GenomeNet

Database: Pfam
Entry: TRAP_beta
LinkDB: TRAP_beta
Original site: TRAP_beta 
#=GF ID   TRAP_beta
#=GF AC   PF05753.18
#=GF DE   Translocon-associated protein beta (TRAPB)
#=GF AU   Moxon SJ;0000-0003-4644-1816
#=GF SE   Pfam-B_6857 (release 8.0)
#=GF GA   22.40 22.40;
#=GF TC   22.40 22.40;
#=GF NC   22.30 22.30;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch --cpu 4 -E 1000 -Z 75585367 HMM pfamseq
#=GF TP   Family
#=GF CL   CL0159
#=GF RN   [1]
#=GF RM   11204460
#=GF RT   The Translocon-Associated Protein beta (TRAPbeta) in zebrafish
#=GF RT   embryogenesis. I. Enhanced expression of transcripts in
#=GF RT   notochord and hatching gland precursors. 
#=GF RA   Mangos S, Krawetz R, Kelly GM; 
#=GF RL   Mol Cell Biochem 2000;215:93-101.
#=GF DR   SO; 0100021; polypeptide_conserved_region;
#=GF CC   This family consists of several eukaryotic translocon-associated
#=GF CC   protein beta (TRAPB) or signal sequence receptor beta subunit
#=GF CC   (SSR-beta) proteins. The normal translocation of nascent
#=GF CC   polypeptides into the lumen of the endoplasmic reticulum (ER) is
#=GF CC   thought to be aided in part by a translocon-associated protein
#=GF CC   (TRAP) complex consisting of 4 protein subunits. The association
#=GF CC   of mature proteins with the ER and Golgi, or other intracellular
#=GF CC   locales, such as lysosomes, depends on the initial targeting of
#=GF CC   the nascent polypeptide to the ER membrane. A similar scenario
#=GF CC   must also exist for proteins destined for secretion [1].
#=GF SQ   1871
#=GS A0A1S3AI82_ERIEU/4-184      AC A0A1S3AI82.1
#=GS A0A1E5W2U4_9POAL/8-189      AC A0A1E5W2U4.1
#=GS A0A7K9I0K0_9AVES/1-130      AC A0A7K9I0K0.1
#=GS A0A0K9RXC0_SPIOL/12-192     AC A0A0K9RXC0.1
#=GS A0A0M0L775_9EUKA/6-176      AC A0A0M0L775.1
#=GS E4XAU5_OIKDI/1-185          AC E4XAU5.1
#=GS A0A8D0G9S3_SPHPU/3-88       AC A0A8D0G9S3.1
#=GS A0A7J7AUF9_9COLE/7-186      AC A0A7J7AUF9.1
#=GS A0A5J9WNH8_9POAL/10-226     AC A0A5J9WNH8.1
#=GS A0A0L1KZ29_9EUGL/3-189      AC A0A0L1KZ29.1
#=GS A0A7K4WUK5_9TYRA/1-130      AC A0A7K4WUK5.1
