#=GF ID TMEM106_N
#=GF AC PF21002.1
#=GF DE Transmembrane protein 106 N-terminal region
#=GF AU Moxon SJ;0000-0003-4644-1816
#=GF SE Pfam-B_14617 (release 10.0)
#=GF GA 24.50 24.50;
#=GF TC 24.50 25.00;
#=GF NC 24.40 24.10;
#=GF BM hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM hmmsearch -Z 75585367 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP Family
#=GF RN [1]
#=GF RM 30456879
#=GF RT TMEM106A inhibits cell proliferation, migration, and induces
#=GF RT apoptosis of lung cancer cells.
#=GF RA Liu J, Zhu H;
#=GF RL J Cell Biochem. 2018; [Epub ahead of print]
#=GF RN [2]
#=GF RM 29131025
#=GF RT TMEM106a is a Novel Tumor Suppressor in Human Renal Cancer.
#=GF RA Wu C, Xu J, Wang H, Zhang J, Zhong J, Zou X, Chen Y, Yang G,
#=GF RA Zhong Y, Lai D, Li X, Tang A;
#=GF RL Kidney Blood Press Res. 2017;42:853-864.
#=GF RN [3]
#=GF RM 24357581
#=GF RT The FTLD risk factor TMEM106B and MAP6 control dendritic
#=GF RT trafficking of lysosomes.
#=GF RA Schwenk BM, Lang CM, Hogl S, Tahirovic S, Orozco D, Rentzsch K,
#=GF RA Lichtenthaler SF, Hoogenraad CC, Capell A, Haass C, Edbauer D;
#=GF RL EMBO J. 2014;33:450-467.
#=GF RN [4]
#=GF RM 23136129
#=GF RT The frontotemporal lobar degeneration risk factor, TMEM106B,
#=GF RT regulates lysosomal morphology and function.
#=GF RA Brady OA, Zheng Y, Murphy K, Huang M, Hu F;
#=GF RL Hum Mol Genet. 2013;22:685-695.
#=GF RN [5]
#=GF RM 34347309
#=GF RT TMEM106B in humans and Vac7 and Tag1 in yeast are predicted to
#=GF RT be lipid transfer proteins.
#=GF RA Levine TP;
#=GF RL Proteins. 2022;90:164-175.
#=GF DR SO; 0100021; polypeptide_conserved_region;
#=GF CC This family includes Transmembrane protein 106A/B/C, type II
#=GF CC transmembrane proteins which have homology to the late
#=GF CC embryogenesis abundant-2 (LEA-2) domain [5]. TMEM106A has been
#=GF CC identified as a key factor to regulate macrophage activation and
#=GF CC a tumour suppressor in gastric, renal cancer and non small-cell
#=GF CC lung carcinoma (NSCLC) [1,2]. TMEM106B localises to late
#=GF CC endosomes and lysosomes, and it is involved in dendrite
#=GF CC morphogenesis and maintenance by regulating lysosomal
#=GF CC trafficking via its interaction with MAP6 [3]. Its
#=GF CC overexpression is associated with familial frontotemporal lobar
#=GF CC degeneration [4]. It has also been identified as a protein
#=GF CC required for productive SARS-CoV-2 [5]. Structural analysis of
#=GF CC LEA-2 domains revealed that they have a long, conserved
#=GF CC lipid-binding groove, implying that TMEM106B and its homologues
#=GF CC Vac7 and Tag1 from yeast, may all be lipid transfer proteins in
#=GF CC the lumen of late endocytic organelles [5].
