#=GF ID   Transformer
#=GF AC   PF06495.15
#=GF DE   Fruit fly transformer protein
#=GF AU   Moxon SJ;0000-0003-4644-1816
#=GF SE   Pfam-B_13780 (release 10.0)
#=GF GA   26.70 26.70;
#=GF TC   26.70 26.70;
#=GF NC   26.60 26.50;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 75585367 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Family
#=GF WK   Tra_(gene)
#=GF RN   [1]
#=GF RM   8013913
#=GF RT   Molecular population genetics of sex determination genes: the
#=GF RT   transformer gene of Drosophila melanogaster. 
#=GF RA   Walthour CS, Schaeffer SW; 
#=GF RL   Genetics 1994;136:1367-1372.
#=GF DR   INTERPRO; IPR010519;
#=GF DR   SO; 0100021; polypeptide_conserved_region;
#=GF CC   This family consists of transformer proteins from several
#=GF CC   Drosophila species and also from Ceratitis capitata
#=GF CC   (Mediterranean fruit fly). The transformer locus (tra) produces
#=GF CC   an RNA processing protein that alternatively splices the
#=GF CC   doublesex pre-mRNA in the sex determination hierarchy of
#=GF CC   Drosophila melanogaster [1].
#=GF SQ   83
#=GS A0A6J2UC87_DROLE/263-386   AC A0A6J2UC87.1
#=GS A0A5N5Q5C2_PANHP/4-131     AC A0A5N5Q5C2.1
#=GS A0A6P6R457_CARAU/4-130     AC A0A6P6R457.1
#=GS A0A182YCS6_ANOST/44-174    AC A0A182YCS6.1
#=GS G7YVU8_CLOSI/44-183        AC G7YVU8.1
#=GS A0A8J5N3W6_HOMAM/32-195    AC A0A8J5N3W6.1
#=GS A0A6P5DDN5_BOSIN/6-124     AC A0A6P5DDN5.1
#=GS A0A3B0KKQ4_DROGU/1-188     AC A0A3B0KKQ4.1
#=GS A0A034WF92_BACDO/141-260   AC A0A034WF92.1
#=GS A0A504Z086_FASGI/36-182    AC A0A504Z086.1
#=GS A0A6P4ERD9_DRORH/3-181     AC A0A6P4ERD9.1
#=GS A0A8C1C3B0_CYPCA/4-130     AC A0A8C1C3B0.1
#=GS A0A8E0VKR5_9TREM/42-182    AC A0A8E0VKR5.1
#=GS A0A074ZGI3_9TREM/102-241   AC A0A074ZGI3.1
#=GS A0A6P4ILQ5_DROKI/1-178     AC A0A6P4ILQ5.1
#=GS A0A6J2UC87_DROLE/1-159     AC A0A6J2UC87.1
#=GS B4LB81_DROVI/1-189         AC B4LB81.2
#=GS R7UB06_CAPTE/564-706       AC R7UB06.1
#=GS A0A5A9N1D7_9TELE/4-129     AC A0A5A9N1D7.1
#=GS S8BSI1_DACHA/12-142        AC S8BSI1.1
#=GS Q8MWH1_CERCA/252-417       AC Q8MWH1.1
#=GS A0A398AWP6_BRACM/27-226    AC A0A398AWP6.1
#=GS A0A6P6R3X2_CARAU/4-130     AC A0A6P6R3X2.1
#=GS A0A8U8C046_GEOPR/6-132     AC A0A8U8C046.1
#=GS A0A8J4TBW6_9TREM/43-186    AC A0A8J4TBW6.1
#=GS V9ERF1_PHYPR/63-214        AC V9ERF1.1
#=GS A0A8C6X926_NAJNA/6-122     AC A0A8C6X926.1
#=GS B5DR46_DROPS/1-187         AC B5DR46.2
#=GS A0A1L3KIY5_9VIRU/2-147     AC A0A1L3KIY5.1
#=GS A0A672N9C4_SINGR/4-132     AC A0A672N9C4.1
#=GS A0A3Q0GZE8_ALLSI/292-408   AC A0A3Q0GZE8.1
#=GS A0A3N0XL71_ANAGA/5-131     AC A0A3N0XL71.1
#=GS A0A1L8FMU9_XENLA/6-121     AC A0A1L8FMU9.1
#=GS A0A671PZU4_9TELE/6-128     AC A0A671PZU4.1
#=GS A0A811V031_CERCA/206-371   AC A0A811V031.1
