#=GF ID TAF1C_HB
#=GF AC PF20642.1
#=GF DE TAF1C, helical bundle domain
#=GF AU Chuguransky S;0000-0002-0520-0736
#=GF SE Manual
#=GF GA 24.80 24.80;
#=GF TC 24.80 24.90;
#=GF NC 24.50 24.50;
#=GF BM hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM hmmsearch -E 1000 --cpu 4 -Z 75585367 HMM pfamseq
#=GF TP Domain
#=GF RN [1]
#=GF RM 28340337
#=GF RT Structural Basis of RNA Polymerase I Transcription Initiation.
#=GF RA Engel C, Gubbey T, Neyer S, Sainsbury S, Oberthuer C, Baejen C,
#=GF RA Bernecky C, Cramer P;
#=GF RL Cell. 2017;169:120-131.
#=GF RN [2]
#=GF RM 28623663
#=GF RT Structural mechanism of ATP-independent transcription initiation
#=GF RT by RNA polymerase I.
#=GF RA Han Y, Yan C, Nguyen THD, Jackobel AJ, Ivanov I, Knutson BA, He
#=GF RA Y;
#=GF RL Elife. 2017; [Epub ahead of print]
#=GF RN [3]
#=GF RM 15970593
#=GF RT TBP-TAF complex SL1 directs RNA polymerase I pre-initiation
#=GF RT complex formation and stabilizes upstream binding factor at the
#=GF RT rDNA promoter.
#=GF RA Friedrich JK, Panov KI, Cabart P, Russell J, Zomerdijk JC;
#=GF RL J Biol Chem. 2005;280:29551-29558.
#=GF DR SO; 0000417; polypeptide_domain;
#=GF CC This is the helical bundle domain (also referred to as the
#=GF CC headlock domain) of TATA box-binding protein-associated factor
#=GF CC RNA polymerase I subunit C (TAF1C) from animals, the orthologue
#=GF CC of yeast Rrn6 [1,2]. TAF1C is a component of the transcription
#=GF CC factor SL1/TIF-IB complex, which is involved in the assembly of
#=GF CC the PIC (preinitiation complex) during RNA polymerase
#=GF CC I-dependent transcription [3].
#=GF SQ 684
#=GS A0A6P7X816_9AMPH/540-636 AC A0A6P7X816.1
#=GS A0A7L1D4L1_9PASS/539-755 AC A0A7L1D4L1.1
#=GS A0A8B9MQI8_9AVES/776-1064 AC A0A8B9MQI8.1
#=GS A0A673G403_9TELE/520-813 AC A0A673G403.1
#=GS A0A7J7SE73_MYOMY/330-530 AC A0A7J7SE73.1
#=GS A0A3P8TWB7_AMPPE/525-712 AC A0A3P8TWB7.1
#=GS A0A8C5Y481_MICMU/597-804 AC A0A8C5Y481.1
#=GS A0A2I0TXM1_LIMLA/460-740 AC A0A2I0TXM1.1
#=GS A0A7K6I7W4_9PASS/542-769 AC A0A7K6I7W4.1
#=GS A0A7L2A0C4_LEILU/542-769 AC A0A7L2A0C4.1
#=GS A0A7K8BYM5_9CORV/534-761 AC A0A7K8BYM5.1