#=GF SQ 2087
#=GS A0A851JV99_9PASS/2-96 AC A0A851JV99.1
#=GS A0A8C3SSX1_CHESE/2-96 AC A0A8C3SSX1.1
#=GS A0A498MSB3_LABRO/2-91 AC A0A498MSB3.1
#=GS A0A2R9B6A7_PANPA/1-45 AC A0A2R9B6A7.1
#=GS A0A851JZ11_9PASS/6-87 AC A0A851JZ11.1
#=GS G3PHD7_GASAC/2-90 AC G3PHD7.1
#=GS A0A6G0HTS8_LARCR/2-87 AC A0A6G0HTS8.1
#=GS A0A0V0WD50_9BILA/6-60 AC A0A0V0WD50.1
#=GS A0A6G1QAL4_9TELE/30-108 AC A0A6G1QAL4.1
#=GS A0A8B9QMK0_APTOW/15-107 AC A0A8B9QMK0.1
#=GS A0A3Q2CVG8_CYPVA/3-89 AC A0A3Q2CVG8.1
#=GS F6S4W7_MONDO/2-89 AC F6S4W7.2
#=GS A0A5F5PV12_HORSE/2-92 AC A0A5F5PV12.1
#=GS F7B9V1_MACMU/3-84 AC F7B9V1.3
#=GS A0A452FH11_CAPHI/2-96 AC A0A452FH11.1
#=GS A0A834BMQ4_ORYME/4-73 AC A0A834BMQ4.1
#=GS A0A7K4TIZ1_9CHAR/2-96 AC A0A7K4TIZ1.1
#=GS A0A672YN18_9TELE/6-82 AC A0A672YN18.1
#=GS G3NIX7_GASAC/6-90 AC G3NIX7.1
#=GS A0A6I9PIV3_9TELE/3-78 AC A0A6I9PIV3.1
#=GS A0A7K6AF28_ONYCO/8-87 AC A0A7K6AF28.1
#=GS A0A8C5F8A1_GADMO/2-89 AC A0A8C5F8A1.1
#=GS A0A803XTK9_MELGA/3-90 AC A0A803XTK9.1
#=GS A0A4Z2DFD9_SCHJA/2-47 AC A0A4Z2DFD9.1
#=GS A0A6J3EAQ2_AYTFU/3-96 AC A0A6J3EAQ2.1
#=GS A0A3B3DJC3_ORYME/7-91 AC A0A3B3DJC3.1
#=GS A0A7K9HNW4_9AVES/4-84 AC A0A7K9HNW4.1
#=GS A0A7L2QSR4_9PASS/2-96 AC A0A7L2QSR4.1
#=GS A0A3Q1J5P2_ANATE/14-63 AC A0A3Q1J5P2.1
#=GS A0A3Q3M377_9TELE/2-88 AC A0A3Q3M377.1
#=GS A0A8C0JDY6_CHEAB/2-96 AC A0A8C0JDY6.1
#=GS A0A7K9X6R4_9GRUI/2-96 AC A0A7K9X6R4.1
#=GS A0A813TFR0_9BILA/2-63 AC A0A813TFR0.1
#=GS A0A7K9F9J8_STEPR/2-103 AC A0A7K9F9J8.1
#=GS F8W098_HUMAN/2-85 AC F8W098.1
#=GS A0A7J6BQF2_9TELE/74-157 AC A0A7J6BQF2.1
#=GS A0A7L1YQU5_9PASS/2-96 AC A0A7L1YQU5.1
#=GS A0A7K7FJK3_CHIMN/2-96 AC A0A7K7FJK3.1
#=GS A0A5N3XR50_MUNRE/2-96 AC A0A5N3XR50.1
#=GS A0A3Q2FGU9_CYPVA/38-125 AC A0A3Q2FGU9.1
#=GS A0A851NFL6_9GALL/2-96 AC A0A851NFL6.1
#=GS A0A2K5PRW8_CEBIM/3-85 AC A0A2K5PRW8.1
#=GS A0A1S3Q5B8_SALSA/3-84 AC A0A1S3Q5B8.1
#=GS A0A4U5V420_COLLU/2-90 AC A0A4U5V420.1
#=GS A0A2Y9JX54_ENHLU/3-92 AC A0A2Y9JX54.1
#=GS A0A7K6XEM2_9PASE/2-96 AC A0A7K6XEM2.1
#=GS A0A8P4G3L3_DICLA/2-88 AC A0A8P4G3L3.1
#=GS A0A6J1URF5_9SAUR/2-92 AC A0A6J1URF5.1
#=GS A0A2K5IL29_COLAP/3-85 AC A0A2K5IL29.1
#=GS A0A6P7IQE2_9TELE/12-88 AC A0A6P7IQE2.1
#=GS A0A6G0HWQ6_LARCR/2-73 AC A0A6G0HWQ6.1
#=GS H0VC42_CAVPO/1-84 AC H0VC42.1
#=GS A0A8J4X1K5_CLAMG/7-94 AC A0A8J4X1K5.1
#=GS A0A8C4S031_ERPCA/8-95 AC A0A8C4S031.1
