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Database: Pfam
Entry: VirC1
LinkDB: VirC1
Original site: VirC1 
#=GF ID   VirC1
#=GF AC   PF07015.15
#=GF DE   VirC1 protein
#=GF AU   Moxon SJ;0000-0003-4644-1816
#=GF SE   Pfam-B_11309 (release 10.0)
#=GF GA   24.00 24.00;
#=GF TC   24.00 24.00;
#=GF NC   23.90 23.90;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 75585367 --cpu 4 -E 1000 HMM pfamseq
#=GF TP   Family
#=GF CL   CL0023
#=GF RN   [1]
#=GF RM   2592351
#=GF RT   The Agrobacterium tumefaciens virC1 gene product binds to
#=GF RT   overdrive, a T-DNA transfer enhancer. 
#=GF RA   Toro N, Datta A, Carmi OA, Young C, Prusti RK, Nester EW; 
#=GF RL   J Bacteriol 1989;171:6845-6849.
#=GF DR   INTERPRO; IPR009744;
#=GF DR   SO; 0100021; polypeptide_conserved_region;
#=GF CC   This family consists of several bacterial VirC1 proteins. In
#=GF CC   Agrobacterium tumefaciens, a cis-active 24-base-pair sequence
#=GF CC   adjacent to the right border of the T-DNA, called overdrive,
#=GF CC   stimulates tumour formation by increasing the level of T-DNA
#=GF CC   processing. It is thought that the virC operon which enhances
#=GF CC   T-DNA processing probably does so because the VirC1 protein
#=GF CC   interacts with overdrive. It has now been shown that the virC1
#=GF CC   gene product binds to overdrive but not to the right border of
#=GF CC   T-DNA [1]. 
#=GF SQ   623
#=GS A0A328TLK6_9GAMM/9-167    AC A0A328TLK6.1
#=GS A0A561QQT1_9HYPH/1-226    AC A0A561QQT1.1
#=GS A3K4N0_9RHOB/5-239        AC A3K4N0.1
#=GS A0A0Q7DKP1_9CAUL/18-237   AC A0A0Q7DKP1.1
#=GS A0A2T7UKE1_9RHOB/5-239    AC A0A2T7UKE1.1
#=GS A0A346YMP6_9HYPH/1-216    AC A0A346YMP6.1
#=GS A0A085TUD6_9RHOB/5-239    AC A0A085TUD6.1
#=GS A0A0A8IL09_9CAUD/3-205    AC A0A0A8IL09.1
#=GS A0A4P7J8K0_9RHOB/15-154   AC A0A4P7J8K0.1
#=GS A0A2A3C400_9HYPH/1-198    AC A0A2A3C400.1
#=GS A0A2T0RE14_9RHOB/2-200    AC A0A2T0RE14.1
#=GS A0A5N7MLN9_9HYPH/4-221    AC A0A5N7MLN9.1
#=GS A0A175RU12_9HYPH/1-223    AC A0A175RU12.1
#=GS W1S8T4_9SPHN/1-226        AC W1S8T4.1
