KEGG   Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9 (MRSA/VISA): SaurJH9_2405
Entry
SaurJH9_2405      CDS       T00522                                 
Name
(GenBank) transcriptional regulator, AraC family
Organism
saj  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9 (MRSA/VISA)
SSDB
Motif
Pfam: HTH_18 HTH_AraC
Other DBs
NCBI-ProteinID: ABQ50185
Position
2538589..2540694
AA seq 701 aa
MTCQLKIHHTLSTIPSRNINNIMVLFSLTSKLNITINGETKDVSNYIILINHGDIYNINH
GENIIELMIPVFYFYQQDDDFFNGYLDRHLLQSSNYIKSLIADLISTPTSSSLMGKNIGQ
SIIDTLLKEAFIRIDHEYLPNIALSNPVFIDCVNYIHDNIDAHLSLKDIAMHCNISESYC
SNLFVRYLSMNFKDYFTSIKLVNAINLLLSTKHSITTVSELAGFNSHTNFANQFKNYLHF
SPKQFRSLVSKITEPPQIHFQQDNVSQFTELISTIDLTAQLATNTTDIHIDDFNPKDRSQ
RAKVFVRFSNFNELFQFIFNEYYDINFEHLPKPVVFIDDIHDIEISQTNYNLLNRCFEKL
FEKNIGLAIAIKSTQQFETMKQLILTFLQGNQDYKTSKKLVKFMLVFCSNSMTAEEIHLC
HLKIKNKNKEIKYSVTVDGFLETYSTVEQVYDVMQRLKFHYYFIDIENSKTATHLITKNQ
HYHQTDTHFEQYKKFILDSGISSTQFVYNNLSVSGFKYTNDGKNPIQLSDIVYHLIALLR
YGGGISYQLLDDHSNYISLYNKYGSPLPLMHLYKMFRPFVNEDIEITNNYVLSRKDNNYH
FLLFNKINDRYMSDVKQDFIFHNELPQDSLMIIKTLNHEHGSIQHLLPISDQLVYIEKEI
LDELDKTNYPKTELAVQEETGRTFELKLNHDEVKYICFKPS
NT seq 2106 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgacatgccaacttaaaatacatcatacattatcgacaataccaagtcgtaatattaat
aatattatggtgctattttcacttacaagtaaactcaatattacgattaatggtgaaacc
aaagacgtaagtaattatattatcttaattaaccatggtgatatttataatattaaccac
ggcgaaaatataatcgaattaatgatacccgttttttatttttatcaacaagatgatgat
ttctttaatggttatttagatcgtcatttattacaatcaagtaattatattaagtcatta
attgccgatttaatcagtacaccaacaagttcttctttaatggggaaaaatataggtcaa
agtattatagacactttacttaaagaagcttttataagaatagatcatgaatatttacca
aatattgctttaagcaatccggtgttcatagactgtgtaaactatattcatgacaatatt
gatgcgcacttgtctttaaaagatatagcgatgcattgcaacatctctgaatcatattgt
tctaatctttttgttcgatatttgagtatgaattttaaagattattttacaagtattaaa
cttgttaacgccatcaatttattactttctacaaaacattctattacaactgtttctgaa
ttggccggttttaacagtcatacaaattttgcaaatcaatttaagaattacttgcatttt
agtcctaaacagttccgttcactcgtttccaagattactgaaccaccacaaatacacttc
caacaagataacgtatcacaattcactgagttaatttcaacaattgatttaacagctcaa
ctggctacaaatacaacagatattcatatagatgattttaatccgaaagatcgaagtcag
cgtgccaaagtatttgttcgatttagtaatttcaatgaactatttcaatttattttcaat
gaatattacgatattaactttgagcacttaccaaaacctgtcgttttcattgacgatatt
cacgatattgagattagccaaacgaattacaacctgttaaatagatgttttgaaaagctt
ttcgaaaaaaatataggtttagcaatcgctattaaatcaacacaacaattcgaaacgatg
aagcagttaatactaacatttttacaaggcaatcaagactataagacaagcaagaaatta
gttaaatttatgctcgtattttgctctaattctatgacagcagaagaaattcatttatgt
catcttaaaattaaaaacaaaaataaagaaattaaatatagtgtgacagtcgatggcttt
ttagaaacttattcaaccgtggaacaagtttatgatgtcatgcagcgtcttaaattccat
tattactttattgatattgaaaattcaaaaactgcaacacatcttatcactaaaaaccaa
cactatcatcaaactgacactcattttgaacagtataagaaatttattttagattcaggt
atatcatcaacacaatttgtatataataacctgtctgtaagcggatttaaatatactaat
gatggtaagaatccaattcaattatctgacatagtgtatcacttaatcgcattattacga
tatggcggtggcattagctatcaattattagatgaccattcaaattatatttccttgtac
aacaaatatggtagccccctaccattaatgcatttatataaaatgtttagaccttttgtt
aatgaagatattgaaattacaaataattatgtattgagtcgtaaagataataactaccat
ttcttattattcaataaaattaatgatcgatatatgtcagacgtaaaacaagatttcatt
ttccataatgaattacctcaagactctttgatgattattaaaacattgaatcatgaacat
ggttcaattcaacatttgcttccaataagcgatcaacttgtttatatagaaaaagaaatt
ttagatgaattagacaaaacgaattaccctaaaacggagcttgcagttcaagaagaaact
ggtcgtacatttgaactcaagttaaatcacgacgaggttaaatatatttgctttaaacca
agctaa

  All links  
Genome (1)   
   KEGG GENOME (1)   
Gene (2)   
   NCBI-PROTEINID (1)   
   OC (1)   
Protein domain (2)   
   Pfam (2)   
All databases (5)   

Download RDF
DBGET integrated database retrieval system