#=GF ID Sde2_N_Ubi
#=GF AC PF13019.10
#=GF DE Silencing defective 2 N-terminal ubiquitin domain
#=GF PI Ubiquitin-like; Telomere_Sde2;
#=GF AU Wood V;0000-0001-6330-7526
#=GF AU Coggill P;0000-0001-5731-1588
#=GF AU El-Gebali S;0000-0003-1378-5495
#=GF SE Pfam-B_2457 (release 24.0)
#=GF GA 26.40 16.00;
#=GF TC 26.40 17.10;
#=GF NC 26.30 15.90;
#=GF BM hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM hmmsearch --cpu 4 -Z 75585367 -E 1000 HMM pfamseq
#=GF TP Domain
#=GF CL CL0072
#=GF RN [1]
#=GF RM 28947618
#=GF RT Sde2 is an intron-specific pre-mRNA splicing regulator activated
#=GF RT by ubiquitin-like processing.
#=GF RA Thakran P, Pandit PA, Datta S, Kolathur KK, Pleiss JA, Mishra
#=GF RA SK;
#=GF RL EMBO J. 2018;37:89-101.
#=GF DR INTERPRO; IPR024974;
#=GF DR SO; 0000417; polypeptide_domain;
#=GF CC Sde2 (silencing defective 2) is a ubiquitin-fold-containing
#=GF CC splicing regulator that supports splicing of selected pre-mRNAs
#=GF CC in an intron-specific manner in Schizosaccharomyces pombe. Both
#=GF CC fission yeast and human Sde2 are translated as inactive
#=GF CC precursor proteins harbouring the ubiquitin-fold domain linked
#=GF CC through an invariant GGKGG motif to a C-terminal domain. The
#=GF CC Sde2 protein has a ubiquitin-fold at its N-terminus, which must
#=GF CC be cleaved by the ubiquitin-specific proteases (USPs) Ubp5 and
#=GF CC Ubp15. After cleavage, the C-terminal domain of Sde2, which
#=GF CC starts with a lysine, gets incorporated into the spliceosome
#=GF CC [1]. This entry represents the ubiquitin fold N-terminal domain
#=GF CC found in Sde2 proteins.
#=GF SQ 2109
#=GS A0A8C6RYG5_NANGA/29-147 AC A0A8C6RYG5.1
#=GS C4R4X5_KOMPG/3-109 AC C4R4X5.1
#=GS A0A1S4A1Z1_TOBAC/10-192 AC A0A1S4A1Z1.1
#=GS A0A7M3Q6K9_SPIER/118-209 AC A0A7M3Q6K9.1
#=GS A0A8B9WLD5_BOSMU/8-121 AC A0A8B9WLD5.1
#=GS A0A428T937_9HYPO/1-63 AC A0A428T937.1
#=GS A0A852N0Q8_9PASS/6-108 AC A0A852N0Q8.1
#=GS A0A6P7GZV8_DIAVI/7-95 AC A0A6P7GZV8.1
#=GS B8NZC7_POSPM/1-158 AC B8NZC7.1
#=GS A0A8J2HXL7_9PLEO/9-167 AC A0A8J2HXL7.1
#=GS A0A1L8G6M9_XENLA/32-144 AC A0A1L8G6M9.1
#=GS A0A7J6TLC8_PEROL/55-170 AC A0A7J6TLC8.1