#=GS A0A7K8GM84_ORTSP/542-769 AC A0A7K8GM84.1
#=GS L8H4N8_ACACA/562-700 AC L8H4N8.1
#=GS A0A7L2XA99_9PASS/479-692 AC A0A7L2XA99.1
#=GS A0A671QLB5_9TELE/520-807 AC A0A671QLB5.1
#=GS A0A484CEJ0_PERFV/685-886 AC A0A484CEJ0.1
#=GS A0A7K7G9J6_ERIRU/540-766 AC A0A7K7G9J6.1
#=GS A0A6J1VL75_9SAUR/520-748 AC A0A6J1VL75.1
#=GS A0A7K7Y6M9_THRLU/542-769 AC A0A7K7Y6M9.1
#=GS A0A7L3QX55_9SYLV/541-761 AC A0A7L3QX55.1
#=GS A0A7K4U195_9SYLV/519-746 AC A0A7K4U195.1
#=GS A0A6P8IWM5_ACTTE/466-575 AC A0A6P8IWM5.1
#=GS A0A2Y9K1N7_ENHLU/529-723 AC A0A2Y9K1N7.1
#=GS A0A7L0PCY6_9AVES/582-644 AC A0A7L0PCY6.1
#=GS A0A455AC67_PHYMC/146-340 AC A0A455AC67.1
#=GS A0A7K7QPW9_POEAT/564-784 AC A0A7K7QPW9.1
#=GS A0A2K5F382_AOTNA/529-739 AC A0A2K5F382.1
#=GS A0A7L2R490_9PASS/541-764 AC A0A7L2R490.1
#=GS A0A3Q1BHI2_AMPOC/387-464 AC A0A3Q1BHI2.1
#=GS A0A8C3WFJ7_9CETA/529-723 AC A0A8C3WFJ7.1
#=GS A0A7K6UND7_9AVES/490-551 AC A0A7K6UND7.1
#=GS A0A340WSV8_LIPVE/529-714 AC A0A340WSV8.1
#=GS A0A6J2AS21_ACIJB/529-723 AC A0A6J2AS21.1
#=GS A0A850UU56_9CORV/539-759 AC A0A850UU56.1
#=GS G1RJJ1_NOMLE/658-696 AC G1RJJ1.3
#=GS A0A6P9E394_PANGU/520-749 AC A0A6P9E394.1
#=GS A0A6P7JBU7_9TELE/664-885 AC A0A6P7JBU7.1
#=GS A0A671UXB7_SPAAU/528-625 AC A0A671UXB7.1
#=GS A0A7J6BV76_9TELE/520-813 AC A0A7J6BV76.1
#=GS A0A3Q1CKG0_AMPOC/394-581 AC A0A3Q1CKG0.1
#=GS A0A2Y9P5X5_DELLE/524-718 AC A0A2Y9P5X5.1
#=GS A0A4W5KY50_9TELE/528-629 AC A0A4W5KY50.1
#=GS A0A667Z1J4_9TELE/533-690 AC A0A667Z1J4.1
#=GS A0A437CRE4_ORYJA/537-676 AC A0A437CRE4.1
#=GS A0A7L4C9C2_9AVES/539-754 AC A0A7L4C9C2.1
#=GS A0A3P9B329_9CICH/527-878 AC A0A3P9B329.1
#=GS A0A6J3ECK2_AYTFU/538-819 AC A0A6J3ECK2.1
#=GS A0A6J0AMP5_VICPA/555-749 AC A0A6J0AMP5.1
#=GS A0A6P8PXG5_GEOSA/1018-1244 AC A0A6P8PXG5.1
#=GS A0A6J0AL94_VICPA/529-723 AC A0A6J0AL94.1
#=GS A0A8B9PYJ7_APTOW/381-668 AC A0A8B9PYJ7.1
#=GS A0A3P8UQ04_CYNSE/557-782 AC A0A3P8UQ04.1
#=GS A0A6J3IDK9_SAPAP/529-739 AC A0A6J3IDK9.1
#=GS A0A7L3Z6S0_FREGA/540-783 AC A0A7L3Z6S0.1
#=GS A0A3P8YIR0_ESOLU/524-725 AC A0A3P8YIR0.1
#=GS A0A6I8N117_ORNAN/466-681 AC A0A6I8N117.1
#=GS A0A3M0KTS5_HIRRU/396-489 AC A0A3M0KTS5.1
#=GS A0A2P4SBR3_BAMTH/519-797 AC A0A2P4SBR3.1
#=GS A0A7K7PQC8_ACRAR/569-795 AC A0A7K7PQC8.1