#=GS A0A091GSS6_BUCRH/1-130      AC A0A091GSS6.1
#=GS A0A7L3JI58_THACH/1-130      AC A0A7L3JI58.1
#=GS A0A8C5IFI5_JUNHY/1-52       AC A0A8C5IFI5.1
#=GS G0N7K5_CAEBE/4-185          AC G0N7K5.1
#=GS A0A3Q0HHD3_ALLSI/1-121      AC A0A3Q0HHD3.1
#=GS A0A453E0J0_AEGTS/49-98      AC A0A453E0J0.1
#=GS A0A7K5EX37_POLCE/1-63       AC A0A7K5EX37.1
#=GS A0A4S2L0E5_9HYME/46-226     AC A0A4S2L0E5.1
#=GS A0A2K6QGT1_RHIRO/3-88       AC A0A2K6QGT1.1
#=GS A0A8J4VSK4_9ROSI/9-157      AC A0A8J4VSK4.1
#=GS A0A2P5D6F1_PARAD/12-191     AC A0A2P5D6F1.1
#=GS A0A7N0VBM9_KALFE/12-176     AC A0A7N0VBM9.1
#=GS A0A7E6CXU8_9CHIR/37-122     AC A0A7E6CXU8.1
#=GS A0A8C9L132_PANTA/4-88       AC A0A8C9L132.1
#=GS D6W8B9_TRICA/7-184          AC D6W8B9.1
#=GS A0A8J2HJ69_COTCN/57-238     AC A0A8J2HJ69.1
#=GS A0A7L2KIK3_9PASS/1-63       AC A0A7L2KIK3.1
#=GS G7YMR7_CLOSI/6-57           AC G7YMR7.1
#=GS A0A5B9D9T5_9ARCH/1136-1243  AC A0A5B9D9T5.1
#=GS A0A4Y7JKM7_PAPSO/8-139      AC A0A4Y7JKM7.1
#=GS J9G9I6_9SPIT/8-184          AC J9G9I6.1
#=GS A0A813PDN0_9BILA/7-188      AC A0A813PDN0.1
#=GS W6UM77_ECHGR/19-194         AC W6UM77.1
#=GS A0A8C3L8M3_CHRPC/1-181      AC A0A8C3L8M3.1
#=GS A0A8B9IGX1_ANSCY/1-180      AC A0A8B9IGX1.1
#=GS I0YXR7_COCSC/34-208         AC I0YXR7.1
#=GS A0A7K9P1R8_9CORV/1-54       AC A0A7K9P1R8.1
#=GS A0A7L2HAP1_SAGSE/1-130      AC A0A7L2HAP1.1
#=GS A0A2T7NG35_POMCA/28-208     AC A0A2T7NG35.1
#=GS A0A835WCT4_9CHLO/13-210     AC A0A835WCT4.1
#=GS A0A7K9IBK2_9AVES/1-97       AC A0A7K9IBK2.1
#=GS A0A7E6EYQ9_OCTVU/20-199     AC A0A7E6EYQ9.1
#=GS A0A2K5WZM6_MACFA/39-181     AC A0A2K5WZM6.2
#=GS A0A672ZBV0_9TELE/1-177      AC A0A672ZBV0.1
#=GS W5J5L7_ANODA/8-187          AC W5J5L7.1
#=GS A0A3Q0HHD3_ALLSI/116-155    AC A0A3Q0HHD3.1
#=GS A0A2V3JKC1_9EURY/152-295    AC A0A2V3JKC1.1
#=GS A0A6A2ZD45_HIBSY/1-77       AC A0A6A2ZD45.1
#=GS A0A2K5ZL96_MANLE/3-61       AC A0A2K5ZL96.1
#=GS A0A2K5X088_MACFA/112-290    AC A0A2K5X088.2
#=GS A0A6A5MXM5_LUPAL/12-193     AC A0A6A5MXM5.1
#=GS A0A6J0L5A8_RAPSA/13-179     AC A0A6J0L5A8.1
#=GS A0A3Q2GZ90_HORSE/4-124      AC A0A3Q2GZ90.1
#=GS A0A4C1WL55_EUMVA/3-185      AC A0A4C1WL55.1