#=GS A0A7K7ZXY3_9PASE/5-87 AC A0A7K7ZXY3.1
#=GS A0A0A0B2U9_CHAVO/1-55 AC A0A0A0B2U9.1
#=GS A0A8C3UUS4_CATUS/11-87 AC A0A8C3UUS4.1
#=GS A0A8B7IGI0_9AVES/2-96 AC A0A8B7IGI0.1
#=GS A0A8B9B9C0_9AVES/2-96 AC A0A8B9B9C0.1
#=GS A0A7K9A3C2_9PASS/2-96 AC A0A7K9A3C2.1
#=GS A0A6J2Q8X0_COTGO/13-82 AC A0A6J2Q8X0.1
#=GS G1NZT0_MYOLU/45-139 AC G1NZT0.1
#=GS A0A7K9B592_DRONO/2-96 AC A0A7K9B592.1
#=GS L8I1Z7_9CETA/4-84 AC L8I1Z7.1
#=GS A0A672MDU7_SINGR/2-83 AC A0A672MDU7.1
#=GS A0A852DJC9_PASAF/4-87 AC A0A852DJC9.1
#=GS A0A8C8WWR8_PANLE/3-84 AC A0A8C8WWR8.1
#=GS A0A6I9J2C0_CHRAS/2-96 AC A0A6I9J2C0.1
#=GS A0A6P6RHM5_CARAU/2-87 AC A0A6P6RHM5.1
#=GS A0A7L0JXC4_CHATO/1-89 AC A0A7L0JXC4.1
#=GS A0A3Q4H3F1_NEOBR/45-88 AC A0A3Q4H3F1.1
#=GS A0A8C9G5X5_PAVCR/2-64 AC A0A8C9G5X5.1
#=GS A0A7J8GI88_ROUAE/2-92 AC A0A7J8GI88.1
#=GS T106B_RAT/2-96 AC Q6AYA5.1
#=GS A0A670YNK0_PSETE/4-84 AC A0A670YNK0.1
#=GS A0A674BEE4_SALTR/2-91 AC A0A674BEE4.1
#=GS H9H0R7_MELGA/3-90 AC H9H0R7.2
#=GS A0A6P8QJI3_GEOSA/2-96 AC A0A6P8QJI3.1
#=GS A0A3Q1H658_ANATE/8-94 AC A0A3Q1H658.1
#=GS A0A0V1DED3_TRIBR/6-60 AC A0A0V1DED3.1
#=GS A0A7L0HQD4_AREIN/2-96 AC A0A7L0HQD4.1
#=GS A0A6P6LFW5_CARAU/2-83 AC A0A6P6LFW5.1
#=GS A0A7J8G278_MOLMO/2-84 AC A0A7J8G278.1
#=GS A0A093G7H0_DRYPU/2-96 AC A0A093G7H0.1
#=GS A0A671MPS2_9TELE/1-64 AC A0A671MPS2.1
#=GS A0A7K8GM43_ORTSP/2-96 AC A0A7K8GM43.1
#=GS A0A3Q3AH62_KRYMA/9-100 AC A0A3Q3AH62.1
#=GS A0A816V6W4_9BILA/9-63 AC A0A816V6W4.1
#=GS A0A7L2WT15_PANHA/2-96 AC A0A7L2WT15.1
#=GS A0A8C7X1T1_9TELE/2-89 AC A0A8C7X1T1.1
#=GS A0A851ED08_9CORV/6-87 AC A0A851ED08.1
#=GS A0A3Q7RKQ2_VULVU/3-92 AC A0A3Q7RKQ2.1
#=GS A0A7K7S9F9_9PASS/4-87 AC A0A7K7S9F9.1
#=GS A0A8C8XAX6_PANLE/1-45 AC A0A8C8XAX6.1
#=GS A0A6G0ID74_LARCR/27-114 AC A0A6G0ID74.1
#=GS A0A1D5QSC1_MACMU/3-84 AC A0A1D5QSC1.1
#=GS A0A7K8FK74_9CORV/6-87 AC A0A7K8FK74.1
#=GS A0A7K7V3S9_EUDEL/2-95 AC A0A7K7V3S9.1
#=GS A0A7K8MB36_9CORV/2-96 AC A0A7K8MB36.1
#=GS A0A7K7BNW0_APHCE/2-96 AC A0A7K7BNW0.1
#=GS A0A2K5C1I0_AOTNA/2-95 AC A0A2K5C1I0.1
#=GS A0A8R1UGM5_PRIPA/16-91 AC A0A8R1UGM5.1
#=GS A0A7L3D176_PLUSO/2-96 AC A0A7L3D176.1
#=GS Q6GQ10_XENLA/2-94 AC Q6GQ10.1
#=GS A0A674NYF3_TAKRU/26-112 AC A0A674NYF3.1
#=GS A0A8C7XYL0_9TELE/8-91 AC A0A8C7XYL0.1
#=GS A0A669PUX4_PHACC/3-90 AC A0A669PUX4.1
#=GS T2M580_HYDVU/5-53 AC T2M580.1
#=GS A0A7K9D602_9AVES/2-96 AC A0A7K9D602.1