#=GS A0A1I1PYK4_9RHOB/6-244    AC A0A1I1PYK4.1
#=GS A0A7W8E616_9BACT/1-219    AC A0A7W8E616.1
#=GS A0A256FXP1_9HYPH/1-236    AC A0A256FXP1.1
#=GS VIRC1_AGRFC/1-231         AC P07165.1
#=GS A0A1W2ELS0_9RHOB/1-218    AC A0A1W2ELS0.1
#=GS A0A549TAB9_9HYPH/1-224    AC A0A549TAB9.1
#=GS E4TMA7_MARTH/2-205        AC E4TMA7.1
#=GS A0A1T0AYE9_9PAST/2-176    AC A0A1T0AYE9.1
#=GS A0A1B9S220_9HYPH/1-220    AC A0A1B9S220.1
#=GS A0A1M5Y4Y1_9RHOB/1-214    AC A0A1M5Y4Y1.1
#=GS A0A0S3F5Q5_9SPHN/1-219    AC A0A0S3F5Q5.1
#=GS A0A2R4MJ49_9HYPH/1-249    AC A0A2R4MJ49.1
#=GS A0A0M3BBP2_9HYPH/1-228    AC A0A0M3BBP2.1
#=GS A0A238LKP9_9RHOB/1-238    AC A0A238LKP9.1
#=GS B4RCT7_PHEZH/1-218        AC B4RCT7.1
#=GS A0A0J5T259_9RHOB/5-239    AC A0A0J5T259.1
#=GS E2CSL1_9HYPH/42-272       AC E2CSL1.1
#=GS A0A0P7KHI7_9RHOB/1-193    AC A0A0P7KHI7.1
#=GS A0A0M4DDW5_SPHS1/1-222    AC A0A0M4DDW5.1
#=GS A0A0M9GLK7_9HYPH/1-231    AC A0A0M9GLK7.1
#=GS A0A1S1SIB0_9HYPH/1-207    AC A0A1S1SIB0.1
#=GS A0A0P6VKQ0_9HYPH/1-227    AC A0A0P6VKQ0.1
#=GS A0A7X4GKN8_9SPHN/1-223    AC A0A7X4GKN8.1
#=GS A0A0B4EED5_9RHOB/5-239    AC A0A0B4EED5.1
#=GS A0A1M7PHY3_9HYPH/24-254   AC A0A1M7PHY3.1
#=GS B8IXU2_METNO/1-191        AC B8IXU2.1
#=GS A0A547PM59_9RHOB/1-223    AC A0A547PM59.1
#=GS A0A239K2P7_9BACT/1-220    AC A0A239K2P7.1
#=GS A0A1Z5HA90_9GAMM/1-220    AC A0A1Z5HA90.1
#=GS A0A0Q6SHN4_9HYPH/1-219    AC A0A0Q6SHN4.1
#=GS A0A4R3ALZ8_9HYPH/1-219    AC A0A4R3ALZ8.1
#=GS A0A4Q8QK02_9BRAD/1-230    AC A0A4Q8QK02.1
#=GS A0A2U1VSI2_9PROT/1-206    AC A0A2U1VSI2.1
#=GS A0A5C4N5Y8_9RHOB/1-218    AC A0A5C4N5Y8.1
#=GS A0A1M5Y922_9RHOB/1-228    AC A0A1M5Y922.1
#=GS A0A1N7A5T2_9HYPH/1-222    AC A0A1N7A5T2.1
#=GS A0A0B4XC35_9HYPH/3-225    AC A0A0B4XC35.1
#=GS A0A3A1P2B7_9SPHN/1-224    AC A0A3A1P2B7.1
#=GS F2IWC0_POLGS/39-256       AC F2IWC0.1
#=GS A0A2M9PD77_9RHOB/1-178    AC A0A2M9PD77.1
#=GS A0A2S6NBB7_RHOGL/1-230    AC A0A2S6NBB7.1
#=GS A0A2C7A765_9PROT/1-218    AC A0A2C7A765.1
#=GS A0A432V3U8_9HYPH/1-225    AC A0A432V3U8.1
#=GS A0A4Q7YF59_9BACT/1-221    AC A0A4Q7YF59.1
#=GS A0A4S5IX13_9HYPH/1-235    AC A0A4S5IX13.1