#=GS A0A7K5KH07_9TYRA/1-130      AC A0A7K5KH07.1
#=GS A0A5P1E7N4_ASPOF/10-189     AC A0A5P1E7N4.1
#=GS A0A672G732_SALFA/2-182      AC A0A672G732.1
#=GS A0A565BS24_9BRAS/13-95      AC A0A565BS24.1
#=GS A0A3Q7SD72_VULVU/4-181      AC A0A3Q7SD72.1
#=GS A0A016UZ73_9BILA/33-216     AC A0A016UZ73.1
#=GS L9KEQ8_TUPCH/52-89          AC L9KEQ8.1
#=GS A0A8J5S859_ZIZPA/7-187      AC A0A8J5S859.1
#=GS A0A6J1VGI8_9SAUR/2-182      AC A0A6J1VGI8.1
#=GS A0A835J5M4_9ROSI/47-178     AC A0A835J5M4.1
#=GS A0A6P5ZH28_DURZI/10-193     AC A0A6P5ZH28.1
#=GS A0A8C4YEP5_9SAUR/3-185      AC A0A8C4YEP5.1
#=GS A0A4Y2RAK6_ARAVE/25-206     AC A0A4Y2RAK6.1
#=GS A0A5J5D0I0_9PERO/124-163    AC A0A5J5D0I0.1
#=GS A0A5N5GFQ8_9ROSA/12-191     AC A0A5N5GFQ8.1
#=GS A0A2J8A797_9CHLO/18-214     AC A0A2J8A797.1
#=GS A0A7J9K7I6_9ROSI/1-126      AC A0A7J9K7I6.1
#=GS A0A0R3QY56_9BILA/71-253     AC A0A0R3QY56.1
#=GS A0A813VKZ5_ADIRI/6-187      AC A0A813VKZ5.1
#=GS A0A7J6E2D8_CANSA/123-170    AC A0A7J6E2D8.1
#=GS F0LL76_THEBM/335-467        AC F0LL76.1
#=GS A0A2I4CTH5_9TELE/6-185      AC A0A2I4CTH5.1
#=GS A0A0V1A6N8_9BILA/297-369    AC A0A0V1A6N8.1
#=GS A0A6P5YIN1_DURZI/11-191     AC A0A6P5YIN1.1
#=GS A0A078H6K4_BRANA/9-191      AC A0A078H6K4.1
#=GS A0A7M7LJ56_NASVI/8-187      AC A0A7M7LJ56.1
#=GS A0A852PHB1_9PASS/1-130      AC A0A852PHB1.1
#=GS Q98SP1_XENLA/2-181          AC Q98SP1.1
#=GS A0A2K5ZL90_MANLE/3-70       AC A0A2K5ZL90.1
#=GS A0A852NBB9_9PASS/1-58       AC A0A852NBB9.1
#=GS A0A6J2WGV4_CHACN/3-182      AC A0A6J2WGV4.1
#=GS A0A6P8Z4Z9_THRPL/8-188      AC A0A6P8Z4Z9.1
#=GS E9PQ05_HUMAN/31-114         AC E9PQ05.9
#=GS A0A7K6VU15_9PASS/1-63       AC A0A7K6VU15.1
#=GS A0A7L3K7G2_9PASS/1-181      AC A0A7L3K7G2.1
#=GS A0A8C9UWG3_SPEDA/1-170      AC A0A8C9UWG3.1
#=GS A0A672Z9E2_9TELE/5-183      AC A0A672Z9E2.1
#=GS A0A059LQ42_9CHLO/8-212      AC A0A059LQ42.1
#=GS A0A482XFY8_LAOST/6-190      AC A0A482XFY8.1
#=GS A0A8C3NYN2_9PASS/70-170     AC A0A8C3NYN2.1
#=GS A0A0K9NUQ2_ZOSMR/11-190     AC A0A0K9NUQ2.1
#=GS A0A2R9B971_PANPA/3-88       AC A0A2R9B971.1
#=GS A0A7L4BJR1_9CHAR/1-130      AC A0A7L4BJR1.1