#=GS G2RHS4_THETT/6-147 AC G2RHS4.1
#=GS A0A453FD24_AEGTS/7-183 AC A0A453FD24.1
#=GS A0A443SKR4_9ACAR/37-151 AC A0A443SKR4.1
#=GS A0A5J4ZQL5_9ASTE/5-183 AC A0A5J4ZQL5.1
#=GS A0A7L3IZ56_THACH/42-162 AC A0A7L3IZ56.1
#=GS A0A8C4UU32_FALTI/48-145 AC A0A8C4UU32.1
#=GS A0A1Y1ULT1_9TREE/4-156 AC A0A1Y1ULT1.1
#=GS A0A8D2LM40_VARKO/57-167 AC A0A8D2LM40.1
#=GS G5EC45_CAEEL/135-239 AC G5EC45.1
#=GS W4GHS0_APHAT/32-149 AC W4GHS0.1
#=GS A0A6I9U2B5_SESIN/85-209 AC A0A6I9U2B5.1
#=GS E3RJ49_PYRTT/9-167 AC E3RJ49.1
#=GS A0A7K6K7Q0_9PASE/28-143 AC A0A7K6K7Q0.1
#=GS A0A261CH41_9PELO/138-247 AC A0A261CH41.1
#=GS A0A433P6E6_9FUNG/5-155 AC A0A433P6E6.1
#=GS A0A7D8VDR8_9TREE/1-60 AC A0A7D8VDR8.1
#=GS A0A2S7PTX8_9HELO/6-169 AC A0A2S7PTX8.1
#=GS A0A5E3WZP3_9AGAM/3-163 AC A0A5E3WZP3.1
#=GS A0A7L3YV89_FREGA/46-145 AC A0A7L3YV89.1
#=GS C5LV54_PERM5/53-168 AC C5LV54.1
#=GS A2DDH6_TRIV3/19-143 AC A2DDH6.1
#=GS A0A1R3KNE9_9ROSI/17-187 AC A0A1R3KNE9.1
#=GS A0A7K4JFD1_GEOCA/17-109 AC A0A7K4JFD1.1
#=GS A0A0E0JMH1_ORYPU/7-183 AC A0A0E0JMH1.1
#=GS A0A6J1PP89_9HYME/46-140 AC A0A6J1PP89.1
#=GS A0A850W229_FREMA/14-109 AC A0A850W229.1
#=GS A0A8J4ZZ52_9CHEL/9-141 AC A0A8J4ZZ52.1
#=GS A0A2I0M539_COLLI/15-136 AC A0A2I0M539.1
#=GS A0A1E3BPM5_ASPCR/5-175 AC A0A1E3BPM5.1
#=GS A0A819JUC3_9BILA/793-893 AC A0A819JUC3.1
#=GS A0A5D6YA50_9STRA/9-139 AC A0A5D6YA50.1
#=GS A0A2T4BDW6_9HYPO/5-169 AC A0A2T4BDW6.1
#=GS A0A8B7V8F1_CASCN/24-148 AC A0A8B7V8F1.1
#=GS W5Q8U6_SHEEP/41-148 AC W5Q8U6.1
#=GS M2SPH3_COCSN/9-167 AC M2SPH3.1
#=GS A0CX15_PARTE/42-217 AC A0CX15.1
#=GS A0A436ZTV8_9PEZI/4-166 AC A0A436ZTV8.1
#=GS A0A183XEF1_WUCBA/16-118 AC A0A183XEF1.1
#=GS A0A851IYM2_9PASS/7-108 AC A0A851IYM2.1
#=GS X0CTI4_FUSOX/6-168 AC X0CTI4.1
#=GS A0A6I9U145_SESIN/9-212 AC A0A6I9U145.1
#=GS A0A670HWK9_PODMU/40-152 AC A0A670HWK9.1
#=GS A0A833R680_9POAL/4-178 AC A0A833R680.1
#=GS A0A316W471_9BASI/32-189 AC A0A316W471.1
#=GS A0A4U0UPC7_9PEZI/32-192 AC A0A4U0UPC7.1
#=GS A0A6P6M5X0_CARAU/4-141 AC A0A6P6M5X0.1
#=GS A0A812PFB1_9DINO/32-173 AC A0A812PFB1.1
#=GS A0A8H5ZUX6_ASPBU/6-175 AC A0A8H5ZUX6.1
#=GS A0A4U6UIG6_SETVI/7-184 AC A0A4U6UIG6.1
#=GS A0A7K6P7G2_9CORV/7-108 AC A0A7K6P7G2.1