#=GS Q7ZY06_XENLA/5-122         AC Q7ZY06.2
#=GS A0A672NDC1_SINGR/4-132     AC A0A672NDC1.1
#=GS A0A6J2UC87_DROLE/157-267   AC A0A6J2UC87.1
#=GS A0A0R3SJW2_HYMDI/34-170    AC A0A0R3SJW2.1
#=GS TRSF_DROME/3-187           AC P11596.1
#=GS A0A498HLI7_MALDO/999-1159  AC A0A498HLI7.1
#=GS A0A7J6C7Y5_9TELE/5-132     AC A0A7J6C7Y5.1
#=GS Q28EQ0_XENTR/6-122         AC Q28EQ0.1
#=GS A0A034WF92_BACDO/256-407   AC A0A034WF92.1
#=GS B4J1D8_DROGR/261-443       AC B4J1D8.1
#=GS A0A484B9M7_DRONA/1-204     AC A0A484B9M7.1
#=GS A0A7J6B1P6_AMEME/5-132     AC A0A7J6B1P6.1
#=GS A0A6P6R451_CARAU/4-130     AC A0A6P6R451.1
#=GS A0A8M2B465_DANRE/5-131     AC A0A8M2B465.1
#=GS A0A8J0TBG2_XENLA/6-121     AC A0A8J0TBG2.1
#=GS A0A4S2LJ24_OPIFE/44-183    AC A0A4S2LJ24.1
#=GS A0A5J4N9G6_9TREM/43-186    AC A0A5J4N9G6.1
#=GS Q8MWH1_CERCA/142-260       AC Q8MWH1.1
#=GS W2PYB1_PHYPN/65-216        AC W2PYB1.1
#=GS A0A812WMA8_9DINO/2-165     AC A0A812WMA8.1
#=GS A0A4W4FQW6_ELEEL/5-129     AC A0A4W4FQW6.1
#=GS A0A498N7F9_LABRO/5-132     AC A0A498N7F9.1
#=GS B3M4G4_DROAN/3-179         AC B3M4G4.2
#=GS A0A1L8FGS2_XENLA/6-122     AC A0A1L8FGS2.1
#=GS A0A6P4F5V6_DRORH/1-122     AC A0A6P4F5V6.1
#=GS A0A811V031_CERCA/97-210    AC A0A811V031.1
#=GS A0A6J2U9M1_DROLE/1-215     AC A0A6J2U9M1.1
#=GS A0A1S3YZ20_TOBAC/116-264   AC A0A1S3YZ20.1
#=GS A0A1U7YQ33_NICSY/115-264   AC A0A1U7YQ33.1
#=GS B4L9E2_DROMO/1-197         AC B4L9E2.1
#=GS H0W3M0_CAVPO/330-455       AC H0W3M0.2
#=GS A0A671Q131_9TELE/4-132     AC A0A671Q131.1
#=GS Q6NVN9_XENTR/6-122         AC Q6NVN9.1
#=GS B4QMV6_DROSI/1-172         AC B4QMV6.1
#=GS A0A6J2W7K5_CHACN/5-129     AC A0A6J2W7K5.1
#=GS A0A3Q0GZD2_ALLSI/292-408   AC A0A3Q0GZD2.1
#=GS W2YXA1_PHYPR/65-216        AC W2YXA1.1
#=GS A0A673IKY5_9TELE/4-132     AC A0A673IKY5.1
#=GS A0A0W8E0Q3_PHYNI/144-295   AC A0A0W8E0Q3.1
#=GS A0A671Q5D0_9TELE/4-132     AC A0A671Q5D0.1
#=GS B4H201_DROPE/1-143         AC B4H201.1
#=GS A0A3B1KG14_ASTMX/5-128     AC A0A3B1KG14.1
#=GS A0A6P6R4X7_CARAU/4-130     AC A0A6P6R4X7.1
#=GS H2Z1Z9_CIOSA/1-132         AC H2Z1Z9.1
#=GS A0A2H1CKV4_FASHE/36-182    AC A0A2H1CKV4.1
#=GS A0A6P8XAT3_DROAB/1-187     AC A0A6P8XAT3.1
#=GS Q4KMI5_DANRE/5-131         AC Q4KMI5.1
#=GS A0A6P8SDK1_GEOSA/6-122     AC A0A6P8SDK1.1
A0A6J2UC87_DROLE/263-386              ..................................................hdhlrdle------------.--.........................-------....-----.---.----------.---------.-----.KRT...........RSRSRSRERRTR.....RTS.C.GRRY...QD...R........NANQ...RGS..TTserr.rsysRD.TSSR.DC.....SPR.R..----RT..R..wRSP...APPIISVP....VP...VPA..ADP.-YGY.L.--...--..---FNAM.....Y..A.P.LS...F....PIH.H....H....P-...-PW-..-.--------..-----.--.--.-----dqfrgrlppppsyfga..........................................