#=GS A0A444YSC5_ARAHY/12-193     AC A0A444YSC5.1
#=GS A0A7K8VHT2_9STRI/1-130      AC A0A7K8VHT2.1
#=GS A0A2I0WFS3_9ASPA/12-193     AC A0A2I0WFS3.1
#=GS A0A0V0VR98_9BILA/342-431    AC A0A0V0VR98.1
#=GS A0A2R9BCX0_PANPA/21-200     AC A0A2R9BCX0.1
#=GS A0A059AP62_EUCGR/14-195     AC A0A059AP62.1
#=GS A0A0V1BTN0_TRISP/305-484    AC A0A0V1BTN0.1
#=GS A0A6A2WPH1_HIBSY/191-263    AC A0A6A2WPH1.1
#=GS A0A0R3WBD7_TAEAS/4-169      AC A0A0R3WBD7.1
#=GS A0A672UQ59_STRHB/3-181      AC A0A672UQ59.1
#=GS A0A851ZGZ6_9AVES/1-130      AC A0A851ZGZ6.1
#=GS A0A091G5I8_9AVES/1-130      AC A0A091G5I8.1
#=GS A0A1U8I629_GOSHI/11-193     AC A0A1U8I629.1
#=GS A0A4P1RJR0_LUPAN/12-192     AC A0A4P1RJR0.1
#=GS A0A7K6Q6Z2_9CORV/1-63       AC A0A7K6Q6Z2.1
#=GS D8M8K8_BLAHO/1-136          AC D8M8K8.1
#=GS A0A7K6GFZ0_9PASS/1-96       AC A0A7K6GFZ0.1
#=GS A0A7T8GYM1_CALRO/6-71       AC A0A7T8GYM1.1
#=GS A0A8K0MXK9_COCNU/86-267     AC A0A8K0MXK9.1
#=GS H2UIQ4_TAKRU/5-183          AC H2UIQ4.3
#=GS A0A0A0AVD7_CHAVO/1-130      AC A0A0A0AVD7.1
#=GS A0A6G0Z792_APHCR/552-732    AC A0A6G0Z792.1
#=GS A0A7J0EF64_9ERIC/14-195     AC A0A7J0EF64.1
#=GS A0A7L1I2Y5_9CHAR/1-130      AC A0A7L1I2Y5.1
#=GS A0A667I3U5_LYNCA/4-56       AC A0A667I3U5.1
#=GS A0A8C6QG35_NANGA/1-181      AC A0A8C6QG35.1
#=GS A0A5E4A7G9_MARMO/1-179      AC A0A5E4A7G9.1
#=GS A0A8J5ZLK1_9ROSI/173-354    AC A0A8J5ZLK1.1
#=GS A0A7N5JSZ3_AILME/3-181      AC A0A7N5JSZ3.1
#=GS A0A8C8YWA0_PROSS/3-181      AC A0A8C8YWA0.1
#=GS A0A093F554_GAVST/1-130      AC A0A093F554.1
#=GS A0A7K9RCR4_9PASS/1-63       AC A0A7K9RCR4.1
#=GS A0A0V1N5S6_9BILA/261-441    AC A0A0V1N5S6.1
#=GS A0A673SQE5_SURSU/431-472    AC A0A673SQE5.1
#=GS A0A7K5TXU7_CEPOR/1-63       AC A0A7K5TXU7.1
#=GS A0A8J4XBJ8_CLAMG/12-77      AC A0A8J4XBJ8.1
#=GS A0A7K4X3Y5_REGSA/1-130      AC A0A7K4X3Y5.1
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#=GS A0A8D0C5N4_SALMN/1-181      AC A0A8D0C5N4.1
#=GS A8WV03_CAEBR/1-181          AC A8WV03.1
#=GS A0A5J5BHF2_9ASTE/15-195     AC A0A5J5BHF2.1
#=GS A0A811YB60_NYCPR/4-153      AC A0A811YB60.1
#=GS A0A8C3Y7H2_CATUS/1-181      AC A0A8C3Y7H2.1