#=GS K2IC40_9RHOB/5-239        AC K2IC40.1
#=GS A0A0D6PGU2_9PROT/1-205    AC A0A0D6PGU2.1
#=GS A0A4R2ZYP0_9HYPH/1-216    AC A0A4R2ZYP0.1
#=GS A0A4Z1CSM8_9RHOB/2-246    AC A0A4Z1CSM8.1
#=GS A0A159ZBB7_9RHOB/3-162    AC A0A159ZBB7.1
#=GS A0A1X7A103_9RHOB/1-223    AC A0A1X7A103.1
#=GS Q2K685_RHIEC/31-248       AC Q2K685.1
#=GS A0A4R5QG90_9PROT/2-151    AC A0A4R5QG90.1
#=GS A0A2Z5ELR8_9SPHN/1-225    AC A0A2Z5ELR8.1
#=GS A0A2L0WBX7_9HYPH/1-218    AC A0A2L0WBX7.1
#=GS A0A3S3TWK4_9HYPH/1-220    AC A0A3S3TWK4.1
#=GS A0A346YSK4_9HYPH/1-227    AC A0A346YSK4.1
#=GS A0A1B3NBR7_9HYPH/1-216    AC A0A1B3NBR7.1
#=GS A0A0T1XAR8_9HYPH/2-228    AC A0A0T1XAR8.1
#=GS B1ZM51_METPB/1-221        AC B1ZM51.1
#=GS A0A6M8HXY3_9PROT/1-206    AC A0A6M8HXY3.1
#=GS Q07GJ4_ROSDO/1-232        AC Q07GJ4.1
#=GS A0A541BVG5_9PROT/1-154    AC A0A541BVG5.1
#=GS A0A7Z2W2W2_9BURK/1-221    AC A0A7Z2W2W2.1
#=GS F5T0Z6_9GAMM/1-227        AC F5T0Z6.1
#=GS A0A2S2CNN9_9PROT/1-206    AC A0A2S2CNN9.1
#=GS A0A1B6YQQ8_9RHOB/5-239    AC A0A1B6YQQ8.1
#=GS A0A1C9WYF9_9MICC/1-209    AC A0A1C9WYF9.1
#=GS A0A494TFR1_SPHPE/1-222    AC A0A494TFR1.1
#=GS A0A5C6U4Z3_9SPHN/1-223    AC A0A5C6U4Z3.1
#=GS A0A1V0GZE3_9RHOB/1-248    AC A0A1V0GZE3.1
#=GS A0A2L0WME2_9HYPH/3-225    AC A0A2L0WME2.1
#=GS A0A4R2RBM3_9RHOB/5-239    AC A0A4R2RBM3.1
#=GS Q5HXJ5_GLUOX/1-220        AC Q5HXJ5.1
#=GS A0A845BEU9_9PROT/1-199    AC A0A845BEU9.1
#=GS H4F1D3_9HYPH/1-229        AC H4F1D3.1
#=GS Q89BF7_BRADU/1-169        AC Q89BF7.1
#=GS A0A0J5QA75_9RHOB/5-239    AC A0A0J5QA75.1
#=GS A0A1G7G5H3_9RHOB/5-235    AC A0A1G7G5H3.1
#=GS A0A0D6T7K6_9RHOB/6-236    AC A0A0D6T7K6.1
#=GS A0A316G6Y3_9RHOB/5-239    AC A0A316G6Y3.1
#=GS A0A1H4G0M3_9RHOB/1-187    AC A0A1H4G0M3.1
#=GS A0A371WY50_9HYPH/1-231    AC A0A371WY50.1
#=GS A0A159ZBL9_9RHOB/45-240   AC A0A159ZBL9.1
#=GS A0A7W6J928_9HYPH/1-225    AC A0A7W6J928.1
#=GS I3ZJC6_TERRK/1-225        AC I3ZJC6.1
#=GS B1MA80_METRJ/1-188        AC B1MA80.1
#=GS A0A285V305_9HYPH/1-219    AC A0A285V305.1
#=GS A0A840SR20_9RHOB/1-230    AC A0A840SR20.1
#=GS G7ZIT9_AZOL4/2-188        AC G7ZIT9.1