#=GS A0A7K9UGV5_9AVES/14-126 AC A0A7K9UGV5.1
#=GS A0A074ZNV9_9TREM/11-124 AC A0A074ZNV9.1
#=GS A0A7K5QJ29_9PASE/8-108 AC A0A7K5QJ29.1
#=GS A0A7K7T4G1_9TYRA/41-144 AC A0A7K7T4G1.1
#=GS A0A7L2GX22_NYCGR/40-165 AC A0A7L2GX22.1
#=GS A0A4V1J1R2_9FUNG/5-117 AC A0A4V1J1R2.1
#=GS A0A1L9PMD0_ASPVE/5-174 AC A0A1L9PMD0.1
#=GS A0A0A2VQG5_BEABA/6-168 AC A0A0A2VQG5.1
#=GS A0A2U1QFR8_ARTAN/4-183 AC A0A2U1QFR8.1
#=GS A0A0N4WER6_HAEPC/342-449 AC A0A0N4WER6.1
#=GS A0A8C5E789_9TELE/9-149 AC A0A8C5E789.1
#=GS A0A8J4KU05_EUDCH/1-70 AC A0A8J4KU05.1
#=GS A0A5C3DRZ6_9BASI/2-158 AC A0A5C3DRZ6.1
#=GS A0A1U8IVY2_GOSHI/21-191 AC A0A1U8IVY2.1
#=GS A0A8C4N6Q1_EPTBU/518-599 AC A0A8C4N6Q1.1
#=GS A0A6P6B0K6_DURZI/19-189 AC A0A6P6B0K6.1
#=GS A0A3Q7TCW7_VULVU/1-65 AC A0A3Q7TCW7.1
#=GS A0A7K8UAP7_OCEOC/46-145 AC A0A7K8UAP7.1
#=GS G3Q8W9_GASAC/1-66 AC G3Q8W9.1
#=GS T1EGK9_HELRO/42-145 AC T1EGK9.1
#=GS A0A2C9VSP4_MANES/8-179 AC A0A2C9VSP4.1
#=GS A0A4V4M317_WALIC/12-137 AC A0A4V4M317.1
#=GS A0A087GLC4_ARAAL/9-183 AC A0A087GLC4.1
#=GS A0A091KE99_COLST/9-104 AC A0A091KE99.1
#=GS U3J0K3_ANAPP/29-146 AC U3J0K3.2
#=GS A0A2S4V0Q3_9BASI/6-168 AC A0A2S4V0Q3.1
#=GS A0A090MAA5_OSTTA/5-165 AC A0A090MAA5.1
#=GS A0A284QU47_ARMOS/3-156 AC A0A284QU47.1
#=GS A0A6A1W331_9ROSI/12-187 AC A0A6A1W331.1
#=GS A0A5N5K4C8_PANHP/70-161 AC A0A5N5K4C8.1
#=GS A0A2T9YLD3_9FUNG/4-159 AC A0A2T9YLD3.1
#=GS A0A507QXK0_MONPU/6-176 AC A0A507QXK0.1
#=GS A0A0L0CJ70_LUCCU/4-137 AC A0A0L0CJ70.1
#=GS A0A6J1A047_9ROSI/21-190 AC A0A6J1A047.1
#=GS A0A7S8E3C1_FUSPS/6-168 AC A0A7S8E3C1.1
#=GS A0A8H7G4S4_9AGAM/3-159 AC A0A8H7G4S4.1
#=GS W9VG12_9EURO/5-178 AC W9VG12.1
#=GS A0A5C3M8P4_9AGAR/14-175 AC A0A5C3M8P4.1
#=GS A0A232EWK3_9HYME/46-143 AC A0A232EWK3.1
#=GS A0A433PKZ6_9FUNG/5-158 AC A0A433PKZ6.1
#=GS A0A8H4FEM9_COLGL/6-168 AC A0A8H4FEM9.1
#=GS A0A850X2P2_PIACA/50-145 AC A0A850X2P2.1
#=GS A0A8B9F004_9PSIT/29-147 AC A0A8B9F004.1
#=GS A9SUP6_PHYPA/8-173 AC A9SUP6.1
#=GS A0A836FZ57_9HYME/7-140 AC A0A836FZ57.1
#=GS A0A7L2ZEF8_9PASE/8-108 AC A0A7L2ZEF8.1
#=GS B4G435_DROPE/27-177 AC B4G435.1
#=GS A0A6J2T905_DROLE/23-140 AC A0A6J2T905.1
#=GS E0W069_PEDHC/39-136 AC E0W069.1
#=GS A0A5E4QVQ2_9NEOP/16-139 AC A0A5E4QVQ2.1