#=GS A0A7J8GH13_ROUAE/2-90 AC A0A7J8GH13.1
#=GS A0A7L2A2C4_LEILU/2-96 AC A0A7L2A2C4.1
#=GS A0A0V1DE20_TRIBR/6-60 AC A0A0V1DE20.1
#=GS A0A8C7DXB5_NAJNA/3-84 AC A0A8C7DXB5.1
#=GS A0A7L2C370_9PASS/2-96 AC A0A7L2C370.1
#=GS A0A7K7EX11_9SYLV/5-87 AC A0A7K7EX11.1
#=GS A0A6J1UT71_9SAUR/2-107 AC A0A6J1UT71.1
#=GS A0A7K4SH71_COLPI/11-88 AC A0A7K4SH71.1
#=GS A0A7L2QHF2_9PASS/5-87 AC A0A7L2QHF2.1
#=GS A0A8J7NKM0_ATRSP/2-94 AC A0A8J7NKM0.1
#=GS A0A8D0EKZ6_STROC/2-96 AC A0A8D0EKZ6.1
#=GS A0A7J5ZDX7_DISMA/3-94 AC A0A7J5ZDX7.1
#=GS A0A5E4CZ64_MARMO/13-107 AC A0A5E4CZ64.1
#=GS A0A8V5GQ95_MELUD/6-85 AC A0A8V5GQ95.1
#=GS A0A287CXI0_ICTTR/2-83 AC A0A287CXI0.1
#=GS A0A7N9AP39_9TELE/9-88 AC A0A7N9AP39.1
#=GS A0A8C1GYR7_CYPCA/8-80 AC A0A8C1GYR7.1
#=GS A0A3M0IPP0_HIRRU/6-87 AC A0A3M0IPP0.1
#=GS A0A2K5Y8Z6_MANLE/2-93 AC A0A2K5Y8Z6.1
#=GS A0A094KZM9_PODCR/1-55 AC A0A094KZM9.1
#=GS A0A8C4X213_EPTBU/5-87 AC A0A8C4X213.1
#=GS A0A8C9JYI1_PANTA/1-45 AC A0A8C9JYI1.1
#=GS A0A4W6DBN1_LATCA/5-73 AC A0A4W6DBN1.1
#=GS A0A7K5HJC2_CROSL/2-96 AC A0A7K5HJC2.1
#=GS A0A087XPL0_POEFO/2-89 AC A0A087XPL0.2
#=GS A0A7L0SV33_PODPO/2-91 AC A0A7L0SV33.1
#=GS A0A158PCZ8_ANGCS/420-467 AC A0A158PCZ8.1
#=GS A0A8I3PIB0_CANLF/3-84 AC A0A8I3PIB0.1
#=GS A0A226MPX9_CALSU/2-96 AC A0A226MPX9.1
#=GS D2I4D7_AILME/2-92 AC D2I4D7.1
#=GS A0A7L2KYL6_9PASS/2-96 AC A0A7L2KYL6.1
#=GS A0A8D2LWW9_VARKO/2-92 AC A0A8D2LWW9.1
#=GS A0A6J2VD13_CHACN/2-79 AC A0A6J2VD13.1
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#=GS A0A1S3ALB1_ERIEU/1-89 AC A0A1S3ALB1.1
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#=GS A0A7M7P405_STRPU/39-106 AC A0A7M7P405.1
#=GS A0A8B6ZK71_ORYAF/3-85 AC A0A8B6ZK71.1
#=GS A0A6P3TCP5_SHEEP/2-96 AC A0A6P3TCP5.1
#=GS A0A8B7B6X7_ORYAF/2-93 AC A0A8B7B6X7.1
#=GS A0A7K9FR12_STEPR/3-87 AC A0A7K9FR12.1
#=GS A0A7K6LFK1_9CORV/7-87 AC A0A7K6LFK1.1
#=GS A0A2I3N0H5_PAPAN/1-45 AC A0A2I3N0H5.1
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#=GS A0A817K7V9_9BILA/6-56 AC A0A817K7V9.1
#=GS A0A7L4CCF9_9AVES/2-96 AC A0A7L4CCF9.1
#=GS A0A091DWS7_FUKDA/2-85 AC A0A091DWS7.1
#=GS A0A091UX59_NIPNI/1-80 AC A0A091UX59.1
#=GS A0A2Y9EK73_PHYMC/3-85 AC A0A2Y9EK73.1
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#=GS A0A851C605_CALVR/7-87 AC A0A851C605.1
#=GS G1KNT8_ANOCA/3-84 AC G1KNT8.3
#=GS A0A7K4KMN6_9AVES/2-96 AC A0A7K4KMN6.1
