A7K6DGQ7.1
#=GS A0A8D0HHD3_SPHPU/374-485   AC A0A8D0HHD3.1
#=GS A0A6J0AL50_VICPA/60-297    AC A0A6J0AL50.1
#=GS A0A2K6N1W6_RHIBE/3-334     AC A0A2K6N1W6.1
#=GS A0A2K5DU29_AOTNA/3-333     AC A0A2K5DU29.1
#=GS A0A2K6S487_SAIBB/1-278     AC A0A2K6S487.1
#=GS F7CZY2_HORSE/124-366       AC F7CZY2.3
#=GS A0A6J1US93_9SAUR/3-337     AC A0A6J1US93.1
#=GS A0A2K6RHD1_RHIRO/3-334     AC A0A2K6RHD1.1
#=GS A0A6J0SVH1_9SAUR/3-335     AC A0A6J0SVH1.1
#=GS A0A1S3JQ74_LINUN/119-353   AC A0A1S3JQ74.1
#=GS A0A8C0J926_CHEAB/3-332     AC A0A8C0J926.1
#=GS A0A8I3QQG8_CANLF/3-328     AC A0A8I3QQG8.1
#=GS A0A2K6S495_SAIBB/3-333     AC A0A2K6S495.1
#=GS A0A7J8ID97_MOLMO/3-324     AC A0A7J8ID97.1
#=GS A0A553MYK9_9TELE/3-364     AC A0A553MYK9.1
#=GS A0A6P9BKT3_PANGU/3-337     AC A0A6P9BKT3.1
#=GS A0A4Z2BQA3_9TELE/3-459     AC A0A4Z2BQA3.1
#=GS G1Q290_MYOLU/3-293         AC G1Q290.1
#=GS A0A6I9XTN7_9SAUR/3-213     AC A0A6I9XTN7.1
#=GS A0A5J5N2X9_MUNRE/3-341     AC A0A5J5N2X9.1
#=GS A0A672PPQ1_SINGR/3-434     AC A0A672PPQ1.1
#=GS A0A8C5MCJ0_9ANUR/39-290    AC A0A8C5MCJ0.1
#=GS A0A5F8AEL3_MACMU/3-333     AC A0A5F8AEL3.1
#=GS A0A2Y9F3D0_PHYMC/3-344     AC A0A2Y9F3D0.1
#=GS A0A8C9YJS8_SANLU/3-333     AC A0A8C9YJS8.1
#=GS G5B4N1_HETGA/3-372         AC G5B4N1.1
#=GS A0A2K6GPL8_PROCO/3-336     AC A0A2K6GPL8.1
#=GS A0A7J7UAD5_PIPKU/1-217     AC A0A7J7UAD5.1
#=GS A0A8C9I6I3_9PRIM/101-311   AC A0A8C9I6I3.1
#=GS A0A4U5VVU6_COLLU/3-391     AC A0A4U5VVU6.1
#=GS A0A5E4CZD0_MARMO/3-321     AC A0A5E4CZD0.1
#=GS A0A8C5K2N5_JACJA/3-110     AC A0A8C5K2N5.1
#=GS A0A8C5K2N5_JACJA/107-245   AC A0A8C5K2N5.1
#=GS A0A852BNU9_9PICI/195-335   AC A0A852BNU9.1
#=GS G1QA63_MYOLU/40-299        AC G1QA63.1
#=GS A0A852HGP9_9PASS/58-106    AC A0A852HGP9.1
#=GS A0A4W5RME2_9TELE/3-622     AC A0A4W5RME2.1
#=GS A0A3Q1F6R3_9TELE/72-266    AC A0A3Q1F6R3.1
#=GS A0A8B8D729_CRAVI/184-383   AC A0A8B8D729.1
#=GS A0A7J8BV54_ROUAE/111-251   AC A0A7J8BV54.1
#=GS H2RHY8_PANTR/3-334         AC H2RHY8.1
#=GS A0A140LID1_MOUSE/3-113     AC A0A140LID1.1
#=GS A0A8C5T0J2_LATLA/3-336     AC A0A8C5T0J2.1
#=GS A0A2B4RS73_STYPI/123-272   AC A0A2B4RS73.1
#=GS A0A8C9I6I3_9PRIM/3-102     AC A0A8C9I6I3.1
#=GS A0A8C6IL55_MUSSI/3-359     AC A0A8C6IL55.1
#=GS A0A2T7P2Y1_POMCA/127-356   AC A0A2T7P2Y1.1