#=GS A0A2M8N1B4_9RHOB/5-239    AC A0A2M8N1B4.1
#=GS A0A4V1E1G8_9RHOB/2-214    AC A0A4V1E1G8.1
#=GS A0A5C4XTE6_9HYPH/1-224    AC A0A5C4XTE6.1
#=GS A0A8B2NPM0_9HYPH/9-228    AC A0A8B2NPM0.1
#=GS F0MCM4_PSEPM/1-208        AC F0MCM4.1
#=GS A0A1Q8ZLA5_9HYPH/1-223    AC A0A1Q8ZLA5.1
#=GS A0A2L0WGQ9_9HYPH/11-230   AC A0A2L0WGQ9.1
#=GS A0A081BF11_9HYPH/2-198    AC A0A081BF11.1
#=GS A0A1N7B8K0_9HYPH/1-228    AC A0A1N7B8K0.1
#=GS A0A239MGT0_9BACT/1-219    AC A0A239MGT0.1
#=GS E8X689_GRATM/1-227        AC E8X689.1
#=GS A6X7N4_BRUA4/1-227        AC A6X7N4.1
#=GS A0A0T1XR46_9HYPH/1-222    AC A0A0T1XR46.1
#=GS A0A7X5F4I7_9HYPH/1-216    AC A0A7X5F4I7.1
#=GS A0A2Z5GAI8_9BACT/1-228    AC A0A2Z5GAI8.1
#=GS A0A1G9MQX0_9RHOB/5-237    AC A0A1G9MQX0.1
#=GS A0A1I3V872_9RHOB/1-221    AC A0A1I3V872.1
#=GS A0A2S6NE29_RHOGL/1-165    AC A0A2S6NE29.1
#=GS A0A2P8N9C2_9HYPH/1-226    AC A0A2P8N9C2.1
#=GS A0A2T6KEZ4_9RHOB/3-145    AC A0A2T6KEZ4.1
#=GS A0A7X6ISQ1_9PSED/1-91     AC A0A7X6ISQ1.1
#=GS A0A7W6P063_9HYPH/12-232   AC A0A7W6P063.1
#=GS A0A2K9EKM6_9RHOB/5-235    AC A0A2K9EKM6.1
#=GS A0A2T4JNH8_9RHOB/1-191    AC A0A2T4JNH8.1
#=GS A0A386E322_9HYPH/1-220    AC A0A386E322.1
#=GS A0A1I0WKH3_9HYPH/1-223    AC A0A1I0WKH3.1
#=GS A0A2U2DK53_9HYPH/3-229    AC A0A2U2DK53.1
#=GS A0A494WHT1_9SPHN/1-225    AC A0A494WHT1.1
#=GS A0A1I3SVH9_9HYPH/1-224    AC A0A1I3SVH9.1
#=GS A0A848IXM9_9BACT/2-182    AC A0A848IXM9.1
#=GS A0A549TCM0_9HYPH/1-226    AC A0A549TCM0.1
#=GS A0A1G8R272_9RHOB/5-239    AC A0A1G8R272.1
#=GS A0A4P6XHH6_9SPHN/1-225    AC A0A4P6XHH6.1
#=GS A0A0L1JK85_9RHOB/2-209    AC A0A0L1JK85.1
#=GS A0A519DUI7_PSESP/1-207    AC A0A519DUI7.1
#=GS A0A212RLK2_9PROT/1-194    AC A0A212RLK2.1
#=GS A0A5B2TCP9_9PROT/3-216    AC A0A5B2TCP9.1
#=GS A0A239M3A6_9BACT/1-231    AC A0A239M3A6.1
#=GS A1URK4_BARBK/1-220        AC A1URK4.1
#=GS A0A5B2TBX6_9PROT/4-203    AC A0A5B2TBX6.1
#=GS A0A3P5XQU5_9RHOB/6-243    AC A0A3P5XQU5.1
#=GS A9CI95_AGRFC/1-221        AC A9CI95.1
#=GS A0A1D9MFY4_9RHOB/5-239    AC A0A1D9MFY4.1
#=GS D3G2F6_ZYMMO/1-205        AC D3G2F6.1