#=GS A0A5F8A7M9_MACMU/6-184      AC A0A5F8A7M9.1
#=GS A0A8C6EEU3_MICMU/4-80       AC A0A8C6EEU3.1
#=GS A0A8C1G3K9_CYPCA/4-182      AC A0A8C1G3K9.1
#=GS A0A7L2W9Z8_PANHA/1-130      AC A0A7L2W9Z8.1
#=GS A0A1U8K0H9_GOSHI/41-220     AC A0A1U8K0H9.1
#=GS A0A8J8WCG3_CHIOP/1605-1775  AC A0A8J8WCG3.1
#=GS E0VR09_PEDHC/7-186          AC E0VR09.1
#=GS A0A3B5QZM0_XIPMA/4-183      AC A0A3B5QZM0.1
#=GS A0A8C3BVQ2_CAIMO/1-181      AC A0A8C3BVQ2.1
#=GS A0A4Y7JI11_PAPSO/11-190     AC A0A4Y7JI11.1
#=GS B4LDE1_DROVI/8-187          AC B4LDE1.1
#=GS A0A093NX05_PYGAD/1-181      AC A0A093NX05.1
#=GS A0A0B1TI32_OESDE/1-145      AC A0A0B1TI32.1
#=GS A0A7L1UP74_PHANI/1-63       AC A0A7L1UP74.1
#=GS A0A3L8Q3U3_CHLGU/1-78       AC A0A3L8Q3U3.1
#=GS A0A667XFZ3_9TELE/3-182      AC A0A667XFZ3.1
#=GS A0A3M0J0L1_HIRRU/55-235     AC A0A3M0J0L1.1
#=GS A0A7J9J4D4_9ROSI/12-205     AC A0A7J9J4D4.1
#=GS A0A8B9MHB7_9AVES/1-181      AC A0A8B9MHB7.1
#=GS D2VPU2_NAEGR/40-216         AC D2VPU2.1
#=GS A0A7J5XBU3_DISMA/218-272    AC A0A7J5XBU3.1
#=GS A0A7K6Z515_ALCTO/1-130      AC A0A7K6Z515.1
#=GS A0A7L0X3H9_TYRSA/1-63       AC A0A7L0X3H9.1
#=GS A0A507DIV2_9FUNG/4-176      AC A0A507DIV2.1
#=GS A0A7L3NKU9_9AVES/1-130      AC A0A7L3NKU9.1
#=GS A0A8C8IZ84_ONCTS/4-182      AC A0A8C8IZ84.1
#=GS A0A6P7SIN5_OCTVU/12-191     AC A0A6P7SIN5.1
#=GS A0A2P6S6K9_ROSCH/12-193     AC A0A2P6S6K9.1
#=GS A0A0Q3QMT0_BRADI/9-194      AC A0A0Q3QMT0.1
#=GS A0A7J7HY17_CAMSI/5-101      AC A0A7J7HY17.1
#=GS Q8U0S9_PYRFU/327-448        AC Q8U0S9.1
#=GS A0A3Q0JQ88_DIACI/8-137      AC A0A3Q0JQ88.1
#=GS A0A0R3TQJ4_RODNA/6-186      AC A0A0R3TQJ4.1
#=GS H2N5F4_PONAB/21-200         AC H2N5F4.2
#=GS F4X4S3_ACREC/8-187          AC F4X4S3.1
#=GS A0A267F5T0_9PLAT/7-185      AC A0A267F5T0.1
#=GS A0A8X8WTF6_SALSN/13-190     AC A0A8X8WTF6.1
#=GS A0A7K8YGY4_9PASS/1-130      AC A0A7K8YGY4.1
#=GS A0A8C4Q0K7_EPTBU/5-183      AC A0A8C4Q0K7.1
#=GS A0A669CWM9_ORENI/4-91       AC A0A669CWM9.1
#=GS D3BIF7_POLPP/3-184          AC D3BIF7.1
#=GS A0A2I2YSH4_GORGO/3-70       AC A0A2I2YSH4.1
#=GS A0A7J8ZK65_9ROSI/11-163     AC A0A7J8ZK65.1
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