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A0A6P6R457_CARAU/4-130                ................................................fdeferqlte------------.--.........................-------....-----.---.----------.---NKQADR.DKENK.HHR...........RSGSRSRSRDQD.....---.-.-RKR...RS...R........DRER...R-G..GS.........RD.RHGD.SK....dRRH.R..RSRSPH..R...EKK...KIKV-KKY....WD...VPP..PGF.EHI-.-.--...--..-------.....-..-.-.--...-....---.-....-....--...----..-.--------..-----.--.--.-----tpmqykamqaagqipatallptmtpeglavtptpvp......................
A0A182YCS6_ANOST/44-174               ................................deiqpddtdgnkqpnadveakinspg------------.--.........................-------....-----.---.----------.---------.-----.---...........GMRSRSGSRNSH.....TSQ.Q.DQRR...RD...R........SGSQ...V-S..ET.........RS.RKSR.STs...rQSR.R..RSRSQA..R...SSSsysSARPYTFP....VA...VPI..R-F.TISF.T.--...--..-------.....-..-.-.--...-....---.-....-....--...----..-.--------..-----.--.--.-----vpitlplsfpvpfaitvsitltltfrf...............................
G7YVU8_CLOSI/44-183                   ..............................................dinsteyldrkd------------.--.........................-------....-----.---.----------.--------R.-SPRH.RKR...........DSSSEDRGRDRK.....RDK.K.RSRS...RS...R........SRER..rRHS..RD.........RH.RDRS.RE.....RRS.K..HRHSRH..R...-SE...TPPLIYKY....WD...VPP..PGF.EHVT.P.AQ...YK..AMQASGQ.....I..P.V.NV...Y....AAG.Q....I....PM...PAH-..A.P-------..-----.--.--.-----napltlttnipfagsa..........................................
A0A8J5N3W6_HOMAM/32-195               ...........................................trnlpeqrehyfimg------------.--.........................-EDREKE....KNEKD.RDE.KKEKDREKDG.KDRDKDKDR.DKDKD.RER...........KKRSRSRS----.....RER.R.KHKT...RS...R........SRGR...TRS..RS.........RS.REAR.R-.....KAR.R..KKPSLY..W...DKP...P-------....--...---..---.----.-.--...--..-------.....-..-.-.--...-....---.-....-....--...----..-.--------..-----.--.--.-----pgfehitpiqykamqaagqipsnvtvpliappsagqvpplaavvpsvpevtnvpqpvp
A0A6P5DDN5_BOSIN/6-124                .................................................eferqlnen------------.--.........................-------....-----.---.----------.---------.--KQE.RDK...........ENRHRKRSHSRS.....RS-.R.DRKR...RS...R........SRDR...R--..-N.........RD.QRSA.SR.....DRR.R..RSRSPR..H...--E...KKKKVRKY....WD...VPP..PGF.EHI-.-.--...--..-------.....-..-.-.--...-....---.-....-....--...----..-.--------..-----.--.--.-----tpmqykamqaagqipatallptmtpdglavtptpvpv.....................