#=GS A0A0J6T568_9HYPH/1-220    AC A0A0J6T568.1
#=GS A0A4Q3DHI2_9RICK/1-217    AC A0A4Q3DHI2.1
#=GS A0A5C4MQ60_9RHOB/6-242    AC A0A5C4MQ60.1
#=GS A0A4R4D3P7_9PROT/1-220    AC A0A4R4D3P7.1
#=GS A0A418WCQ0_9PROT/1-189    AC A0A418WCQ0.1
#=GS A0A3P3DBT0_9RHOB/1-192    AC A0A3P3DBT0.1
#=GS E8X6U0_GRATM/1-225        AC E8X6U0.1
#=GS A0A1I2E5P0_9RHOB/1-255    AC A0A1I2E5P0.1
#=GS A0A0M7AEU0_9HYPH/1-208    AC A0A0M7AEU0.1
#=GS Q2K2E7_RHIEC/1-231        AC Q2K2E7.1
#=GS V7F770_9HYPH/1-195        AC V7F770.1
#=GS A0A1N7MWP7_9RHOB/5-239    AC A0A1N7MWP7.1
#=GS A0A097IJN4_9CORY/10-181   AC A0A097IJN4.1
#=GS T0KJQ7_9SPHN/1-219        AC T0KJQ7.1
#=GS A0A2P7ASK4_9HYPH/3-224    AC A0A2P7ASK4.1
#=GS A0A2V3W7G6_9PROT/1-234    AC A0A2V3W7G6.1
#=GS A0A5N7MSS1_9HYPH/1-231    AC A0A5N7MSS1.1
#=GS A0A1V0GYK4_9RHOB/5-236    AC A0A1V0GYK4.1
#=GS A1ZZU3_9BACT/2-180        AC A1ZZU3.1
#=GS A0A7W6MLR4_9HYPH/1-222    AC A0A7W6MLR4.1
#=GS A0A1A8XII6_9PROT/4-217    AC A0A1A8XII6.1
#=GS A0A0S3F6D7_9SPHN/1-215    AC A0A0S3F6D7.1
#=GS A0A521FVJ5_9RHOB/1-231    AC A0A521FVJ5.1
#=GS A0A1B9SCQ5_9HYPH/1-216    AC A0A1B9SCQ5.1
#=GS A0A0T5NPB7_9RHOB/5-239    AC A0A0T5NPB7.1
#=GS J1T0H2_9HYPH/1-219        AC J1T0H2.1
#=GS A0A6L6JHE6_9RHOB/5-236    AC A0A6L6JHE6.1
#=GS A0A0M6ZCQ9_9HYPH/1-220    AC A0A0M6ZCQ9.1
#=GS K0Q092_9HYPH/1-229        AC K0Q092.1
#=GS A0A021WXU1_9HYPH/1-228    AC A0A021WXU1.1
#=GS A0A0M3AYR8_9HYPH/1-220    AC A0A0M3AYR8.1
#=GS A0A6I4VBF5_9GAMM/1-220    AC A0A6I4VBF5.1
#=GS A0A256FS59_9HYPH/49-273   AC A0A256FS59.1
#=GS A0A0N0J5P9_9HYPH/1-222    AC A0A0N0J5P9.1
#=GS A0A0D6JBU0_9HYPH/19-236   AC A0A0D6JBU0.1
#=GS A0A074T8P6_9RHOB/5-239    AC A0A074T8P6.1
#=GS A0A545TXM5_9PROT/1-199    AC A0A545TXM5.1
#=GS A0A549TB05_9HYPH/1-220    AC A0A549TB05.1
#=GS A0A2M9P7I4_9RHOB/1-140    AC A0A2M9P7I4.1
#=GS L0NNS2_9HYPH/1-220        AC L0NNS2.1
#=GS A0A376AF62_9HYPH/1-221    AC A0A376AF62.1
#=GS A0A1N7MR67_9RHOB/5-239    AC A0A1N7MR67.1
#=GS A0A0B2AIL6_9MICC/1-208    AC A0A0B2AIL6.1
#=GS A0A6M1MST7_9RHOB/5-239    AC A0A6M1MST7.1
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