KEGG   Rickettsia typhi Wilmington: RT0195
Entry
RT0195            CDS       T00193                                 
Name
(GenBank) probable ATP binding cassette transporter
  KO
K24821  ATP-binding cassette, subfamily B, heavy metal transporter
Organism
rty  Rickettsia typhi Wilmington
Pathway
rty02010  ABC transporters
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:rty00001]
 09130 Environmental Information Processing
  09131 Membrane transport
   02010 ABC transporters
    RT0195
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02000 Transporters [BR:rty02000]
    RT0195
Transporters [BR:rty02000]
 ABC transporters, eukaryotic type
  ABCB (MDR/TAP) subfamily
   ABCB-BAC subgroup
    RT0195
SSDB
Motif
Pfam: ABC_membrane ABC_tran SMC_N Zeta_toxin RsgA_GTPase AAA_22 AAA_18 AAA_29 DUF87 AAA_16
Other DBs
NCBI-ProteinID: AAU03679
UniProt: Q68XG3
Position
247019..248797
AA seq 592 aa
MPKNNNHKNAFYILLTYLWLKDFDIRLRIVTSLICLVIAKVINIFVPIVYKYIIDGLNQN
LPLSVIIGVIIGYGVTKILVQIFSELRNIIFSKVGYQATRLVALNVFKHMHSLSMRFHIT
RKTGGLSRSIERGTKGIEAVLRYSLFNIFPTSLEIILVIGILWYLHGVWFAVTVLITMIV
YVCYTLLISTWRIAFAREMNKSDNTANNRAIDSLLNFETVKYFNNEEYEAMKFNDALQTY
EKSATKTTNSLSILNIGQDVIISLGLISLMILSVNAINQNKMMIGDLIMVNAYLFQLSIP
LSILGFAYREIKNALVNMEDMFKLLDIPAEIQDSVDAKELIISKCEVSFNNVSFAYNKER
TILHNITFTIESGKTIAVVGSSGAGKSTISRLLFRFYDINSGSIIIDNQDIRKVKQRSLR
ESIGIVPQDTVLFNDTIYYNIAYGNNAASYDEVIAASKNAHIHEFISVLPEGYATQVGER
GLKLSGGEKQRIAIARTILKNPSIYVFDEATSSLDTKTEKLIQASLKEISANHTTLIIAH
RLSTIVDADEIIVLDNGYIVERGNHKTLLKYQGYYAELWYKQQEECKQDTEL
NT seq 1779 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgcctaaaaataacaatcacaaaaatgcgttttatatacttcttacatatttatggttg
aaggattttgatatcagattacgtattgttacgtctcttatttgtttagttatagctaaa
gtaataaatatttttgttccaattgtttataaatatataatagacggactaaatcaaaat
ttacctctctcagttattattggtgttattattggatatggtgtgacaaaaatacttgtc
caaatttttagtgaattgcgaaatataattttttcaaaagttggatatcaagcaacacgc
ttagtagctttaaatgtctttaaacacatgcatagtttaagtatgcgtttccatattact
agaaaaacaggtggtttaagtaggtcaatagaacgtggtactaaaggtattgaagcagtg
ctacggtattcattatttaatattttcccgacaagcttagaaattatattggtcatcgga
atattatggtatcttcatggtgtatggtttgcagtaactgtcttaataacaatgatagtt
tatgtgtgttatactttattaatcagtacttggcgtattgcatttgcaagggaaatgaac
aaaagcgataacactgcaaataatagagcgatcgatagtttattgaattttgaaacagtt
aaatattttaataatgaagaatatgaggcgatgaagtttaatgatgctttgcaaacttat
gaaaaatcagctactaaaactactaacagtctatcaattttgaatattggacaggatgtc
ataatatcattagggcttatttctttaatgatactttcagtaaatgctattaatcaaaat
aaaatgatgatcggcgatttaataatggttaatgcttatctatttcagttatcaattcca
ctttcaatacttggtttcgcttatagagaaattaaaaatgctctagttaatatggaagat
atgtttaagttacttgatataccggcagaaatacaagattcagtagatgctaaggagtta
attatctcaaaatgtgaggtcagttttaataatgttagctttgcttataataaggaacgt
actattttgcataatatcacttttacgattgagagcggtaaaacaattgcagtggtaggt
agtagcggtgcaggtaaatcaacgatatcacgattgctttttaggttttacgatattaat
agtggtagtattattatagataatcaagatataagaaaagttaagcaacgctcacttcgt
gaatctattgggattgttccacaagatacggtattgtttaatgatacgatatattataac
atcgcatatggtaataatgcagctagttacgatgaagttatagccgcatcaaaaaatgct
catattcatgaatttattagtgtgttacctgaaggttatgcaacacaggtaggcgagaga
ggtttaaaactttcaggtggtgaaaaacaacgtattgcgattgcaagaactatcttaaaa
aatccatcaatatatgtttttgatgaagcaacaagttcacttgatactaaaactgaaaag
ctaattcaagcaagtcttaaagagatttcagctaaccatactactcttatcatcgctcat
agattatcgactattgttgatgcagatgagattatagttttagataatggttatatagtt
gaacgaggcaatcataaaacattgttaaaatatcaaggctattacgctgaattatggtat
aaacagcaggaggaatgtaaacaagatacagaattataa

  All links  
Ontology (2)   
   KEGG BRITE (2)   
Pathway (1)   
   KEGG PATHWAY (1)   
Genome (1)   
   KEGG GENOME (1)   
Gene (3)   
   KEGG ORTHOLOGY (1)   
   NCBI-PROTEINID (1)   
   OC (1)   
Protein sequence (1)   
   UniProt (1)   
Protein domain (10)   
   Pfam (10)   
All databases (18)   

Download RDF
DBGET integrated database retrieval system