#=GS A0A1B9GHV7_9TREE/4-158 AC A0A1B9GHV7.1
#=GS A0A7K4T083_9CHAR/1-71 AC A0A7K4T083.1
#=GS A0A8H7UIR6_9FUNG/10-163 AC A0A8H7UIR6.1
#=GS A0A8H7P580_9APHY/3-161 AC A0A8H7P580.1
#=GS A0A5N5Q216_9PEZI/6-169 AC A0A5N5Q216.1
#=GS H2MZH8_ORYLA/7-125 AC H2MZH8.2
#=GS A0A2P6NH18_9EUKA/108-272 AC A0A2P6NH18.1
#=GS A0A8H8JJ73_9AGAM/4-157 AC A0A8H8JJ73.1
#=GS C5FL14_ARTOC/6-180 AC C5FL14.1
#=GS A0A6P9CHJ1_PANGU/58-161 AC A0A6P9CHJ1.1
#=GS A0A0F8XJ62_9EURO/6-175 AC A0A0F8XJ62.1
#=GS A0A0R3QKH5_9BILA/20-118 AC A0A0R3QKH5.1
#=GS A0A100IPZ3_ASPNG/6-175 AC A0A100IPZ3.1
#=GS A0A7L3L0H1_9CHAR/17-109 AC A0A7L3L0H1.1
#=GS A0A1B6Q5C6_SORBI/7-184 AC A0A1B6Q5C6.1
#=GS A0A3P9CDN3_9CICH/73-143 AC A0A3P9CDN3.1
#=GS I4Y5Q4_WALMC/1-106 AC I4Y5Q4.1
#=GS A0A4Z1IIM3_9HELO/8-171 AC A0A4Z1IIM3.1
#=GS A0A6P8AUK1_MAGGR/5-167 AC A0A6P8AUK1.1
#=GS A0A7K8L262_9GRUI/15-109 AC A0A7K8L262.1
#=GS A0A8B9VEF3_9AVES/29-146 AC A0A8B9VEF3.1
#=GS A0A8H6STZ4_9AGAR/2-154 AC A0A8H6STZ4.1
#=GS A0A5M6C3H3_9TREE/4-155 AC A0A5M6C3H3.1
#=GS A0A7K7XPE6_9PASS/10-108 AC A0A7K7XPE6.1
#=GS A0A507FSZ2_9FUNG/5-96 AC A0A507FSZ2.1
#=GS A0A284RJ95_ARMOS/3-93 AC A0A284RJ95.1
#=GS A0A8X7SYL3_9BASI/7-177 AC A0A8X7SYL3.1
#=GS A0A7K6WT40_STECA/15-109 AC A0A7K6WT40.1
#=GS A0A3P8X4F8_CYNSE/47-142 AC A0A3P8X4F8.1
#=GS A0A1M8ABC4_MALS4/21-175 AC A0A1M8ABC4.1
#=GS Q6C0I7_YARLI/3-154 AC Q6C0I7.1
#=GS A0A662WT90_9STRA/11-147 AC A0A662WT90.1
#=GS A0A851Q6C9_ANHAN/18-109 AC A0A851Q6C9.1
#=GS T5A914_OPHSC/6-168 AC T5A914.1
#=GS A0A6J1T1Y4_FRAOC/50-146 AC A0A6J1T1Y4.1
#=GS A0A5J4Z637_PORPP/50-126 AC A0A5J4Z637.1
#=GS A0A091NUS3_APAVI/9-120 AC A0A091NUS3.1
#=GS SDE2_MOUSE/33-148 AC Q8K1J5.1
#=GS A0A7K5HF71_CROSL/35-144 AC A0A7K5HF71.1
#=GS A0A165PXI5_EXIGL/3-153 AC A0A165PXI5.1
#=GS A0A165YSF0_9AGAM/3-166 AC A0A165YSF0.1
#=GS A0A830CGU5_9LAMI/9-156 AC A0A830CGU5.1
#=GS A0A1B8EU38_9PEZI/6-169 AC A0A1B8EU38.1
#=GS A0A7K6HSD9_9PASS/26-142 AC A0A7K6HSD9.1
#=GS A0A6A6Y4G1_9PEZI/1-165 AC A0A6A6Y4G1.1
#=GS A0A6P5D5R5_BOSIN/47-148 AC A0A6P5D5R5.1
#=GS C1N150_MICPC/2-185 AC C1N150.1
#=GS A0A8C8WSB0_PANLE/42-147 AC A0A8C8WSB0.1
#=GS A0A397V0Y4_9GLOM/25-179 AC A0A397V0Y4.1