#=GS A0A7L3BLW1_PELUR/552-776 AC A0A7L3BLW1.1
#=GS H2QBM1_PANTR/555-764 AC H2QBM1.2
#=GS A0A5C6NIH3_9TELE/516-816 AC A0A5C6NIH3.1
#=GS A0A6P6J243_CARAU/686-812 AC A0A6P6J243.1
#=GS A0A2K5RCS6_CEBIM/529-739 AC A0A2K5RCS6.1
#=GS A0A8C7D134_ONCKI/647-840 AC A0A8C7D134.1
#=GS A0A7K6ACQ9_ONYCO/570-801 AC A0A7K6ACQ9.1
#=GS A0A8C5WRZ0_LATLA/239-467 AC A0A8C5WRZ0.1
#=GS A0A553QYE9_9TELE/334-613 AC A0A553QYE9.1
#=GS A0A7K5YZM3_9AVES/513-757 AC A0A7K5YZM3.1
#=GS A0A3P9B385_9CICH/437-639 AC A0A3P9B385.1
#=GS G3GRX9_CRIGR/533-744 AC G3GRX9.1
#=GS A0A6P9DZ69_PANGU/496-725 AC A0A6P9DZ69.1
#=GS A0A7L1MX29_RHICY/538-754 AC A0A7L1MX29.1
#=GS A0A8B7JCK3_9AVES/496-688 AC A0A8B7JCK3.1
#=GS A0A672PPB1_SINGR/520-630 AC A0A672PPB1.1
#=GS A0A3Q7N8J0_CALUR/528-722 AC A0A3Q7N8J0.1
#=GS A0A6J2UTG2_CHACN/516-817 AC A0A6J2UTG2.1
#=GS A0A669QB93_PHACC/435-715 AC A0A669QB93.1
#=GS A0A7K7I9C1_LOXCU/540-766 AC A0A7K7I9C1.1
#=GS A0A7L1GE37_9PICI/490-704 AC A0A7L1GE37.1
#=GS A0A7L4N8K8_9AVES/587-811 AC A0A7L4N8K8.1
#=GS A0A3Q7SUX5_VULVU/554-748 AC A0A3Q7SUX5.1
#=GS A0A8C5R197_9ANUR/635-937 AC A0A8C5R197.1
#=GS A0A7K9X7L8_9GRUI/505-732 AC A0A7K9X7L8.1
#=GS A0A7L3LMB1_9CHAR/567-779 AC A0A7L3LMB1.1
#=GS A0A811ZKR3_NYCPR/549-743 AC A0A811ZKR3.1
#=GS A0A8C0JSU7_CANLU/526-720 AC A0A8C0JSU7.1
#=GS A0A6P6HLP7_PUMCO/480-667 AC A0A6P6HLP7.1
#=GS A0A3B1K0C4_ASTMX/410-723 AC A0A3B1K0C4.1
#=GS A0A226ME66_CALSU/537-814 AC A0A226ME66.1
#=GS A0A7L2HXH4_SAGSE/502-719 AC A0A7L2HXH4.1
#=GS A0A553QYX2_9TELE/342-621 AC A0A553QYX2.1
#=GS G1RJJ7_NOMLE/655-693 AC G1RJJ7.2
#=GS A0A851IUQ7_9PASS/541-768 AC A0A851IUQ7.1
#=GS A0A6J0E6E6_PERMB/527-738 AC A0A6J0E6E6.1
#=GS A0A7L0CL38_9AVES/545-762 AC A0A7L0CL38.1
#=GS A0A7L1LKH8_HIMHI/432-494 AC A0A7L1LKH8.1
#=GS A0A669QBP6_PHACC/534-814 AC A0A669QBP6.1
#=GS A0A3N0XSS1_ANAGA/637-829 AC A0A3N0XSS1.1
#=GS A0A226PGX5_COLVI/520-797 AC A0A226PGX5.1
#=GS A0A6P7XEJ5_9AMPH/540-636 AC A0A6P7XEJ5.1
#=GS A0A2B4S8V3_STYPI/559-651 AC A0A2B4S8V3.1
#=GS A0A7L3MUT1_9PASS/537-757 AC A0A7L3MUT1.1
#=GS A0A3Q3E375_9LABR/443-586 AC A0A3Q3E375.1
#=GS K7EUE4_PONAB/555-764 AC K7EUE4.2
#=GS A0A7K9F9J6_STEPR/547-764 AC A0A7K9F9J6.1