#=GS A0A2U3XR46_LEPWE/3-331     AC A0A2U3XR46.1
#=GS A0A3P8SUK1_AMPPE/3-496     AC A0A3P8SUK1.1
#=GS A0A3Q3MHT2_9TELE/72-436    AC A0A3Q3MHT2.1
#=GS A0A8C6CHJ4_MOSMO/9-92      AC A0A8C6CHJ4.1
#=GS F7IN07_CALJA/3-333         AC F7IN07.4
#=GS A0A8C5K0N5_JACJA/3-343     AC A0A8C5K0N5.1
#=GS A0A8D2FYQ3_THEGE/3-326     AC A0A8D2FYQ3.1
#=GS A0A1A6GFS7_NEOLE/3-356     AC A0A1A6GFS7.1
#=GS A0A7J8BVS6_ROUAE/3-276     AC A0A7J8BVS6.1
#=GS K7GCW4_PELSI/3-343         AC K7GCW4.1
#=GS A0A673YQ98_SALTR/3-495     AC A0A673YQ98.1
#=GS A0A7J8BUT5_ROUAE/1-221     AC A0A7J8BUT5.1
#=GS A0A8C7WXD6_9TELE/3-86      AC A0A8C7WXD6.1
#=GS A0A654HMV5_9CEST/55-179    AC A0A654HMV5.1
#=GS A0A7J8IC70_MOLMO/1-221     AC A0A7J8IC70.1
#=GS A0A7J6B2D1_AMEME/26-490    AC A0A7J6B2D1.1
#=GS A0A8W8KU08_CRAGI/163-370   AC A0A8W8KU08.1
#=GS A0A8J1MHE5_XENLA/3-409     AC A0A8J1MHE5.1
#=GS A0A8I6SEK0_CIMLE/18-117    AC A0A8I6SEK0.1
#=GS A0A7J7XKM2_MYOMY/3-313     AC A0A7J7XKM2.1
#=GS A0A6J1WCL3_GALME/2-101     AC A0A6J1WCL3.1
#=GS A0A8B8CY63_CRAVI/170-369   AC A0A8B8CY63.1
#=GS A0A2K5MQP5_CERAT/9-292     AC A0A2K5MQP5.1
#=GS A0A6P7WP16_9AMPH/3-390     AC A0A6P7WP16.1
#=GS A0A8C6EDW5_MICMU/3-357     AC A0A8C6EDW5.1
#=GS A0A3Q1F6R3_9TELE/3-75      AC A0A3Q1F6R3.1
#=GS A0A3Q3MQ25_9TELE/8-364     AC A0A3Q3MQ25.2
#=GS A0A2K5RVU4_CEBIM/3-333     AC A0A2K5RVU4.1
#=GS A0A8C3F948_CHRPI/3-401     AC A0A8C3F948.1
#=GS A0A3Q7NE18_CALUR/3-62      AC A0A3Q7NE18.1
#=GS I3MCY0_ICTTR/3-321         AC I3MCY0.1
#=GS G1PNH8_MYOLU/40-285        AC G1PNH8.1
#=GS A0A5N3X7P9_MUNRE/2-51      AC A0A5N3X7P9.1
#=GS A0A6P6PQ13_CARAU/3-422     AC A0A6P6PQ13.1
#=GS A0A4E0RDS5_FASHE/93-209    AC A0A4E0RDS5.1
#=GS M3Y9E5_MUSPF/3-337         AC M3Y9E5.1
#=GS A0A212D251_CEREH/708-1046  AC A0A212D251.1
#=GS A0A8B9YA98_BOSMU/3-341     AC A0A8B9YA98.1
#=GS A7RYD0_NEMVE/425-580       AC A7RYD0.1
#=GS A0A8J6EJE4_ELECQ/2-240     AC A0A8J6EJE4.1
#=GS A0A6J1URX2_9SAUR/3-337     AC A0A6J1URX2.1
#=GS M0QXY9_HUMAN/1-224         AC M0QXY9.1
#=GS A0A7J8BV54_ROUAE/3-116     AC A0A7J8BV54.1
#=GS A0A3P8SSY5_AMPPE/3-296     AC A0A3P8SSY5.1
#=GS A0A3Q1HJA9_ANATE/3-545     AC A0A3Q1HJA9.1
#=GS A0A8B8D742_CRAVI/170-369   AC A0A8B8D742.1
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