#=GS A0A2K6TBY8_SAIBB/3-85 AC A0A2K6TBY8.1
#=GS A0A2K6C300_MACNE/3-84 AC A0A2K6C300.1
#=GS A0A7L0UYC7_9PASE/2-96 AC A0A7L0UYC7.1
#=GS A0A2K6NLQ7_RHIRO/2-65 AC A0A2K6NLQ7.1
#=GS A0A3L8RRQ3_CHLGU/4-87 AC A0A3L8RRQ3.1
#=GS A0A6G1B8V4_CROCR/2-92 AC A0A6G1B8V4.1
#=GS A0A7K9LEV6_9PASS/5-87 AC A0A7K9LEV6.1
#=GS G1RN57_NOMLE/2-93 AC G1RN57.1
#=GS A0A3Q4MYQ0_NEOBR/2-93 AC A0A3Q4MYQ0.1
#=GS A0A2I3RRJ3_PANTR/2-65 AC A0A2I3RRJ3.1
#=GS T106A_BOVIN/2-92 AC Q5EA90.1
#=GS A0A7J8D2Z3_MOLMO/1-46 AC A0A7J8D2Z3.1
#=GS A0A7K6A8B6_ONYCO/2-96 AC A0A7K6A8B6.1
#=GS A0A5J5CX81_9PERO/8-73 AC A0A5J5CX81.1
#=GS A0A643BQQ9_BALPH/2-96 AC A0A643BQQ9.1
#=GS A0A6J1YJQ0_ACIJB/3-93 AC A0A6J1YJQ0.1
#=GS A0A7L3YT25_FREGA/6-91 AC A0A7L3YT25.1
#=GS A0A665X7T8_ECHNA/9-94 AC A0A665X7T8.1
#=GS A0A8C8BER1_9STRI/4-86 AC A0A8C8BER1.1
#=GS A0A4U5VLN1_COLLU/2-87 AC A0A4U5VLN1.1
#=GS A0A7L0XLC6_TYRSA/11-90 AC A0A7L0XLC6.1
#=GS A0A851RN62_CERFA/2-96 AC A0A851RN62.1
#=GS A0A7R5KYN7_9PASS/9-87 AC A0A7R5KYN7.1
#=GS A0A821N6K6_9BILA/9-62 AC A0A821N6K6.1
#=GS A0A7K8J7V8_9PASS/6-87 AC A0A7K8J7V8.1
#=GS A0A1S3S4U6_SALSA/3-71 AC A0A1S3S4U6.1
#=GS A0A6J0TVT9_9SAUR/5-98 AC A0A6J0TVT9.1
#=GS A0A8B6CBE0_MYTGA/1-76 AC A0A8B6CBE0.1
#=GS A0A7K6QTT1_9PASS/2-96 AC A0A7K6QTT1.1
#=GS A0A2K6SEH4_SAIBB/2-93 AC A0A2K6SEH4.1
#=GS A0A4Z2FY27_9TELE/19-102 AC A0A4Z2FY27.1
#=GS A0A8U0MIK5_MUSPF/2-96 AC A0A8U0MIK5.1
#=GS A0A2I3LEA2_PAPAN/2-93 AC A0A2I3LEA2.1
#=GS A0A8C2E5A4_CYPCA/1-64 AC A0A8C2E5A4.1
#=GS A0A7K9RBK4_9PASS/2-96 AC A0A7K9RBK4.1
#=GS A0A8C7YVE7_9TELE/4-74 AC A0A8C7YVE7.1
#=GS A0A6J3CGY4_AYTFU/2-96 AC A0A6J3CGY4.1
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A0A851JV99_9PASS/2-96 ................................................GKSLSHLPMHt.......cKE..D..G..YD...G.S.S.vS.DN.V..RN.G..L.V..HSE...vHN.ED.......S.R.C..GDVS.....Q.F...P..Y.VE.F..T..G.R.D..S.V.....T...CPTC.QGTGRIP..........R...............G.......Q......EN....QLVALIPYSDQRL...RPRRTK..................
A0A8C3SSX1_CHESE/2-96 ................................................GETFSQFWKVsd.....rkER..G..G..KS...I.L.C..R.KS.A..GE.D..E.V..NNY....GT.IN.......G.G.D..SAAS.....C.M...P..C.VG.T..V..S.R.G..C.I.....N...CPTC.QGTGRIP..........R...............E.......Q......EK....QLVALIPYGDQRL...KPRRTK..................
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