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A0A034WF92_BACDO/141-260              ........................................sddkyaarrnaspspnyr------------.--.........................--RKTPE....KIPYF.VDQ.VRERDRIRRK.YGSTRNKSP.PASSKfRRR...........RSISRSRSRSHS.....RDS.L.KTKQ...RSparR........TNYR...RRS..IS.........VD.REWG.GN.....SKR.E..REREKS..R...AD-...--------....--...---..---.----.-.--...--..-------.....-..-.-.--...-....---.-....-....--...----..-.--------..-----.--.--.-----kdlhg.....................................................
A0A504Z086_FASGI/36-182               .........................................hddrdgdfsthsqennk------------.--.........................-------....-----.---.----------.---------.-NLSP.KSH...........KRDSSNEDRSRD.....RKR.D.KRRS...RS...R........SYSRdrrRRS..RS.........RH.RDRS.RE.....RRS.K..RRHSRH..R...SPS...TPPLIYKY....WD...VPP..PGF.EHVT.P.--...--..-AQYKAM.....QasG.Q.IP...V....NLY.A....A....GQ...IPM-..-.--------..-----.--.--.-----pahtpnapltlntnipfagsa.....................................
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A0A8C1C3B0_CYPCA/4-130                ................................................fdeferqlte------------.--.........................-------....-----.---.----------.---NKQADR.DKENK.HHR...........RTGSRSRSRDQD.....R--.-.--KR...RS...R........DRER...R-G..GS.........RD.RHGD.SK....dRRH.R..RSRSPH..R...EKK...KIKV-KKY....WD...VPP..PGF.EHI-.-.--...--..-------.....-..-.-.--...-....---.-....-....--...----..-.--------..-----.--.--.-----tpmqykamqaagqipatallptmtpeglavtptpvp......................
A0A8E0VKR5_9TREM/42-182               ...............................................eysahsqennk------------.--.........................-------....-----.---.----------.---------.-NLSP.KSH...........KRESSNEDRSRD.....RKR.E.KRRS...RS...R........SYSRdrrRRS..RS.........RH.RDRS.RE.....RRS.K..RRHSRH..R...SPS...TPPLIYKY....WD...VPP..PGF.EHVT.P.--...--..-AQYKAM.....QasG.Q.IP...V....NLY.A....A....GQ...IPM-..-.--------..-----.--.--.-----pahtpnapltlntnipfagsa.....................................
A0A074ZGI3_9TREM/102-241              ..............................................dinsteyldrkd------------.--.........................-------....-----.---.----------.--------R.-SPRH.RKR...........DSSSEDRGRDRK.....RDK.K.RSRS...RS...R........SRER..rRHS..RD.........RH.RDRS.RE.....RRS.K..HRHSRH..R...-SE...TPPLIYKY....WD...VPP..PGF.EHVT.P.AQ...YK..AMQASGQ.....I..P.V.NV...Y....AAG.Q....I....PM...PAH-..A.P-------..-----.--.--.-----napltlttnipfagsa..........................................
A0A6P4ILQ5_DROKI/1-178                ..........................................................MDADSSGSAQRD.SQasrsrsrrerekyprerererererERAREEP....KVPYF.SDA.VRERDR--RL.RHRSPRTA-.---P-.--T...........RHRSRSKSHSSE.....RDS.R.YRRQ...RR...R........SRSR...N--..--.........RS.RSRS.SE.....QRR.T..RPR---..-...-SP...PPKIINYY....VQ...VPA..HEF.---Y.G.--...--..--MYSPY.....P..P.R.FG...Y....PRP.P....P....PR...LPHF..P.PSGHRR--..YAQR-.AP.FTgGAPRY..........................................................
A0A6J2UC87_DROLE/1-159                ..........................................................MDPDSSGYTARV.LQihifddkqd......nevssstsytRHIERLE....KLPYF.IGNaKRENDRLRNL.EKRTKRTSK.-SPPK.REKv........gtRSRSRSRERRTR.....RPS.C.DRRY...QD...R........NSNH...RGS..TTses...rrgYS.RDTS.SQ.....DRS.P..RRGTRS..R...-SA...AACIITVP....VP...VPA..ADF.PYGY.-.--...--..-------.....-..-.-.--...-....---.-....-....--...----..-.--------..-----.--.--.-----hd........................................................