#=GS A0A8C4DY22_DICLA/708-908 AC A0A8C4DY22.2
#=GS A0A7K5CFL1_MOTAL/459-687 AC A0A7K5CFL1.1
#=GS A0A851EVH8_PITSO/495-718 AC A0A851EVH8.1
#=GS A0A672PR66_SINGR/520-813 AC A0A672PR66.1
#=GS A0A851WL84_CORMO/541-768 AC A0A851WL84.1
#=GS A0A315UZ67_GAMAF/504-794 AC A0A315UZ67.1
#=GS A0A2R9BT12_PANPA/547-756 AC A0A2R9BT12.1
#=GS A0A3Q4GCD9_NEOBR/328-471 AC A0A3Q4GCD9.1
#=GS A0A7J7SDG6_MYOMY/105-305 AC A0A7J7SDG6.1
#=GS A0A834C530_ORYME/487-622 AC A0A834C530.1
#=GS G5BFY3_HETGA/566-783 AC G5BFY3.1
#=GS A0A7L1UM08_PHANI/546-770 AC A0A7L1UM08.1
#=GS G1RJJ1_NOMLE/520-635 AC G1RJJ1.3
#=GS A0A8P0TI31_CANLF/561-755 AC A0A8P0TI31.1
#=GS A0A8B6ZNY7_ORYAF/529-749 AC A0A8B6ZNY7.1
#=GS A0A3B1K959_ASTMX/564-877 AC A0A3B1K959.1
#=GS M3ZDY9_XIPMA/516-801 AC M3ZDY9.2
#=GS A0A2U3Y803_LEPWE/529-723 AC A0A2U3Y803.1
#=GS A0A7L0WB70_ALELA/458-619 AC A0A7L0WB70.1
#=GS A0A851CAC1_CALVR/514-729 AC A0A851CAC1.1
#=GS A0A7K8KIC5_9GRUI/497-715 AC A0A7K8KIC5.1
#=GS S9WTS8_CAMFR/487-681 AC S9WTS8.1
#=GS A0A6P8WAF8_GYMAC/525-655 AC A0A6P8WAF8.1
#=GS A0A8C0JP90_CANLU/526-720 AC A0A8C0JP90.1
#=GS S4RCL8_PETMA/436-637 AC S4RCL8.1
#=GS A0A4U5V878_COLLU/537-905 AC A0A4U5V878.1
#=GS A0A7J5YH01_DISMA/454-578 AC A0A7J5YH01.1
#=GS L9KJM0_TUPCH/533-748 AC L9KJM0.1
#=GS A0A7K6C2B7_PTIVI/470-697 AC A0A7K6C2B7.1
#=GS A0A1U8DNA6_ALLSI/412-709 AC A0A1U8DNA6.1
#=GS A0A6P6C3H6_PTEVA/313-510 AC A0A6P6C3H6.1
#=GS A0A7K7X7L7_9PASS/485-712 AC A0A7K7X7L7.1
#=GS A0A6J2IY54_9PASS/535-818 AC A0A6J2IY54.1
#=GS A0A3P8YIR0_ESOLU/399-494 AC A0A3P8YIR0.1
#=GS A0A6P5DE57_BOSIN/468-662 AC A0A6P5DE57.1
#=GS A0A8J6ECJ1_ELECQ/247-489 AC A0A8J6ECJ1.1
#=GS A0A1U7QIT1_MESAU/527-735 AC A0A1U7QIT1.1
#=GS A0A3P8U216_AMPPE/522-607 AC A0A3P8U216.1
#=GS L8I7A5_9CETA/515-667 AC L8I7A5.1
#=GS A0A1S3LV14_SALSA/528-625 AC A0A1S3LV14.1
#=GS F1S5S8_PIG/529-723 AC F1S5S8.4
#=GS A0A8C3APL6_CYCLU/528-620 AC A0A8C3APL6.1
#=GS A0A6J0E896_PERMB/537-748 AC A0A6J0E896.1
#=GS A0A8C3NBS5_GEOPR/534-818 AC A0A8C3NBS5.1
#=GS A0A673YBS7_SALTR/427-525 AC A0A673YBS7.1
#=GS A0A7J8CM25_ROUAE/188-385 AC A0A7J8CM25.1
#=GS A0A8C7Z897_9TELE/557-737 AC A0A8C7Z897.1
#=GS A0A6I9NH48_9TELE/525-655 AC A0A6I9NH48.1