#=GS A0A0D1Z055_9PEZI/6-168 AC A0A0D1Z055.1
#=GS A0A6J2YLS0_SITOR/17-138 AC A0A6J2YLS0.1
#=GS SDE2_DANRE/9-141 AC Q7T293.2
#=GS A0A8H5M603_9AGAR/7-171 AC A0A8H5M603.1
#=GS A0A4P9XP72_9FUNG/3-159 AC A0A4P9XP72.1
#=GS A0A061H1F5_9BASI/31-193 AC A0A061H1F5.1
#=GS H0EK07_GLAL7/1-64 AC H0EK07.1
#=GS A0A8H5LJA7_9AGAR/7-165 AC A0A8H5LJA7.1
#=GS A0A3N4ILN0_ASCIM/5-166 AC A0A3N4ILN0.1
#=GS A0A8B9WHZ0_BOSMU/47-148 AC A0A8B9WHZ0.1
#=GS A0A452HWP3_9SAUR/42-162 AC A0A452HWP3.1
#=GS A0A674HHK3_TAEGU/28-183 AC A0A674HHK3.1
#=GS A0A1Y2M2I2_EPING/9-168 AC A0A1Y2M2I2.1
#=GS A0A4V3WL43_CAMSI/54-120 AC A0A4V3WL43.1
#=GS F8PYV3_SERL3/3-161 AC F8PYV3.1
#=GS A0A3Q3X0A7_MOLML/46-141 AC A0A3Q3X0A7.1
#=GS S4RR83_PETMA/31-143 AC S4RR83.1
#=GS A0A2J6JN40_LACSA/9-160 AC A0A2J6JN40.1
#=GS A0A851FAT2_PITSO/8-108 AC A0A851FAT2.1
#=GS A0A4S4LW22_9APHY/3-78 AC A0A4S4LW22.1
#=GS A0A090LE25_STRRB/914-1016 AC A0A090LE25.1
#=GS A0A319CM92_9EURO/6-177 AC A0A319CM92.1
#=GS A0A016RYX7_9BILA/4-128 AC A0A016RYX7.1
#=GS C6KSN0_PLAF7/364-475 AC C6KSN0.1
#=GS A0A8B9DDW5_ANSCY/2-112 AC A0A8B9DDW5.1
#=GS A0A5J4ZEE2_9ASTE/4-182 AC A0A5J4ZEE2.1
#=GS A0A0N5D3D5_THECL/4-117 AC A0A0N5D3D5.1
#=GS A0A5D2TW38_GOSMU/21-191 AC A0A5D2TW38.1
#=GS V4ZVA7_TOXGV/251-420 AC V4ZVA7.1
#=GS A0A1V2L6Z4_CYBFA/6-171 AC A0A1V2L6Z4.1
#=GS A0A8E2E0X7_9PEZI/5-169 AC A0A8E2E0X7.1
#=GS A0A4Y7TKS6_9AGAR/3-163 AC A0A4Y7TKS6.1
#=GS A0A8H4PXI7_9HYPO/6-168 AC A0A8H4PXI7.1
#=GS I3MJE6_ICTTR/67-166 AC I3MJE6.2
#=GS A0A8H6R3C9_9PEZI/8-172 AC A0A8H6R3C9.1
#=GS A0A0J0XTW4_9TREE/2-142 AC A0A0J0XTW4.1
#=GS A0A8C5U350_9PASS/21-149 AC A0A8C5U350.1
#=GS A0A5A8CE22_CAFRO/23-154 AC A0A5A8CE22.1
#=GS A0A091JFP4_EGRGA/8-103 AC A0A091JFP4.1
#=GS A0A6I9LAT8_PERMB/54-149 AC A0A6I9LAT8.1
#=GS A0A7J7AAN6_9COLE/9-139 AC A0A7J7AAN6.1
#=GS A0A7K7B7S4_9AVES/42-145 AC A0A7K7B7S4.1
#=GS A0A1V6S5K2_9EURO/6-174 AC A0A1V6S5K2.1
#=GS A0A409WQ88_9AGAR/3-162 AC A0A409WQ88.1
#=GS A0A6J1V3R3_9SAUR/61-161 AC A0A6J1V3R3.1
#=GS A0A6J8B9F3_MYTCO/14-133 AC A0A6J8B9F3.1
#=GS G7NTV7_MACFA/37-149 AC G7NTV7.2
#=GS A0A2K5DJB3_AOTNA/50-149 AC A0A2K5DJB3.1
#=GS A0A238BU63_9BILA/25-119 AC A0A238BU63.1
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