B4LB81_DROVI/1-189                    ..........................................................MDADSSSRSPRD.TR.........................RRSRQRE....KMPYF.ADE.VRERDRVRNL.RKLKTTQKR.TPTPP.RERrs......rheRPRSRSRTHSPE.....QSR.C.QRR-...RS...R........SYVR...HRS..VS.........RQ.KTSSsSC.....SRR.R..RSRSRS..RsrgRSR...TPRIITVP....VP...VPA..AEY.SYAY.G.WP...PP..RPHFNPM.....Y..G.A.LP...F....GMQ.P....R....PL...NPYF..G.SYARPP-P..FRYRA.GP.FR.PHPRY..........................................................
R7UB06_CAPTE/564-706                  dndykpldsrdirlpppmppserllaaveafysapsherprdsdgweklalfefykak------------.--.........................-------....-----.---.----RRARE-.-QKEERQKR.SYKS-.RSR..........sKSRSRSRSRSRS.....RSR.TpKRRR...RS...R........SRSR...SKS..YS.........RS.RSRS.HS....pPRR.R..KSRSRS..V...--T...--------....--...---..---.----.-.--...--..-------.....-..-.-.--...-....---.-....-....--...----..-.--------..-----.--.--.-----ppgffqayqp................................................
A0A5A9N1D7_9TELE/4-129                ................................................fdeferqlte------------.--.........................-------....-----.---.----------.---------.NKQAD.RDK...........ENKHHRRSGSRS.....RSR.D.HDR-...KR...R........SGDR...EQR..GS.........RD.RHGD.SK....dHRH.R..RSRSPH..R...EKK...KIKV-KKY....WD...VPP..PGF.EHI-.-.--...--..-------.....-..-.-.--...-....---.-....-....--...----..-.--------..-----.--.--.-----tpmqykamqaagqipatallptmtpeglavtptpvp......................
S8BSI1_DACHA/12-142                   ................................................ddayaaasaa------------.--.........................-------....-----.---.----------.---------.-----.KKG...........KLKLKSKRRSHR.....HND.G.HRRH...RS...R........TRSR...SRS..RT.........RS.RSAS.PI.....SLN.R..KKRKQP..Tv.tETD...DPSLY-DD....VY...LPG..QNS.-FKY.K.DP...EA..A-FQESL.....F..E.A.--...-....---.-....-....--...----..-.--------..-----.--.--.-----madddgaaywegvygqpihnysrprvenek............................
Q8MWH1_CERCA/252-417                  ......................................................enlr------------.--.........................-------....-----.---.-TERDRDGQY.RHHGHRSEE.QERSR.RGRs.........pRARTRSRTRSRE.....RSK.H.-V--...RA...R........NDER...NKNlhGN.........HD.ELTN.A-.....---.-..--ELNQ..R...NLT...QPQIITIP....VP...VPA..DFL.NYAY.StWP...TQ..TQWSHPMtppprY..G.A.PA...Y....HMP.Ti.lpAtvmpPM...RPAL..P.PYGLPPQP..MRYG-.--.--.-----grglrfpqqhgpr.............................................
A0A398AWP6_BRACM/27-226               ..........................................ksspfksrdshdldkd---------SSR.SR.........................DKDKDKE....KGPDKdRDR.DRERDRHRRD.RHRDRSRER.SEKRE.RERddlddddddddHYRSRHRHRSSR.....DRD.R.EERH...RR...R........SRSR...SRS..RS.........ER.RSRS.EH.....RRR.SqhRSRSRS..R..sRSK...SKRVSGFD....MA...PPA..SAM.----.-.--...--..-------.....-..-.-.--...-....---.-....-....--...----..-.--------..-----.--.--.-----laatavaaagqvpsvpatagipgmfpnmlamvpgqqmgalpllpmqamtqqa......
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