#=GS A0A6P6DRE2_OCTDE/425-642 AC A0A6P6DRE2.1
#=GS A0A2Y9R8X8_TRIMA/535-755 AC A0A2Y9R8X8.1
#=GS A0A8C0JQ57_CANLU/525-719 AC A0A8C0JQ57.1
#=GS A0A7K9K4L7_9PASE/595-822 AC A0A7K9K4L7.1
#=GS A0A8C5HPI7_9TELE/522-820 AC A0A8C5HPI7.1
#=GS A0A8B7ZD85_ACAPL/529-731 AC A0A8B7ZD85.1
#=GS A0A7K5NSL4_CHRMC/600-805 AC A0A7K5NSL4.1
#=GS A0A7K6PGS8_9CORV/541-768 AC A0A7K6PGS8.1
#=GS A0A5J5CV02_9PERO/514-604 AC A0A5J5CV02.1
#=GS A0A5N4DQ70_CAMDR/516-710 AC A0A5N4DQ70.1
#=GS A0A7K5CQS7_9TYRA/548-775 AC A0A7K5CQS7.1
#=GS A0A7L0ZPD9_9PASS/465-682 AC A0A7L0ZPD9.1
#=GS A0A8C4U4M4_FALTI/533-816 AC A0A8C4U4M4.1
#=GS A0A7K4XHY8_REGSA/463-691 AC A0A7K4XHY8.1
#=GS A0A851LX40_CORCR/591-804 AC A0A851LX40.1
#=GS A0A8D0FCQ2_STROC/457-634 AC A0A8D0FCQ2.1
#=GS A0A0Q3MK96_AMAAE/381-674 AC A0A0Q3MK96.1
#=GS A0A3Q7SHP3_VULVU/549-743 AC A0A3Q7SHP3.1
#=GS A0A7L0DLX5_9CHAR/289-503 AC A0A7L0DLX5.1
#=GS A0A3M6UD36_POCDA/559-650 AC A0A3M6UD36.1
#=GS A0A6P6DRE8_OCTDE/504-721 AC A0A6P6DRE8.1
#=GS A0A7K8DYG4_LEURO/542-769 AC A0A7K8DYG4.1
#=GS A0A7N4P5S7_SARHA/534-757 AC A0A7N4P5S7.1
#=GS A0A7E6CQ08_9CHIR/531-731 AC A0A7E6CQ08.1
#=GS A0A7L0FYM6_CORCN/590-834 AC A0A7L0FYM6.1
#=GS A0A2Y9K2D7_ENHLU/553-747 AC A0A2Y9K2D7.1
#=GS A0A4D9DIG3_9SAUR/490-750 AC A0A4D9DIG3.1
#=GS A0A662YMW6_ACIRT/354-455 AC A0A662YMW6.1
#=GS A0A6P6C3B4_PTEVA/336-533 AC A0A6P6C3B4.1
#=GS A0A8C5HNF8_9TELE/538-836 AC A0A8C5HNF8.1
#=GS A0A212DCP0_CEREH/563-757 AC A0A212DCP0.1
#=GS A0A6J3QBR7_TURTR/554-748 AC A0A6J3QBR7.1
#=GS A0A8U0NSI7_MUSPF/528-722 AC A0A8U0NSI7.1
#=GS A0A670Z8K4_PSETE/501-723 AC A0A670Z8K4.1
#=GS A0A8B7QRJ0_HIPAR/509-709 AC A0A8B7QRJ0.1
#=GS A0A7L3DX34_9PASS/540-759 AC A0A7L3DX34.1
#=GS A0A7K9BGQ8_DRONO/498-723 AC A0A7K9BGQ8.1
#=GS A0A7K8YWG7_9PASS/535-752 AC A0A7K8YWG7.1
#=GS A0A8C4DY22_DICLA/543-685 AC A0A8C4DY22.2
#=GS A0A8I3P2T8_CANLF/525-719 AC A0A8I3P2T8.1
#=GS A0A8C8WRN0_PANLE/526-720 AC A0A8C8WRN0.1
#=GS A0A7K7SPJ5_9TYRA/566-790 AC A0A7K7SPJ5.1
#=GS H3BR71_HUMAN/134-335 AC H3BR71.1
#=GS A0A6P8J288_ACTTE/568-677 AC A0A6P8J288.1
#=GS A0A4X2M116_VOMUR/534-761 AC A0A4X2M116.1
#=GS A0A7L1S535_9PASS/541-768 AC A0A7L1S535.1
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